MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022655	GCG	2	6	389237	389242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560426
6502	NC_022655	TGG	2	6	389302	389307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560426
6503	NC_022655	CTT	2	6	389316	389321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560426
6504	NC_022655	TTGG	2	8	389363	389370	0 %	50 %	50 %	0 %	556560426
6505	NC_022655	CGT	2	6	389381	389386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560426
6506	NC_022655	AGA	2	6	389480	389485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560426
6507	NC_022655	GGAG	2	8	389525	389532	25 %	0 %	75 %	0 %	556560426
6508	NC_022655	TGA	2	6	389616	389621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560427
6509	NC_022655	TGA	2	6	389655	389660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560427
6510	NC_022655	GTT	2	6	389668	389673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560427
6511	NC_022655	GGT	2	6	389674	389679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560427
6512	NC_022655	TTGG	2	8	389681	389688	0 %	50 %	50 %	0 %	556560427
6513	NC_022655	TGGT	2	8	389711	389718	0 %	50 %	50 %	0 %	556560427
6514	NC_022655	TGA	2	6	389804	389809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560427
6515	NC_022655	CAG	2	6	389855	389860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560427
6516	NC_022655	GAA	2	6	389884	389889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560427
6517	NC_022655	TCGC	2	8	389909	389916	0 %	25 %	25 %	50 %	556560427
6518	NC_022655	TAT	2	6	389949	389954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560427
6519	NC_022655	ATT	2	6	389959	389964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560427
6520	NC_022655	GGT	2	6	389974	389979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560427
6521	NC_022655	GGCTCT	2	12	389988	389999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560427
6522	NC_022655	TCTA	2	8	390034	390041	25 %	50 %	0 %	25 %	556560427
6523	NC_022655	AGC	2	6	390105	390110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560427
6524	NC_022655	TGA	2	6	390116	390121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560427
6525	NC_022655	GTG	2	6	390154	390159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560427
6526	NC_022655	A	6	6	390214	390219	100 %	0 %	0 %	0 %	556560427
6527	NC_022655	AGA	2	6	390261	390266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560427
6528	NC_022655	GAA	2	6	390274	390279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560427
6529	NC_022655	T	6	6	390337	390342	0 %	100 %	0 %	0 %	556560428
6530	NC_022655	GAG	2	6	390380	390385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560428
6531	NC_022655	A	6	6	390404	390409	100 %	0 %	0 %	0 %	556560428
6532	NC_022655	AATT	2	8	390496	390503	50 %	50 %	0 %	0 %	556560429
6533	NC_022655	GTT	2	6	390520	390525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560429
6534	NC_022655	AAG	2	6	390554	390559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560429
6535	NC_022655	TAG	2	6	390655	390660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560429
6536	NC_022655	TTATA	2	10	390665	390674	40 %	60 %	0 %	0 %	556560429
6537	NC_022655	TA	3	6	390716	390721	50 %	50 %	0 %	0 %	556560429
6538	NC_022655	CTTTTT	2	12	391512	391523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	556560430
6539	NC_022655	TTC	2	6	391528	391533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560430
6540	NC_022655	GAG	2	6	391632	391637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560430
6541	NC_022655	AGG	2	6	391673	391678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560430
6542	NC_022655	TC	3	6	391681	391686	0 %	50 %	0 %	50 %	556560430
6543	NC_022655	TTC	2	6	391750	391755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560430
6544	NC_022655	AGC	2	6	392027	392032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560431
6545	NC_022655	ACGG	2	8	392054	392061	25 %	0 %	50 %	25 %	556560431
6546	NC_022655	AGAT	2	8	392127	392134	50 %	25 %	25 %	0 %	556560431
6547	NC_022655	CTG	2	6	392137	392142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560431
6548	NC_022655	TTC	2	6	392147	392152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560431
6549	NC_022655	T	6	6	392269	392274	0 %	100 %	0 %	0 %	556560431
6550	NC_022655	GTT	2	6	392308	392313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560431
6551	NC_022655	TCAAC	2	10	392512	392521	40 %	20 %	0 %	40 %	556560432
6552	NC_022655	AGT	2	6	392522	392527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560432
6553	NC_022655	ATA	2	6	392712	392717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560432
6554	NC_022655	GCT	2	6	393113	393118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560433
6555	NC_022655	AT	3	6	393167	393172	50 %	50 %	0 %	0 %	556560433
6556	NC_022655	TAT	2	6	393217	393222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560433
6557	NC_022655	AAGT	2	8	393237	393244	50 %	25 %	25 %	0 %	556560433
6558	NC_022655	T	6	6	393282	393287	0 %	100 %	0 %	0 %	556560434
6559	NC_022655	TCT	2	6	393344	393349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560434
6560	NC_022655	CGA	2	6	393351	393356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560434
6561	NC_022655	AATTT	2	10	393365	393374	40 %	60 %	0 %	0 %	556560434
6562	NC_022655	CAG	2	6	393393	393398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560434
6563	NC_022655	ATTC	2	8	393489	393496	25 %	50 %	0 %	25 %	556560434
6564	NC_022655	ACC	2	6	393530	393535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560434
6565	NC_022655	ACT	2	6	393581	393586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560434
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6569	NC_022655	ACA	2	6	393806	393811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560434
6570	NC_022655	AGA	2	6	393832	393837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560434
6571	NC_022655	CAG	2	6	393861	393866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560434
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6574	NC_022655	AGT	2	6	394487	394492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560435
6575	NC_022655	TTGGC	2	10	394511	394520	0 %	40 %	40 %	20 %	556560435
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6586	NC_022655	ACC	2	6	395173	395178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560435
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6589	NC_022655	TCC	2	6	395333	395338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560435
6590	NC_022655	CTT	2	6	395403	395408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560435
6591	NC_022655	TCAA	2	8	395441	395448	50 %	25 %	0 %	25 %	556560435
6592	NC_022655	TCT	2	6	395564	395569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560435
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6594	NC_022655	AGT	2	6	395652	395657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560435
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6600	NC_022655	GA	3	6	396029	396034	50 %	0 %	50 %	0 %	556560436
6601	NC_022655	CAG	2	6	396038	396043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560436
6602	NC_022655	GA	3	6	396126	396131	50 %	0 %	50 %	0 %	556560436
6603	NC_022655	AAATC	2	10	396170	396179	60 %	20 %	0 %	20 %	556560436
6604	NC_022655	CTT	2	6	396237	396242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560436
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6609	NC_022655	TCA	2	6	396346	396351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560436
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6984	NC_022655	GTT	2	6	421239	421244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560454
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6987	NC_022655	ATTTG	2	10	421363	421372	20 %	60 %	20 %	0 %	556560454
6988	NC_022655	GGTG	2	8	421398	421405	0 %	25 %	75 %	0 %	556560454
6989	NC_022655	TTTA	2	8	421454	421461	25 %	75 %	0 %	0 %	556560454
6990	NC_022655	TGAT	2	8	421503	421510	25 %	50 %	25 %	0 %	556560454
6991	NC_022655	TAA	3	9	421972	421980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560455
6992	NC_022655	CTC	2	6	422000	422005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560455
6993	NC_022655	AGG	3	9	422009	422017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560455
6994	NC_022655	AAT	2	6	422075	422080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560455
6995	NC_022655	TTA	2	6	422086	422091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560455
6996	NC_022655	ATT	2	6	422108	422113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560455
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6998	NC_022655	TAA	2	6	422298	422303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560455
6999	NC_022655	CAAA	2	8	422332	422339	75 %	0 %	0 %	25 %	556560455
7000	NC_022655	A	6	6	422370	422375	100 %	0 %	0 %	0 %	556560455

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