MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_022665	ATC	2	6	1820284	1820289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589409
31502	NC_022665	CAA	3	9	1820333	1820341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589409
31503	NC_022665	TCGT	2	8	1820384	1820391	0 %	50 %	25 %	25 %	556589409
31504	NC_022665	TGC	2	6	1820427	1820432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589409
31505	NC_022665	GCT	2	6	1820449	1820454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589409
31506	NC_022665	CTT	3	9	1820518	1820526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589409
31507	NC_022665	GGT	2	6	1820584	1820589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589409
31508	NC_022665	TGG	3	9	1820598	1820606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589409
31509	NC_022665	GTT	2	6	1820611	1820616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589409
31510	NC_022665	ATG	2	6	1820644	1820649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589409
31511	NC_022665	TTC	2	6	1820671	1820676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589409
31512	NC_022665	TGC	2	6	1820694	1820699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589409
31513	NC_022665	GGT	2	6	1820794	1820799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589409
31514	NC_022665	ACT	2	6	1820837	1820842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589409
31515	NC_022665	TCA	2	6	1820857	1820862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589410
31516	NC_022665	A	6	6	1820869	1820874	100 %	0 %	0 %	0 %	556589410
31517	NC_022665	A	6	6	1820898	1820903	100 %	0 %	0 %	0 %	556589410
31518	NC_022665	TGG	2	6	1820907	1820912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589410
31519	NC_022665	CCTT	2	8	1820920	1820927	0 %	50 %	0 %	50 %	556589410
31520	NC_022665	A	6	6	1820994	1820999	100 %	0 %	0 %	0 %	556589410
31521	NC_022665	A	6	6	1821009	1821014	100 %	0 %	0 %	0 %	556589410
31522	NC_022665	GCT	3	9	1821024	1821032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589410
31523	NC_022665	TTC	2	6	1821051	1821056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589410
31524	NC_022665	AC	4	8	1821058	1821065	50 %	0 %	0 %	50 %	556589410
31525	NC_022665	GAA	2	6	1821108	1821113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589410
31526	NC_022665	ATG	2	6	1821171	1821176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589410
31527	NC_022665	TCT	2	6	1821205	1821210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589410
31528	NC_022665	ATC	2	6	1821282	1821287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589410
31529	NC_022665	TTC	2	6	1821288	1821293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589410
31530	NC_022665	TGG	2	6	1821383	1821388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589410
31531	NC_022665	TGCA	2	8	1821678	1821685	25 %	25 %	25 %	25 %	556589410
31532	NC_022665	AAG	2	6	1821693	1821698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589410
31533	NC_022665	TTC	2	6	1821756	1821761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589410
31534	NC_022665	TGG	2	6	1821895	1821900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589411
31535	NC_022665	A	6	6	1822196	1822201	100 %	0 %	0 %	0 %	556589411
31536	NC_022665	TGGA	2	8	1822351	1822358	25 %	25 %	50 %	0 %	556589412
31537	NC_022665	TC	3	6	1822383	1822388	0 %	50 %	0 %	50 %	556589412
31538	NC_022665	T	6	6	1822397	1822402	0 %	100 %	0 %	0 %	556589412
31539	NC_022665	GTG	2	6	1822482	1822487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589413
31540	NC_022665	AGA	2	6	1822555	1822560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589413
31541	NC_022665	CAG	2	6	1822587	1822592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589413
31542	NC_022665	CAA	2	6	1822612	1822617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589413
31543	NC_022665	TGA	2	6	1822627	1822632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589413
31544	NC_022665	TGC	2	6	1822639	1822644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589413
31545	NC_022665	A	6	6	1822669	1822674	100 %	0 %	0 %	0 %	556589413
31546	NC_022665	TGA	2	6	1822699	1822704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589413
31547	NC_022665	TTC	2	6	1822728	1822733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589413
31548	NC_022665	CGC	2	6	1822740	1822745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556589413
31549	NC_022665	GAA	3	9	1822772	1822780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589413
31550	NC_022665	ATC	2	6	1822997	1823002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589413
31551	NC_022665	ACT	2	6	1823130	1823135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589413
31552	NC_022665	GAA	2	6	1823153	1823158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589413
31553	NC_022665	CTG	2	6	1823217	1823222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589413
31554	NC_022665	ATG	2	6	1823304	1823309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589413
31555	NC_022665	A	6	6	1823316	1823321	100 %	0 %	0 %	0 %	556589413
31556	NC_022665	GCT	2	6	1823408	1823413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589413
31557	NC_022665	TCG	2	6	1823500	1823505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589413
31558	NC_022665	TGC	2	6	1823527	1823532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589413
31559	NC_022665	TGGG	2	8	1823667	1823674	0 %	25 %	75 %	0 %	556589413
31560	NC_022665	TTG	2	6	1823773	1823778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589414
31561	NC_022665	ATCTT	2	10	1823783	1823792	20 %	60 %	0 %	20 %	556589414
31562	NC_022665	TGC	2	6	1823828	1823833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589414
31563	NC_022665	TCTTCC	2	12	1823855	1823866	0 %	50 %	0 %	50 %	556589414
31564	NC_022665	TCT	2	6	1823921	1823926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589414
31565	NC_022665	T	6	6	1823985	1823990	0 %	100 %	0 %	0 %	556589414
31566	NC_022665	ATC	2	6	1823998	1824003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589414
31567	NC_022665	TTC	2	6	1824020	1824025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589414
31568	NC_022665	AGA	2	6	1824057	1824062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589414
31569	NC_022665	T	8	8	1824080	1824087	0 %	100 %	0 %	0 %	556589414
31570	NC_022665	AAT	2	6	1824172	1824177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589414
31571	NC_022665	CTG	2	6	1824198	1824203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589414
31572	NC_022665	TAT	2	6	1824252	1824257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589414
31573	NC_022665	GAT	2	6	1824261	1824266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589414
31574	NC_022665	GGGT	2	8	1824382	1824389	0 %	25 %	75 %	0 %	556589414
31575	NC_022665	CGA	2	6	1824393	1824398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589414
31576	NC_022665	ATT	2	6	1824475	1824480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589414
31577	NC_022665	CAT	2	6	1824511	1824516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589414
31578	NC_022665	AGT	2	6	1824541	1824546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589414
31579	NC_022665	TAG	2	6	1824610	1824615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589414
31580	NC_022665	T	6	6	1824739	1824744	0 %	100 %	0 %	0 %	556589414
31581	NC_022665	TCCTT	2	10	1824800	1824809	0 %	60 %	0 %	40 %	556589414
31582	NC_022665	ATCA	2	8	1824832	1824839	50 %	25 %	0 %	25 %	556589414
31583	NC_022665	CCA	2	6	1825185	1825190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589414
31584	NC_022665	AGAT	2	8	1825210	1825217	50 %	25 %	25 %	0 %	556589414
31585	NC_022665	TGA	2	6	1825390	1825395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589415
31586	NC_022665	TAA	2	6	1825400	1825405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589415
31587	NC_022665	AAG	2	6	1825423	1825428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589415
31588	NC_022665	ACT	2	6	1825465	1825470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589415
31589	NC_022665	AATT	2	8	1825556	1825563	50 %	50 %	0 %	0 %	556589415
31590	NC_022665	TAG	2	6	1825576	1825581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589415
31591	NC_022665	ACA	2	6	1825630	1825635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589415
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31593	NC_022665	AAT	2	6	1825758	1825763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589415
31594	NC_022665	TACA	2	8	1825781	1825788	50 %	25 %	0 %	25 %	556589415
31595	NC_022665	CAT	2	6	1825799	1825804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589415
31596	NC_022665	AATG	2	8	1825826	1825833	50 %	25 %	25 %	0 %	556589415
31597	NC_022665	GAT	2	6	1825855	1825860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589415
31598	NC_022665	GTTT	2	8	1825881	1825888	0 %	75 %	25 %	0 %	556589415
31599	NC_022665	ACCA	2	8	1826102	1826109	50 %	0 %	0 %	50 %	556589416
31600	NC_022665	GTC	2	6	1826111	1826116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589416
31601	NC_022665	CTT	2	6	1826218	1826223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589416
31602	NC_022665	ATC	2	6	1826249	1826254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589416
31603	NC_022665	CCA	2	6	1826284	1826289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589416
31604	NC_022665	CTT	2	6	1826354	1826359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589416
31605	NC_022665	CTT	2	6	1826380	1826385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589416
31606	NC_022665	TCT	2	6	1826392	1826397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589416
31607	NC_022665	TCT	2	6	1826563	1826568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589416
31608	NC_022665	GTC	2	6	1826724	1826729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589416
31609	NC_022665	TTC	2	6	1826738	1826743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589416
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31611	NC_022665	CT	3	6	1826936	1826941	0 %	50 %	0 %	50 %	556589416
31612	NC_022665	GTTT	2	8	1826955	1826962	0 %	75 %	25 %	0 %	556589416
31613	NC_022665	CCA	2	6	1826995	1827000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589416
31614	NC_022665	T	7	7	1827006	1827012	0 %	100 %	0 %	0 %	556589416
31615	NC_022665	T	7	7	1827021	1827027	0 %	100 %	0 %	0 %	556589416
31616	NC_022665	GCA	2	6	1827048	1827053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589416
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31732	NC_022665	GAT	2	6	1833350	1833355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589421
31733	NC_022665	CTC	2	6	1833428	1833433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589421
31734	NC_022665	TTC	2	6	1833582	1833587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589421
31735	NC_022665	CCAC	2	8	1833639	1833646	25 %	0 %	0 %	75 %	556589421
31736	NC_022665	TCA	2	6	1833657	1833662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589421
31737	NC_022665	TCA	2	6	1833696	1833701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589421
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31739	NC_022665	GTC	2	6	1833726	1833731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589421
31740	NC_022665	CAA	2	6	1833855	1833860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589422
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31742	NC_022665	CGT	2	6	1833935	1833940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589422
31743	NC_022665	ACCA	2	8	1833949	1833956	50 %	0 %	0 %	50 %	556589422
31744	NC_022665	ATA	2	6	1833977	1833982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589422
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31750	NC_022665	GCT	2	6	1834337	1834342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589422
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31754	NC_022665	T	6	6	1834627	1834632	0 %	100 %	0 %	0 %	556589422
31755	NC_022665	T	6	6	1834666	1834671	0 %	100 %	0 %	0 %	556589423
31756	NC_022665	TTC	2	6	1834674	1834679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589423
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31758	NC_022665	CCA	2	6	1834733	1834738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589423
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31762	NC_022665	GTA	2	6	1834884	1834889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589423
31763	NC_022665	TCT	2	6	1835053	1835058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589423
31764	NC_022665	GT	3	6	1835159	1835164	0 %	50 %	50 %	0 %	556589423
31765	NC_022665	ACTG	2	8	1835239	1835246	25 %	25 %	25 %	25 %	556589423
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31768	NC_022665	GTT	2	6	1835331	1835336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589423
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31845	NC_022665	TACC	2	8	1840628	1840635	25 %	25 %	0 %	50 %	556589429
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31849	NC_022665	CAA	2	6	1840904	1840909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589429
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31861	NC_022665	ATT	2	6	1841548	1841553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589430
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31954	NC_022665	TTA	2	6	1847498	1847503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589438
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31959	NC_022665	TAT	2	6	1847835	1847840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589438
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31962	NC_022665	CT	3	6	1847902	1847907	0 %	50 %	0 %	50 %	556589438
31963	NC_022665	GAA	2	6	1847980	1847985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589438
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31965	NC_022665	T	7	7	1848018	1848024	0 %	100 %	0 %	0 %	556589438
31966	NC_022665	ACC	2	6	1849197	1849202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589439
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31969	NC_022665	TTG	2	6	1849645	1849650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589439
31970	NC_022665	TTC	2	6	1849799	1849804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589439
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31974	NC_022665	GCT	2	6	1850082	1850087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589439
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31981	NC_022665	ATA	2	6	1850842	1850847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589441
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31985	NC_022665	TGAT	2	8	1850985	1850992	25 %	50 %	25 %	0 %	556589441
31986	NC_022665	GATTG	2	10	1851000	1851009	20 %	40 %	40 %	0 %	556589441
31987	NC_022665	GACT	2	8	1851029	1851036	25 %	25 %	25 %	25 %	556589441
31988	NC_022665	TTC	2	6	1851129	1851134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589441
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31990	NC_022665	ATC	2	6	1851243	1851248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589441
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31997	NC_022665	TCA	2	6	1851608	1851613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589441
31998	NC_022665	GA	3	6	1851624	1851629	50 %	0 %	50 %	0 %	556589441
31999	NC_022665	TAGA	2	8	1851630	1851637	50 %	25 %	25 %	0 %	556589441
32000	NC_022665	GAC	2	6	1851662	1851667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589441

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