MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187081	CGC	2	6	48	53	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
2	NT_187081	GCT	2	6	97	102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
3	NT_187081	CTG	2	6	119	124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
4	NT_187081	CGGCG	2	10	127	136	0 %	0 %	60 %	40 %	409249207
5	NT_187081	ACT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249207
6	NT_187081	GGC	3	9	217	225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
7	NT_187081	CAT	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249207
8	NT_187081	CGG	2	6	238	243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
9	NT_187081	GCT	2	6	292	297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
10	NT_187081	GGC	2	6	313	318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
11	NT_187081	GCC	2	6	352	357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
12	NT_187081	GC	4	8	364	371	0 %	0 %	50 %	50 %	409249207
13	NT_187081	GGT	2	6	448	453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
14	NT_187081	TAC	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249207
15	NT_187081	TGG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
16	NT_187081	CTG	3	9	473	481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
17	NT_187081	CGC	2	6	487	492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
18	NT_187081	GCT	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
19	NT_187081	GCG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
20	NT_187081	TGG	2	6	543	548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
21	NT_187081	TGG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249207
22	NT_187081	CTG	3	9	668	676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
23	NT_187081	CGG	2	6	702	707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
24	NT_187081	TGA	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249207
25	NT_187081	CGG	2	6	774	779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
26	NT_187081	CGG	2	6	786	791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
27	NT_187081	GGC	2	6	799	804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249207
28	NT_187081	CTG	2	6	851	856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249207
29	NT_187081	GCC	2	6	905	910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249207
30	NT_187081	TGA	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249208
31	NT_187081	AAC	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249208
32	NT_187081	CTG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
33	NT_187081	GTT	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249208
34	NT_187081	GGC	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249208
35	NT_187081	GCT	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
36	NT_187081	GCA	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249208
37	NT_187081	GTC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
38	NT_187081	CAGT	2	8	1372	1379	25 %	25 %	25 %	25 %	409249208
39	NT_187081	TGGCA	2	10	1387	1396	20 %	20 %	40 %	20 %	409249208
40	NT_187081	GCA	2	6	1437	1442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249208
41	NT_187081	CGG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249208
42	NT_187081	CTGC	2	8	1495	1502	0 %	25 %	25 %	50 %	409249208
43	NT_187081	CTG	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
44	NT_187081	CTG	2	6	1520	1525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
45	NT_187081	GCA	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249208
46	NT_187081	GCT	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
47	NT_187081	GCG	2	6	1584	1589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249208
48	NT_187081	GAT	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249208
49	NT_187081	CTG	2	6	1676	1681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249208
50	NT_187081	CTGA	2	8	1728	1735	25 %	25 %	25 %	25 %	409249208
51	NT_187081	GAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249209
52	NT_187081	TGG	2	6	2248	2253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
53	NT_187081	TGG	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
54	NT_187081	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249209
55	NT_187081	GCGCT	2	10	2491	2500	0 %	20 %	40 %	40 %	409249209
56	NT_187081	GCC	2	6	2538	2543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249209
57	NT_187081	CGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249209
58	NT_187081	GTG	2	6	2637	2642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
59	NT_187081	TGA	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249209
60	NT_187081	CG	3	6	2757	2762	0 %	0 %	50 %	50 %	409249209
61	NT_187081	GTG	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249209
62	NT_187081	T	6	6	2809	2814	0 %	100 %	0 %	0 %	409249209
63	NT_187081	AG	3	6	2861	2866	50 %	0 %	50 %	0 %	409249209
64	NT_187081	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249209
65	NT_187081	CTG	2	6	2904	2909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249209
66	NT_187081	TTG	2	6	2913	2918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249209
67	NT_187081	TCG	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249209
68	NT_187081	GCG	2	6	3084	3089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249209
69	NT_187081	CG	3	6	3276	3281	0 %	0 %	50 %	50 %	409249210
70	NT_187081	TAC	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249210
71	NT_187081	GCT	2	6	3373	3378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249210
72	NT_187081	GGC	2	6	3509	3514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249210
73	NT_187081	CGG	2	6	3607	3612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249210
74	NT_187081	TCG	2	6	3649	3654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249210
75	NT_187081	GC	3	6	3687	3692	0 %	0 %	50 %	50 %	409249210
76	NT_187081	GCG	2	6	3846	3851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249210
77	NT_187081	GGT	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249210
78	NT_187081	TCG	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249211
79	NT_187081	GCG	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249211
80	NT_187081	TCA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249211
81	NT_187081	CGG	2	6	4442	4447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249211
82	NT_187081	CTT	3	9	4669	4677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249211
83	NT_187081	GCT	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249211
84	NT_187081	CAT	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249211
85	NT_187081	CTC	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249212
86	NT_187081	GAT	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249212
87	NT_187081	GCA	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249212
88	NT_187081	GGT	2	6	5247	5252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249212
89	NT_187081	CAT	2	6	5259	5264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249212
90	NT_187081	GCC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249212
91	NT_187081	TGGT	2	8	5554	5561	0 %	50 %	50 %	0 %	409249212
92	NT_187081	TCA	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249212
93	NT_187081	AAT	2	6	5698	5703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249212
94	NT_187081	GCG	2	6	5736	5741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249212
95	NT_187081	CCG	2	6	5761	5766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249212
96	NT_187081	AGA	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249212
97	NT_187081	ACC	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249212
98	NT_187081	CATA	2	8	6102	6109	50 %	25 %	0 %	25 %	409249213
99	NT_187081	ACA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249213
100	NT_187081	GCC	2	6	6206	6211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
101	NT_187081	GCC	3	9	6215	6223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
102	NT_187081	CGC	2	6	6235	6240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
103	NT_187081	ATC	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249213
104	NT_187081	GC	3	6	6376	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
105	NT_187081	GC	3	6	6398	6403	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
106	NT_187081	GCT	2	6	6502	6507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
107	NT_187081	GAA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249213
108	NT_187081	CGG	2	6	6540	6545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249213
109	NT_187081	TAT	2	6	6547	6552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249213
110	NT_187081	CCA	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249213
111	NT_187081	TGA	2	6	6589	6594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249213
112	NT_187081	CAC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249213
113	NT_187081	CAAT	2	8	6648	6655	50 %	25 %	0 %	25 %	409249213
114	NT_187081	T	6	6	6671	6676	0 %	100 %	0 %	0 %	409249213
115	NT_187081	GC	3	6	6763	6768	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
116	NT_187081	GCT	2	6	6790	6795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
117	NT_187081	GGA	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249213
118	NT_187081	TGA	2	6	6868	6873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249213
119	NT_187081	CGC	2	6	6883	6888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
120	NT_187081	GTT	2	6	6896	6901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249213
121	NT_187081	CGC	2	6	6925	6930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249213
122	NT_187081	CTG	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
123	NT_187081	CGG	2	6	7012	7017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249213
124	NT_187081	GTACG	2	10	7027	7036	20 %	20 %	40 %	20 %	409249213
125	NT_187081	TCG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249213
126	NT_187081	CG	3	6	7042	7047	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
127	NT_187081	CAT	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249213
128	NT_187081	GTGG	2	8	7157	7164	0 %	25 %	75 %	0 %	409249213
129	NT_187081	GC	4	8	7192	7199	0 %	0 %	50 %	50 %	409249213
130	NT_187081	CG	3	6	7258	7263	0 %	0 %	50 %	50 %	409249214
131	NT_187081	ACGG	2	8	7339	7346	25 %	0 %	50 %	25 %	409249214
132	NT_187081	GCA	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249214
133	NT_187081	GCG	2	6	7362	7367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249214
134	NT_187081	TTC	2	6	7402	7407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249214
135	NT_187081	GC	3	6	7419	7424	0 %	0 %	50 %	50 %	409249214
136	NT_187081	GGAA	2	8	7446	7453	50 %	0 %	50 %	0 %	409249214
137	NT_187081	CGCCAG	2	12	7495	7506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409249214
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139	NT_187081	GCT	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249214
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143	NT_187081	CCA	2	6	7671	7676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249214
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149	NT_187081	CA	3	6	8103	8108	50 %	0 %	0 %	50 %	409249214
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154	NT_187081	TAAT	2	8	8439	8446	50 %	50 %	0 %	0 %	409249215
155	NT_187081	ACG	2	6	8562	8567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249215
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157	NT_187081	GCGA	2	8	8649	8656	25 %	0 %	50 %	25 %	409249215
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161	NT_187081	GCA	2	6	8770	8775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249215
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164	NT_187081	GGA	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249215
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169	NT_187081	GCA	2	6	9232	9237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249215
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174	NT_187081	T	6	6	9635	9640	0 %	100 %	0 %	0 %	409249216
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230	NT_187081	CCGCG	2	10	12286	12295	0 %	0 %	40 %	60 %	409249218
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232	NT_187081	CG	3	6	12337	12342	0 %	0 %	50 %	50 %	409249218
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243	NT_187081	AG	3	6	12858	12863	50 %	0 %	50 %	0 %	409249218
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245	NT_187081	TTA	2	6	13066	13071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249219
246	NT_187081	TCA	2	6	13091	13096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249219
247	NT_187081	CAT	2	6	13116	13121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249219
248	NT_187081	T	6	6	13160	13165	0 %	100 %	0 %	0 %	409249219
249	NT_187081	CAGA	2	8	13191	13198	50 %	0 %	25 %	25 %	409249219
250	NT_187081	CGC	3	9	13468	13476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249220
251	NT_187081	AACG	2	8	13483	13490	50 %	0 %	25 %	25 %	409249220
252	NT_187081	A	6	6	13517	13522	100 %	0 %	0 %	0 %	409249220
253	NT_187081	ATGTGG	2	12	13530	13541	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409249220
254	NT_187081	CCT	2	6	13554	13559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249220
255	NT_187081	GC	3	6	13571	13576	0 %	0 %	50 %	50 %	409249220
256	NT_187081	GC	3	6	13590	13595	0 %	0 %	50 %	50 %	409249220
257	NT_187081	CGG	2	6	13596	13601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249220
258	NT_187081	CTG	2	6	13614	13619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249220
259	NT_187081	ATGG	2	8	13627	13634	25 %	25 %	50 %	0 %	409249220
260	NT_187081	A	6	6	13649	13654	100 %	0 %	0 %	0 %	409249220
261	NT_187081	TGG	3	9	13698	13706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249220
262	NT_187081	ACA	2	6	13746	13751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249220
263	NT_187081	CTG	2	6	13769	13774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249220
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387	NT_187081	CCTA	2	8	20593	20600	25 %	25 %	0 %	50 %	409249228
388	NT_187081	GTTAC	2	10	20638	20647	20 %	40 %	20 %	20 %	409249228
389	NT_187081	GCGG	2	8	20696	20703	0 %	0 %	75 %	25 %	409249228
390	NT_187081	A	6	6	20761	20766	100 %	0 %	0 %	0 %	409249228
391	NT_187081	TGA	2	6	20791	20796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249228
392	NT_187081	GGC	2	6	20924	20929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249228
393	NT_187081	A	6	6	20999	21004	100 %	0 %	0 %	0 %	409249228
394	NT_187081	ATA	2	6	21010	21015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249228
395	NT_187081	TAT	2	6	21073	21078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249228
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398	NT_187081	GATGCT	2	12	21170	21181	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409249228
399	NT_187081	GTA	2	6	21204	21209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249228
400	NT_187081	A	6	6	21209	21214	100 %	0 %	0 %	0 %	409249228
401	NT_187081	GGC	2	6	21219	21224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249228
402	NT_187081	ATC	2	6	21252	21257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249228
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405	NT_187081	ATA	2	6	21319	21324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249228
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412	NT_187081	GGC	2	6	21534	21539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249228
413	NT_187081	GCC	2	6	21540	21545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249228
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415	NT_187081	TGG	2	6	21595	21600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249228
416	NT_187081	ACTA	2	8	21608	21615	50 %	25 %	0 %	25 %	409249228
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420	NT_187081	A	6	6	21885	21890	100 %	0 %	0 %	0 %	409249229
421	NT_187081	CCTCG	2	10	21911	21920	0 %	20 %	20 %	60 %	409249229
422	NT_187081	ATA	2	6	21922	21927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249229
423	NT_187081	TAT	2	6	21998	22003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249229
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425	NT_187081	CGA	2	6	22103	22108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249229
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491	NT_187081	TGG	2	6	25717	25722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249231
492	NT_187081	GAC	2	6	25819	25824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249231
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497	NT_187081	CTG	2	6	25998	26003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249231
498	NT_187081	GC	3	6	26004	26009	0 %	0 %	50 %	50 %	409249231
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500	NT_187081	GCT	2	6	26045	26050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249231

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