MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022655	GCT	2	6	1062605	1062610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561028
17502	NC_022655	ATG	2	6	1062662	1062667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561028
17503	NC_022655	CAATC	2	10	1062736	1062745	40 %	20 %	0 %	40 %	556561028
17504	NC_022655	GAAG	2	8	1062746	1062753	50 %	0 %	50 %	0 %	556561028
17505	NC_022655	ATCT	2	8	1062777	1062784	25 %	50 %	0 %	25 %	556561028
17506	NC_022655	TAGTT	2	10	1062928	1062937	20 %	60 %	20 %	0 %	556561028
17507	NC_022655	CAA	2	6	1063737	1063742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561029
17508	NC_022655	AAG	2	6	1063870	1063875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561029
17509	NC_022655	TTGG	2	8	1063926	1063933	0 %	50 %	50 %	0 %	556561029
17510	NC_022655	TGG	2	6	1064048	1064053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561029
17511	NC_022655	ATG	2	6	1064065	1064070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561029
17512	NC_022655	TGC	2	6	1064084	1064089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561029
17513	NC_022655	TTA	2	6	1064151	1064156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561029
17514	NC_022655	TCA	2	6	1064249	1064254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561029
17515	NC_022655	AGGAGC	2	12	1064372	1064383	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	556561029
17516	NC_022655	TGG	2	6	1064399	1064404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561029
17517	NC_022655	TG	3	6	1064407	1064412	0 %	50 %	50 %	0 %	556561029
17518	NC_022655	GTT	3	9	1064499	1064507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561029
17519	NC_022655	GAAG	2	8	1064511	1064518	50 %	0 %	50 %	0 %	556561029
17520	NC_022655	AGA	2	6	1064687	1064692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561029
17521	NC_022655	TTA	2	6	1064748	1064753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561029
17522	NC_022655	TTC	2	6	1064781	1064786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561030
17523	NC_022655	TTC	2	6	1064807	1064812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561030
17524	NC_022655	TCT	2	6	1064859	1064864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561030
17525	NC_022655	TGG	2	6	1064932	1064937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561030
17526	NC_022655	CTT	2	6	1064959	1064964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561030
17527	NC_022655	ATAA	2	8	1065051	1065058	75 %	25 %	0 %	0 %	556561030
17528	NC_022655	ATTT	2	8	1065158	1065165	25 %	75 %	0 %	0 %	556561030
17529	NC_022655	CCA	2	6	1065171	1065176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561030
17530	NC_022655	A	6	6	1065373	1065378	100 %	0 %	0 %	0 %	556561031
17531	NC_022655	ATT	2	6	1065384	1065389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561031
17532	NC_022655	GGT	2	6	1065555	1065560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561031
17533	NC_022655	ACA	2	6	1065592	1065597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561031
17534	NC_022655	CAA	2	6	1065636	1065641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561031
17535	NC_022655	GT	3	6	1065715	1065720	0 %	50 %	50 %	0 %	556561031
17536	NC_022655	TGC	3	9	1065737	1065745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561031
17537	NC_022655	TGG	2	6	1065779	1065784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561031
17538	NC_022655	TTC	2	6	1065799	1065804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561031
17539	NC_022655	ATG	2	6	1065813	1065818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561031
17540	NC_022655	CAT	2	6	1065821	1065826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561031
17541	NC_022655	GGT	2	6	1065831	1065836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561031
17542	NC_022655	AAG	2	6	1065904	1065909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561031
17543	NC_022655	CTC	2	6	1066003	1066008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561031
17544	NC_022655	TGC	2	6	1066046	1066051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561031
17545	NC_022655	GCT	2	6	1066059	1066064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561031
17546	NC_022655	TCA	2	6	1066110	1066115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561031
17547	NC_022655	TGAAGG	2	12	1066160	1066171	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	556561031
17548	NC_022655	TGC	2	6	1066172	1066177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561031
17549	NC_022655	GAA	2	6	1066212	1066217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561031
17550	NC_022655	ATC	2	6	1066236	1066241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561031
17551	NC_022655	TTG	2	6	1066321	1066326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561031
17552	NC_022655	GAC	2	6	1066329	1066334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561031
17553	NC_022655	TTC	2	6	1066335	1066340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561031
17554	NC_022655	AACA	2	8	1066343	1066350	75 %	0 %	0 %	25 %	556561031
17555	NC_022655	AAG	2	6	1066375	1066380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561031
17556	NC_022655	TGC	2	6	1066382	1066387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561031
17557	NC_022655	AAG	2	6	1066459	1066464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561031
17558	NC_022655	CTG	2	6	1066474	1066479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561031
17559	NC_022655	CAA	2	6	1066513	1066518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561031
17560	NC_022655	A	6	6	1066674	1066679	100 %	0 %	0 %	0 %	556561031
17561	NC_022655	CTT	2	6	1069682	1069687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561032
17562	NC_022655	AG	3	6	1069705	1069710	50 %	0 %	50 %	0 %	556561032
17563	NC_022655	AGA	2	6	1069713	1069718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561032
17564	NC_022655	TCT	2	6	1069742	1069747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561032
17565	NC_022655	CT	3	6	1069761	1069766	0 %	50 %	0 %	50 %	556561032
17566	NC_022655	CAG	2	6	1069807	1069812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561032
17567	NC_022655	CTT	2	6	1069814	1069819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561032
17568	NC_022655	ACT	2	6	1069888	1069893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561032
17569	NC_022655	TGA	2	6	1069896	1069901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561032
17570	NC_022655	CAG	2	6	1069999	1070004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561032
17571	NC_022655	T	6	6	1070046	1070051	0 %	100 %	0 %	0 %	556561032
17572	NC_022655	TTGA	2	8	1070167	1070174	25 %	50 %	25 %	0 %	556561032
17573	NC_022655	AGT	2	6	1070197	1070202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561032
17574	NC_022655	AATCA	2	10	1070209	1070218	60 %	20 %	0 %	20 %	556561032
17575	NC_022655	CTG	2	6	1070249	1070254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561032
17576	NC_022655	ACTT	2	8	1070273	1070280	25 %	50 %	0 %	25 %	556561032
17577	NC_022655	CAT	2	6	1070386	1070391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561032
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17582	NC_022655	CTT	2	6	1070666	1070671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561032
17583	NC_022655	TC	3	6	1070680	1070685	0 %	50 %	0 %	50 %	556561032
17584	NC_022655	GAAGC	2	10	1070729	1070738	40 %	0 %	40 %	20 %	556561032
17585	NC_022655	TCA	2	6	1070745	1070750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561032
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17587	NC_022655	TCT	2	6	1070823	1070828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561032
17588	NC_022655	TCAG	2	8	1070852	1070859	25 %	25 %	25 %	25 %	556561032
17589	NC_022655	AT	3	6	1070883	1070888	50 %	50 %	0 %	0 %	556561032
17590	NC_022655	CCA	2	6	1070943	1070948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561032
17591	NC_022655	TCC	2	6	1070978	1070983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556561032
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17598	NC_022655	CAG	2	6	1071468	1071473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561032
17599	NC_022655	GTT	2	6	1071534	1071539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561032
17600	NC_022655	GAAAGT	2	12	1071565	1071576	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	556561032
17601	NC_022655	GA	4	8	1071624	1071631	50 %	0 %	50 %	0 %	556561032
17602	NC_022655	AGG	2	6	1071659	1071664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561032
17603	NC_022655	CAG	2	6	1071712	1071717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561032
17604	NC_022655	A	6	6	1071781	1071786	100 %	0 %	0 %	0 %	556561032
17605	NC_022655	AGC	2	6	1071832	1071837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561032
17606	NC_022655	CT	3	6	1071866	1071871	0 %	50 %	0 %	50 %	556561032
17607	NC_022655	CTACG	2	10	1071946	1071955	20 %	20 %	20 %	40 %	556561032
17608	NC_022655	AGG	2	6	1071968	1071973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561032
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17611	NC_022655	TGG	2	6	1072245	1072250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561032
17612	NC_022655	AGT	2	6	1072350	1072355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561032
17613	NC_022655	TGC	2	6	1072434	1072439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561032
17614	NC_022655	CTT	2	6	1072578	1072583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561032
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17967	NC_022655	CAG	2	6	1091850	1091855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561042
17968	NC_022655	CCA	2	6	1091861	1091866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556561042
17969	NC_022655	CAT	2	6	1091886	1091891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561042
17970	NC_022655	CAT	2	6	1091901	1091906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561042
17971	NC_022655	TACAGG	2	12	1091923	1091934	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	556561042
17972	NC_022655	TGC	2	6	1091950	1091955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561042
17973	NC_022655	TTC	2	6	1091980	1091985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561042
17974	NC_022655	TCT	2	6	1092059	1092064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561042
17975	NC_022655	CTT	2	6	1092120	1092125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561042
17976	NC_022655	T	6	6	1092142	1092147	0 %	100 %	0 %	0 %	556561042
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17978	NC_022655	GGT	2	6	1092345	1092350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561043
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17981	NC_022655	TAA	2	6	1092459	1092464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561043
17982	NC_022655	TCA	2	6	1092633	1092638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561043
17983	NC_022655	ATCC	2	8	1092646	1092653	25 %	25 %	0 %	50 %	556561043
17984	NC_022655	ATA	2	6	1092689	1092694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561043
17985	NC_022655	TCT	2	6	1092704	1092709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561043
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17989	NC_022655	CTT	2	6	1092787	1092792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561043
17990	NC_022655	CTT	2	6	1092823	1092828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561043
17991	NC_022655	CTT	2	6	1092984	1092989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561043
17992	NC_022655	CTT	2	6	1093063	1093068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561043
17993	NC_022655	ATGTT	2	10	1093115	1093124	20 %	60 %	20 %	0 %	556561043
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17996	NC_022655	ATC	2	6	1093252	1093257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561043
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17999	NC_022655	TTCTGA	2	12	1093667	1093678	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	556561044
18000	NC_022655	AAT	2	6	1093679	1093684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556561044

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