MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187073	GAC	2	6	506	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248676
2	NT_187073	GCG	2	6	618	623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248676
3	NT_187073	CAC	2	6	646	651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248676
4	NT_187073	AG	3	6	703	708	50 %	0 %	50 %	0 %	409248676
5	NT_187073	A	6	6	713	718	100 %	0 %	0 %	0 %	409248676
6	NT_187073	GAA	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248676
7	NT_187073	A	6	6	815	820	100 %	0 %	0 %	0 %	409248676
8	NT_187073	CCA	2	6	909	914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248676
9	NT_187073	GGT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248676
10	NT_187073	CCA	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248676
11	NT_187073	GCAA	2	8	1148	1155	50 %	0 %	25 %	25 %	409248676
12	NT_187073	CTG	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248676
13	NT_187073	AGC	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248676
14	NT_187073	TA	3	6	1325	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	409248677
15	NT_187073	GTA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248677
16	NT_187073	CAG	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248677
17	NT_187073	CCA	2	6	1441	1446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248677
18	NT_187073	CG	3	6	1455	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	409248677
19	NT_187073	ATCA	2	8	1469	1476	50 %	25 %	0 %	25 %	409248677
20	NT_187073	GTT	2	6	1519	1524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248677
21	NT_187073	GAA	2	6	1545	1550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248677
22	NT_187073	CG	4	8	1734	1741	0 %	0 %	50 %	50 %	409248677
23	NT_187073	TGA	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248677
24	NT_187073	GAG	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248677
25	NT_187073	GCA	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248677
26	NT_187073	CG	3	6	1927	1932	0 %	0 %	50 %	50 %	409248677
27	NT_187073	GCG	2	6	1965	1970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248677
28	NT_187073	GTA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248677
29	NT_187073	CTG	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248677
30	NT_187073	CTT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248677
31	NT_187073	GCT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248677
32	NT_187073	GCC	2	6	2133	2138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248677
33	NT_187073	TTC	2	6	2183	2188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248677
34	NT_187073	TATG	2	8	2303	2310	25 %	50 %	25 %	0 %	409248678
35	NT_187073	CAA	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248678
36	NT_187073	CCG	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248678
37	NT_187073	GC	3	6	2468	2473	0 %	0 %	50 %	50 %	409248678
38	NT_187073	CGG	2	6	2543	2548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
39	NT_187073	TGGCA	2	10	2558	2567	20 %	20 %	40 %	20 %	409248678
40	NT_187073	TCG	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
41	NT_187073	CTG	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
42	NT_187073	TTC	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248678
43	NT_187073	TAT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248678
44	NT_187073	TGG	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248678
45	NT_187073	TGGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	50 %	25 %	409248678
46	NT_187073	CCTT	2	8	2783	2790	0 %	50 %	0 %	50 %	409248678
47	NT_187073	TGA	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248678
48	NT_187073	CTG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
49	NT_187073	GCC	2	6	2866	2871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248678
50	NT_187073	CGG	2	6	2946	2951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
51	NT_187073	GAT	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248678
52	NT_187073	GCA	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248678
53	NT_187073	GTGCC	2	10	3098	3107	0 %	20 %	40 %	40 %	409248678
54	NT_187073	CGC	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248678
55	NT_187073	TGTT	2	8	3134	3141	0 %	75 %	25 %	0 %	409248678
56	NT_187073	CTG	2	6	3142	3147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
57	NT_187073	GCG	2	6	3313	3318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
58	NT_187073	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
59	NT_187073	TGG	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248678
60	NT_187073	CTG	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
61	NT_187073	A	6	6	3620	3625	100 %	0 %	0 %	0 %	409248679
62	NT_187073	ATGCG	2	10	3631	3640	20 %	20 %	40 %	20 %	409248679
63	NT_187073	CCG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
64	NT_187073	GCC	2	6	3674	3679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
65	NT_187073	CCG	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
66	NT_187073	AT	3	6	3763	3768	50 %	50 %	0 %	0 %	409248679
67	NT_187073	AGC	3	9	3772	3780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248679
68	NT_187073	GAA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248679
69	NT_187073	AGG	2	6	3841	3846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248679
70	NT_187073	GAC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248679
71	NT_187073	GCC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
72	NT_187073	GCC	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
73	NT_187073	CTG	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248679
74	NT_187073	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248679
75	NT_187073	GTA	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248679
76	NT_187073	GCC	2	6	4198	4203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
77	NT_187073	CGT	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248679
78	NT_187073	GAC	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248679
79	NT_187073	T	6	6	4309	4314	0 %	100 %	0 %	0 %	409248679
80	NT_187073	TGAA	2	8	4330	4337	50 %	25 %	25 %	0 %	409248679
81	NT_187073	CG	3	6	4354	4359	0 %	0 %	50 %	50 %	409248679
82	NT_187073	CAT	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248680
83	NT_187073	GCG	2	6	4745	4750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248680
84	NT_187073	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248680
85	NT_187073	GGT	2	6	4828	4833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248680
86	NT_187073	ACG	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248680
87	NT_187073	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248680
88	NT_187073	ATGTC	2	10	4932	4941	20 %	40 %	20 %	20 %	409248680
89	NT_187073	TGGC	2	8	5030	5037	0 %	25 %	50 %	25 %	409248680
90	NT_187073	AAT	2	6	5045	5050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248680
91	NT_187073	GTTG	2	8	5137	5144	0 %	50 %	50 %	0 %	409248680
92	NT_187073	CGATT	2	10	5148	5157	20 %	40 %	20 %	20 %	409248680
93	NT_187073	AGC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248680
94	NT_187073	AAC	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248681
95	NT_187073	GCT	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
96	NT_187073	GTT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248681
97	NT_187073	CTG	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
98	NT_187073	TGT	2	6	5916	5921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248681
99	NT_187073	GTTTC	2	10	5993	6002	0 %	60 %	20 %	20 %	409248681
100	NT_187073	AAAG	2	8	6010	6017	75 %	0 %	25 %	0 %	409248681
101	NT_187073	TTTG	2	8	6048	6055	0 %	75 %	25 %	0 %	409248681
102	NT_187073	CGC	2	6	6083	6088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248681
103	NT_187073	CAT	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248681
104	NT_187073	CGG	2	6	6161	6166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248681
105	NT_187073	ACA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248681
106	NT_187073	CG	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	409248681
107	NT_187073	GTA	3	9	6314	6322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248681
108	NT_187073	TTCTGT	2	12	6430	6441	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409248681
109	NT_187073	TCG	2	6	6481	6486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
110	NT_187073	CGT	2	6	6530	6535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
111	NT_187073	CCAT	2	8	6536	6543	25 %	25 %	0 %	50 %	409248681
112	NT_187073	GTGC	2	8	6599	6606	0 %	25 %	50 %	25 %	409248681
113	NT_187073	TG	4	8	6686	6693	0 %	50 %	50 %	0 %	409248681
114	NT_187073	TCTT	2	8	6768	6775	0 %	75 %	0 %	25 %	409248682
115	NT_187073	GTT	2	6	6805	6810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248682
116	NT_187073	TTAA	2	8	6837	6844	50 %	50 %	0 %	0 %	409248682
117	NT_187073	A	7	7	6864	6870	100 %	0 %	0 %	0 %	409248682
118	NT_187073	T	7	7	6917	6923	0 %	100 %	0 %	0 %	409248682
119	NT_187073	ATA	2	6	6947	6952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248682
120	NT_187073	GCA	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248682
121	NT_187073	GT	3	6	7036	7041	0 %	50 %	50 %	0 %	409248682
122	NT_187073	AG	3	6	7050	7055	50 %	0 %	50 %	0 %	409248682
123	NT_187073	GCC	2	6	7115	7120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248682
124	NT_187073	CGC	2	6	7135	7140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248682
125	NT_187073	TAAG	2	8	7145	7152	50 %	25 %	25 %	0 %	409248682
126	NT_187073	ATCGCC	2	12	7235	7246	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409248682
127	NT_187073	GTGATG	2	12	7346	7357	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409248682
128	NT_187073	CAA	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248682
129	NT_187073	CA	3	6	7439	7444	50 %	0 %	0 %	50 %	409248682
130	NT_187073	TCA	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248682
131	NT_187073	AT	3	6	7512	7517	50 %	50 %	0 %	0 %	409248682
132	NT_187073	CT	3	6	7563	7568	0 %	50 %	0 %	50 %	409248683
133	NT_187073	TAC	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248683
134	NT_187073	CAG	2	6	7638	7643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248683
135	NT_187073	TC	3	6	7732	7737	0 %	50 %	0 %	50 %	409248683
136	NT_187073	CTG	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248683
137	NT_187073	GTG	2	6	7850	7855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248683
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139	NT_187073	ACTGG	2	10	8024	8033	20 %	20 %	40 %	20 %	409248683
140	NT_187073	G	7	7	8099	8105	0 %	0 %	100 %	0 %	409248683
141	NT_187073	CGCTTA	2	12	8176	8187	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248683
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152	NT_187073	T	6	6	8635	8640	0 %	100 %	0 %	0 %	409248684
153	NT_187073	ACC	2	6	8840	8845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248685
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158	NT_187073	TGG	2	6	8967	8972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248685
159	NT_187073	CTG	2	6	9014	9019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248685
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162	NT_187073	GA	3	6	9369	9374	50 %	0 %	50 %	0 %	409248685
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166	NT_187073	GGCG	2	8	9519	9526	0 %	0 %	75 %	25 %	409248685
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262	NT_187073	TCGC	2	8	14876	14883	0 %	25 %	25 %	50 %	409248690
263	NT_187073	GCC	2	6	14896	14901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248690
264	NT_187073	GCCC	2	8	14910	14917	0 %	0 %	25 %	75 %	409248690
265	NT_187073	GCC	2	6	14990	14995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248690
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282	NT_187073	AAT	2	6	15782	15787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248691
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286	NT_187073	TCA	2	6	15903	15908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248691
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302	NT_187073	TGA	2	6	17018	17023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248692
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374	NT_187073	CGA	2	6	20224	20229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248694
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382	NT_187073	GCGGT	2	10	20823	20832	0 %	20 %	60 %	20 %	409248694
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393	NT_187073	AGT	2	6	21259	21264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248694
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