MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19618	NC_022655	CTCAT	2	10	1198642	1198651	20 %	40 %	0 %	40 %	556561147
19619	NC_022655	TCC	2	6	1198789	1198794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561147
19620	NC_022655	CTT	2	6	1198817	1198822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561147
19621	NC_022655	ATT	2	6	1198848	1198853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561147
19622	NC_022655	AGT	2	6	1198887	1198892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561147
19623	NC_022655	CGA	2	6	1198895	1198900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561147
19624	NC_022655	AAAT	2	8	1198992	1198999	75 %	25 %	0 %	0 %	556561147
19625	NC_022655	TTC	2	6	1199028	1199033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561147
19626	NC_022655	AGCA	2	8	1199061	1199068	50 %	0 %	25 %	25 %	556561147
19627	NC_022655	TCT	2	6	1199078	1199083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561147
19628	NC_022655	CAT	2	6	1199153	1199158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561147
19629	NC_022655	TCA	2	6	1199176	1199181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561147
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19632	NC_022655	GCTT	2	8	1199446	1199453	0 %	50 %	25 %	25 %	556561147
19633	NC_022655	TAC	2	6	1199495	1199500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561147
19634	NC_022655	TTA	2	6	1199506	1199511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561147
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19638	NC_022655	AAC	2	6	1199736	1199741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561147
19639	NC_022655	ATC	2	6	1199751	1199756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561147
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19641	NC_022655	CT	3	6	1199853	1199858	0 %	50 %	0 %	50 %	556561147
19642	NC_022655	CTC	2	6	1199862	1199867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561147
19643	NC_022655	CTG	2	6	1199870	1199875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561147
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19645	NC_022655	GAT	2	6	1200140	1200145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561147
19646	NC_022655	TA	3	6	1200180	1200185	50 %	50 %	0 %	0 %	556561147
19647	NC_022655	TCC	2	6	1200247	1200252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561147
19648	NC_022655	TCA	2	6	1200311	1200316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561147
19649	NC_022655	CTG	2	6	1200318	1200323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561147
19650	NC_022655	TAGA	2	8	1200335	1200342	50 %	25 %	25 %	0 %	556561147
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19653	NC_022655	CAT	2	6	1200471	1200476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561147
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19655	NC_022655	TCGA	2	8	1200523	1200530	25 %	25 %	25 %	25 %	556561147
19656	NC_022655	A	7	7	1200990	1200996	100 %	0 %	0 %	0 %	556561148
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19660	NC_022655	CTG	2	6	1201126	1201131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561148
19661	NC_022655	T	6	6	1201135	1201140	0 %	100 %	0 %	0 %	556561148
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19680	NC_022655	GGT	2	6	1202101	1202106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561148
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19683	NC_022655	AAG	2	6	1202618	1202623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561148
19684	NC_022655	GCTCA	2	10	1202773	1202782	20 %	20 %	20 %	40 %	556561148
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19706	NC_022655	AGT	2	6	1204316	1204321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561151
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19710	NC_022655	CT	3	6	1204480	1204485	0 %	50 %	0 %	50 %	556561151
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19714	NC_022655	TAT	2	6	1204620	1204625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561151
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19720	NC_022655	CTT	2	6	1204854	1204859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561151
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19723	NC_022655	CTC	2	6	1205033	1205038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561151
19724	NC_022655	CATCT	2	10	1205041	1205050	20 %	40 %	0 %	40 %	556561151
19725	NC_022655	TCA	2	6	1205060	1205065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561151
19726	NC_022655	GA	4	8	1205076	1205083	50 %	0 %	50 %	0 %	556561151
19727	NC_022655	T	7	7	1205084	1205090	0 %	100 %	0 %	0 %	556561151
19728	NC_022655	CAG	2	6	1205109	1205114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561151
19729	NC_022655	CT	3	6	1205198	1205203	0 %	50 %	0 %	50 %	556561151
19730	NC_022655	GCT	2	6	1205229	1205234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561151
19731	NC_022655	TCT	2	6	1205258	1205263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561151
19732	NC_022655	TAAA	2	8	1205310	1205317	75 %	25 %	0 %	0 %	556561151
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19734	NC_022655	AAT	2	6	1205373	1205378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561151
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19851	NC_022655	ATC	2	6	1211811	1211816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561156
19852	NC_022655	TGT	2	6	1211817	1211822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561156
19853	NC_022655	TAA	2	6	1211878	1211883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561156
19854	NC_022655	TAA	2	6	1211924	1211929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561156
19855	NC_022655	TTA	2	6	1211944	1211949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561156
19856	NC_022655	CTG	2	6	1211961	1211966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561156
19857	NC_022655	T	6	6	1211968	1211973	0 %	100 %	0 %	0 %	556561156
19858	NC_022655	CTA	2	6	1211978	1211983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561156
19859	NC_022655	GAT	2	6	1211984	1211989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561156
19860	NC_022655	CT	4	8	1211998	1212005	0 %	50 %	0 %	50 %	556561156
19861	NC_022655	ATT	2	6	1212024	1212029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561156
19862	NC_022655	T	6	6	1212254	1212259	0 %	100 %	0 %	0 %	556561157
19863	NC_022655	AC	3	6	1212289	1212294	50 %	0 %	0 %	50 %	556561157
19864	NC_022655	CTT	2	6	1212305	1212310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561157
19865	NC_022655	GAA	2	6	1212363	1212368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561157
19866	NC_022655	ATTAGC	2	12	1212381	1212392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	556561157
19867	NC_022655	CTT	2	6	1212402	1212407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561157
19868	NC_022655	TTG	2	6	1212446	1212451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561157
19869	NC_022655	AGA	2	6	1212510	1212515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561157
19870	NC_022655	ATTT	2	8	1212567	1212574	25 %	75 %	0 %	0 %	556561157
19871	NC_022655	T	6	6	1212572	1212577	0 %	100 %	0 %	0 %	556561157
19872	NC_022655	AGAT	2	8	1212595	1212602	50 %	25 %	25 %	0 %	556561157
19873	NC_022655	CCA	2	6	1212613	1212618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561158
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19875	NC_022655	CAT	2	6	1212676	1212681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561158
19876	NC_022655	CTG	2	6	1212698	1212703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561158
19877	NC_022655	TTC	2	6	1212710	1212715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561158
19878	NC_022655	CAC	2	6	1212733	1212738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561158
19879	NC_022655	TAC	2	6	1212833	1212838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561158
19880	NC_022655	TTC	2	6	1212929	1212934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561159
19881	NC_022655	TTC	2	6	1212946	1212951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561159
19882	NC_022655	G	6	6	1213028	1213033	0 %	0 %	100 %	0 %	556561159
19883	NC_022655	T	8	8	1213047	1213054	0 %	100 %	0 %	0 %	556561159
19884	NC_022655	ATT	3	9	1213108	1213116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561159
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19887	NC_022655	GTA	2	6	1213222	1213227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561159
19888	NC_022655	TTG	2	6	1213251	1213256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561159
19889	NC_022655	CTC	2	6	1213387	1213392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561159
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19893	NC_022655	TTA	2	6	1213607	1213612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561159
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19895	NC_022655	AT	3	6	1213719	1213724	50 %	50 %	0 %	0 %	556561159
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19898	NC_022655	CCAT	2	8	1213820	1213827	25 %	25 %	0 %	50 %	556561159
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19903	NC_022655	AGCCA	2	10	1214059	1214068	40 %	0 %	20 %	40 %	556561160
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19905	NC_022655	AATCAT	2	12	1214172	1214183	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	556561160
19906	NC_022655	AAAG	2	8	1214209	1214216	75 %	0 %	25 %	0 %	556561160
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19910	NC_022655	ATC	2	6	1214311	1214316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561160
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19913	NC_022655	CTG	2	6	1214541	1214546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561160
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19928	NC_022655	GAT	2	6	1214986	1214991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561160
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19937	NC_022655	ATC	2	6	1216064	1216069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561161
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19939	NC_022655	CTG	2	6	1216165	1216170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561161
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19944	NC_022655	ATA	2	6	1216501	1216506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561161
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19950	NC_022655	TTTC	2	8	1216767	1216774	0 %	75 %	0 %	25 %	556561161
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19952	NC_022655	TTC	2	6	1216850	1216855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561161
19953	NC_022655	TTA	2	6	1217132	1217137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561161
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19957	NC_022655	CGA	2	6	1218120	1218125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561162
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19959	NC_022655	ATC	2	6	1218174	1218179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561162
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19961	NC_022655	CTT	2	6	1218257	1218262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561162
19962	NC_022655	A	6	6	1218284	1218289	100 %	0 %	0 %	0 %	556561162
19963	NC_022655	CCT	2	6	1218346	1218351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561162
19964	NC_022655	ACC	2	6	1218424	1218429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561162
19965	NC_022655	ACC	2	6	1218462	1218467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561162
19966	NC_022655	CTG	2	6	1218471	1218476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561162
19967	NC_022655	TCAT	2	8	1218517	1218524	25 %	50 %	0 %	25 %	556561162
19968	NC_022655	CAT	2	6	1218536	1218541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561162
19969	NC_022655	A	6	6	1218638	1218643	100 %	0 %	0 %	0 %	556561162
19970	NC_022655	ACA	2	6	1218667	1218672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561162
19971	NC_022655	GAA	3	9	1218710	1218718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561162
19972	NC_022655	GATT	2	8	1218790	1218797	25 %	50 %	25 %	0 %	556561162
19973	NC_022655	ATCA	2	8	1218950	1218957	50 %	25 %	0 %	25 %	556561163
19974	NC_022655	TCA	2	6	1218960	1218965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561163
19975	NC_022655	GCTC	2	8	1219020	1219027	0 %	25 %	25 %	50 %	556561163
19976	NC_022655	ACA	2	6	1219118	1219123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561163
19977	NC_022655	ATG	2	6	1219215	1219220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561163
19978	NC_022655	TGGC	2	8	1219266	1219273	0 %	25 %	50 %	25 %	556561163
19979	NC_022655	TGA	2	6	1219297	1219302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561163
19980	NC_022655	AACCA	2	10	1219304	1219313	60 %	0 %	0 %	40 %	556561163
19981	NC_022655	CAT	2	6	1219346	1219351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561163
19982	NC_022655	CGA	2	6	1219356	1219361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561163
19983	NC_022655	TCA	2	6	1219369	1219374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561163
19984	NC_022655	GCTTTG	2	12	1219389	1219400	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556561163
19985	NC_022655	TGG	2	6	1219514	1219519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561163
19986	NC_022655	ACA	2	6	1219600	1219605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561163
19987	NC_022655	ACC	2	6	1219640	1219645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561163
19988	NC_022655	AAGA	2	8	1219666	1219673	75 %	0 %	25 %	0 %	556561163
19989	NC_022655	GCT	2	6	1219677	1219682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561163
19990	NC_022655	CCTT	2	8	1219845	1219852	0 %	50 %	0 %	50 %	556561163
19991	NC_022655	AGA	2	6	1219880	1219885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561163
19992	NC_022655	GA	3	6	1219955	1219960	50 %	0 %	50 %	0 %	556561163
19993	NC_022655	CTG	2	6	1219969	1219974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561163
19994	NC_022655	CTG	2	6	1220017	1220022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561163
19995	NC_022655	TAGA	2	8	1220040	1220047	50 %	25 %	25 %	0 %	556561163
19996	NC_022655	ATT	2	6	1220063	1220068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561163
19997	NC_022655	TGA	2	6	1220080	1220085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561163
19998	NC_022655	GTT	2	6	1220342	1220347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561164
19999	NC_022655	AGA	2	6	1220477	1220482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561164
20000	NC_022655	CCA	2	6	1220621	1220626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561164

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