MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces rapamycinicus NRRL 5491 genome

Total Repeats: 295945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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288002	NC_022785	GGGGT	2	10	12300824	12300833	0 %	20 %	80 %	0 %	557692613
288003	NC_022785	CGT	2	6	12300870	12300875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692613
288004	NC_022785	GCA	2	6	12300877	12300882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692613
288005	NC_022785	GACG	2	8	12300922	12300929	25 %	0 %	50 %	25 %	557692614
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288007	NC_022785	GAG	2	6	12301044	12301049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557692614
288008	NC_022785	ACG	2	6	12301057	12301062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692614
288009	NC_022785	ACCGC	2	10	12301121	12301130	20 %	0 %	20 %	60 %	557692614
288010	NC_022785	GGC	3	9	12301188	12301196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692614
288011	NC_022785	TGT	2	6	12301226	12301231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557692614
288012	NC_022785	GAT	2	6	12301263	12301268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557692614
288013	NC_022785	ATG	2	6	12301288	12301293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557692614
288014	NC_022785	CTG	2	6	12301306	12301311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692614
288015	NC_022785	GCC	2	6	12301332	12301337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557692614
288016	NC_022785	GAC	2	6	12301368	12301373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692614
288017	NC_022785	CTG	2	6	12301395	12301400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692614
288018	NC_022785	GCA	2	6	12301409	12301414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692614
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288023	NC_022785	CGC	2	6	12301557	12301562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557692614
288024	NC_022785	CGG	2	6	12301577	12301582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692614
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288028	NC_022785	CGA	3	9	12301682	12301690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692614
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288032	NC_022785	GAC	2	6	12301857	12301862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692614
288033	NC_022785	AGC	2	6	12301864	12301869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692614
288034	NC_022785	GAGC	2	8	12301874	12301881	25 %	0 %	50 %	25 %	557692614
288035	NC_022785	GGCC	2	8	12301883	12301890	0 %	0 %	50 %	50 %	557692614
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288049	NC_022785	CGGAG	2	10	12302594	12302603	20 %	0 %	60 %	20 %	557692615
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288108	NC_022785	GAATG	2	10	12305139	12305148	40 %	20 %	40 %	0 %	557692616
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288432	NC_022785	TCG	2	6	12320090	12320095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692629
288433	NC_022785	ACG	2	6	12320099	12320104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692629
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288439	NC_022785	TAC	2	6	12320398	12320403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557692629
288440	NC_022785	GCT	3	9	12320454	12320462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692629
288441	NC_022785	CGGC	2	8	12320492	12320499	0 %	0 %	50 %	50 %	557692629
288442	NC_022785	CAT	2	6	12320514	12320519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557692629
288443	NC_022785	GGT	2	6	12320543	12320548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557692629
288444	NC_022785	CGT	2	6	12320556	12320561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692629
288445	NC_022785	CGG	2	6	12320576	12320581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692629
288446	NC_022785	CGGA	2	8	12320595	12320602	25 %	0 %	50 %	25 %	557692629
288447	NC_022785	TCCG	2	8	12320604	12320611	0 %	25 %	25 %	50 %	557692629
288448	NC_022785	GGCT	2	8	12320626	12320633	0 %	25 %	50 %	25 %	557692629
288449	NC_022785	CGG	2	6	12320639	12320644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692629
288450	NC_022785	CGA	2	6	12320646	12320651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692629
288451	NC_022785	CGGGC	2	10	12320660	12320669	0 %	0 %	60 %	40 %	557692629
288452	NC_022785	GAT	2	6	12320688	12320693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557692629
288453	NC_022785	GC	3	6	12320769	12320774	0 %	0 %	50 %	50 %	557692629
288454	NC_022785	CAC	2	6	12320853	12320858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557692629
288455	NC_022785	CG	3	6	12320883	12320888	0 %	0 %	50 %	50 %	557692629
288456	NC_022785	GGGC	2	8	12320892	12320899	0 %	0 %	75 %	25 %	557692629
288457	NC_022785	CGT	2	6	12320930	12320935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692629
288458	NC_022785	GCG	2	6	12320949	12320954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692629
288459	NC_022785	GGC	2	6	12320958	12320963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692629
288460	NC_022785	GATC	2	8	12321142	12321149	25 %	25 %	25 %	25 %	557692630
288461	NC_022785	GCT	2	6	12321184	12321189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692630
288462	NC_022785	CAC	2	6	12321217	12321222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557692630
288463	NC_022785	TTCGA	2	10	12321230	12321239	20 %	40 %	20 %	20 %	557692630
288464	NC_022785	CGCA	2	8	12321250	12321257	25 %	0 %	25 %	50 %	557692630
288465	NC_022785	GAC	2	6	12321266	12321271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692630
288466	NC_022785	CGA	2	6	12321286	12321291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692630
288467	NC_022785	TGG	2	6	12321339	12321344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557692630
288468	NC_022785	CTG	2	6	12321365	12321370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692630
288469	NC_022785	AGC	2	6	12321396	12321401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692630
288470	NC_022785	CCGG	2	8	12321454	12321461	0 %	0 %	50 %	50 %	557692630
288471	NC_022785	CCGG	2	8	12321463	12321470	0 %	0 %	50 %	50 %	557692630
288472	NC_022785	GGA	2	6	12321508	12321513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557692630
288473	NC_022785	GTC	2	6	12321587	12321592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692630
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288475	NC_022785	GGA	3	9	12321679	12321687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557692630
288476	NC_022785	GC	3	6	12321692	12321697	0 %	0 %	50 %	50 %	557692630
288477	NC_022785	GGT	2	6	12321744	12321749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557692630
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288480	NC_022785	GGC	2	6	12321833	12321838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692630
288481	NC_022785	CAGG	2	8	12321976	12321983	25 %	0 %	50 %	25 %	557692630
288482	NC_022785	GC	3	6	12321987	12321992	0 %	0 %	50 %	50 %	557692630
288483	NC_022785	CTG	2	6	12322024	12322029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692630
288484	NC_022785	GGGC	2	8	12322053	12322060	0 %	0 %	75 %	25 %	557692630
288485	NC_022785	AGC	2	6	12322085	12322090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557692630
288486	NC_022785	AC	5	10	12322119	12322128	50 %	0 %	0 %	50 %	557692630
288487	NC_022785	GGTGA	2	10	12322136	12322145	20 %	20 %	60 %	0 %	557692630
288488	NC_022785	CTGACC	2	12	12322184	12322195	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	557692630
288489	NC_022785	GAG	2	6	12322214	12322219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557692630
288490	NC_022785	CGC	2	6	12322309	12322314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557692630
288491	NC_022785	ACCGG	2	10	12322464	12322473	20 %	0 %	40 %	40 %	557692631
288492	NC_022785	TGAGC	2	10	12322499	12322508	20 %	20 %	40 %	20 %	557692631
288493	NC_022785	GCC	2	6	12322527	12322532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557692631
288494	NC_022785	TCG	2	6	12322534	12322539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692631
288495	NC_022785	GCG	2	6	12322551	12322556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557692631
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288500	NC_022785	TCG	2	6	12322702	12322707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557692631

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