MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_022665	AAT	2	6	1555879	1555884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589116
27003	NC_022665	TAA	2	6	1556021	1556026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589117
27004	NC_022665	CAAAT	2	10	1556030	1556039	60 %	20 %	0 %	20 %	556589117
27005	NC_022665	AAT	2	6	1556041	1556046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589117
27006	NC_022665	GAC	2	6	1556099	1556104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589117
27007	NC_022665	T	6	6	1556105	1556110	0 %	100 %	0 %	0 %	556589117
27008	NC_022665	TACTT	2	10	1556151	1556160	20 %	60 %	0 %	20 %	556589117
27009	NC_022665	ATA	2	6	1556184	1556189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589117
27010	NC_022665	CTA	2	6	1556203	1556208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589117
27011	NC_022665	CTG	2	6	1556210	1556215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589117
27012	NC_022665	TAG	2	6	1556234	1556239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589117
27013	NC_022665	ATG	2	6	1556277	1556282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589117
27014	NC_022665	TCC	2	6	1556301	1556306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589117
27015	NC_022665	GAA	2	6	1556461	1556466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589117
27016	NC_022665	CAAAAT	2	12	1556491	1556502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556589117
27017	NC_022665	CTC	2	6	1556533	1556538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589117
27018	NC_022665	GAG	2	6	1556636	1556641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556589117
27019	NC_022665	GAC	2	6	1556650	1556655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589117
27020	NC_022665	GTT	2	6	1556697	1556702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589117
27021	NC_022665	TCA	2	6	1556742	1556747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589117
27022	NC_022665	T	6	6	1556762	1556767	0 %	100 %	0 %	0 %	556589117
27023	NC_022665	AAT	2	6	1556788	1556793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589117
27024	NC_022665	ACT	2	6	1556802	1556807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589117
27025	NC_022665	AAG	2	6	1556820	1556825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589117
27026	NC_022665	TGA	2	6	1556853	1556858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589117
27027	NC_022665	AAGT	2	8	1556927	1556934	50 %	25 %	25 %	0 %	556589117
27028	NC_022665	T	7	7	1556999	1557005	0 %	100 %	0 %	0 %	556589117
27029	NC_022665	GCTA	2	8	1557183	1557190	25 %	25 %	25 %	25 %	556589118
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27031	NC_022665	CCA	2	6	1557211	1557216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589118
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27033	NC_022665	TCT	2	6	1557263	1557268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589118
27034	NC_022665	TA	3	6	1557354	1557359	50 %	50 %	0 %	0 %	556589118
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27038	NC_022665	GTA	2	6	1557512	1557517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589118
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27040	NC_022665	AAAT	2	8	1557747	1557754	75 %	25 %	0 %	0 %	556589118
27041	NC_022665	AAT	2	6	1557917	1557922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589119
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27050	NC_022665	T	6	6	1559245	1559250	0 %	100 %	0 %	0 %	556589120
27051	NC_022665	CTT	2	6	1559253	1559258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589120
27052	NC_022665	GAG	2	6	1559266	1559271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556589120
27053	NC_022665	TTCCTG	2	12	1559277	1559288	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556589120
27054	NC_022665	TTG	2	6	1559345	1559350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589120
27055	NC_022665	TCAA	2	8	1559360	1559367	50 %	25 %	0 %	25 %	556589120
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27076	NC_022665	GTCAC	2	10	1560634	1560643	20 %	20 %	20 %	40 %	556589121
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27085	NC_022665	CTG	2	6	1561210	1561215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589122
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27093	NC_022665	CCAA	2	8	1561612	1561619	50 %	0 %	0 %	50 %	556589122
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27096	NC_022665	ATCGC	2	10	1561730	1561739	20 %	20 %	20 %	40 %	556589123
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27100	NC_022665	AAT	2	6	1561816	1561821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589123
27101	NC_022665	GTA	2	6	1561897	1561902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589123
27102	NC_022665	GCA	2	6	1561922	1561927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589123
27103	NC_022665	AGCTG	2	10	1561991	1562000	20 %	20 %	40 %	20 %	556589123
27104	NC_022665	CGCA	2	8	1562020	1562027	25 %	0 %	25 %	50 %	556589123
27105	NC_022665	AATT	2	8	1562056	1562063	50 %	50 %	0 %	0 %	556589123
27106	NC_022665	AAT	2	6	1562098	1562103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589123
27107	NC_022665	CTG	2	6	1562181	1562186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589123
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27109	NC_022665	GCT	2	6	1562246	1562251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589123
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27111	NC_022665	CCA	2	6	1562357	1562362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589123
27112	NC_022665	ATT	2	6	1562380	1562385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589123
27113	NC_022665	CAT	2	6	1562413	1562418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589123
27114	NC_022665	GTT	2	6	1562526	1562531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589123
27115	NC_022665	GAT	2	6	1562764	1562769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589124
27116	NC_022665	TCT	2	6	1562770	1562775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589124
27117	NC_022665	AAC	2	6	1562790	1562795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589124
27118	NC_022665	CTG	3	9	1562888	1562896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589124
27119	NC_022665	TGC	2	6	1562913	1562918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589124
27120	NC_022665	CTG	2	6	1562921	1562926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589124
27121	NC_022665	CAT	2	6	1562996	1563001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589124
27122	NC_022665	TGCTTT	2	12	1563006	1563017	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	556589124
27123	NC_022665	GTA	2	6	1563048	1563053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589124
27124	NC_022665	TGC	2	6	1563063	1563068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589124
27125	NC_022665	TGCT	2	8	1563150	1563157	0 %	50 %	25 %	25 %	556589124
27126	NC_022665	GTA	2	6	1563180	1563185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589124
27127	NC_022665	ATG	2	6	1563193	1563198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589124
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27136	NC_022665	CTG	2	6	1563626	1563631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589124
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27141	NC_022665	AGA	2	6	1563801	1563806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589124
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27145	NC_022665	T	7	7	1564124	1564130	0 %	100 %	0 %	0 %	556589125
27146	NC_022665	CTA	2	6	1564168	1564173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589125
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27149	NC_022665	T	6	6	1564573	1564578	0 %	100 %	0 %	0 %	556589126
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27160	NC_022665	GCT	2	6	1565234	1565239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589127
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27189	NC_022665	CTG	2	6	1566656	1566661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589128
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27218	NC_022665	GGCAA	2	10	1568226	1568235	40 %	0 %	40 %	20 %	556589129
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27220	NC_022665	CTG	2	6	1568270	1568275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589129
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27222	NC_022665	AAT	2	6	1568429	1568434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589129
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27225	NC_022665	TCA	2	6	1568523	1568528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589129
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27227	NC_022665	AAATC	2	10	1568605	1568614	60 %	20 %	0 %	20 %	556589129
27228	NC_022665	TCT	2	6	1568619	1568624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589129
27229	NC_022665	TCTT	2	8	1568691	1568698	0 %	75 %	0 %	25 %	556589129
27230	NC_022665	TGAT	2	8	1568739	1568746	25 %	50 %	25 %	0 %	556589129
27231	NC_022665	TGA	2	6	1568858	1568863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589129
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27233	NC_022665	ATT	2	6	1569068	1569073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589130
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27340	NC_022665	CATCC	2	10	1574843	1574852	20 %	20 %	0 %	60 %	556589134
27341	NC_022665	CAAC	2	8	1574887	1574894	50 %	0 %	0 %	50 %	556589134
27342	NC_022665	AGC	2	6	1574899	1574904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589134
27343	NC_022665	ATTA	2	8	1574932	1574939	50 %	50 %	0 %	0 %	556589134
27344	NC_022665	GAT	2	6	1574983	1574988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589134
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27347	NC_022665	A	7	7	1575267	1575273	100 %	0 %	0 %	0 %	556589134
27348	NC_022665	CTT	2	6	1575347	1575352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589135
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27350	NC_022665	CCTT	2	8	1575400	1575407	0 %	50 %	0 %	50 %	556589135
27351	NC_022665	CAT	2	6	1575422	1575427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589135
27352	NC_022665	GAA	2	6	1575452	1575457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589135
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27465	NC_022665	TCC	2	6	1581617	1581622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589144
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27467	NC_022665	ATG	2	6	1581655	1581660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589144
27468	NC_022665	CAG	2	6	1581705	1581710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589144
27469	NC_022665	ATA	2	6	1581791	1581796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589144
27470	NC_022665	TC	3	6	1581940	1581945	0 %	50 %	0 %	50 %	556589145
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27473	NC_022665	CGG	2	6	1582019	1582024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556589145
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27483	NC_022665	ATA	2	6	1582457	1582462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589145
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27489	NC_022665	TGC	2	6	1582900	1582905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589145
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27499	NC_022665	TTGT	2	8	1583318	1583325	0 %	75 %	25 %	0 %	556589145
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