MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187085	GC	3	6	1180	1185	0 %	0 %	50 %	50 %	409249424
2	NT_187085	T	6	6	1206	1211	0 %	100 %	0 %	0 %	409249424
3	NT_187085	CTT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249424
4	NT_187085	CA	3	6	1240	1245	50 %	0 %	0 %	50 %	409249424
5	NT_187085	GGT	2	6	1246	1251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249424
6	NT_187085	CAG	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249425
7	NT_187085	GGC	2	6	1310	1315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249425
8	NT_187085	AAAATC	2	12	2124	2135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409249426
9	NT_187085	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249426
10	NT_187085	CTC	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249426
11	NT_187085	CAG	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249426
12	NT_187085	ACCCAA	2	12	2299	2310	50 %	0 %	0 %	50 %	409249426
13	NT_187085	CCAAG	2	10	2322	2331	40 %	0 %	20 %	40 %	409249426
14	NT_187085	A	6	6	2971	2976	100 %	0 %	0 %	0 %	409249427
15	NT_187085	ACA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249427
16	NT_187085	CAT	2	6	3069	3074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249427
17	NT_187085	TGA	3	9	3180	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249427
18	NT_187085	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249427
19	NT_187085	ATT	2	6	3388	3393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249427
20	NT_187085	TGC	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249427
21	NT_187085	TCA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249427
22	NT_187085	CCAG	2	8	3813	3820	25 %	0 %	25 %	50 %	409249428
23	NT_187085	CTG	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249428
24	NT_187085	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
25	NT_187085	GCG	2	6	4113	4118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249428
26	NT_187085	ATC	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249428
27	NT_187085	CGG	2	6	4142	4147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249428
28	NT_187085	TGG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
29	NT_187085	CCTGA	2	10	4173	4182	20 %	20 %	20 %	40 %	409249428
30	NT_187085	ACG	2	6	4204	4209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249428
31	NT_187085	TGA	2	6	4235	4240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249428
32	NT_187085	CTG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249428
33	NT_187085	GTG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
34	NT_187085	ATCG	2	8	4326	4333	25 %	25 %	25 %	25 %	409249428
35	NT_187085	TC	3	6	4337	4342	0 %	50 %	0 %	50 %	409249428
36	NT_187085	ATCG	2	8	4416	4423	25 %	25 %	25 %	25 %	409249428
37	NT_187085	GAT	2	6	4548	4553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249429
38	NT_187085	ACG	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
39	NT_187085	ACG	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
40	NT_187085	CGG	2	6	4643	4648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249429
41	NT_187085	GGC	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249429
42	NT_187085	TGAT	2	8	4730	4737	25 %	50 %	25 %	0 %	409249429
43	NT_187085	CAG	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
44	NT_187085	CAA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249429
45	NT_187085	G	6	6	4851	4856	0 %	0 %	100 %	0 %	409249429
46	NT_187085	TCA	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249430
47	NT_187085	GAA	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249430
48	NT_187085	GCC	2	6	5034	5039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249430
49	NT_187085	GCT	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249430
50	NT_187085	GCA	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249430
51	NT_187085	CAG	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249430
52	NT_187085	AATT	2	8	5904	5911	50 %	50 %	0 %	0 %	409249431
53	NT_187085	TCG	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249431
54	NT_187085	TGC	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249431
55	NT_187085	A	6	6	6005	6010	100 %	0 %	0 %	0 %	409249431
56	NT_187085	GAC	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249431
57	NT_187085	TTA	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249431
58	NT_187085	TCA	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249432
59	NT_187085	TGG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249432
60	NT_187085	CGC	2	6	6630	6635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
61	NT_187085	CGG	2	6	6680	6685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249432
62	NT_187085	CCG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
63	NT_187085	GCA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249432
64	NT_187085	CAG	2	6	6969	6974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249432
65	NT_187085	CGC	3	9	7052	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.