MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022655	TCA	2	6	1128300	1128305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561076
18502	NC_022655	CG	3	6	1128308	1128313	0 %	0 %	50 %	50 %	556561076
18503	NC_022655	ACG	2	6	1128331	1128336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561076
18504	NC_022655	AAG	2	6	1128388	1128393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561076
18505	NC_022655	TA	3	6	1128412	1128417	50 %	50 %	0 %	0 %	556561076
18506	NC_022655	ACG	3	9	1128502	1128510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561076
18507	NC_022655	AGC	2	6	1128622	1128627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561076
18508	NC_022655	CGA	2	6	1128720	1128725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561076
18509	NC_022655	TTTC	2	8	1128785	1128792	0 %	75 %	0 %	25 %	556561077
18510	NC_022655	T	6	6	1128794	1128799	0 %	100 %	0 %	0 %	556561077
18511	NC_022655	CTT	2	6	1128800	1128805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561077
18512	NC_022655	CTTC	2	8	1128859	1128866	0 %	50 %	0 %	50 %	556561077
18513	NC_022655	ACG	2	6	1128875	1128880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18514	NC_022655	TC	3	6	1128970	1128975	0 %	50 %	0 %	50 %	556561077
18515	NC_022655	ACGGAT	2	12	1129001	1129012	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556561077
18516	NC_022655	CTG	2	6	1129013	1129018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18517	NC_022655	CAT	2	6	1129177	1129182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561077
18518	NC_022655	TTC	2	6	1129199	1129204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561077
18519	NC_022655	ACG	2	6	1129256	1129261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18520	NC_022655	AAG	2	6	1129361	1129366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561077
18521	NC_022655	ACG	2	6	1129376	1129381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18522	NC_022655	CAG	2	6	1129411	1129416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18523	NC_022655	CTG	2	6	1129457	1129462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18524	NC_022655	GAA	2	6	1129471	1129476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561077
18525	NC_022655	CAT	2	6	1129478	1129483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561077
18526	NC_022655	ATG	2	6	1129524	1129529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561077
18527	NC_022655	CCT	2	6	1129540	1129545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561077
18528	NC_022655	CTC	2	6	1129631	1129636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561077
18529	NC_022655	ATC	2	6	1129719	1129724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561077
18530	NC_022655	GAA	2	6	1129747	1129752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561077
18531	NC_022655	TTC	2	6	1129910	1129915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561077
18532	NC_022655	ATA	2	6	1130025	1130030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561077
18533	NC_022655	GA	3	6	1130063	1130068	50 %	0 %	50 %	0 %	556561077
18534	NC_022655	CAC	2	6	1130105	1130110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561077
18535	NC_022655	ATA	2	6	1130180	1130185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561077
18536	NC_022655	GAC	2	6	1130314	1130319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18537	NC_022655	ACA	2	6	1130370	1130375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561077
18538	NC_022655	CAC	2	6	1130453	1130458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561077
18539	NC_022655	CTTG	2	8	1130492	1130499	0 %	50 %	25 %	25 %	556561077
18540	NC_022655	T	6	6	1130589	1130594	0 %	100 %	0 %	0 %	556561077
18541	NC_022655	TGT	2	6	1130654	1130659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561077
18542	NC_022655	AAT	2	6	1130681	1130686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561077
18543	NC_022655	CTG	3	9	1130695	1130703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18544	NC_022655	CAT	2	6	1130773	1130778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561077
18545	NC_022655	GTC	2	6	1130795	1130800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561077
18546	NC_022655	CAAAAC	2	12	1130821	1130832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561077
18547	NC_022655	T	6	6	1130876	1130881	0 %	100 %	0 %	0 %	556561077
18548	NC_022655	TCT	2	6	1130907	1130912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561077
18549	NC_022655	CTTT	2	8	1130930	1130937	0 %	75 %	0 %	25 %	556561077
18550	NC_022655	CTTGT	2	10	1131029	1131038	0 %	60 %	20 %	20 %	556561077
18551	NC_022655	ATA	2	6	1131177	1131182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561078
18552	NC_022655	CAAA	2	8	1131276	1131283	75 %	0 %	0 %	25 %	556561078
18553	NC_022655	TGGT	2	8	1131324	1131331	0 %	50 %	50 %	0 %	556561078
18554	NC_022655	CAATCA	2	12	1131345	1131356	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	556561078
18555	NC_022655	ATA	2	6	1131363	1131368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561078
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18557	NC_022655	TAA	2	6	1131382	1131387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561078
18558	NC_022655	TTTC	2	8	1131467	1131474	0 %	75 %	0 %	25 %	556561079
18559	NC_022655	TAA	2	6	1131606	1131611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561080
18560	NC_022655	CAA	2	6	1131725	1131730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561080
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18562	NC_022655	GAT	2	6	1131909	1131914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561080
18563	NC_022655	GAT	2	6	1131947	1131952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561080
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18566	NC_022655	TCTG	2	8	1132051	1132058	0 %	50 %	25 %	25 %	556561080
18567	NC_022655	CGAT	2	8	1132094	1132101	25 %	25 %	25 %	25 %	556561080
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18569	NC_022655	TTG	2	6	1132184	1132189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561080
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18572	NC_022655	AAT	2	6	1132303	1132308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561080
18573	NC_022655	CCA	2	6	1132321	1132326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561080
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18577	NC_022655	CCTC	2	8	1132796	1132803	0 %	25 %	0 %	75 %	556561081
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18582	NC_022655	TCTT	2	8	1132874	1132881	0 %	75 %	0 %	25 %	556561081
18583	NC_022655	T	7	7	1132880	1132886	0 %	100 %	0 %	0 %	556561081
18584	NC_022655	ACCA	2	8	1132985	1132992	50 %	0 %	0 %	50 %	556561081
18585	NC_022655	GAA	2	6	1133047	1133052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561081
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18587	NC_022655	TC	3	6	1133078	1133083	0 %	50 %	0 %	50 %	556561081
18588	NC_022655	CTAG	2	8	1133165	1133172	25 %	25 %	25 %	25 %	556561081
18589	NC_022655	GAC	2	6	1133244	1133249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561081
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18591	NC_022655	ACT	2	6	1133291	1133296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561081
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18596	NC_022655	TGA	2	6	1133491	1133496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561082
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18598	NC_022655	TGGTC	2	10	1133588	1133597	0 %	40 %	40 %	20 %	556561082
18599	NC_022655	CTT	2	6	1133612	1133617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561082
18600	NC_022655	CTG	2	6	1133618	1133623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561082
18601	NC_022655	GGTCT	2	10	1133709	1133718	0 %	40 %	40 %	20 %	556561082
18602	NC_022655	T	6	6	1133811	1133816	0 %	100 %	0 %	0 %	556561082
18603	NC_022655	CCA	2	6	1133899	1133904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561082
18604	NC_022655	GAAA	2	8	1133915	1133922	75 %	0 %	25 %	0 %	556561082
18605	NC_022655	TGTC	2	8	1134005	1134012	0 %	50 %	25 %	25 %	556561082
18606	NC_022655	A	6	6	1134017	1134022	100 %	0 %	0 %	0 %	556561082
18607	NC_022655	ACG	2	6	1134036	1134041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561082
18608	NC_022655	ATC	2	6	1134103	1134108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561082
18609	NC_022655	TCT	2	6	1134137	1134142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561082
18610	NC_022655	CTTGAC	2	12	1134315	1134326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556561083
18611	NC_022655	ACG	2	6	1134372	1134377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561083
18612	NC_022655	GAT	2	6	1134420	1134425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561083
18613	NC_022655	ATG	2	6	1134454	1134459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561083
18614	NC_022655	TGTC	2	8	1134479	1134486	0 %	50 %	25 %	25 %	556561083
18615	NC_022655	CAA	2	6	1134509	1134514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561083
18616	NC_022655	TCA	2	6	1134742	1134747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561083
18617	NC_022655	CAC	2	6	1134792	1134797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561083
18618	NC_022655	AAT	2	6	1134834	1134839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561083
18619	NC_022655	TCA	2	6	1134865	1134870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561083
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18645	NC_022655	CTTC	2	8	1136855	1136862	0 %	50 %	0 %	50 %	556561086
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18731	NC_022655	ATA	2	6	1140874	1140879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561088
18732	NC_022655	AAT	2	6	1140948	1140953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561088
18733	NC_022655	TCCCA	2	10	1141120	1141129	20 %	20 %	0 %	60 %	556561089
18734	NC_022655	ATC	2	6	1141171	1141176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561089
18735	NC_022655	TGAT	2	8	1141184	1141191	25 %	50 %	25 %	0 %	556561089
18736	NC_022655	TCA	2	6	1141197	1141202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561089
18737	NC_022655	AAC	2	6	1141258	1141263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561089
18738	NC_022655	CAT	2	6	1141293	1141298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561089
18739	NC_022655	TTA	2	6	1141358	1141363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561089
18740	NC_022655	ACT	2	6	1141382	1141387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561089
18741	NC_022655	CAAG	2	8	1141422	1141429	50 %	0 %	25 %	25 %	556561089
18742	NC_022655	CAC	2	6	1141446	1141451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561089
18743	NC_022655	CAA	2	6	1141452	1141457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561089
18744	NC_022655	TCA	2	6	1141475	1141480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561089
18745	NC_022655	CATCA	2	10	1141516	1141525	40 %	20 %	0 %	40 %	556561089
18746	NC_022655	A	6	6	1141551	1141556	100 %	0 %	0 %	0 %	556561089
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18748	NC_022655	GAA	2	6	1141674	1141679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561089
18749	NC_022655	ACC	2	6	1141760	1141765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561089
18750	NC_022655	CTT	2	6	1141798	1141803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561089
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18752	NC_022655	TGA	2	6	1142189	1142194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561090
18753	NC_022655	ACCA	2	8	1142242	1142249	50 %	0 %	0 %	50 %	556561090
18754	NC_022655	CAACTC	2	12	1142278	1142289	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	556561090
18755	NC_022655	ATC	2	6	1142293	1142298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561090
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18757	NC_022655	GT	3	6	1142426	1142431	0 %	50 %	50 %	0 %	556561090
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18759	NC_022655	GTT	2	6	1142502	1142507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561091
18760	NC_022655	AGCA	2	8	1142578	1142585	50 %	0 %	25 %	25 %	556561091
18761	NC_022655	GCC	2	6	1142660	1142665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556561091
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18764	NC_022655	TAG	2	6	1142732	1142737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561091
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18767	NC_022655	GAC	2	6	1142991	1142996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561092
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18771	NC_022655	T	6	6	1143102	1143107	0 %	100 %	0 %	0 %	556561092
18772	NC_022655	ATT	2	6	1143149	1143154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561093
18773	NC_022655	T	6	6	1143153	1143158	0 %	100 %	0 %	0 %	556561093
18774	NC_022655	TCCA	2	8	1143195	1143202	25 %	25 %	0 %	50 %	556561093
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18797	NC_022655	AAT	2	6	1144611	1144616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561094
18798	NC_022655	GAT	2	6	1144638	1144643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561094
18799	NC_022655	TTC	2	6	1144807	1144812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561094
18800	NC_022655	TAG	2	6	1144834	1144839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561094
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18802	NC_022655	TAA	2	6	1144863	1144868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561094
18803	NC_022655	T	7	7	1144900	1144906	0 %	100 %	0 %	0 %	556561094
18804	NC_022655	ATT	2	6	1144917	1144922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561094
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18806	NC_022655	TTCATT	2	12	1144977	1144988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	556561094
18807	NC_022655	TG	3	6	1145039	1145044	0 %	50 %	50 %	0 %	556561094
18808	NC_022655	TAAA	2	8	1145064	1145071	75 %	25 %	0 %	0 %	556561094
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18810	NC_022655	TAAAC	2	10	1145168	1145177	60 %	20 %	0 %	20 %	556561094
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18815	NC_022655	ATA	2	6	1145313	1145318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561095
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18819	NC_022655	TCCA	2	8	1145538	1145545	25 %	25 %	0 %	50 %	556561095
18820	NC_022655	ATA	2	6	1145562	1145567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561095
18821	NC_022655	AGG	2	6	1145577	1145582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561095
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18823	NC_022655	GTC	2	6	1145638	1145643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561095
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18826	NC_022655	CAG	2	6	1145980	1145985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561096
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18828	NC_022655	TGA	2	6	1146353	1146358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561097
18829	NC_022655	T	6	6	1146359	1146364	0 %	100 %	0 %	0 %	556561097
18830	NC_022655	TC	3	6	1146430	1146435	0 %	50 %	0 %	50 %	556561097
18831	NC_022655	TCC	2	6	1146441	1146446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561097
18832	NC_022655	ATC	2	6	1146503	1146508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561097
18833	NC_022655	TCC	2	6	1146512	1146517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561097
18834	NC_022655	TAC	2	6	1146589	1146594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561097
18835	NC_022655	TTTG	2	8	1146600	1146607	0 %	75 %	25 %	0 %	556561097
18836	NC_022655	TGCTTC	2	12	1146633	1146644	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	556561097
18837	NC_022655	CTC	2	6	1146760	1146765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561097
18838	NC_022655	GTC	2	6	1146807	1146812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561097
18839	NC_022655	ACC	2	6	1146857	1146862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561097
18840	NC_022655	AAT	2	6	1147127	1147132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561097
18841	NC_022655	GAAAG	2	10	1147180	1147189	60 %	0 %	40 %	0 %	556561097
18842	NC_022655	AAATA	2	10	1147193	1147202	80 %	20 %	0 %	0 %	556561097
18843	NC_022655	AAG	2	6	1147215	1147220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561097
18844	NC_022655	GTCAA	2	10	1147221	1147230	40 %	20 %	20 %	20 %	556561097
18845	NC_022655	CCCCT	2	10	1147352	1147361	0 %	20 %	0 %	80 %	556561097
18846	NC_022655	TGGTCA	2	12	1147369	1147380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	556561097
18847	NC_022655	CTC	2	6	1147408	1147413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561097
18848	NC_022655	CTG	2	6	1147414	1147419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561097
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18968	NC_022655	AGA	2	6	1156161	1156166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561106
18969	NC_022655	GTT	2	6	1156173	1156178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561106
18970	NC_022655	AAG	2	6	1156201	1156206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561106
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18972	NC_022655	GTC	2	6	1156426	1156431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561106
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18975	NC_022655	CTTG	2	8	1156599	1156606	0 %	50 %	25 %	25 %	556561106
18976	NC_022655	GCT	2	6	1156628	1156633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561106
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18980	NC_022655	TAA	2	6	1156800	1156805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561106
18981	NC_022655	TCA	2	6	1156829	1156834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561106
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18992	NC_022655	GCA	2	6	1157417	1157422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561952
18993	NC_022655	GTA	2	6	1157446	1157451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561952
18994	NC_022655	TTC	2	6	1157480	1157485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561952
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18996	NC_022655	TCA	2	6	1158280	1158285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561107
18997	NC_022655	ACAT	2	8	1158290	1158297	50 %	25 %	0 %	25 %	556561107
18998	NC_022655	ACG	2	6	1158363	1158368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561107
18999	NC_022655	TCT	2	6	1158469	1158474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561107
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