MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_022665	AGAC	2	8	1501967	1501974	50 %	0 %	25 %	25 %	556589061
26003	NC_022665	T	6	6	1502036	1502041	0 %	100 %	0 %	0 %	556589061
26004	NC_022665	CACT	2	8	1502080	1502087	25 %	25 %	0 %	50 %	556589061
26005	NC_022665	CTG	2	6	1502089	1502094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589061
26006	NC_022665	CT	3	6	1502141	1502146	0 %	50 %	0 %	50 %	556589061
26007	NC_022665	TC	3	6	1502190	1502195	0 %	50 %	0 %	50 %	556589061
26008	NC_022665	GAA	2	6	1502241	1502246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589061
26009	NC_022665	AAATA	2	10	1502254	1502263	80 %	20 %	0 %	0 %	556589061
26010	NC_022665	TTGT	2	8	1502265	1502272	0 %	75 %	25 %	0 %	556589061
26011	NC_022665	TCAATC	2	12	1502280	1502291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589061
26012	NC_022665	GT	3	6	1502305	1502310	0 %	50 %	50 %	0 %	556589061
26013	NC_022665	TGG	2	6	1502365	1502370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589061
26014	NC_022665	TTG	2	6	1502371	1502376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589061
26015	NC_022665	CAA	2	6	1502390	1502395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589061
26016	NC_022665	CCT	2	6	1502458	1502463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589062
26017	NC_022665	CTT	2	6	1502481	1502486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589062
26018	NC_022665	TCGC	2	8	1502510	1502517	0 %	25 %	25 %	50 %	556589062
26019	NC_022665	TTC	2	6	1502592	1502597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589062
26020	NC_022665	AATA	2	8	1502604	1502611	75 %	25 %	0 %	0 %	556589062
26021	NC_022665	CT	3	6	1502686	1502691	0 %	50 %	0 %	50 %	556589062
26022	NC_022665	CAT	2	6	1502750	1502755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589062
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26024	NC_022665	AT	3	6	1502801	1502806	50 %	50 %	0 %	0 %	556589062
26025	NC_022665	CAA	2	6	1502921	1502926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589062
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26027	NC_022665	CACT	2	8	1502942	1502949	25 %	25 %	0 %	50 %	556589062
26028	NC_022665	GTT	2	6	1502971	1502976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589062
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26032	NC_022665	GGTTTA	2	12	1503278	1503289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	556589062
26033	NC_022665	A	6	6	1503532	1503537	100 %	0 %	0 %	0 %	556589063
26034	NC_022665	TAC	2	6	1503549	1503554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589063
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26042	NC_022665	CGA	2	6	1503995	1504000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589063
26043	NC_022665	TAC	2	6	1504021	1504026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589063
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26052	NC_022665	GTTC	2	8	1504612	1504619	0 %	50 %	25 %	25 %	556589063
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26054	NC_022665	CAT	2	6	1504695	1504700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589063
26055	NC_022665	TTGA	2	8	1504705	1504712	25 %	50 %	25 %	0 %	556589063
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26061	NC_022665	GCTA	2	8	1505126	1505133	25 %	25 %	25 %	25 %	556589064
26062	NC_022665	ATATT	2	10	1505162	1505171	40 %	60 %	0 %	0 %	556589064
26063	NC_022665	CAA	2	6	1505234	1505239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589064
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26088	NC_022665	GCTC	2	8	1507050	1507057	0 %	25 %	25 %	50 %	556589067
26089	NC_022665	GCG	2	6	1507102	1507107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556589067
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26099	NC_022665	CTC	2	6	1507588	1507593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589067
26100	NC_022665	GGAG	2	8	1507606	1507613	25 %	0 %	75 %	0 %	556589067
26101	NC_022665	GTA	2	6	1507636	1507641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589067
26102	NC_022665	GAT	2	6	1507699	1507704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589067
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26104	NC_022665	GCA	2	6	1507820	1507825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589067
26105	NC_022665	GTT	2	6	1507898	1507903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589067
26106	NC_022665	TGG	2	6	1507959	1507964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589067
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26109	NC_022665	AAT	2	6	1508085	1508090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589067
26110	NC_022665	GGT	2	6	1508241	1508246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589067
26111	NC_022665	AGC	2	6	1508285	1508290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589067
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26113	NC_022665	AG	3	6	1508326	1508331	50 %	0 %	50 %	0 %	556589067
26114	NC_022665	TGGTC	2	10	1508355	1508364	0 %	40 %	40 %	20 %	556589067
26115	NC_022665	ACC	2	6	1508413	1508418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589067
26116	NC_022665	TCA	2	6	1508457	1508462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589067
26117	NC_022665	CGT	2	6	1508527	1508532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589067
26118	NC_022665	GTC	2	6	1508539	1508544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589067
26119	NC_022665	TC	3	6	1508640	1508645	0 %	50 %	0 %	50 %	556589067
26120	NC_022665	TCT	2	6	1508660	1508665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589067
26121	NC_022665	TGCC	2	8	1508694	1508701	0 %	25 %	25 %	50 %	556589067
26122	NC_022665	T	6	6	1508705	1508710	0 %	100 %	0 %	0 %	556589067
26123	NC_022665	TAAA	2	8	1508760	1508767	75 %	25 %	0 %	0 %	556589067
26124	NC_022665	AAT	2	6	1508809	1508814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589067
26125	NC_022665	ACC	2	6	1508966	1508971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589068
26126	NC_022665	GAA	2	6	1509069	1509074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589068
26127	NC_022665	CT	3	6	1509093	1509098	0 %	50 %	0 %	50 %	556589068
26128	NC_022665	CTAT	2	8	1509153	1509160	25 %	50 %	0 %	25 %	556589068
26129	NC_022665	CAAGG	2	10	1509306	1509315	40 %	0 %	40 %	20 %	556589069
26130	NC_022665	CTGC	2	8	1509329	1509336	0 %	25 %	25 %	50 %	556589069
26131	NC_022665	TAA	2	6	1509471	1509476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589069
26132	NC_022665	TAA	2	6	1509511	1509516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589069
26133	NC_022665	CTG	2	6	1509551	1509556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589069
26134	NC_022665	CAT	2	6	1509569	1509574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589069
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26136	NC_022665	TCA	2	6	1509617	1509622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589069
26137	NC_022665	GTC	2	6	1509763	1509768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589069
26138	NC_022665	CTT	2	6	1509791	1509796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589069
26139	NC_022665	CTT	2	6	1509836	1509841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589069
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26143	NC_022665	TCTT	2	8	1510064	1510071	0 %	75 %	0 %	25 %	556589070
26144	NC_022665	CTG	2	6	1510115	1510120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589070
26145	NC_022665	AGT	2	6	1510126	1510131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589070
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26148	NC_022665	CTG	2	6	1510360	1510365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589070
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26154	NC_022665	AACC	2	8	1510643	1510650	50 %	0 %	0 %	50 %	556589070
26155	NC_022665	TCC	2	6	1510688	1510693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589070
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26187	NC_022665	TTC	2	6	1512387	1512392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589071
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26191	NC_022665	TTCA	2	8	1512480	1512487	25 %	50 %	0 %	25 %	556589071
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26202	NC_022665	A	6	6	1513361	1513366	100 %	0 %	0 %	0 %	556589073
26203	NC_022665	T	6	6	1513435	1513440	0 %	100 %	0 %	0 %	556589073
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26219	NC_022665	AGGGT	2	10	1514469	1514478	20 %	20 %	60 %	0 %	556589074
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26221	NC_022665	TTC	2	6	1514587	1514592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589074
26222	NC_022665	CAC	2	6	1514608	1514613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589074
26223	NC_022665	TGG	2	6	1514616	1514621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556589074
26224	NC_022665	T	6	6	1514624	1514629	0 %	100 %	0 %	0 %	556589074
26225	NC_022665	CAA	2	6	1514634	1514639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589074
26226	NC_022665	ACC	2	6	1514767	1514772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589075
26227	NC_022665	ACA	2	6	1514803	1514808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589075
26228	NC_022665	CTT	2	6	1514921	1514926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589075
26229	NC_022665	GAT	2	6	1514955	1514960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589075
26230	NC_022665	GAA	2	6	1515078	1515083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589075
26231	NC_022665	CAC	2	6	1515099	1515104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589075
26232	NC_022665	ACCTAG	2	12	1515114	1515125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556589075
26233	NC_022665	AGGA	2	8	1515153	1515160	50 %	0 %	50 %	0 %	556589075
26234	NC_022665	AAGC	2	8	1515288	1515295	50 %	0 %	25 %	25 %	556589075
26235	NC_022665	CAA	2	6	1515320	1515325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589075
26236	NC_022665	CTG	2	6	1515329	1515334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589075
26237	NC_022665	CTC	2	6	1515389	1515394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589075
26238	NC_022665	GTC	2	6	1515415	1515420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589075
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26240	NC_022665	CAT	2	6	1515567	1515572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589076
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26245	NC_022665	AGCC	2	8	1515939	1515946	25 %	0 %	25 %	50 %	556589076
26246	NC_022665	TCT	2	6	1515947	1515952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589076
26247	NC_022665	GCT	2	6	1515953	1515958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589076
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26262	NC_022665	ATTTTT	2	12	1516519	1516530	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	556589076
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26264	NC_022665	TTTC	2	8	1517359	1517366	0 %	75 %	0 %	25 %	556589077
26265	NC_022665	CAT	3	9	1517391	1517399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589077
26266	NC_022665	CAAT	2	8	1517459	1517466	50 %	25 %	0 %	25 %	556589077
26267	NC_022665	AAG	2	6	1517475	1517480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589077
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26334	NC_022665	TG	3	6	1520804	1520809	0 %	50 %	50 %	0 %	556589079
26335	NC_022665	GTA	2	6	1520818	1520823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589079
26336	NC_022665	TTGA	2	8	1520836	1520843	25 %	50 %	25 %	0 %	556589079
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26338	NC_022665	AAT	2	6	1520866	1520871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589079
26339	NC_022665	GCT	2	6	1520963	1520968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589079
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26341	NC_022665	T	7	7	1520998	1521004	0 %	100 %	0 %	0 %	556589079
26342	NC_022665	ATG	2	6	1521005	1521010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589079
26343	NC_022665	T	6	6	1521019	1521024	0 %	100 %	0 %	0 %	556589079
26344	NC_022665	CTC	2	6	1521037	1521042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589079
26345	NC_022665	ACT	2	6	1521086	1521091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589079
26346	NC_022665	CCTT	2	8	1521092	1521099	0 %	50 %	0 %	50 %	556589079
26347	NC_022665	TCA	2	6	1521152	1521157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589079
26348	NC_022665	TAT	2	6	1521190	1521195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589079
26349	NC_022665	A	6	6	1521278	1521283	100 %	0 %	0 %	0 %	556589079
26350	NC_022665	T	6	6	1521285	1521290	0 %	100 %	0 %	0 %	556589079
26351	NC_022665	GAA	2	6	1521296	1521301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556589079
26352	NC_022665	CTT	2	6	1521322	1521327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589079
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26354	NC_022665	TTA	2	6	1521371	1521376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556589079
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26356	NC_022665	GCA	2	6	1521847	1521852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556589080
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26362	NC_022665	TGA	2	6	1522259	1522264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556589080
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26454	NC_022665	TCATA	2	10	1526114	1526123	40 %	40 %	0 %	20 %	556589083
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26461	NC_022665	CAA	2	6	1526477	1526482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589084
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26465	NC_022665	TTG	2	6	1526614	1526619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589084
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26467	NC_022665	TGC	2	6	1526679	1526684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589084
26468	NC_022665	CCA	2	6	1526688	1526693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556589084
26469	NC_022665	GCT	2	6	1526745	1526750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589084
26470	NC_022665	CAA	2	6	1526767	1526772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589084
26471	NC_022665	T	6	6	1526882	1526887	0 %	100 %	0 %	0 %	556589084
26472	NC_022665	TGT	2	6	1526897	1526902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556589084
26473	NC_022665	AAT	2	6	1526934	1526939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589084
26474	NC_022665	TCAT	2	8	1526973	1526980	25 %	50 %	0 %	25 %	556589084
26475	NC_022665	TGATT	2	10	1527040	1527049	20 %	60 %	20 %	0 %	556589084
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26480	NC_022665	TGC	2	6	1527339	1527344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556589085
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26482	NC_022665	AAC	2	6	1527414	1527419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589085
26483	NC_022665	ATA	2	6	1527488	1527493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589085
26484	NC_022665	CTT	2	6	1527497	1527502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556589085
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26491	NC_022665	CAA	2	6	1527741	1527746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556589085
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26493	NC_022665	AAT	2	6	1527823	1527828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556589085
26494	NC_022665	AATA	2	8	1527873	1527880	75 %	25 %	0 %	0 %	556589085
26495	NC_022665	AGAT	2	8	1527906	1527913	50 %	25 %	25 %	0 %	556589085
26496	NC_022665	TCA	2	6	1527946	1527951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589085
26497	NC_022665	A	6	6	1527966	1527971	100 %	0 %	0 %	0 %	556589085
26498	NC_022665	ACT	2	6	1527976	1527981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556589085
26499	NC_022665	TCC	2	6	1527985	1527990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556589086
26500	NC_022665	TA	3	6	1527995	1528000	50 %	50 %	0 %	0 %	556589086

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