MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_022655	A	6	6	610992	610997	100 %	0 %	0 %	0 %	556560610
10003	NC_022655	ACC	2	6	611004	611009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560610
10004	NC_022655	CAG	2	6	611025	611030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560610
10005	NC_022655	TGT	2	6	611132	611137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560610
10006	NC_022655	GGTCA	2	10	611154	611163	20 %	20 %	40 %	20 %	556560610
10007	NC_022655	ATG	2	6	611205	611210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560610
10008	NC_022655	TCA	2	6	611237	611242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560610
10009	NC_022655	TTG	2	6	611314	611319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560610
10010	NC_022655	TCAA	2	8	611386	611393	50 %	25 %	0 %	25 %	556560610
10011	NC_022655	GCA	2	6	611405	611410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560610
10012	NC_022655	AC	3	6	611462	611467	50 %	0 %	0 %	50 %	556560610
10013	NC_022655	GTCA	2	8	611553	611560	25 %	25 %	25 %	25 %	556560610
10014	NC_022655	AGA	2	6	611563	611568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560610
10015	NC_022655	TCA	2	6	611601	611606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560610
10016	NC_022655	CTTG	2	8	611648	611655	0 %	50 %	25 %	25 %	556560610
10017	NC_022655	TCT	2	6	611672	611677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560610
10018	NC_022655	TGTC	2	8	611678	611685	0 %	50 %	25 %	25 %	556560610
10019	NC_022655	GA	3	6	611738	611743	50 %	0 %	50 %	0 %	556560610
10020	NC_022655	GA	3	6	611810	611815	50 %	0 %	50 %	0 %	556560610
10021	NC_022655	GAA	2	6	611883	611888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560610
10022	NC_022655	CAT	2	6	611963	611968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560610
10023	NC_022655	GTG	2	6	612000	612005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560610
10024	NC_022655	TCAA	2	8	612046	612053	50 %	25 %	0 %	25 %	556560610
10025	NC_022655	TC	3	6	612071	612076	0 %	50 %	0 %	50 %	556560610
10026	NC_022655	ATCA	2	8	612084	612091	50 %	25 %	0 %	25 %	556560610
10027	NC_022655	AAC	2	6	612118	612123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560610
10028	NC_022655	AAGGAA	2	12	612237	612248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560610
10029	NC_022655	GAT	2	6	612312	612317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560610
10030	NC_022655	TAG	2	6	612344	612349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560610
10031	NC_022655	GATT	2	8	612437	612444	25 %	50 %	25 %	0 %	556560610
10032	NC_022655	AT	4	8	612474	612481	50 %	50 %	0 %	0 %	556560610
10033	NC_022655	ATAGA	2	10	612484	612493	60 %	20 %	20 %	0 %	556560610
10034	NC_022655	TCT	2	6	612718	612723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560611
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10036	NC_022655	GTA	2	6	612809	612814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560611
10037	NC_022655	GTT	2	6	612865	612870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560611
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10039	NC_022655	TGGAT	2	10	613008	613017	20 %	40 %	40 %	0 %	556560611
10040	NC_022655	GCAT	2	8	613037	613044	25 %	25 %	25 %	25 %	556560611
10041	NC_022655	GA	4	8	613080	613087	50 %	0 %	50 %	0 %	556560611
10042	NC_022655	GTC	2	6	613118	613123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560611
10043	NC_022655	GTGCGC	2	12	613139	613150	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	556560611
10044	NC_022655	A	6	6	613210	613215	100 %	0 %	0 %	0 %	556560612
10045	NC_022655	TAAA	2	8	613319	613326	75 %	25 %	0 %	0 %	556560612
10046	NC_022655	ATT	2	6	613330	613335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560612
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10049	NC_022655	AGAA	2	8	613501	613508	75 %	0 %	25 %	0 %	556560612
10050	NC_022655	TTC	2	6	613550	613555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560612
10051	NC_022655	GTT	2	6	613612	613617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560612
10052	NC_022655	TATC	2	8	613645	613652	25 %	50 %	0 %	25 %	556560612
10053	NC_022655	GCTTG	2	10	613671	613680	0 %	40 %	40 %	20 %	556560612
10054	NC_022655	AGA	2	6	613692	613697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560612
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10056	NC_022655	CAA	3	9	613751	613759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560612
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10064	NC_022655	CAG	2	6	613919	613924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560612
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10072	NC_022655	CAGC	2	8	614185	614192	25 %	0 %	25 %	50 %	556560612
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10091	NC_022655	AGA	2	6	614745	614750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560612
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10093	NC_022655	AACC	2	8	614810	614817	50 %	0 %	0 %	50 %	556560612
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10103	NC_022655	A	6	6	615103	615108	100 %	0 %	0 %	0 %	556560612
10104	NC_022655	TGA	2	6	615140	615145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560612
10105	NC_022655	GAT	2	6	615151	615156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560612
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10107	NC_022655	AACAA	2	10	615241	615250	80 %	0 %	0 %	20 %	556560612
10108	NC_022655	GAA	2	6	615274	615279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560612
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10111	NC_022655	A	7	7	615449	615455	100 %	0 %	0 %	0 %	556560612
10112	NC_022655	ACTCCA	2	12	615502	615513	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	556560612
10113	NC_022655	GC	3	6	615592	615597	0 %	0 %	50 %	50 %	556560612
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10119	NC_022655	GCT	2	6	615946	615951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560612
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10121	NC_022655	TGG	2	6	616065	616070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560612
10122	NC_022655	TA	3	6	616099	616104	50 %	50 %	0 %	0 %	556560612
10123	NC_022655	ATG	2	6	616120	616125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560612
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10130	NC_022655	ACTT	2	8	616434	616441	25 %	50 %	0 %	25 %	556560612
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10153	NC_022655	TAA	2	6	617409	617414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560612
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10229	NC_022655	GAA	2	6	621440	621445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560615
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10232	NC_022655	CTT	2	6	621774	621779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560615
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10238	NC_022655	AATG	2	8	622115	622122	50 %	25 %	25 %	0 %	556560615
10239	NC_022655	TGG	2	6	622129	622134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560615
10240	NC_022655	TTA	2	6	622138	622143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560615
10241	NC_022655	GGAA	2	8	622164	622171	50 %	0 %	50 %	0 %	556560615
10242	NC_022655	CAAG	2	8	622175	622182	50 %	0 %	25 %	25 %	556560615
10243	NC_022655	CTT	2	6	622188	622193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560615
10244	NC_022655	CTG	2	6	622221	622226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560615
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10246	NC_022655	ATG	2	6	622320	622325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560615
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10252	NC_022655	TGA	2	6	622618	622623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560616
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10263	NC_022655	A	6	6	623027	623032	100 %	0 %	0 %	0 %	556560616
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10342	NC_022655	TCTG	2	8	627103	627110	0 %	50 %	25 %	25 %	556560620
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10347	NC_022655	ATTA	2	8	627447	627454	50 %	50 %	0 %	0 %	556560620
10348	NC_022655	TTA	2	6	627644	627649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560621
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10351	NC_022655	CATT	2	8	627813	627820	25 %	50 %	0 %	25 %	556560621
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10357	NC_022655	AAG	2	6	628327	628332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560621
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10482	NC_022655	T	7	7	634968	634974	0 %	100 %	0 %	0 %	556560631
10483	NC_022655	CTT	2	6	634980	634985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560631
10484	NC_022655	CTTG	2	8	634987	634994	0 %	50 %	25 %	25 %	556560631
10485	NC_022655	ATT	2	6	634996	635001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560631
10486	NC_022655	A	6	6	635062	635067	100 %	0 %	0 %	0 %	556560631
10487	NC_022655	AGA	2	6	635146	635151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560631
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10491	NC_022655	GAAA	2	8	635304	635311	75 %	0 %	25 %	0 %	556560631
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