MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_022655	TTCAAG	2	12	2023683	2023694	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556561881
33002	NC_022655	TTGG	2	8	2023708	2023715	0 %	50 %	50 %	0 %	556561881
33003	NC_022655	T	6	6	2023752	2023757	0 %	100 %	0 %	0 %	556561881
33004	NC_022655	TCT	2	6	2023775	2023780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561881
33005	NC_022655	T	6	6	2023818	2023823	0 %	100 %	0 %	0 %	556561881
33006	NC_022655	TCTA	2	8	2023968	2023975	25 %	50 %	0 %	25 %	556561881
33007	NC_022655	T	8	8	2024000	2024007	0 %	100 %	0 %	0 %	556561881
33008	NC_022655	CGACT	2	10	2024013	2024022	20 %	20 %	20 %	40 %	556561881
33009	NC_022655	TCA	2	6	2024023	2024028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561881
33010	NC_022655	CTT	2	6	2024034	2024039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561881
33011	NC_022655	AT	3	6	2024042	2024047	50 %	50 %	0 %	0 %	556561881
33012	NC_022655	ACC	2	6	2024082	2024087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561881
33013	NC_022655	ACT	2	6	2024104	2024109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561881
33014	NC_022655	CCT	2	6	2024110	2024115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561881
33015	NC_022655	ACT	2	6	2024131	2024136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561881
33016	NC_022655	AAT	2	6	2024171	2024176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561881
33017	NC_022655	TTTC	2	8	2024182	2024189	0 %	75 %	0 %	25 %	556561881
33018	NC_022655	TCG	2	6	2024349	2024354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561882
33019	NC_022655	CAA	2	6	2024412	2024417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561882
33020	NC_022655	GAA	2	6	2024438	2024443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561882
33021	NC_022655	ATT	2	6	2024505	2024510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561882
33022	NC_022655	CAA	2	6	2024544	2024549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561882
33023	NC_022655	CAACAT	2	12	2024559	2024570	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	556561882
33024	NC_022655	A	6	6	2024579	2024584	100 %	0 %	0 %	0 %	556561882
33025	NC_022655	ACCA	2	8	2024598	2024605	50 %	0 %	0 %	50 %	556561882
33026	NC_022655	AG	3	6	2024655	2024660	50 %	0 %	50 %	0 %	556561882
33027	NC_022655	A	6	6	2024663	2024668	100 %	0 %	0 %	0 %	556561882
33028	NC_022655	A	7	7	2024764	2024770	100 %	0 %	0 %	0 %	556561882
33029	NC_022655	AAT	2	6	2024796	2024801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561882
33030	NC_022655	AT	3	6	2025051	2025056	50 %	50 %	0 %	0 %	556561883
33031	NC_022655	AAAT	2	8	2025058	2025065	75 %	25 %	0 %	0 %	556561883
33032	NC_022655	AG	3	6	2025109	2025114	50 %	0 %	50 %	0 %	556561883
33033	NC_022655	GAC	2	6	2025220	2025225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561883
33034	NC_022655	CTA	2	6	2025303	2025308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561883
33035	NC_022655	AGA	2	6	2025361	2025366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561883
33036	NC_022655	CTT	2	6	2025375	2025380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561883
33037	NC_022655	TTAT	2	8	2025407	2025414	25 %	75 %	0 %	0 %	556561883
33038	NC_022655	AT	3	6	2025425	2025430	50 %	50 %	0 %	0 %	556561883
33039	NC_022655	GAT	2	6	2025435	2025440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561883
33040	NC_022655	TGC	2	6	2025461	2025466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561883
33041	NC_022655	CAA	2	6	2025601	2025606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561883
33042	NC_022655	CATA	2	8	2025612	2025619	50 %	25 %	0 %	25 %	556561883
33043	NC_022655	TCA	2	6	2025665	2025670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561883
33044	NC_022655	A	6	6	2025723	2025728	100 %	0 %	0 %	0 %	556561883
33045	NC_022655	A	6	6	2025762	2025767	100 %	0 %	0 %	0 %	556561883
33046	NC_022655	CTT	2	6	2025831	2025836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561883
33047	NC_022655	CTG	2	6	2025885	2025890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561883
33048	NC_022655	TCA	2	6	2026049	2026054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561883
33049	NC_022655	ATA	2	6	2026126	2026131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561883
33050	NC_022655	AAAT	2	8	2026145	2026152	75 %	25 %	0 %	0 %	556561883
33051	NC_022655	ATGA	2	8	2026159	2026166	50 %	25 %	25 %	0 %	556561883
33052	NC_022655	ACC	2	6	2026177	2026182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561883
33053	NC_022655	CTT	2	6	2026196	2026201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561883
33054	NC_022655	A	6	6	2026202	2026207	100 %	0 %	0 %	0 %	556561883
33055	NC_022655	TAA	2	6	2026216	2026221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561883
33056	NC_022655	T	6	6	2026229	2026234	0 %	100 %	0 %	0 %	556561883
33057	NC_022655	T	6	6	2026293	2026298	0 %	100 %	0 %	0 %	556561884
33058	NC_022655	TTC	2	6	2026365	2026370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561884
33059	NC_022655	CT	3	6	2026380	2026385	0 %	50 %	0 %	50 %	556561884
33060	NC_022655	TTC	2	6	2026455	2026460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561884
33061	NC_022655	GTA	2	6	2026533	2026538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561884
33062	NC_022655	ATC	2	6	2026602	2026607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561884
33063	NC_022655	AGT	2	6	2026635	2026640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561884
33064	NC_022655	TGAT	2	8	2026687	2026694	25 %	50 %	25 %	0 %	556561884
33065	NC_022655	CAT	2	6	2026728	2026733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561884
33066	NC_022655	TGC	2	6	2026836	2026841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561884
33067	NC_022655	TC	4	8	2026889	2026896	0 %	50 %	0 %	50 %	556561884
33068	NC_022655	A	6	6	2027209	2027214	100 %	0 %	0 %	0 %	556561885
33069	NC_022655	CTA	2	6	2027267	2027272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561885
33070	NC_022655	ACG	2	6	2027292	2027297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561885
33071	NC_022655	TAA	2	6	2027303	2027308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561885
33072	NC_022655	TGC	2	6	2027581	2027586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561887
33073	NC_022655	AAG	3	9	2027606	2027614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561887
33074	NC_022655	TCC	2	6	2027628	2027633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561887
33075	NC_022655	CAC	2	6	2027783	2027788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561887
33076	NC_022655	ACC	2	6	2027823	2027828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561887
33077	NC_022655	TCA	2	6	2027832	2027837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
33078	NC_022655	TGA	2	6	2027845	2027850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561887
33079	NC_022655	T	6	6	2027867	2027872	0 %	100 %	0 %	0 %	556561887
33080	NC_022655	TTC	2	6	2027876	2027881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561887
33081	NC_022655	ATC	2	6	2027948	2027953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
33082	NC_022655	ATAATG	2	12	2027985	2027996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556561887
33083	NC_022655	TCA	2	6	2028099	2028104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
33084	NC_022655	CTT	2	6	2028157	2028162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561887
33085	NC_022655	GGA	2	6	2028180	2028185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561887
33086	NC_022655	GGCT	2	8	2028199	2028206	0 %	25 %	50 %	25 %	556561887
33087	NC_022655	ACTC	2	8	2028223	2028230	25 %	25 %	0 %	50 %	556561887
33088	NC_022655	TCA	2	6	2028258	2028263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
33089	NC_022655	CTGA	2	8	2028364	2028371	25 %	25 %	25 %	25 %	556561887
33090	NC_022655	GCG	2	6	2028374	2028379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556561887
33091	NC_022655	GGT	2	6	2028515	2028520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561887
33092	NC_022655	CTT	2	6	2028568	2028573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561887
33093	NC_022655	CCAT	2	8	2028606	2028613	25 %	25 %	0 %	50 %	556561887
33094	NC_022655	ATTT	2	8	2028667	2028674	25 %	75 %	0 %	0 %	556561887
33095	NC_022655	TGC	2	6	2028683	2028688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561887
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33098	NC_022655	ACG	2	6	2028884	2028889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561887
33099	NC_022655	TGC	2	6	2028896	2028901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561887
33100	NC_022655	TTC	2	6	2028926	2028931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561887
33101	NC_022655	GTG	2	6	2028936	2028941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561887
33102	NC_022655	AATC	2	8	2029009	2029016	50 %	25 %	0 %	25 %	556561887
33103	NC_022655	ATG	2	6	2029032	2029037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561887
33104	NC_022655	TCT	2	6	2029074	2029079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561887
33105	NC_022655	TGA	2	6	2029090	2029095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561887
33106	NC_022655	TAT	2	6	2029096	2029101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561887
33107	NC_022655	TTC	2	6	2029109	2029114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561887
33108	NC_022655	CAC	2	6	2029120	2029125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561887
33109	NC_022655	TCA	2	6	2029150	2029155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
33110	NC_022655	CAC	2	6	2029201	2029206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561887
33111	NC_022655	CCAA	2	8	2029263	2029270	50 %	0 %	0 %	50 %	556561887
33112	NC_022655	GTT	2	6	2029277	2029282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561887
33113	NC_022655	CCGA	2	8	2029331	2029338	25 %	0 %	25 %	50 %	556561887
33114	NC_022655	ACC	2	6	2029400	2029405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561887
33115	NC_022655	CAT	2	6	2029427	2029432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
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33117	NC_022655	TTC	2	6	2029517	2029522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561887
33118	NC_022655	CGA	2	6	2029530	2029535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561887
33119	NC_022655	AGC	2	6	2029538	2029543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561887
33120	NC_022655	TCTT	2	8	2029557	2029564	0 %	75 %	0 %	25 %	556561887
33121	NC_022655	CAT	2	6	2029618	2029623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
33122	NC_022655	TCA	2	6	2029695	2029700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561887
33123	NC_022655	ACG	2	6	2029715	2029720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561887
33124	NC_022655	TCAG	2	8	2029767	2029774	25 %	25 %	25 %	25 %	556561887
33125	NC_022655	CAA	2	6	2029868	2029873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561887
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33222	NC_022655	AGTA	2	8	2035061	2035068	50 %	25 %	25 %	0 %	556561894
33223	NC_022655	AATA	2	8	2035125	2035132	75 %	25 %	0 %	0 %	556561894
33224	NC_022655	GGAT	2	8	2035134	2035141	25 %	25 %	50 %	0 %	556561894
33225	NC_022655	T	7	7	2035168	2035174	0 %	100 %	0 %	0 %	556561894
33226	NC_022655	TCT	2	6	2035234	2035239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561894
33227	NC_022655	T	7	7	2035244	2035250	0 %	100 %	0 %	0 %	556561894
33228	NC_022655	CCTC	2	8	2035290	2035297	0 %	25 %	0 %	75 %	556561895
33229	NC_022655	ATA	2	6	2035379	2035384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561895
33230	NC_022655	TTA	2	6	2035394	2035399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561895
33231	NC_022655	CTC	2	6	2035411	2035416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561895
33232	NC_022655	TTC	2	6	2035417	2035422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561895
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33348	NC_022655	TGAC	2	8	2040315	2040322	25 %	25 %	25 %	25 %	556561899
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33457	NC_022655	CTT	2	6	2046697	2046702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561906
33458	NC_022655	ACATC	2	10	2046739	2046748	40 %	20 %	0 %	40 %	556561906
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33462	NC_022655	GAA	2	6	2046835	2046840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561906
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33464	NC_022655	TTTC	2	8	2046874	2046881	0 %	75 %	0 %	25 %	556561906
33465	NC_022655	CAAC	2	8	2046932	2046939	50 %	0 %	0 %	50 %	556561906
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33468	NC_022655	CTT	2	6	2046973	2046978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561906
33469	NC_022655	GCT	2	6	2046993	2046998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561906
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