MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_022655	CCAA	2	8	1312838	1312845	50 %	0 %	0 %	50 %	556561249
21502	NC_022655	TAA	2	6	1312992	1312997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561249
21503	NC_022655	TTC	2	6	1313006	1313011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561249
21504	NC_022655	TCA	2	6	1313060	1313065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561249
21505	NC_022655	CAGCT	2	10	1313074	1313083	20 %	20 %	20 %	40 %	556561249
21506	NC_022655	T	6	6	1313086	1313091	0 %	100 %	0 %	0 %	556561249
21507	NC_022655	TTC	2	6	1313098	1313103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561249
21508	NC_022655	AGT	2	6	1313178	1313183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561249
21509	NC_022655	AAT	2	6	1313236	1313241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561250
21510	NC_022655	T	6	6	1313250	1313255	0 %	100 %	0 %	0 %	556561250
21511	NC_022655	AAT	2	6	1313274	1313279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561250
21512	NC_022655	CCT	2	6	1313288	1313293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561250
21513	NC_022655	A	6	6	1313361	1313366	100 %	0 %	0 %	0 %	556561250
21514	NC_022655	TC	3	6	1313421	1313426	0 %	50 %	0 %	50 %	556561250
21515	NC_022655	T	7	7	1313493	1313499	0 %	100 %	0 %	0 %	556561250
21516	NC_022655	T	6	6	1313629	1313634	0 %	100 %	0 %	0 %	556561250
21517	NC_022655	CTA	2	6	1313652	1313657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561250
21518	NC_022655	TA	3	6	1313728	1313733	50 %	50 %	0 %	0 %	556561250
21519	NC_022655	TTC	2	6	1313749	1313754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561250
21520	NC_022655	T	6	6	1313792	1313797	0 %	100 %	0 %	0 %	556561250
21521	NC_022655	AGG	3	9	1313863	1313871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561250
21522	NC_022655	CTTT	2	8	1313940	1313947	0 %	75 %	0 %	25 %	556561250
21523	NC_022655	AG	3	6	1313965	1313970	50 %	0 %	50 %	0 %	556561250
21524	NC_022655	CTT	2	6	1314287	1314292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561954
21525	NC_022655	TCC	2	6	1314337	1314342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561954
21526	NC_022655	ATC	2	6	1314569	1314574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561251
21527	NC_022655	TGG	2	6	1314633	1314638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561251
21528	NC_022655	T	6	6	1314646	1314651	0 %	100 %	0 %	0 %	556561251
21529	NC_022655	T	6	6	1314659	1314664	0 %	100 %	0 %	0 %	556561251
21530	NC_022655	CGC	2	6	1314718	1314723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556561251
21531	NC_022655	TTG	2	6	1314838	1314843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561251
21532	NC_022655	AGG	2	6	1314846	1314851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561251
21533	NC_022655	GCTT	2	8	1314855	1314862	0 %	50 %	25 %	25 %	556561251
21534	NC_022655	TTTC	2	8	1314883	1314890	0 %	75 %	0 %	25 %	556561251
21535	NC_022655	GCAA	2	8	1315019	1315026	50 %	0 %	25 %	25 %	556561251
21536	NC_022655	ATC	2	6	1315067	1315072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561251
21537	NC_022655	A	6	6	1315250	1315255	100 %	0 %	0 %	0 %	556561251
21538	NC_022655	TAC	2	6	1315264	1315269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561251
21539	NC_022655	TCCC	2	8	1315318	1315325	0 %	25 %	0 %	75 %	556561251
21540	NC_022655	CT	3	6	1315379	1315384	0 %	50 %	0 %	50 %	556561251
21541	NC_022655	CGT	2	6	1315411	1315416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561251
21542	NC_022655	AAG	2	6	1315439	1315444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561251
21543	NC_022655	TC	3	6	1315468	1315473	0 %	50 %	0 %	50 %	556561251
21544	NC_022655	TCA	2	6	1315547	1315552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561251
21545	NC_022655	AGG	2	6	1315562	1315567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561251
21546	NC_022655	T	6	6	1315570	1315575	0 %	100 %	0 %	0 %	556561251
21547	NC_022655	ATG	3	9	1315621	1315629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561251
21548	NC_022655	TTC	2	6	1315721	1315726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561251
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21550	NC_022655	ACC	2	6	1315863	1315868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561251
21551	NC_022655	GAA	2	6	1315871	1315876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561251
21552	NC_022655	CGT	2	6	1315880	1315885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561251
21553	NC_022655	ATG	2	6	1315888	1315893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561251
21554	NC_022655	GTA	2	6	1316424	1316429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561252
21555	NC_022655	TCAAC	2	10	1316455	1316464	40 %	20 %	0 %	40 %	556561252
21556	NC_022655	CTG	2	6	1316506	1316511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561252
21557	NC_022655	AGT	2	6	1316537	1316542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561252
21558	NC_022655	GTT	2	6	1316567	1316572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561252
21559	NC_022655	GAA	2	6	1316573	1316578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561252
21560	NC_022655	CTT	3	9	1316596	1316604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561252
21561	NC_022655	GT	3	6	1316637	1316642	0 %	50 %	50 %	0 %	556561252
21562	NC_022655	TTGA	2	8	1316646	1316653	25 %	50 %	25 %	0 %	556561252
21563	NC_022655	TCA	2	6	1316688	1316693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561252
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21568	NC_022655	CAA	2	6	1316809	1316814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561252
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21570	NC_022655	GAA	2	6	1316908	1316913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561252
21571	NC_022655	GTTCTG	2	12	1316935	1316946	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556561252
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21575	NC_022655	GTC	2	6	1317119	1317124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561252
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21579	NC_022655	CGCGTT	2	12	1317370	1317381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561252
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21582	NC_022655	TGA	2	6	1317428	1317433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561252
21583	NC_022655	TAC	2	6	1317529	1317534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561252
21584	NC_022655	TGC	3	9	1318506	1318514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561253
21585	NC_022655	CTA	2	6	1318523	1318528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561253
21586	NC_022655	ACC	2	6	1318544	1318549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561253
21587	NC_022655	GGAA	2	8	1318588	1318595	50 %	0 %	50 %	0 %	556561253
21588	NC_022655	TCC	2	6	1318653	1318658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561253
21589	NC_022655	GT	3	6	1318726	1318731	0 %	50 %	50 %	0 %	556561253
21590	NC_022655	AAG	2	6	1318828	1318833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561253
21591	NC_022655	AACAA	2	10	1318861	1318870	80 %	0 %	0 %	20 %	556561253
21592	NC_022655	CAA	2	6	1318877	1318882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561253
21593	NC_022655	TGC	2	6	1318908	1318913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561253
21594	NC_022655	CTTT	2	8	1318921	1318928	0 %	75 %	0 %	25 %	556561253
21595	NC_022655	CCATA	2	10	1319183	1319192	40 %	20 %	0 %	40 %	556561253
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21598	NC_022655	TCT	2	6	1319569	1319574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561254
21599	NC_022655	T	6	6	1319574	1319579	0 %	100 %	0 %	0 %	556561254
21600	NC_022655	GAA	2	6	1319583	1319588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561254
21601	NC_022655	CT	4	8	1319673	1319680	0 %	50 %	0 %	50 %	556561254
21602	NC_022655	CTT	2	6	1319825	1319830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561254
21603	NC_022655	TGT	2	6	1319904	1319909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561254
21604	NC_022655	AAC	2	6	1319979	1319984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561254
21605	NC_022655	TCT	2	6	1319986	1319991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561254
21606	NC_022655	AATG	2	8	1320023	1320030	50 %	25 %	25 %	0 %	556561254
21607	NC_022655	AGT	2	6	1321294	1321299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561255
21608	NC_022655	TCA	2	6	1321312	1321317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561255
21609	NC_022655	CTTTAG	2	12	1321319	1321330	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	556561255
21610	NC_022655	AGC	2	6	1321332	1321337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561255
21611	NC_022655	ATT	2	6	1321392	1321397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561255
21612	NC_022655	TTC	2	6	1321441	1321446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561255
21613	NC_022655	TTA	2	6	1321462	1321467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561255
21614	NC_022655	T	6	6	1321521	1321526	0 %	100 %	0 %	0 %	556561256
21615	NC_022655	TGCTTC	2	12	1321539	1321550	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556561256
21616	NC_022655	TTG	2	6	1321569	1321574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561256
21617	NC_022655	T	7	7	1321588	1321594	0 %	100 %	0 %	0 %	556561256
21618	NC_022655	T	6	6	1321617	1321622	0 %	100 %	0 %	0 %	556561256
21619	NC_022655	A	6	6	1321670	1321675	100 %	0 %	0 %	0 %	556561256
21620	NC_022655	TTG	2	6	1321685	1321690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561256
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21625	NC_022655	TAT	2	6	1322699	1322704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561257
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21727	NC_022655	ATA	2	6	1328822	1328827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561263
21728	NC_022655	AAT	2	6	1328953	1328958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561263
21729	NC_022655	ATA	2	6	1329004	1329009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561263
21730	NC_022655	AAGGCA	2	12	1329101	1329112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	556561263
21731	NC_022655	AAAT	2	8	1329205	1329212	75 %	25 %	0 %	0 %	556561263
21732	NC_022655	CCT	2	6	1329226	1329231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561263
21733	NC_022655	TAT	2	6	1329247	1329252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561263
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21735	NC_022655	CAT	2	6	1329397	1329402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561264
21736	NC_022655	TAAG	2	8	1329416	1329423	50 %	25 %	25 %	0 %	556561264
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21738	NC_022655	AGAT	2	8	1329471	1329478	50 %	25 %	25 %	0 %	556561264
21739	NC_022655	ATC	2	6	1329582	1329587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561264
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21844	NC_022655	TCT	2	6	1335518	1335523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561269
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