MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022655	CTT	2	6	850705	850710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560836
14002	NC_022655	AAT	2	6	850715	850720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560836
14003	NC_022655	TTTGT	2	10	850781	850790	0 %	80 %	20 %	0 %	556560836
14004	NC_022655	TGAT	2	8	850803	850810	25 %	50 %	25 %	0 %	556560836
14005	NC_022655	TGA	2	6	851649	851654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560837
14006	NC_022655	GTAT	2	8	851729	851736	25 %	50 %	25 %	0 %	556560837
14007	NC_022655	AGTT	2	8	851801	851808	25 %	50 %	25 %	0 %	556560837
14008	NC_022655	AAG	2	6	851864	851869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560837
14009	NC_022655	GAT	2	6	851875	851880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560837
14010	NC_022655	GAA	3	9	851977	851985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560837
14011	NC_022655	GAA	2	6	852034	852039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560837
14012	NC_022655	CAA	2	6	852049	852054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560837
14013	NC_022655	AAAG	2	8	852060	852067	75 %	0 %	25 %	0 %	556560837
14014	NC_022655	AAT	2	6	852116	852121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560837
14015	NC_022655	A	7	7	852131	852137	100 %	0 %	0 %	0 %	556560838
14016	NC_022655	AGA	2	6	852155	852160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560838
14017	NC_022655	GAC	2	6	852248	852253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560838
14018	NC_022655	TTG	2	6	852289	852294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560838
14019	NC_022655	AG	3	6	852329	852334	50 %	0 %	50 %	0 %	556560838
14020	NC_022655	A	6	6	852393	852398	100 %	0 %	0 %	0 %	556560838
14021	NC_022655	GAA	2	6	852450	852455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560838
14022	NC_022655	TGT	2	6	852494	852499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560838
14023	NC_022655	A	6	6	852579	852584	100 %	0 %	0 %	0 %	556560838
14024	NC_022655	GCC	2	6	852629	852634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556560838
14025	NC_022655	ATTT	2	8	852666	852673	25 %	75 %	0 %	0 %	556560838
14026	NC_022655	A	6	6	852695	852700	100 %	0 %	0 %	0 %	556560838
14027	NC_022655	AAG	2	6	852970	852975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560839
14028	NC_022655	CAA	2	6	853037	853042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560839
14029	NC_022655	GTG	2	6	853081	853086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560839
14030	NC_022655	TGT	2	6	853145	853150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560839
14031	NC_022655	TGA	2	6	853175	853180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560839
14032	NC_022655	CTT	2	6	853201	853206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560839
14033	NC_022655	TGG	2	6	853243	853248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560839
14034	NC_022655	ATG	2	6	853249	853254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560839
14035	NC_022655	TGC	2	6	853280	853285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560839
14036	NC_022655	ATA	2	6	853291	853296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560839
14037	NC_022655	GTC	2	6	853309	853314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560839
14038	NC_022655	A	6	6	853388	853393	100 %	0 %	0 %	0 %	556560839
14039	NC_022655	GAA	2	6	853413	853418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560839
14040	NC_022655	ATC	2	6	853419	853424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560839
14041	NC_022655	TGA	2	6	853442	853447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560839
14042	NC_022655	GAA	2	6	853470	853475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560839
14043	NC_022655	CAA	2	6	853512	853517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560840
14044	NC_022655	TCT	2	6	853645	853650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560840
14045	NC_022655	TTGGA	2	10	853702	853711	20 %	40 %	40 %	0 %	556560840
14046	NC_022655	GACTT	2	10	853714	853723	20 %	40 %	20 %	20 %	556560840
14047	NC_022655	TAA	2	6	853745	853750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560840
14048	NC_022655	TG	3	6	853806	853811	0 %	50 %	50 %	0 %	556560840
14049	NC_022655	ACT	2	6	853831	853836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560840
14050	NC_022655	ATTG	2	8	853844	853851	25 %	50 %	25 %	0 %	556560840
14051	NC_022655	CAT	2	6	853874	853879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560840
14052	NC_022655	TGG	2	6	853883	853888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560840
14053	NC_022655	GCTT	2	8	853918	853925	0 %	50 %	25 %	25 %	556560840
14054	NC_022655	TGA	2	6	853930	853935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560840
14055	NC_022655	TGA	2	6	854120	854125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560840
14056	NC_022655	ATG	2	6	854148	854153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560840
14057	NC_022655	AGA	2	6	854204	854209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560840
14058	NC_022655	GAAA	2	8	854255	854262	75 %	0 %	25 %	0 %	556560840
14059	NC_022655	CAAT	2	8	854287	854294	50 %	25 %	0 %	25 %	556560840
14060	NC_022655	CAA	2	6	854349	854354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560840
14061	NC_022655	AGA	2	6	854496	854501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560841
14062	NC_022655	AAGGC	2	10	854516	854525	40 %	0 %	40 %	20 %	556560841
14063	NC_022655	TGA	2	6	854670	854675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560841
14064	NC_022655	ATT	2	6	854686	854691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560841
14065	NC_022655	GTT	2	6	854710	854715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560841
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14067	NC_022655	GACA	2	8	854925	854932	50 %	0 %	25 %	25 %	556560841
14068	NC_022655	CTA	2	6	854948	854953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560841
14069	NC_022655	GTG	2	6	854989	854994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560841
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14072	NC_022655	TGT	2	6	855119	855124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560841
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14079	NC_022655	GAT	2	6	855522	855527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560841
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14081	NC_022655	A	6	6	855887	855892	100 %	0 %	0 %	0 %	556560842
14082	NC_022655	ATT	3	9	855916	855924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560842
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14085	NC_022655	GTT	2	6	855994	855999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560842
14086	NC_022655	CAT	2	6	856023	856028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560842
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14090	NC_022655	GGA	2	6	856242	856247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560842
14091	NC_022655	AAC	2	6	856283	856288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560842
14092	NC_022655	AGA	2	6	856320	856325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560842
14093	NC_022655	TCGT	2	8	856364	856371	0 %	50 %	25 %	25 %	556560842
14094	NC_022655	TGG	2	6	856386	856391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560842
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14096	NC_022655	TG	3	6	856406	856411	0 %	50 %	50 %	0 %	556560842
14097	NC_022655	TTGA	2	8	856477	856484	25 %	50 %	25 %	0 %	556560842
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14100	NC_022655	ATT	2	6	856675	856680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560842
14101	NC_022655	AGCT	2	8	856715	856722	25 %	25 %	25 %	25 %	556560842
14102	NC_022655	TAT	2	6	856744	856749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560842
14103	NC_022655	TCT	2	6	857040	857045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560842
14104	NC_022655	CAC	2	6	857077	857082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560842
14105	NC_022655	GCA	2	6	857101	857106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560842
14106	NC_022655	TGA	2	6	857112	857117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560842
14107	NC_022655	TTGA	2	8	857122	857129	25 %	50 %	25 %	0 %	556560842
14108	NC_022655	TCT	2	6	857159	857164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560842
14109	NC_022655	TCG	2	6	857181	857186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560842
14110	NC_022655	AC	3	6	857192	857197	50 %	0 %	0 %	50 %	556560842
14111	NC_022655	GAA	2	6	857200	857205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560842
14112	NC_022655	TCT	2	6	857231	857236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560842
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14120	NC_022655	GAA	2	6	858031	858036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560842
14121	NC_022655	CTG	2	6	858059	858064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560842
14122	NC_022655	CAC	2	6	858227	858232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560842
14123	NC_022655	ATG	2	6	858310	858315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560842
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14125	NC_022655	CT	3	6	858623	858628	0 %	50 %	0 %	50 %	556560842
14126	NC_022655	CTT	2	6	858644	858649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560842
14127	NC_022655	GTC	2	6	858676	858681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560842
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14133	NC_022655	TGA	2	6	858828	858833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560842
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14140	NC_022655	CCTT	2	8	859506	859513	0 %	50 %	0 %	50 %	556560843
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14144	NC_022655	TCT	2	6	859812	859817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560843
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14237	NC_022655	GAA	2	6	865174	865179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560848
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14239	NC_022655	TC	3	6	865405	865410	0 %	50 %	0 %	50 %	556560849
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14482	NC_022655	CAT	2	6	879200	879205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560863
14483	NC_022655	ATGA	2	8	879213	879220	50 %	25 %	25 %	0 %	556560863
14484	NC_022655	CGT	3	9	879258	879266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560863
14485	NC_022655	TTG	2	6	879274	879279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560863
14486	NC_022655	AGA	2	6	879335	879340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560863
14487	NC_022655	GCT	2	6	879369	879374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560863
14488	NC_022655	AGA	2	6	879494	879499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560863
14489	NC_022655	ATG	2	6	879517	879522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560863
14490	NC_022655	A	6	6	879546	879551	100 %	0 %	0 %	0 %	556560863
14491	NC_022655	AAT	2	6	879567	879572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560863
14492	NC_022655	TGA	2	6	879596	879601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560863
14493	NC_022655	TGA	2	6	879611	879616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560863
14494	NC_022655	GAT	2	6	879621	879626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560863
14495	NC_022655	ATT	2	6	879652	879657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560864
14496	NC_022655	GAA	2	6	879673	879678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560864
14497	NC_022655	TGA	2	6	879894	879899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560864
14498	NC_022655	T	6	6	879912	879917	0 %	100 %	0 %	0 %	556560864
14499	NC_022655	AG	3	6	879984	879989	50 %	0 %	50 %	0 %	556560864
14500	NC_022655	ATC	2	6	880064	880069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560864

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