MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187072	CCGG	2	8	181201	181208	0 %	0 %	50 %	50 %	409248633
3502	NT_187072	CGT	2	6	181256	181261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248633
3503	NT_187072	GAC	2	6	181281	181286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248633
3504	NT_187072	TGA	2	6	181337	181342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248633
3505	NT_187072	GCC	2	6	181387	181392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248633
3506	NT_187072	GCC	2	6	181464	181469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248633
3507	NT_187072	GCA	2	6	181505	181510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248633
3508	NT_187072	CTT	3	9	181517	181525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248633
3509	NT_187072	ATG	2	6	181537	181542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248633
3510	NT_187072	ATCG	2	8	181643	181650	25 %	25 %	25 %	25 %	409248634
3511	NT_187072	TCG	2	6	181676	181681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248634
3512	NT_187072	GCA	2	6	181781	181786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248634
3513	NT_187072	A	6	6	181786	181791	100 %	0 %	0 %	0 %	409248634
3514	NT_187072	GCC	2	6	181894	181899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248634
3515	NT_187072	GGA	2	6	181919	181924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248634
3516	NT_187072	GCCT	2	8	181974	181981	0 %	25 %	25 %	50 %	409248634
3517	NT_187072	CCG	2	6	182001	182006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248634
3518	NT_187072	GGC	2	6	182024	182029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248634
3519	NT_187072	TG	3	6	182100	182105	0 %	50 %	50 %	0 %	409248634
3520	NT_187072	GAA	2	6	182133	182138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248634
3521	NT_187072	CGC	2	6	182154	182159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248634
3522	NT_187072	TGG	2	6	182286	182291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248634
3523	NT_187072	GAA	2	6	182327	182332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248634
3524	NT_187072	TAT	2	6	182340	182345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248634
3525	NT_187072	GAT	2	6	182439	182444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248634
3526	NT_187072	AGC	2	6	182503	182508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248634
3527	NT_187072	CCA	2	6	182537	182542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248634
3528	NT_187072	TGG	2	6	182566	182571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248634
3529	NT_187072	T	6	6	182631	182636	0 %	100 %	0 %	0 %	409248634
3530	NT_187072	TAAA	2	8	182659	182666	75 %	25 %	0 %	0 %	409248634
3531	NT_187072	GCC	2	6	182764	182769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248634
3532	NT_187072	ATT	2	6	182864	182869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248634
3533	NT_187072	TGG	2	6	182920	182925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248634
3534	NT_187072	GTC	2	6	183009	183014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248634
3535	NT_187072	CGG	2	6	183034	183039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248634
3536	NT_187072	ATT	2	6	183058	183063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248634
3537	NT_187072	TGAC	2	8	183100	183107	25 %	25 %	25 %	25 %	409248634
3538	NT_187072	A	7	7	183288	183294	100 %	0 %	0 %	0 %	409248635
3539	NT_187072	CGG	2	6	183358	183363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248635
3540	NT_187072	CAG	2	6	183393	183398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3541	NT_187072	GGT	2	6	183440	183445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248635
3542	NT_187072	CAC	2	6	183467	183472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248635
3543	NT_187072	CGC	2	6	183481	183486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248635
3544	NT_187072	CAG	2	6	183504	183509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3545	NT_187072	GCG	2	6	183577	183582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248635
3546	NT_187072	GCG	2	6	183586	183591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248635
3547	NT_187072	CGG	2	6	183596	183601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248635
3548	NT_187072	CAA	2	6	183603	183608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248635
3549	NT_187072	ATT	2	6	183639	183644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248635
3550	NT_187072	CGC	2	6	183647	183652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248635
3551	NT_187072	CGT	2	6	183662	183667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3552	NT_187072	CAA	2	6	183671	183676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248635
3553	NT_187072	GAA	2	6	183797	183802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248635
3554	NT_187072	CGC	2	6	183971	183976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248635
3555	NT_187072	CGG	2	6	183995	184000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248635
3556	NT_187072	CGG	2	6	184061	184066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248635
3557	NT_187072	TGG	2	6	184126	184131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248635
3558	NT_187072	CAG	2	6	184319	184324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3559	NT_187072	GCG	2	6	184329	184334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248635
3560	NT_187072	GC	3	6	184337	184342	0 %	0 %	50 %	50 %	409248635
3561	NT_187072	GCA	2	6	184366	184371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3562	NT_187072	CTG	2	6	184386	184391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3563	NT_187072	GCA	2	6	184427	184432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3564	NT_187072	AGC	2	6	184434	184439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3565	NT_187072	AGC	2	6	184527	184532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3566	NT_187072	CGC	2	6	184550	184555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248635
3567	NT_187072	A	6	6	184569	184574	100 %	0 %	0 %	0 %	409248635
3568	NT_187072	GTGAT	2	10	184576	184585	20 %	40 %	40 %	0 %	409248635
3569	NT_187072	CAG	2	6	184599	184604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248635
3570	NT_187072	GTG	2	6	184678	184683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248635
3571	NT_187072	TATT	2	8	184691	184698	25 %	75 %	0 %	0 %	409248635
3572	NT_187072	TGGC	3	12	184866	184877	0 %	25 %	50 %	25 %	409248636
3573	NT_187072	GC	3	6	184910	184915	0 %	0 %	50 %	50 %	409248636
3574	NT_187072	CAT	2	6	184924	184929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248636
3575	NT_187072	TAT	2	6	184966	184971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248636
3576	NT_187072	GCG	2	6	184977	184982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248636
3577	NT_187072	GC	3	6	185013	185018	0 %	0 %	50 %	50 %	409248636
3578	NT_187072	CGA	2	6	185053	185058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248636
3579	NT_187072	GT	3	6	185186	185191	0 %	50 %	50 %	0 %	409248636
3580	NT_187072	GAT	2	6	185203	185208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248636
3581	NT_187072	TGA	2	6	185271	185276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248636
3582	NT_187072	GAA	2	6	185291	185296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248636
3583	NT_187072	TGG	2	6	185310	185315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248636
3584	NT_187072	GGC	2	6	185359	185364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248636
3585	NT_187072	GGT	2	6	185365	185370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248636
3586	NT_187072	CAG	2	6	185420	185425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248636
3587	NT_187072	AAC	2	6	185456	185461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248636
3588	NT_187072	TC	3	6	185477	185482	0 %	50 %	0 %	50 %	409248636
3589	NT_187072	TGG	2	6	185490	185495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248636
3590	NT_187072	ATC	2	6	185541	185546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248636
3591	NT_187072	AGC	2	6	185559	185564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248636
3592	NT_187072	CCGGG	2	10	185628	185637	0 %	0 %	60 %	40 %	409248636
3593	NT_187072	GC	3	6	185663	185668	0 %	0 %	50 %	50 %	409248636
3594	NT_187072	GAT	2	6	185674	185679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248636
3595	NT_187072	TGC	2	6	185733	185738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248636
3596	NT_187072	GGC	2	6	185762	185767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248636
3597	NT_187072	GC	3	6	185786	185791	0 %	0 %	50 %	50 %	409248636
3598	NT_187072	AAC	2	6	185819	185824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248636
3599	NT_187072	TTA	2	6	185828	185833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248636
3600	NT_187072	CTTA	2	8	186110	186117	25 %	50 %	0 %	25 %	409248637
3601	NT_187072	CGA	2	6	186164	186169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248637
3602	NT_187072	GTC	2	6	186189	186194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248637
3603	NT_187072	CTT	2	6	186293	186298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248637
3604	NT_187072	CCA	2	6	186323	186328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248637
3605	NT_187072	CTT	2	6	186425	186430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248637
3606	NT_187072	CGAT	2	8	186445	186452	25 %	25 %	25 %	25 %	409248637
3607	NT_187072	CATA	2	8	186491	186498	50 %	25 %	0 %	25 %	409248637
3608	NT_187072	CTA	2	6	186763	186768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248638
3609	NT_187072	GTG	2	6	186777	186782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248638
3610	NT_187072	TAT	2	6	186826	186831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248638
3611	NT_187072	GC	3	6	186844	186849	0 %	0 %	50 %	50 %	409248638
3612	NT_187072	T	8	8	186865	186872	0 %	100 %	0 %	0 %	409248638
3613	NT_187072	TCT	2	6	186903	186908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248638
3614	NT_187072	T	6	6	186957	186962	0 %	100 %	0 %	0 %	409248638
3615	NT_187072	TTA	2	6	186999	187004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248638
3616	NT_187072	G	6	6	187014	187019	0 %	0 %	100 %	0 %	409248638
3617	NT_187072	TGCC	2	8	187047	187054	0 %	25 %	25 %	50 %	409248638
3618	NT_187072	GC	3	6	187072	187077	0 %	0 %	50 %	50 %	409248638
3619	NT_187072	TGC	2	6	187169	187174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248638
3620	NT_187072	GC	3	6	187198	187203	0 %	0 %	50 %	50 %	409248638
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3622	NT_187072	ATT	2	6	187232	187237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248638
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3735	NT_187072	GCT	2	6	193336	193341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248642
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3740	NT_187072	GAA	2	6	193789	193794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248642
3741	NT_187072	TAA	2	6	193813	193818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248642
3742	NT_187072	ATG	2	6	194130	194135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248643
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3986	NT_187072	GAT	2	6	207365	207370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248655
3987	NT_187072	CTG	2	6	207387	207392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248655
3988	NT_187072	CGG	2	6	207403	207408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248655
3989	NT_187072	CTGG	2	8	207473	207480	0 %	25 %	50 %	25 %	409248655
3990	NT_187072	CTG	2	6	207522	207527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248655
3991	NT_187072	GGGAA	2	10	207530	207539	40 %	0 %	60 %	0 %	409248655
3992	NT_187072	CAG	2	6	207660	207665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248655
3993	NT_187072	GGC	2	6	207689	207694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248655
3994	NT_187072	CA	3	6	207738	207743	50 %	0 %	0 %	50 %	409248656
3995	NT_187072	TGG	2	6	207786	207791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248656
3996	NT_187072	CCG	3	9	207804	207812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248656
3997	NT_187072	TCG	2	6	207837	207842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248656
3998	NT_187072	A	6	6	207857	207862	100 %	0 %	0 %	0 %	409248656
3999	NT_187072	CGT	2	6	207875	207880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248656
4000	NT_187072	CG	3	6	207932	207937	0 %	0 %	50 %	50 %	409248656

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