MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_022655	GAA	2	6	1992933	1992938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561855
32503	NC_022655	CTT	2	6	1992993	1992998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561855
32504	NC_022655	CAA	2	6	1992999	1993004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561855
32505	NC_022655	ATC	2	6	1993252	1993257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561855
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32507	NC_022655	CTA	2	6	1993464	1993469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561855
32508	NC_022655	CTT	2	6	1993471	1993476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561855
32509	NC_022655	TTAA	2	8	1993484	1993491	50 %	50 %	0 %	0 %	556561855
32510	NC_022655	TAA	2	6	1993643	1993648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561856
32511	NC_022655	CT	3	6	1993649	1993654	0 %	50 %	0 %	50 %	556561856
32512	NC_022655	CTC	2	6	1993666	1993671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561856
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32514	NC_022655	CAA	2	6	1993728	1993733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561856
32515	NC_022655	CCT	2	6	1993826	1993831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561856
32516	NC_022655	AT	3	6	1993840	1993845	50 %	50 %	0 %	0 %	556561856
32517	NC_022655	AGTT	2	8	1993864	1993871	25 %	50 %	25 %	0 %	556561856
32518	NC_022655	CT	3	6	1993951	1993956	0 %	50 %	0 %	50 %	556561856
32519	NC_022655	ATG	2	6	1993963	1993968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561856
32520	NC_022655	ATCA	2	8	1994035	1994042	50 %	25 %	0 %	25 %	556561856
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32525	NC_022655	GTA	2	6	1994225	1994230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561856
32526	NC_022655	AAGT	2	8	1994241	1994248	50 %	25 %	25 %	0 %	556561856
32527	NC_022655	CCAA	2	8	1994255	1994262	50 %	0 %	0 %	50 %	556561856
32528	NC_022655	TGA	2	6	1994275	1994280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561856
32529	NC_022655	AATA	2	8	1994281	1994288	75 %	25 %	0 %	0 %	556561856
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32536	NC_022655	ATCA	2	8	1994776	1994783	50 %	25 %	0 %	25 %	556561856
32537	NC_022655	GATA	2	8	1994815	1994822	50 %	25 %	25 %	0 %	556561856
32538	NC_022655	TAG	2	6	1994872	1994877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561856
32539	NC_022655	ATTT	2	8	1994935	1994942	25 %	75 %	0 %	0 %	556561856
32540	NC_022655	ATTG	2	8	1995232	1995239	25 %	50 %	25 %	0 %	556561857
32541	NC_022655	A	7	7	1995254	1995260	100 %	0 %	0 %	0 %	556561857
32542	NC_022655	CGT	2	6	1995314	1995319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561857
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32544	NC_022655	TCA	2	6	1995406	1995411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561857
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32546	NC_022655	TATC	2	8	1995490	1995497	25 %	50 %	0 %	25 %	556561857
32547	NC_022655	TAC	2	6	1995508	1995513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561857
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32552	NC_022655	A	6	6	1995787	1995792	100 %	0 %	0 %	0 %	556561857
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32555	NC_022655	T	6	6	1995860	1995865	0 %	100 %	0 %	0 %	556561857
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32590	NC_022655	T	7	7	1998646	1998652	0 %	100 %	0 %	0 %	556561860
32591	NC_022655	AAT	2	6	1998716	1998721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561861
32592	NC_022655	ACTTGC	2	12	1998728	1998739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556561861
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32600	NC_022655	TTC	2	6	1999079	1999084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561861
32601	NC_022655	CCG	2	6	1999252	1999257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556561861
32602	NC_022655	TAG	2	6	1999276	1999281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561861
32603	NC_022655	TCA	2	6	1999354	1999359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561861
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32605	NC_022655	ATA	2	6	1999456	1999461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561861
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32607	NC_022655	AAC	2	6	1999505	1999510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561862
32608	NC_022655	CTT	2	6	1999568	1999573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561862
32609	NC_022655	ATC	2	6	1999588	1999593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561862
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32611	NC_022655	CATC	2	8	1999661	1999668	25 %	25 %	0 %	50 %	556561862
32612	NC_022655	CGCT	2	8	1999731	1999738	0 %	25 %	25 %	50 %	556561862
32613	NC_022655	CTC	2	6	1999821	1999826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561862
32614	NC_022655	ACG	2	6	1999842	1999847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561862
32615	NC_022655	TTG	2	6	1999929	1999934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561862
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32617	NC_022655	CGT	2	6	2000037	2000042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561862
32618	NC_022655	ATA	2	6	2000130	2000135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561862
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32641	NC_022655	T	6	6	2001057	2001062	0 %	100 %	0 %	0 %	556561864
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32735	NC_022655	CTT	2	6	2005755	2005760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561869
32736	NC_022655	ATA	2	6	2005794	2005799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561869
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32739	NC_022655	GAA	2	6	2006021	2006026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561869
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32741	NC_022655	AACT	2	8	2006098	2006105	50 %	25 %	0 %	25 %	556561869
32742	NC_022655	GAA	2	6	2006169	2006174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561869
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32750	NC_022655	CAA	2	6	2006553	2006558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561869
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32754	NC_022655	TTGT	2	8	2009560	2009567	0 %	75 %	25 %	0 %	556561870
32755	NC_022655	TGA	2	6	2009574	2009579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561870
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32759	NC_022655	G	6	6	2009937	2009942	0 %	0 %	100 %	0 %	556561870
32760	NC_022655	AAT	2	6	2009955	2009960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561870
32761	NC_022655	TGG	2	6	2009961	2009966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561870
32762	NC_022655	TAC	2	6	2010025	2010030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561870
32763	NC_022655	AAC	2	6	2010126	2010131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561870
32764	NC_022655	T	6	6	2010264	2010269	0 %	100 %	0 %	0 %	556561871
32765	NC_022655	AGCTC	2	10	2010277	2010286	20 %	20 %	20 %	40 %	556561871
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32771	NC_022655	TGT	2	6	2010896	2010901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561872
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32773	NC_022655	CAAAG	2	10	2010983	2010992	60 %	0 %	20 %	20 %	556561872
32774	NC_022655	TCT	2	6	2011101	2011106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561872
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32837	NC_022655	GCTC	2	8	2014418	2014425	0 %	25 %	25 %	50 %	556561874
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32840	NC_022655	GTTG	2	8	2014635	2014642	0 %	50 %	50 %	0 %	556561874
32841	NC_022655	GATTT	2	10	2014660	2014669	20 %	60 %	20 %	0 %	556561874
32842	NC_022655	ACTG	2	8	2014706	2014713	25 %	25 %	25 %	25 %	556561874
32843	NC_022655	CAACC	2	10	2014746	2014755	40 %	0 %	0 %	60 %	556561874
32844	NC_022655	T	6	6	2014810	2014815	0 %	100 %	0 %	0 %	556561874
32845	NC_022655	ATG	2	6	2014823	2014828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561874
32846	NC_022655	ATG	2	6	2014862	2014867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561874
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32848	NC_022655	T	6	6	2015095	2015100	0 %	100 %	0 %	0 %	556561875
32849	NC_022655	ATA	2	6	2015103	2015108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561875
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