MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_022655	CTA	2	6	794833	794838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560790
13003	NC_022655	TCT	2	6	794961	794966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560790
13004	NC_022655	AGA	2	6	795019	795024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560790
13005	NC_022655	CTG	2	6	795087	795092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560790
13006	NC_022655	TGG	2	6	795159	795164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560790
13007	NC_022655	ACA	2	6	795267	795272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560790
13008	NC_022655	TTC	2	6	795363	795368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560790
13009	NC_022655	GTC	2	6	795369	795374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560790
13010	NC_022655	CGT	2	6	795380	795385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560790
13011	NC_022655	CCTTT	2	10	795422	795431	0 %	60 %	0 %	40 %	556560790
13012	NC_022655	CTA	2	6	795469	795474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560790
13013	NC_022655	GAA	3	9	795524	795532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560790
13014	NC_022655	GAAA	2	8	795592	795599	75 %	0 %	25 %	0 %	556560790
13015	NC_022655	GAA	2	6	795674	795679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560790
13016	NC_022655	GAA	2	6	795686	795691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560790
13017	NC_022655	AGC	2	6	795724	795729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560790
13018	NC_022655	CG	4	8	795749	795756	0 %	0 %	50 %	50 %	556560790
13019	NC_022655	TCT	2	6	795854	795859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560790
13020	NC_022655	CAGG	2	8	796208	796215	25 %	0 %	50 %	25 %	556560790
13021	NC_022655	CTG	2	6	796272	796277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560790
13022	NC_022655	TGCG	2	8	796284	796291	0 %	25 %	50 %	25 %	556560790
13023	NC_022655	A	6	6	796311	796316	100 %	0 %	0 %	0 %	556560790
13024	NC_022655	TCGTG	2	10	796417	796426	0 %	40 %	40 %	20 %	556560790
13025	NC_022655	ACT	2	6	796437	796442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560790
13026	NC_022655	TGG	2	6	796456	796461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560790
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13028	NC_022655	GCA	2	6	796610	796615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560790
13029	NC_022655	TCAAG	2	10	796630	796639	40 %	20 %	20 %	20 %	556560790
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13031	NC_022655	GAAA	2	8	796708	796715	75 %	0 %	25 %	0 %	556560790
13032	NC_022655	ACT	2	6	796851	796856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560790
13033	NC_022655	TCT	2	6	796861	796866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560790
13034	NC_022655	AGCA	2	8	796909	796916	50 %	0 %	25 %	25 %	556560790
13035	NC_022655	ATC	2	6	796964	796969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560790
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13037	NC_022655	CATGGC	2	12	796996	797007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	556560790
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13040	NC_022655	TCA	2	6	797225	797230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560791
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13042	NC_022655	GATT	2	8	797351	797358	25 %	50 %	25 %	0 %	556560791
13043	NC_022655	AGT	2	6	797403	797408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560791
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13050	NC_022655	TTC	2	6	797767	797772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560791
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13052	NC_022655	AAAG	2	8	797884	797891	75 %	0 %	25 %	0 %	556560791
13053	NC_022655	AGCCC	2	10	798061	798070	20 %	0 %	20 %	60 %	556560791
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13057	NC_022655	GTTG	2	8	798466	798473	0 %	50 %	50 %	0 %	556560791
13058	NC_022655	TGG	2	6	798484	798489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560791
13059	NC_022655	CGT	2	6	798561	798566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560791
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13065	NC_022655	TTTGA	2	10	799295	799304	20 %	60 %	20 %	0 %	556561951
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13091	NC_022655	ATG	2	6	800523	800528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560792
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13099	NC_022655	CTTG	2	8	801083	801090	0 %	50 %	25 %	25 %	556560792
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13101	NC_022655	A	6	6	801145	801150	100 %	0 %	0 %	0 %	556560792
13102	NC_022655	GAATA	2	10	801842	801851	60 %	20 %	20 %	0 %	556560793
13103	NC_022655	AAG	2	6	801873	801878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560793
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13105	NC_022655	TCAA	2	8	802045	802052	50 %	25 %	0 %	25 %	556560793
13106	NC_022655	CTTT	2	8	802054	802061	0 %	75 %	0 %	25 %	556560793
13107	NC_022655	GTT	2	6	802067	802072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560793
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13113	NC_022655	TGA	2	6	802411	802416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560793
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13117	NC_022655	GGGA	2	8	802808	802815	25 %	0 %	75 %	0 %	556560793
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13483	NC_022655	CTTA	2	8	822430	822437	25 %	50 %	0 %	25 %	556560811
13484	NC_022655	TAT	2	6	822514	822519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560812
13485	NC_022655	TTG	2	6	822619	822624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560812
13486	NC_022655	GCA	2	6	822741	822746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560812
13487	NC_022655	CAG	2	6	822809	822814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560812
13488	NC_022655	TACC	2	8	822860	822867	25 %	25 %	0 %	50 %	556560812
13489	NC_022655	ATCA	2	8	822882	822889	50 %	25 %	0 %	25 %	556560812
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13492	NC_022655	AGT	2	6	823047	823052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560812
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13499	NC_022655	AAGC	2	8	823473	823480	50 %	0 %	25 %	25 %	556560812
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