MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_022655	TCA	2	6	1642185	1642190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561549
27003	NC_022655	GCT	2	6	1642226	1642231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561549
27004	NC_022655	TTC	2	6	1642375	1642380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561549
27005	NC_022655	ACG	2	6	1642402	1642407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561549
27006	NC_022655	TTG	2	6	1642442	1642447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561549
27007	NC_022655	AAC	2	6	1642459	1642464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561549
27008	NC_022655	GTT	2	6	1642594	1642599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561549
27009	NC_022655	TGTT	2	8	1642603	1642610	0 %	75 %	25 %	0 %	556561549
27010	NC_022655	GAA	2	6	1642697	1642702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561549
27011	NC_022655	CATAAA	2	12	1642731	1642742	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	556561549
27012	NC_022655	CTT	2	6	1642773	1642778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561549
27013	NC_022655	GAA	2	6	1642788	1642793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561549
27014	NC_022655	GTC	2	6	1642906	1642911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561549
27015	NC_022655	AGC	2	6	1642948	1642953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561549
27016	NC_022655	TG	3	6	1642981	1642986	0 %	50 %	50 %	0 %	556561549
27017	NC_022655	AAG	2	6	1643018	1643023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561549
27018	NC_022655	CTT	2	6	1643034	1643039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561549
27019	NC_022655	AGT	2	6	1643077	1643082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561549
27020	NC_022655	TGT	2	6	1643087	1643092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561549
27021	NC_022655	AGA	2	6	1643354	1643359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561550
27022	NC_022655	ATT	2	6	1643454	1643459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561550
27023	NC_022655	GAC	2	6	1643487	1643492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561550
27024	NC_022655	CTA	3	9	1643495	1643503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561550
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27029	NC_022655	ATT	2	6	1643755	1643760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561550
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27032	NC_022655	ATG	2	6	1643890	1643895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561550
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27034	NC_022655	CAGC	2	8	1643995	1644002	25 %	0 %	25 %	50 %	556561550
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27036	NC_022655	TCATT	2	10	1644073	1644082	20 %	60 %	0 %	20 %	556561550
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27038	NC_022655	CT	3	6	1644120	1644125	0 %	50 %	0 %	50 %	556561550
27039	NC_022655	GAA	2	6	1644144	1644149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561550
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27041	NC_022655	T	6	6	1644311	1644316	0 %	100 %	0 %	0 %	556561551
27042	NC_022655	TGT	2	6	1644468	1644473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561551
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27051	NC_022655	AT	3	6	1644994	1644999	50 %	50 %	0 %	0 %	556561551
27052	NC_022655	C	6	6	1645015	1645020	0 %	0 %	0 %	100 %	556561551
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27060	NC_022655	CAT	2	6	1645271	1645276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561551
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27062	NC_022655	ACCTG	2	10	1645318	1645327	20 %	20 %	20 %	40 %	556561551
27063	NC_022655	TA	3	6	1645334	1645339	50 %	50 %	0 %	0 %	556561551
27064	NC_022655	CTG	2	6	1645340	1645345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561551
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27091	NC_022655	AG	3	6	1647186	1647191	50 %	0 %	50 %	0 %	556561554
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27098	NC_022655	ACCA	2	8	1647723	1647730	50 %	0 %	0 %	50 %	556561555
27099	NC_022655	AGAT	2	8	1647794	1647801	50 %	25 %	25 %	0 %	556561555
27100	NC_022655	GCC	2	6	1647818	1647823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556561555
27101	NC_022655	ACC	2	6	1647951	1647956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561555
27102	NC_022655	CG	3	6	1648007	1648012	0 %	0 %	50 %	50 %	556561555
27103	NC_022655	CTT	2	6	1648030	1648035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561555
27104	NC_022655	GTC	2	6	1648097	1648102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561555
27105	NC_022655	ATC	2	6	1648235	1648240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561555
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27107	NC_022655	CCAG	2	8	1648278	1648285	25 %	0 %	25 %	50 %	556561555
27108	NC_022655	AG	3	6	1648284	1648289	50 %	0 %	50 %	0 %	556561555
27109	NC_022655	AAAT	2	8	1648310	1648317	75 %	25 %	0 %	0 %	556561555
27110	NC_022655	ACG	2	6	1648408	1648413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561555
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27112	NC_022655	GTT	2	6	1648439	1648444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561555
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27115	NC_022655	TTC	2	6	1648831	1648836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561556
27116	NC_022655	TTGCT	2	10	1648872	1648881	0 %	60 %	20 %	20 %	556561556
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27118	NC_022655	CTGA	2	8	1649117	1649124	25 %	25 %	25 %	25 %	556561556
27119	NC_022655	GCTG	2	8	1649143	1649150	0 %	25 %	50 %	25 %	556561556
27120	NC_022655	ATTGAG	2	12	1649163	1649174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561556
27121	NC_022655	ATTG	2	8	1649182	1649189	25 %	50 %	25 %	0 %	556561556
27122	NC_022655	GCCT	2	8	1649235	1649242	0 %	25 %	25 %	50 %	556561556
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27211	NC_022655	CAC	2	6	1654239	1654244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561561
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27223	NC_022655	CGAA	2	8	1655211	1655218	50 %	0 %	25 %	25 %	556561562
27224	NC_022655	CAT	2	6	1655334	1655339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561562
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27228	NC_022655	A	6	6	1655529	1655534	100 %	0 %	0 %	0 %	556561563
27229	NC_022655	A	6	6	1655571	1655576	100 %	0 %	0 %	0 %	556561563
27230	NC_022655	CTG	2	6	1655605	1655610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561563
27231	NC_022655	A	6	6	1655626	1655631	100 %	0 %	0 %	0 %	556561563
27232	NC_022655	TTA	2	6	1655935	1655940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561564
27233	NC_022655	TC	3	6	1655971	1655976	0 %	50 %	0 %	50 %	556561564
27234	NC_022655	CAG	2	6	1656029	1656034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561564
27235	NC_022655	CTC	2	6	1656041	1656046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561564
27236	NC_022655	AGTATG	2	12	1656098	1656109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561564
27237	NC_022655	TGC	2	6	1656148	1656153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561564
27238	NC_022655	GCC	2	6	1656179	1656184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556561564
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27247	NC_022655	TGG	2	6	1656603	1656608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561564
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27251	NC_022655	TGTC	2	8	1656798	1656805	0 %	50 %	25 %	25 %	556561564
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27336	NC_022655	AG	4	8	1661296	1661303	50 %	0 %	50 %	0 %	556561570
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27338	NC_022655	CTTC	2	8	1661426	1661433	0 %	50 %	0 %	50 %	556561571
27339	NC_022655	GATA	2	8	1661444	1661451	50 %	25 %	25 %	0 %	556561571
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27344	NC_022655	T	6	6	1661676	1661681	0 %	100 %	0 %	0 %	556561571
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27349	NC_022655	TTTAA	2	10	1662115	1662124	40 %	60 %	0 %	0 %	556561571
27350	NC_022655	T	7	7	1662173	1662179	0 %	100 %	0 %	0 %	556561572
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27352	NC_022655	TCT	2	6	1662586	1662591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561572
27353	NC_022655	GACA	2	8	1662815	1662822	50 %	0 %	25 %	25 %	556561572
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27465	NC_022655	AGGA	2	8	1670399	1670406	50 %	0 %	50 %	0 %	556561579
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27470	NC_022655	GGT	2	6	1670613	1670618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561579
27471	NC_022655	GTG	2	6	1670629	1670634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561579
27472	NC_022655	GAT	2	6	1670635	1670640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561579
27473	NC_022655	TCTA	2	8	1670716	1670723	25 %	50 %	0 %	25 %	556561579
27474	NC_022655	TA	3	6	1670728	1670733	50 %	50 %	0 %	0 %	556561579
27475	NC_022655	GACG	2	8	1670872	1670879	25 %	0 %	50 %	25 %	556561579
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27488	NC_022655	ATA	2	6	1674893	1674898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561581
27489	NC_022655	TTCA	2	8	1674916	1674923	25 %	50 %	0 %	25 %	556561581
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27499	NC_022655	T	6	6	1675258	1675263	0 %	100 %	0 %	0 %	556561582
27500	NC_022655	GAA	2	6	1675327	1675332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561582

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