MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022655	ATC	2	6	823593	823598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560812
13502	NC_022655	GAA	2	6	823666	823671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560812
13503	NC_022655	TCAA	2	8	823795	823802	50 %	25 %	0 %	25 %	556560812
13504	NC_022655	AGGA	2	8	823870	823877	50 %	0 %	50 %	0 %	556560812
13505	NC_022655	G	6	6	823902	823907	0 %	0 %	100 %	0 %	556560812
13506	NC_022655	GAT	2	6	823986	823991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560812
13507	NC_022655	TC	3	6	824077	824082	0 %	50 %	0 %	50 %	556560812
13508	NC_022655	TGA	2	6	824167	824172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560812
13509	NC_022655	AGG	2	6	824218	824223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560812
13510	NC_022655	TCC	2	6	824294	824299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560813
13511	NC_022655	TACC	2	8	824347	824354	25 %	25 %	0 %	50 %	556560813
13512	NC_022655	TCA	2	6	824398	824403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560813
13513	NC_022655	T	6	6	824408	824413	0 %	100 %	0 %	0 %	556560813
13514	NC_022655	TGG	2	6	824438	824443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560813
13515	NC_022655	TCCTC	2	10	824475	824484	0 %	40 %	0 %	60 %	556560813
13516	NC_022655	TCT	2	6	824498	824503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560813
13517	NC_022655	ATC	2	6	824530	824535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560813
13518	NC_022655	GGCAA	2	10	824573	824582	40 %	0 %	40 %	20 %	556560813
13519	NC_022655	GA	3	6	824585	824590	50 %	0 %	50 %	0 %	556560813
13520	NC_022655	TGA	2	6	824672	824677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560813
13521	NC_022655	CT	3	6	824723	824728	0 %	50 %	0 %	50 %	556560813
13522	NC_022655	ATC	2	6	824789	824794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560813
13523	NC_022655	TTGA	2	8	824836	824843	25 %	50 %	25 %	0 %	556560813
13524	NC_022655	CAG	2	6	824857	824862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560813
13525	NC_022655	ACT	2	6	824927	824932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560813
13526	NC_022655	TCAG	2	8	824943	824950	25 %	25 %	25 %	25 %	556560813
13527	NC_022655	TTC	2	6	824961	824966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560813
13528	NC_022655	ATG	2	6	825043	825048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560813
13529	NC_022655	GTCG	2	8	825064	825071	0 %	25 %	50 %	25 %	556560813
13530	NC_022655	T	6	6	825081	825086	0 %	100 %	0 %	0 %	556560813
13531	NC_022655	TTC	2	6	825126	825131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560813
13532	NC_022655	A	6	6	825290	825295	100 %	0 %	0 %	0 %	556560813
13533	NC_022655	GTA	2	6	825332	825337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560813
13534	NC_022655	CAG	2	6	825475	825480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560813
13535	NC_022655	CA	3	6	825510	825515	50 %	0 %	0 %	50 %	556560813
13536	NC_022655	ATA	2	6	825530	825535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560813
13537	NC_022655	TGC	3	9	825576	825584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560813
13538	NC_022655	AGC	2	6	825588	825593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560813
13539	NC_022655	GATAC	2	10	825629	825638	40 %	20 %	20 %	20 %	556560813
13540	NC_022655	TC	4	8	825661	825668	0 %	50 %	0 %	50 %	556560813
13541	NC_022655	AGCTC	2	10	825678	825687	20 %	20 %	20 %	40 %	556560813
13542	NC_022655	TCTTA	2	10	825726	825735	20 %	60 %	0 %	20 %	556560813
13543	NC_022655	CTT	2	6	825746	825751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560813
13544	NC_022655	TCA	2	6	825821	825826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560813
13545	NC_022655	TAG	2	6	825875	825880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560813
13546	NC_022655	TTG	2	6	825890	825895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560813
13547	NC_022655	CAG	2	6	826506	826511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556561963
13548	NC_022655	AAG	2	6	826551	826556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561963
13549	NC_022655	AAC	3	9	826582	826590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556561963
13550	NC_022655	GGT	2	6	826642	826647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561963
13551	NC_022655	GTT	2	6	826665	826670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561963
13552	NC_022655	CT	3	6	826683	826688	0 %	50 %	0 %	50 %	556561963
13553	NC_022655	TTC	2	6	826690	826695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561963
13554	NC_022655	CTG	2	6	826710	826715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556561963
13555	NC_022655	CAT	2	6	826738	826743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561963
13556	NC_022655	TCCATG	2	12	826869	826880	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	556561963
13557	NC_022655	AGG	2	6	826893	826898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556561963
13558	NC_022655	GAA	2	6	826949	826954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561963
13559	NC_022655	ATC	2	6	826968	826973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556561963
13560	NC_022655	GA	4	8	827006	827013	50 %	0 %	50 %	0 %	556561963
13561	NC_022655	TCT	2	6	827030	827035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561963
13562	NC_022655	GACT	2	8	827137	827144	25 %	25 %	25 %	25 %	556561963
13563	NC_022655	AGGA	3	12	827178	827189	50 %	0 %	50 %	0 %	556561963
13564	NC_022655	CTT	2	6	827198	827203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561963
13565	NC_022655	AGA	2	6	827205	827210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561963
13566	NC_022655	GCCA	2	8	827225	827232	25 %	0 %	25 %	50 %	556561963
13567	NC_022655	TGGAA	2	10	827287	827296	40 %	20 %	40 %	0 %	556561963
13568	NC_022655	GCAA	2	8	827322	827329	50 %	0 %	25 %	25 %	556561963
13569	NC_022655	GAT	2	6	827429	827434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556561963
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13572	NC_022655	AC	3	6	827736	827741	50 %	0 %	0 %	50 %	556560814
13573	NC_022655	ATT	2	6	827756	827761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560814
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13575	NC_022655	GTA	2	6	827786	827791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560814
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13577	NC_022655	GCT	2	6	827807	827812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560814
13578	NC_022655	TCG	2	6	827820	827825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560814
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13591	NC_022655	GAA	3	9	828401	828409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560815
13592	NC_022655	GCT	2	6	828425	828430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560815
13593	NC_022655	TGC	2	6	828442	828447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560815
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13595	NC_022655	ATTC	2	8	828480	828487	25 %	50 %	0 %	25 %	556560815
13596	NC_022655	A	6	6	828515	828520	100 %	0 %	0 %	0 %	556560815
13597	NC_022655	TGGTCT	2	12	828553	828564	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	556560815
13598	NC_022655	AAG	2	6	828567	828572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560815
13599	NC_022655	TTG	2	6	828582	828587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560815
13600	NC_022655	AAG	2	6	828609	828614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560815
13601	NC_022655	GAA	2	6	828635	828640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560815
13602	NC_022655	GAA	2	6	828656	828661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560815
13603	NC_022655	ATA	2	6	828685	828690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560815
13604	NC_022655	AGGG	2	8	828978	828985	25 %	0 %	75 %	0 %	556560816
13605	NC_022655	AGGA	2	8	829056	829063	50 %	0 %	50 %	0 %	556560816
13606	NC_022655	AAC	2	6	829072	829077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560816
13607	NC_022655	TAT	2	6	829126	829131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560816
13608	NC_022655	TCAG	2	8	829177	829184	25 %	25 %	25 %	25 %	556560816
13609	NC_022655	A	7	7	829190	829196	100 %	0 %	0 %	0 %	556560816
13610	NC_022655	TGT	2	6	829241	829246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560816
13611	NC_022655	CTT	2	6	829251	829256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560816
13612	NC_022655	AGA	2	6	829279	829284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560816
13613	NC_022655	A	6	6	829290	829295	100 %	0 %	0 %	0 %	556560816
13614	NC_022655	ATC	2	6	829308	829313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560816
13615	NC_022655	ATTG	2	8	829318	829325	25 %	50 %	25 %	0 %	556560816
13616	NC_022655	AGAT	2	8	829356	829363	50 %	25 %	25 %	0 %	556560816
13617	NC_022655	TATC	2	8	829385	829392	25 %	50 %	0 %	25 %	556560816
13618	NC_022655	ATG	2	6	829446	829451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560816
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13982	NC_022655	T	6	6	849674	849679	0 %	100 %	0 %	0 %	556560836
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13986	NC_022655	AGTT	2	8	849812	849819	25 %	50 %	25 %	0 %	556560836
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