MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_022665	TTC	2	6	2023250	2023255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589602
35003	NC_022665	CTT	2	6	2023297	2023302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589602
35004	NC_022665	CAA	2	6	2023303	2023308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589602
35005	NC_022665	GTA	2	6	2023317	2023322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589602
35006	NC_022665	CAC	2	6	2023351	2023356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589602
35007	NC_022665	AAC	2	6	2023391	2023396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589602
35008	NC_022665	ATC	2	6	2023403	2023408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589602
35009	NC_022665	CCA	2	6	2023434	2023439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589602
35010	NC_022665	TCA	2	6	2023452	2023457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589602
35011	NC_022665	T	6	6	2023460	2023465	0 %	100 %	0 %	0 %	556589602
35012	NC_022665	GATTT	2	10	2023466	2023475	20 %	60 %	20 %	0 %	556589602
35013	NC_022665	CTT	2	6	2023480	2023485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589602
35014	NC_022665	GTT	2	6	2023489	2023494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589602
35015	NC_022665	TGT	2	6	2023497	2023502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589602
35016	NC_022665	ATT	2	6	2023679	2023684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589603
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35018	NC_022665	TTC	2	6	2023857	2023862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589603
35019	NC_022665	AC	3	6	2024012	2024017	50 %	0 %	0 %	50 %	556589603
35020	NC_022665	CAC	2	6	2024034	2024039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589603
35021	NC_022665	AACC	2	8	2024047	2024054	50 %	0 %	0 %	50 %	556589603
35022	NC_022665	TACA	2	8	2024177	2024184	50 %	25 %	0 %	25 %	556589603
35023	NC_022665	CAA	2	6	2024186	2024191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589603
35024	NC_022665	CTTG	2	8	2024202	2024209	0 %	50 %	25 %	25 %	556589603
35025	NC_022665	CAC	2	6	2024234	2024239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589603
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35029	NC_022665	CAAA	2	8	2024459	2024466	75 %	0 %	0 %	25 %	556589603
35030	NC_022665	TTG	2	6	2024584	2024589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589603
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35032	NC_022665	TGT	2	6	2024694	2024699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589603
35033	NC_022665	GAA	2	6	2024790	2024795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589603
35034	NC_022665	GT	3	6	2024848	2024853	0 %	50 %	50 %	0 %	556589603
35035	NC_022665	CAC	2	6	2024864	2024869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589603
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35039	NC_022665	ACT	2	6	2024959	2024964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589603
35040	NC_022665	TTC	2	6	2025368	2025373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589604
35041	NC_022665	CAGA	2	8	2025484	2025491	50 %	0 %	25 %	25 %	556589604
35042	NC_022665	TCG	2	6	2025549	2025554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589604
35043	NC_022665	AGA	3	9	2025642	2025650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589604
35044	NC_022665	CAA	2	6	2025781	2025786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589604
35045	NC_022665	ACCT	2	8	2025883	2025890	25 %	25 %	0 %	50 %	556589604
35046	NC_022665	TAGCC	2	10	2025903	2025912	20 %	20 %	20 %	40 %	556589604
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35049	NC_022665	TCCG	2	8	2026090	2026097	0 %	25 %	25 %	50 %	556589604
35050	NC_022665	TATCT	2	10	2026230	2026239	20 %	60 %	0 %	20 %	556589604
35051	NC_022665	CTT	2	6	2026240	2026245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589604
35052	NC_022665	CA	3	6	2026327	2026332	50 %	0 %	0 %	50 %	556589604
35053	NC_022665	CGATGC	2	12	2026344	2026355	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556589604
35054	NC_022665	ACT	2	6	2026409	2026414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589604
35055	NC_022665	GCA	2	6	2026441	2026446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589604
35056	NC_022665	AGCAG	2	10	2026482	2026491	40 %	0 %	40 %	20 %	556589604
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35058	NC_022665	GAC	2	6	2026532	2026537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589604
35059	NC_022665	GAT	2	6	2026608	2026613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589604
35060	NC_022665	GAA	2	6	2026660	2026665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589604
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35062	NC_022665	AAG	2	6	2026780	2026785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589604
35063	NC_022665	AGCC	3	12	2026937	2026948	25 %	0 %	25 %	50 %	556589604
35064	NC_022665	GGA	2	6	2027007	2027012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556589604
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35067	NC_022665	A	7	7	2027135	2027141	100 %	0 %	0 %	0 %	556589604
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35069	NC_022665	CAG	2	6	2027224	2027229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589604
35070	NC_022665	AC	3	6	2027234	2027239	50 %	0 %	0 %	50 %	556589604
35071	NC_022665	GTG	2	6	2027303	2027308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589604
35072	NC_022665	GACC	2	8	2027322	2027329	25 %	0 %	25 %	50 %	556589604
35073	NC_022665	GCC	2	6	2027356	2027361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556589604
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35083	NC_022665	TATCTA	2	12	2029072	2029083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	556589605
35084	NC_022665	AAAC	2	8	2029224	2029231	75 %	0 %	0 %	25 %	556589605
35085	NC_022665	A	6	6	2029276	2029281	100 %	0 %	0 %	0 %	556589605
35086	NC_022665	CTG	2	6	2029395	2029400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589605
35087	NC_022665	CAA	2	6	2029417	2029422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
35088	NC_022665	CT	3	6	2029493	2029498	0 %	50 %	0 %	50 %	556589605
35089	NC_022665	CAA	2	6	2029521	2029526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
35090	NC_022665	GTCG	2	8	2029562	2029569	0 %	25 %	50 %	25 %	556589605
35091	NC_022665	AATC	2	8	2029604	2029611	50 %	25 %	0 %	25 %	556589605
35092	NC_022665	GTA	2	6	2029631	2029636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589605
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35095	NC_022665	CAG	2	6	2029923	2029928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589605
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35097	NC_022665	ACG	2	6	2029941	2029946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589605
35098	NC_022665	TGG	2	6	2030007	2030012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589605
35099	NC_022665	GAT	2	6	2030021	2030026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589605
35100	NC_022665	A	6	6	2030047	2030052	100 %	0 %	0 %	0 %	556589605
35101	NC_022665	AAT	2	6	2030096	2030101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589605
35102	NC_022665	AAT	2	6	2030132	2030137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589605
35103	NC_022665	ACT	2	6	2030193	2030198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589605
35104	NC_022665	GAT	2	6	2030258	2030263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589605
35105	NC_022665	ACA	2	6	2030306	2030311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
35106	NC_022665	ATG	2	6	2030325	2030330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589605
35107	NC_022665	CTT	2	6	2030346	2030351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589605
35108	NC_022665	CTG	2	6	2030370	2030375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589605
35109	NC_022665	GATT	2	8	2030457	2030464	25 %	50 %	25 %	0 %	556589605
35110	NC_022665	ACA	2	6	2030475	2030480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
35111	NC_022665	AGC	2	6	2030548	2030553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589605
35112	NC_022665	CGG	2	6	2030554	2030559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556589605
35113	NC_022665	ACCTAT	2	12	2030564	2030575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589605
35114	NC_022665	ACA	2	6	2030595	2030600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
35115	NC_022665	GGA	2	6	2030606	2030611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556589605
35116	NC_022665	AGGA	2	8	2030613	2030620	50 %	0 %	50 %	0 %	556589605
35117	NC_022665	CAAC	2	8	2030751	2030758	50 %	0 %	0 %	50 %	556589605
35118	NC_022665	GAA	2	6	2030903	2030908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589605
35119	NC_022665	AGG	2	6	2031043	2031048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556589605
35120	NC_022665	GTC	2	6	2031066	2031071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589605
35121	NC_022665	AACT	2	8	2031142	2031149	50 %	25 %	0 %	25 %	556589605
35122	NC_022665	GAA	2	6	2031200	2031205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589605
35123	NC_022665	CAGA	2	8	2031296	2031303	50 %	0 %	25 %	25 %	556589605
35124	NC_022665	CAA	2	6	2031319	2031324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
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35126	NC_022665	CAA	2	6	2031346	2031351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
35127	NC_022665	CAA	2	6	2031360	2031365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589605
35128	NC_022665	TGA	2	6	2031400	2031405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589605
35129	NC_022665	ACAA	2	8	2031430	2031437	75 %	0 %	0 %	25 %	556589605
35130	NC_022665	GAA	2	6	2031491	2031496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589605
35131	NC_022665	GCCT	2	8	2031539	2031546	0 %	25 %	25 %	50 %	556589605
35132	NC_022665	A	6	6	2031551	2031556	100 %	0 %	0 %	0 %	556589605
35133	NC_022665	ATT	2	6	2031660	2031665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589606
35134	NC_022665	CGT	2	6	2031757	2031762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589606
35135	NC_022665	ATC	2	6	2031873	2031878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589606
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35137	NC_022665	TCA	2	6	2032000	2032005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589606
35138	NC_022665	ACAG	2	8	2032089	2032096	50 %	0 %	25 %	25 %	556589606
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35141	NC_022665	CAAGGT	2	12	2032148	2032159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556589606
35142	NC_022665	TGG	2	6	2032163	2032168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589606
35143	NC_022665	CTT	2	6	2032169	2032174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589606
35144	NC_022665	TGCC	2	8	2032240	2032247	0 %	25 %	25 %	50 %	556589606
35145	NC_022665	CGA	3	9	2032307	2032315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589606
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35147	NC_022665	AGA	3	9	2032424	2032432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589606
35148	NC_022665	GGA	2	6	2032496	2032501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556589606
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35151	NC_022665	CGA	2	6	2032710	2032715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589607
35152	NC_022665	TGG	2	6	2032746	2032751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589607
35153	NC_022665	CAA	2	6	2032839	2032844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589607
35154	NC_022665	CAT	2	6	2032902	2032907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589607
35155	NC_022665	GT	3	6	2033015	2033020	0 %	50 %	50 %	0 %	556589607
35156	NC_022665	ACGG	2	8	2033036	2033043	25 %	0 %	50 %	25 %	556589607
35157	NC_022665	AGA	2	6	2033151	2033156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589607
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35164	NC_022665	GTT	2	6	2033680	2033685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589608
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35217	NC_022665	CGT	2	6	2036676	2036681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589610
35218	NC_022665	CAT	2	6	2036693	2036698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589610
35219	NC_022665	TCA	2	6	2036736	2036741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589610
35220	NC_022665	TCA	2	6	2036779	2036784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589610
35221	NC_022665	TCA	2	6	2036790	2036795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589610
35222	NC_022665	ACC	4	12	2036915	2036926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589610
35223	NC_022665	CAA	2	6	2036938	2036943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589610
35224	NC_022665	GGCT	2	8	2036953	2036960	0 %	25 %	50 %	25 %	556589610
35225	NC_022665	CAC	2	6	2036999	2037004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589610
35226	NC_022665	AG	3	6	2037061	2037066	50 %	0 %	50 %	0 %	556589610
35227	NC_022665	CTC	2	6	2037077	2037082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589610
35228	NC_022665	T	7	7	2037291	2037297	0 %	100 %	0 %	0 %	556589611
35229	NC_022665	AAGC	2	8	2037335	2037342	50 %	0 %	25 %	25 %	556589611
35230	NC_022665	GCT	2	6	2037352	2037357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589611
35231	NC_022665	GCT	3	9	2037436	2037444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589611
35232	NC_022665	CTT	2	6	2037462	2037467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589611
35233	NC_022665	GCG	2	6	2037566	2037571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556589611
35234	NC_022665	AGC	2	6	2037589	2037594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589611
35235	NC_022665	AGA	2	6	2037600	2037605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589611
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35238	NC_022665	AGA	2	6	2040421	2040426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589612
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35245	NC_022665	GTT	2	6	2040588	2040593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589612
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35264	NC_022665	AAC	2	6	2041040	2041045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589612
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35270	NC_022665	TCT	2	6	2041318	2041323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589612
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35317	NC_022665	T	7	7	2043659	2043665	0 %	100 %	0 %	0 %	556589613
35318	NC_022665	GCT	2	6	2043714	2043719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589613
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35322	NC_022665	GAT	2	6	2044097	2044102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589614
35323	NC_022665	GAT	2	6	2044163	2044168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589614
35324	NC_022665	ATC	2	6	2044178	2044183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589614
35325	NC_022665	T	6	6	2044229	2044234	0 %	100 %	0 %	0 %	556589614
35326	NC_022665	CTT	2	6	2044237	2044242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589614
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35328	NC_022665	CAA	2	6	2044270	2044275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589614
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35332	NC_022665	TCT	2	6	2044395	2044400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589614
35333	NC_022665	TTTC	2	8	2044414	2044421	0 %	75 %	0 %	25 %	556589614
35334	NC_022665	CAAC	2	8	2044472	2044479	50 %	0 %	0 %	50 %	556589614
35335	NC_022665	GGT	2	6	2044480	2044485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589614
35336	NC_022665	TGA	2	6	2044486	2044491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589614
35337	NC_022665	CAG	2	6	2044531	2044536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589614
35338	NC_022665	T	6	6	2044541	2044546	0 %	100 %	0 %	0 %	556589614
35339	NC_022665	CGT	2	6	2044570	2044575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589614
35340	NC_022665	TGC	2	6	2044577	2044582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589614
35341	NC_022665	TTG	2	6	2044628	2044633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589614
35342	NC_022665	CGA	2	6	2044698	2044703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589614
35343	NC_022665	AAG	2	6	2044733	2044738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589614
35344	NC_022665	AATC	2	8	2045115	2045122	50 %	25 %	0 %	25 %	556589615
35345	NC_022665	TCA	2	6	2045138	2045143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589615
35346	NC_022665	CAT	2	6	2045160	2045165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589615
35347	NC_022665	T	6	6	2045167	2045172	0 %	100 %	0 %	0 %	556589615
35348	NC_022665	A	6	6	2045182	2045187	100 %	0 %	0 %	0 %	556589615
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35465	NC_022665	TCT	2	6	2051685	2051690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589617
35466	NC_022665	TTC	2	6	2051825	2051830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589617
35467	NC_022665	AAAC	2	8	2051977	2051984	75 %	0 %	0 %	25 %	556589617
35468	NC_022665	ACC	2	6	2052178	2052183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589618
35469	NC_022665	ATTT	2	8	2052353	2052360	25 %	75 %	0 %	0 %	556589619
35470	NC_022665	AGGCT	2	10	2052431	2052440	20 %	20 %	40 %	20 %	556589619
35471	NC_022665	T	7	7	2052444	2052450	0 %	100 %	0 %	0 %	556589619
35472	NC_022665	GTTTG	2	10	2052581	2052590	0 %	60 %	40 %	0 %	556589620
35473	NC_022665	TCAA	2	8	2052592	2052599	50 %	25 %	0 %	25 %	556589620
35474	NC_022665	CTAT	2	8	2052799	2052806	25 %	50 %	0 %	25 %	556589620
35475	NC_022665	TCTG	2	8	2052820	2052827	0 %	50 %	25 %	25 %	556589620
35476	NC_022665	ACTG	2	8	2052842	2052849	25 %	25 %	25 %	25 %	556589620
35477	NC_022665	GT	3	6	2052863	2052868	0 %	50 %	50 %	0 %	556589620
35478	NC_022665	GTT	2	6	2052919	2052924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589620
35479	NC_022665	CTG	2	6	2052959	2052964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589620
35480	NC_022665	CAT	2	6	2052996	2053001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589620
35481	NC_022665	TGA	2	6	2053097	2053102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589620
35482	NC_022665	TCA	2	6	2053115	2053120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589620
35483	NC_022665	TA	3	6	2053281	2053286	50 %	50 %	0 %	0 %	556589620
35484	NC_022665	AG	4	8	2053305	2053312	50 %	0 %	50 %	0 %	556589620
35485	NC_022665	AAT	2	6	2053349	2053354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589620
35486	NC_022665	CGC	2	6	2053425	2053430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556589620
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35488	NC_022665	CAA	2	6	2053448	2053453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589620
35489	NC_022665	TTG	2	6	2053463	2053468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589620
35490	NC_022665	GCTTG	2	10	2053481	2053490	0 %	40 %	40 %	20 %	556589620
35491	NC_022665	ACCA	2	8	2053542	2053549	50 %	0 %	0 %	50 %	556589620
35492	NC_022665	CCA	2	6	2053561	2053566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589620
35493	NC_022665	TCA	2	6	2053639	2053644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589620
35494	NC_022665	TTA	2	6	2053708	2053713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589620
35495	NC_022665	GGAT	2	8	2053776	2053783	25 %	25 %	50 %	0 %	556589620
35496	NC_022665	AAT	2	6	2053787	2053792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589620
35497	NC_022665	CGA	2	6	2053912	2053917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589620
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35499	NC_022665	TTG	2	6	2054080	2054085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589620
35500	NC_022665	CTTG	2	8	2054105	2054112	0 %	50 %	25 %	25 %	556589620

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