MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022665	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587608
2	NC_022665	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	556587608
3	NC_022665	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	556587608
4	NC_022665	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	556587608
5	NC_022665	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587608
6	NC_022665	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
7	NC_022665	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587608
8	NC_022665	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587608
9	NC_022665	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587608
10	NC_022665	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587608
11	NC_022665	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587608
12	NC_022665	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	556587608
13	NC_022665	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	556587608
14	NC_022665	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587608
15	NC_022665	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	556587608
16	NC_022665	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587608
17	NC_022665	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587608
18	NC_022665	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
19	NC_022665	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	556587608
20	NC_022665	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587608
21	NC_022665	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	556587608
22	NC_022665	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	556587608
23	NC_022665	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587608
24	NC_022665	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	556587608
25	NC_022665	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	556587608
26	NC_022665	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	556587608
27	NC_022665	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	556587608
28	NC_022665	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	556587608
29	NC_022665	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587608
30	NC_022665	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587608
31	NC_022665	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	556587608
32	NC_022665	TAA	2	6	1546	1551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
33	NC_022665	AT	3	6	1554	1559	50 %	50 %	0 %	0 %	556587609
34	NC_022665	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	556587609
35	NC_022665	TTTA	2	8	1697	1704	25 %	75 %	0 %	0 %	556587609
36	NC_022665	TTA	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587609
37	NC_022665	AAG	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587609
38	NC_022665	ACAA	2	8	1957	1964	75 %	0 %	0 %	25 %	556587609
39	NC_022665	GTC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587609
40	NC_022665	TGA	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587609
41	NC_022665	TGT	2	6	2128	2133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587609
42	NC_022665	TC	3	6	2147	2152	0 %	50 %	0 %	50 %	556587609
43	NC_022665	GAT	2	6	2177	2182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587609
44	NC_022665	TCT	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
45	NC_022665	AAT	2	6	2210	2215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
46	NC_022665	TTA	2	6	2258	2263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587609
47	NC_022665	TACC	2	8	2269	2276	25 %	25 %	0 %	50 %	556587609
48	NC_022665	ACCG	2	8	2282	2289	25 %	0 %	25 %	50 %	556587609
49	NC_022665	AAC	2	6	2311	2316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587609
50	NC_022665	TCT	2	6	2365	2370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
51	NC_022665	TAA	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
52	NC_022665	TGT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587609
53	NC_022665	ACTT	2	8	2522	2529	25 %	50 %	0 %	25 %	556587609
54	NC_022665	TCT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587609
55	NC_022665	GTCC	2	8	2588	2595	0 %	25 %	25 %	50 %	556587609
56	NC_022665	AAT	2	6	2612	2617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587609
57	NC_022665	A	6	6	2884	2889	100 %	0 %	0 %	0 %	556587610
58	NC_022665	AGT	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587610
59	NC_022665	TTA	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
60	NC_022665	TA	3	6	3064	3069	50 %	50 %	0 %	0 %	556587610
61	NC_022665	AG	3	6	3089	3094	50 %	0 %	50 %	0 %	556587610
62	NC_022665	AT	3	6	3108	3113	50 %	50 %	0 %	0 %	556587610
63	NC_022665	A	7	7	3204	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	556587610
64	NC_022665	ATT	2	6	3266	3271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
65	NC_022665	TGA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587610
66	NC_022665	T	6	6	3336	3341	0 %	100 %	0 %	0 %	556587610
67	NC_022665	TGG	2	6	3368	3373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587610
68	NC_022665	GAAG	2	8	3410	3417	50 %	0 %	50 %	0 %	556587610
69	NC_022665	TTA	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
70	NC_022665	TCT	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556587610
71	NC_022665	ATT	3	9	3557	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587610
72	NC_022665	GA	3	6	3577	3582	50 %	0 %	50 %	0 %	556587610
73	NC_022665	GTAT	2	8	3625	3632	25 %	50 %	25 %	0 %	556587610
74	NC_022665	AGG	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587610
75	NC_022665	TCA	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587611
76	NC_022665	TAA	2	6	3722	3727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556587611
77	NC_022665	ATG	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587611
78	NC_022665	TGG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587612
79	NC_022665	AAC	2	6	4178	4183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587612
80	NC_022665	AATG	2	8	4191	4198	50 %	25 %	25 %	0 %	556587612
81	NC_022665	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587612
82	NC_022665	TGT	2	6	4248	4253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556587612
83	NC_022665	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587612
84	NC_022665	ATT	2	6	4304	4309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587612
85	NC_022665	CAG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
86	NC_022665	TCG	2	6	4421	4426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587613
87	NC_022665	TCA	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587613
88	NC_022665	AAAT	2	8	4662	4669	75 %	25 %	0 %	0 %	556587613
89	NC_022665	AG	3	6	4824	4829	50 %	0 %	50 %	0 %	556587613
90	NC_022665	CAA	2	6	4833	4838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556587613
91	NC_022665	A	6	6	4856	4861	100 %	0 %	0 %	0 %	556587613
92	NC_022665	A	6	6	4913	4918	100 %	0 %	0 %	0 %	556587613
93	NC_022665	AGA	2	6	4932	4937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
94	NC_022665	GAA	2	6	4972	4977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
95	NC_022665	A	6	6	4979	4984	100 %	0 %	0 %	0 %	556587613
96	NC_022665	TGA	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587613
97	NC_022665	GCA	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
98	NC_022665	GTG	3	9	5122	5130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587613
99	NC_022665	GAA	3	9	5146	5154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
100	NC_022665	CGA	2	6	5166	5171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
101	NC_022665	CTTG	2	8	5250	5257	0 %	50 %	25 %	25 %	556587613
102	NC_022665	CAG	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587613
103	NC_022665	AGG	2	6	5288	5293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556587613
104	NC_022665	CTC	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556587613
105	NC_022665	GAT	2	6	5398	5403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587613
106	NC_022665	AAG	2	6	5435	5440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
107	NC_022665	GAA	2	6	5455	5460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587613
108	NC_022665	CAT	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556587613
109	NC_022665	A	6	6	5670	5675	100 %	0 %	0 %	0 %	556587614
110	NC_022665	GATT	2	8	5682	5689	25 %	50 %	25 %	0 %	556587614
111	NC_022665	AAACA	2	10	5724	5733	80 %	0 %	0 %	20 %	556587614
112	NC_022665	TGC	2	6	5748	5753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556587614
113	NC_022665	A	6	6	5841	5846	100 %	0 %	0 %	0 %	556587614
114	NC_022665	ATGA	2	8	5873	5880	50 %	25 %	25 %	0 %	556587614
115	NC_022665	TTA	2	6	5911	5916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587614
116	NC_022665	TAG	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587614
117	NC_022665	GAC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556587614
118	NC_022665	TGG	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556587614
119	NC_022665	TGTCT	2	10	6115	6124	0 %	60 %	20 %	20 %	556587614
120	NC_022665	GAA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587614
121	NC_022665	GAT	2	6	6206	6211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587614
122	NC_022665	ATCA	2	8	6280	6287	50 %	25 %	0 %	25 %	556587615
123	NC_022665	AATC	2	8	6304	6311	50 %	25 %	0 %	25 %	556587615
124	NC_022665	TTA	3	9	6322	6330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
125	NC_022665	ATG	2	6	6419	6424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
126	NC_022665	ATT	2	6	6454	6459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556587615
127	NC_022665	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	556587615
128	NC_022665	GAT	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
129	NC_022665	GTTT	2	8	6510	6517	0 %	75 %	25 %	0 %	556587615
130	NC_022665	TCAA	2	8	6537	6544	50 %	25 %	0 %	25 %	556587615
131	NC_022665	A	6	6	6727	6732	100 %	0 %	0 %	0 %	556587615
132	NC_022665	T	6	6	6826	6831	0 %	100 %	0 %	0 %	556587615
133	NC_022665	GAGAT	2	10	6833	6842	40 %	20 %	40 %	0 %	556587615
134	NC_022665	TC	3	6	6908	6913	0 %	50 %	0 %	50 %	556587615
135	NC_022665	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556587615
136	NC_022665	TAG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556587615
137	NC_022665	CTTA	2	8	7010	7017	25 %	50 %	0 %	25 %	556587615
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