MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_022655	CTGA	3	12	1492580	1492591	25 %	25 %	25 %	25 %	556561411
24503	NC_022655	AAAG	2	8	1492593	1492600	75 %	0 %	25 %	0 %	556561411
24504	NC_022655	CGCA	2	8	1492629	1492636	25 %	0 %	25 %	50 %	556561411
24505	NC_022655	CCA	2	6	1492684	1492689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561411
24506	NC_022655	AAT	2	6	1492698	1492703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561411
24507	NC_022655	GTTT	2	8	1492705	1492712	0 %	75 %	25 %	0 %	556561411
24508	NC_022655	GA	3	6	1493017	1493022	50 %	0 %	50 %	0 %	556561412
24509	NC_022655	CTG	2	6	1493047	1493052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561412
24510	NC_022655	TGG	2	6	1493059	1493064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561412
24511	NC_022655	TCC	2	6	1493229	1493234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561412
24512	NC_022655	AAG	2	6	1493345	1493350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561412
24513	NC_022655	T	6	6	1493352	1493357	0 %	100 %	0 %	0 %	556561412
24514	NC_022655	CGT	2	6	1493371	1493376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561412
24515	NC_022655	TCAA	2	8	1493454	1493461	50 %	25 %	0 %	25 %	556561412
24516	NC_022655	TA	3	6	1493522	1493527	50 %	50 %	0 %	0 %	556561413
24517	NC_022655	TAT	2	6	1493579	1493584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561413
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24520	NC_022655	CTT	2	6	1493657	1493662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561413
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24528	NC_022655	GGTTT	2	10	1494321	1494330	0 %	60 %	40 %	0 %	556561413
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24535	NC_022655	GCTTCT	2	12	1494790	1494801	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556561413
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24540	NC_022655	TTCT	2	8	1495020	1495027	0 %	75 %	0 %	25 %	556561413
24541	NC_022655	TAGTT	2	10	1495042	1495051	20 %	60 %	20 %	0 %	556561413
24542	NC_022655	T	7	7	1495154	1495160	0 %	100 %	0 %	0 %	556561413
24543	NC_022655	TAG	2	6	1495183	1495188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561413
24544	NC_022655	TTTC	2	8	1495256	1495263	0 %	75 %	0 %	25 %	556561413
24545	NC_022655	TAC	2	6	1495286	1495291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561413
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24554	NC_022655	T	6	6	1495830	1495835	0 %	100 %	0 %	0 %	556561414
24555	NC_022655	TCC	2	6	1495864	1495869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561414
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24557	NC_022655	GCT	2	6	1495903	1495908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561414
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24560	NC_022655	AACA	2	8	1496057	1496064	75 %	0 %	0 %	25 %	556561414
24561	NC_022655	TTGA	2	8	1496071	1496078	25 %	50 %	25 %	0 %	556561414
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24571	NC_022655	A	6	6	1496554	1496559	100 %	0 %	0 %	0 %	556561414
24572	NC_022655	ATA	2	6	1496641	1496646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561415
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24578	NC_022655	TGCATA	2	12	1497008	1497019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556561415
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24600	NC_022655	TGG	2	6	1498107	1498112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561416
24601	NC_022655	TTG	2	6	1498180	1498185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561416
24602	NC_022655	ATG	2	6	1498201	1498206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561416
24603	NC_022655	CTT	2	6	1498235	1498240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561416
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24610	NC_022655	TTTC	2	8	1498811	1498818	0 %	75 %	0 %	25 %	556561417
24611	NC_022655	TAGA	2	8	1499031	1499038	50 %	25 %	25 %	0 %	556561417
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24615	NC_022655	TGC	2	6	1499214	1499219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561417
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24617	NC_022655	TTG	2	6	1499597	1499602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561418
24618	NC_022655	ATCC	2	8	1499648	1499655	25 %	25 %	0 %	50 %	556561418
24619	NC_022655	AAT	2	6	1499669	1499674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561418
24620	NC_022655	TGC	2	6	1499683	1499688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561418
24621	NC_022655	CAAT	2	8	1499775	1499782	50 %	25 %	0 %	25 %	556561418
24622	NC_022655	TCA	2	6	1499816	1499821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561418
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24624	NC_022655	AATC	2	8	1499988	1499995	50 %	25 %	0 %	25 %	556561419
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24630	NC_022655	ATT	2	6	1500256	1500261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561419
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24729	NC_022655	AGT	2	6	1505447	1505452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561423
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24731	NC_022655	CTG	2	6	1505589	1505594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561423
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24733	NC_022655	TTTG	2	8	1505766	1505773	0 %	75 %	25 %	0 %	556561424
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24836	NC_022655	TCT	2	6	1510597	1510602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561427
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24844	NC_022655	CCCAG	2	10	1510725	1510734	20 %	0 %	20 %	60 %	556561428
24845	NC_022655	CGT	2	6	1510756	1510761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561428
24846	NC_022655	CCA	3	9	1510778	1510786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561428
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24853	NC_022655	GATTA	2	10	1511083	1511092	40 %	40 %	20 %	0 %	556561428
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24966	NC_022655	AG	3	6	1521012	1521017	50 %	0 %	50 %	0 %	556561434
24967	NC_022655	CTG	2	6	1521108	1521113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561434
24968	NC_022655	TGG	2	6	1521191	1521196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561434
24969	NC_022655	CTG	2	6	1521276	1521281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561434
24970	NC_022655	TCT	2	6	1521503	1521508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561434
24971	NC_022655	TGA	2	6	1521543	1521548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561434
24972	NC_022655	CTGA	2	8	1521565	1521572	25 %	25 %	25 %	25 %	556561434
24973	NC_022655	TCT	2	6	1521608	1521613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561434
24974	NC_022655	ATA	2	6	1521793	1521798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561434
24975	NC_022655	AGAA	2	8	1521829	1521836	75 %	0 %	25 %	0 %	556561434
24976	NC_022655	TCCAGC	2	12	1521854	1521865	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	556561434
24977	NC_022655	GGAAA	2	10	1521894	1521903	60 %	0 %	40 %	0 %	556561434
24978	NC_022655	CTG	2	6	1521954	1521959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561434
24979	NC_022655	TAA	2	6	1522028	1522033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561435
24980	NC_022655	TC	3	6	1522037	1522042	0 %	50 %	0 %	50 %	556561435
24981	NC_022655	GAG	2	6	1522057	1522062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561435
24982	NC_022655	ACC	2	6	1522067	1522072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561435
24983	NC_022655	TCCA	2	8	1522272	1522279	25 %	25 %	0 %	50 %	556561435
24984	NC_022655	CTTC	2	8	1522551	1522558	0 %	50 %	0 %	50 %	556561435
24985	NC_022655	TCA	2	6	1522619	1522624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561435
24986	NC_022655	GTT	2	6	1522668	1522673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561435
24987	NC_022655	CT	3	6	1522708	1522713	0 %	50 %	0 %	50 %	556561435
24988	NC_022655	AATC	2	8	1522737	1522744	50 %	25 %	0 %	25 %	556561435
24989	NC_022655	TCCAG	2	10	1522805	1522814	20 %	20 %	20 %	40 %	556561435
24990	NC_022655	CAT	2	6	1522956	1522961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561435
24991	NC_022655	GGCAAC	2	12	1522975	1522986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561435
24992	NC_022655	TTGG	2	8	1523102	1523109	0 %	50 %	50 %	0 %	556561435
24993	NC_022655	TCC	2	6	1523136	1523141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561436
24994	NC_022655	CCT	2	6	1523308	1523313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561436
24995	NC_022655	TTC	2	6	1523450	1523455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561436
24996	NC_022655	TCA	2	6	1523485	1523490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561436
24997	NC_022655	TCT	2	6	1523552	1523557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561436
24998	NC_022655	TGGT	2	8	1523620	1523627	0 %	50 %	50 %	0 %	556561437
24999	NC_022655	GAC	2	6	1523631	1523636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561437
25000	NC_022655	AT	3	6	1523741	1523746	50 %	50 %	0 %	0 %	556561437

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