MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 38727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022665	CAGCTA	2	12	656187	656198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	556588226
11002	NC_022665	ACA	3	9	656228	656236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556588226
11003	NC_022665	AGAA	2	8	656394	656401	75 %	0 %	25 %	0 %	556588227
11004	NC_022665	A	6	6	656469	656474	100 %	0 %	0 %	0 %	556588227
11005	NC_022665	AGG	2	6	656502	656507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556588227
11006	NC_022665	TA	3	6	656516	656521	50 %	50 %	0 %	0 %	556588227
11007	NC_022665	CAG	2	6	656753	656758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588228
11008	NC_022665	TAT	2	6	656844	656849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588228
11009	NC_022665	AGA	2	6	656853	656858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588228
11010	NC_022665	TCA	2	6	656903	656908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588228
11011	NC_022665	TTG	2	6	656942	656947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588228
11012	NC_022665	ATT	2	6	656984	656989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588228
11013	NC_022665	CTA	2	6	657033	657038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588228
11014	NC_022665	TGG	2	6	657138	657143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588228
11015	NC_022665	TTC	2	6	657157	657162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588228
11016	NC_022665	AT	3	6	657261	657266	50 %	50 %	0 %	0 %	556588228
11017	NC_022665	CAG	2	6	657350	657355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588228
11018	NC_022665	ATTG	2	8	657464	657471	25 %	50 %	25 %	0 %	556588228
11019	NC_022665	GCA	2	6	657750	657755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588229
11020	NC_022665	GGCTT	2	10	657784	657793	0 %	40 %	40 %	20 %	556588229
11021	NC_022665	CTG	2	6	657800	657805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588229
11022	NC_022665	CTT	2	6	657924	657929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588229
11023	NC_022665	AGA	2	6	657999	658004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588229
11024	NC_022665	TTC	2	6	658030	658035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588229
11025	NC_022665	TAGTC	2	10	658143	658152	20 %	40 %	20 %	20 %	556588229
11026	NC_022665	CT	3	6	658157	658162	0 %	50 %	0 %	50 %	556588229
11027	NC_022665	T	6	6	658194	658199	0 %	100 %	0 %	0 %	556588229
11028	NC_022665	CAGC	2	8	658233	658240	25 %	0 %	25 %	50 %	556588229
11029	NC_022665	AGC	2	6	658247	658252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588229
11030	NC_022665	GCA	2	6	658276	658281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588229
11031	NC_022665	TTATGA	2	12	658286	658297	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	556588229
11032	NC_022665	GAT	2	6	658359	658364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588229
11033	NC_022665	TTA	2	6	658466	658471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588229
11034	NC_022665	ATT	2	6	658524	658529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588229
11035	NC_022665	AT	3	6	658614	658619	50 %	50 %	0 %	0 %	556588229
11036	NC_022665	GAT	3	9	658644	658652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588229
11037	NC_022665	AAGA	2	8	658714	658721	75 %	0 %	25 %	0 %	556588229
11038	NC_022665	GGC	2	6	658728	658733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556588229
11039	NC_022665	TTG	2	6	658790	658795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588229
11040	NC_022665	T	6	6	658829	658834	0 %	100 %	0 %	0 %	556588229
11041	NC_022665	AGA	2	6	658948	658953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588229
11042	NC_022665	TAT	2	6	658960	658965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588229
11043	NC_022665	TTGGG	2	10	659054	659063	0 %	40 %	60 %	0 %	556588229
11044	NC_022665	TGA	2	6	659112	659117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588229
11045	NC_022665	GGA	2	6	659348	659353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556588229
11046	NC_022665	GTTT	2	8	659370	659377	0 %	75 %	25 %	0 %	556588229
11047	NC_022665	ATG	2	6	659537	659542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588230
11048	NC_022665	GTG	2	6	659601	659606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588230
11049	NC_022665	TGG	3	9	659692	659700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588230
11050	NC_022665	CTG	3	9	659721	659729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588230
11051	NC_022665	CAGT	2	8	659858	659865	25 %	25 %	25 %	25 %	556588230
11052	NC_022665	CAG	2	6	659970	659975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588230
11053	NC_022665	TGC	2	6	659983	659988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588230
11054	NC_022665	GAA	2	6	660055	660060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588230
11055	NC_022665	CT	3	6	660147	660152	0 %	50 %	0 %	50 %	556588230
11056	NC_022665	ATGA	2	8	660188	660195	50 %	25 %	25 %	0 %	556588230
11057	NC_022665	TAC	2	6	660238	660243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588230
11058	NC_022665	TTC	2	6	660253	660258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588230
11059	NC_022665	AGA	2	6	660259	660264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588230
11060	NC_022665	AAAT	2	8	660266	660273	75 %	25 %	0 %	0 %	556588230
11061	NC_022665	ATT	2	6	660417	660422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588231
11062	NC_022665	TCA	2	6	660452	660457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588231
11063	NC_022665	TTG	2	6	660510	660515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588231
11064	NC_022665	TAC	2	6	660534	660539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588231
11065	NC_022665	A	6	6	660756	660761	100 %	0 %	0 %	0 %	556588231
11066	NC_022665	CGT	2	6	660798	660803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588231
11067	NC_022665	A	6	6	660822	660827	100 %	0 %	0 %	0 %	556588231
11068	NC_022665	AGA	2	6	660851	660856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588231
11069	NC_022665	GAT	2	6	660897	660902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588231
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11071	NC_022665	TTG	2	6	660948	660953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588231
11072	NC_022665	G	6	6	661042	661047	0 %	0 %	100 %	0 %	556588232
11073	NC_022665	AGAA	2	8	661079	661086	75 %	0 %	25 %	0 %	556588232
11074	NC_022665	ATGA	2	8	661094	661101	50 %	25 %	25 %	0 %	556588232
11075	NC_022665	TTA	2	6	661103	661108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588232
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11077	NC_022665	TTGG	2	8	661305	661312	0 %	50 %	50 %	0 %	556588232
11078	NC_022665	CAAG	2	8	661372	661379	50 %	0 %	25 %	25 %	556588232
11079	NC_022665	GTT	2	6	661382	661387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588232
11080	NC_022665	A	6	6	661427	661432	100 %	0 %	0 %	0 %	556588232
11081	NC_022665	AAG	2	6	661466	661471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588232
11082	NC_022665	AAG	2	6	661500	661505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588232
11083	NC_022665	ATA	2	6	661536	661541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588232
11084	NC_022665	GCGA	2	8	661558	661565	25 %	0 %	50 %	25 %	556588232
11085	NC_022665	AATG	2	8	661582	661589	50 %	25 %	25 %	0 %	556588232
11086	NC_022665	ACA	3	9	661611	661619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556588232
11087	NC_022665	TC	3	6	661727	661732	0 %	50 %	0 %	50 %	556588232
11088	NC_022665	ATG	2	6	661761	661766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588232
11089	NC_022665	GAT	2	6	661771	661776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588232
11090	NC_022665	A	6	6	661877	661882	100 %	0 %	0 %	0 %	556588232
11091	NC_022665	TGG	2	6	661888	661893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588232
11092	NC_022665	TGA	2	6	661896	661901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588232
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11094	NC_022665	CAT	2	6	662128	662133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588233
11095	NC_022665	GA	3	6	662152	662157	50 %	0 %	50 %	0 %	556588233
11096	NC_022665	CGA	2	6	662277	662282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588233
11097	NC_022665	TAT	2	6	662311	662316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588233
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11100	NC_022665	TGAA	2	8	662445	662452	50 %	25 %	25 %	0 %	556588233
11101	NC_022665	TGT	2	6	662482	662487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588233
11102	NC_022665	TGA	2	6	662523	662528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588233
11103	NC_022665	ATT	2	6	662566	662571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588233
11104	NC_022665	GAA	2	6	662657	662662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588233
11105	NC_022665	GAA	2	6	662692	662697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588233
11106	NC_022665	GAT	2	6	662827	662832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588233
11107	NC_022665	AG	3	6	662854	662859	50 %	0 %	50 %	0 %	556588233
11108	NC_022665	GAA	2	6	662912	662917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588234
11109	NC_022665	TGCCT	2	10	662926	662935	0 %	40 %	20 %	40 %	556588234
11110	NC_022665	GGAA	2	8	662943	662950	50 %	0 %	50 %	0 %	556588234
11111	NC_022665	TAT	2	6	663032	663037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588234
11112	NC_022665	CCTTG	2	10	663097	663106	0 %	40 %	20 %	40 %	556588234
11113	NC_022665	CA	3	6	663120	663125	50 %	0 %	0 %	50 %	556588234
11114	NC_022665	TGC	2	6	663181	663186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588234
11115	NC_022665	TA	3	6	663308	663313	50 %	50 %	0 %	0 %	556588234
11116	NC_022665	A	7	7	663324	663330	100 %	0 %	0 %	0 %	556588234
11117	NC_022665	GAA	2	6	663353	663358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588235
11118	NC_022665	TGA	2	6	663374	663379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588235
11119	NC_022665	TGA	2	6	663435	663440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588235
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11121	NC_022665	T	6	6	663486	663491	0 %	100 %	0 %	0 %	556588235
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11242	NC_022665	TTA	2	6	671120	671125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588243
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11244	NC_022665	ACAG	2	8	671199	671206	50 %	0 %	25 %	25 %	556588243
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11357	NC_022665	TATG	2	8	676679	676686	25 %	50 %	25 %	0 %	556588246
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11483	NC_022665	T	7	7	683491	683497	0 %	100 %	0 %	0 %	556588252
11484	NC_022665	TCAG	2	8	683555	683562	25 %	25 %	25 %	25 %	556588252
11485	NC_022665	A	6	6	683596	683601	100 %	0 %	0 %	0 %	556588252
11486	NC_022665	G	6	6	683678	683683	0 %	0 %	100 %	0 %	556588252
11487	NC_022665	GAAAA	2	10	683713	683722	80 %	0 %	20 %	0 %	556588252
11488	NC_022665	AAT	2	6	683757	683762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588252
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11491	NC_022665	GAA	2	6	683829	683834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588252
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