MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae A026 genome

Total Repeats: 34283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022655	A	6	6	2406	2411	100 %	0 %	0 %	0 %	556560057
2	NC_022655	GAA	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560057
3	NC_022655	TAT	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560057
4	NC_022655	TTG	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560057
5	NC_022655	ATGT	2	8	2824	2831	25 %	50 %	25 %	0 %	556560058
6	NC_022655	GTT	3	9	2875	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560058
7	NC_022655	TGA	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
8	NC_022655	GGT	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560058
9	NC_022655	TTC	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560058
10	NC_022655	A	6	6	3053	3058	100 %	0 %	0 %	0 %	556560058
11	NC_022655	ATGGT	2	10	3074	3083	20 %	40 %	40 %	0 %	556560058
12	NC_022655	AAC	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
13	NC_022655	AAG	3	9	3212	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
14	NC_022655	GCT	2	6	3283	3288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
15	NC_022655	GAT	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
16	NC_022655	GAA	2	6	3424	3429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
17	NC_022655	CAA	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
18	NC_022655	GATA	2	8	3465	3472	50 %	25 %	25 %	0 %	556560058
19	NC_022655	ATG	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
20	NC_022655	TCA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560058
21	NC_022655	TGG	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560058
22	NC_022655	CAAG	2	8	3629	3636	50 %	0 %	25 %	25 %	556560058
23	NC_022655	GTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560058
24	NC_022655	TGA	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560058
25	NC_022655	ACA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560058
26	NC_022655	GTC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
27	NC_022655	CGT	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
28	NC_022655	GGTT	2	8	3784	3791	0 %	50 %	50 %	0 %	556560058
29	NC_022655	CGT	2	6	3817	3822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
30	NC_022655	CTTT	2	8	3841	3848	0 %	75 %	0 %	25 %	556560058
31	NC_022655	TG	3	6	3892	3897	0 %	50 %	50 %	0 %	556560058
32	NC_022655	ACT	2	6	3926	3931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560058
33	NC_022655	CTAT	2	8	3968	3975	25 %	50 %	0 %	25 %	556560058
34	NC_022655	AGA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560058
35	NC_022655	TCG	2	6	4056	4061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560058
36	NC_022655	TTGG	2	8	4072	4079	0 %	50 %	50 %	0 %	556560058
37	NC_022655	AACA	2	8	4118	4125	75 %	0 %	0 %	25 %	556560058
38	NC_022655	TAT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560059
39	NC_022655	GAA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560059
40	NC_022655	AAG	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560059
41	NC_022655	GAGG	2	8	4388	4395	25 %	0 %	75 %	0 %	556560059
42	NC_022655	GA	3	6	4400	4405	50 %	0 %	50 %	0 %	556560059
43	NC_022655	TG	3	6	4446	4451	0 %	50 %	50 %	0 %	556560059
44	NC_022655	AGCG	2	8	4507	4514	25 %	0 %	50 %	25 %	556560059
45	NC_022655	ATGC	2	8	4518	4525	25 %	25 %	25 %	25 %	556560059
46	NC_022655	GCT	2	6	4689	4694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560059
47	NC_022655	ATC	2	6	4732	4737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560059
48	NC_022655	T	7	7	4793	4799	0 %	100 %	0 %	0 %	556560059
49	NC_022655	A	6	6	4812	4817	100 %	0 %	0 %	0 %	556560059
50	NC_022655	GTT	2	6	5118	5123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561944
51	NC_022655	GA	3	6	5131	5136	50 %	0 %	50 %	0 %	556561944
52	NC_022655	TTC	2	6	5204	5209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556561944
53	NC_022655	AAG	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561944
54	NC_022655	TTAA	2	8	5235	5242	50 %	50 %	0 %	0 %	556561944
55	NC_022655	ATT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556561944
56	NC_022655	GAA	2	6	5312	5317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556561944
57	NC_022655	GTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556561944
58	NC_022655	TGG	2	6	5423	5428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556561944
59	NC_022655	TA	3	6	5512	5517	50 %	50 %	0 %	0 %	556560060
60	NC_022655	GCA	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560060
61	NC_022655	AAT	2	6	5607	5612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560060
62	NC_022655	TCT	2	6	5617	5622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560060
63	NC_022655	TTA	2	6	5695	5700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560060
64	NC_022655	AGA	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560060
65	NC_022655	ATGT	2	8	5841	5848	25 %	50 %	25 %	0 %	556560060
66	NC_022655	GTT	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560060
67	NC_022655	GATT	2	8	5925	5932	25 %	50 %	25 %	0 %	556560060
68	NC_022655	GT	3	6	6117	6122	0 %	50 %	50 %	0 %	556560061
69	NC_022655	GGA	2	6	6202	6207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560061
70	NC_022655	GAG	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560061
71	NC_022655	CAG	2	6	6362	6367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560061
72	NC_022655	CCAG	2	8	6466	6473	25 %	0 %	25 %	50 %	556560061
73	NC_022655	ATT	2	6	6482	6487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560061
74	NC_022655	TCCA	2	8	6491	6498	25 %	25 %	0 %	50 %	556560061
75	NC_022655	CAT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560061
76	NC_022655	AAG	2	6	6627	6632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560061
77	NC_022655	TGG	2	6	6666	6671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560061
78	NC_022655	CAC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556560061
79	NC_022655	GGC	2	6	6782	6787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560061
80	NC_022655	AGA	2	6	6823	6828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560061
81	NC_022655	TCC	2	6	6851	6856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560061
82	NC_022655	TAC	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560061
83	NC_022655	CTG	2	6	7044	7049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560061
84	NC_022655	GTG	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560061
85	NC_022655	GA	3	6	7170	7175	50 %	0 %	50 %	0 %	556560061
86	NC_022655	AGG	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556560062
87	NC_022655	GGT	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560062
88	NC_022655	TTCG	2	8	7620	7627	0 %	50 %	25 %	25 %	556560062
89	NC_022655	CAA	2	6	7643	7648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560062
90	NC_022655	AG	3	6	7658	7663	50 %	0 %	50 %	0 %	556560062
91	NC_022655	CTT	2	6	7768	7773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560062
92	NC_022655	AGA	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560062
93	NC_022655	GAA	2	6	7939	7944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
94	NC_022655	TATTT	2	10	7951	7960	20 %	80 %	0 %	0 %	556560063
95	NC_022655	TTTTA	2	10	7963	7972	20 %	80 %	0 %	0 %	556560063
96	NC_022655	CTA	2	6	8005	8010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560063
97	NC_022655	ACGG	2	8	8012	8019	25 %	0 %	50 %	25 %	556560063
98	NC_022655	CT	3	6	8070	8075	0 %	50 %	0 %	50 %	556560063
99	NC_022655	A	6	6	8117	8122	100 %	0 %	0 %	0 %	556560063
100	NC_022655	AAG	2	6	8135	8140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
101	NC_022655	GGGA	2	8	8161	8168	25 %	0 %	75 %	0 %	556560063
102	NC_022655	AGA	2	6	8290	8295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560063
103	NC_022655	ATT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560063
104	NC_022655	TTGTTT	2	12	8316	8327	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	556560063
105	NC_022655	ATC	2	6	8477	8482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560063
106	NC_022655	GTA	2	6	8522	8527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560063
107	NC_022655	CTT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560063
108	NC_022655	CT	3	6	8691	8696	0 %	50 %	0 %	50 %	556560063
109	NC_022655	TTG	2	6	8721	8726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560063
110	NC_022655	TGA	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560063
111	NC_022655	TCT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560064
112	NC_022655	GA	3	6	9015	9020	50 %	0 %	50 %	0 %	556560064
113	NC_022655	GAA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560064
114	NC_022655	TGT	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560064
115	NC_022655	TGC	2	6	9292	9297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560064
116	NC_022655	CTC	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560064
117	NC_022655	ATT	2	6	9360	9365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560064
118	NC_022655	CGT	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560064
119	NC_022655	TGGT	2	8	9381	9388	0 %	50 %	50 %	0 %	556560064
120	NC_022655	TAT	2	6	9472	9477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560064
121	NC_022655	CAT	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556560064
122	NC_022655	TTGA	2	8	9560	9567	25 %	50 %	25 %	0 %	556560064
123	NC_022655	TGAT	2	8	9573	9580	25 %	50 %	25 %	0 %	556560064
124	NC_022655	TTCT	2	8	9663	9670	0 %	75 %	0 %	25 %	556560064
125	NC_022655	GTT	2	6	9716	9721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560064
126	NC_022655	ATCT	2	8	9731	9738	25 %	50 %	0 %	25 %	556560064
127	NC_022655	AGA	2	6	9742	9747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560064
128	NC_022655	TGAT	2	8	9753	9760	25 %	50 %	25 %	0 %	556560064
129	NC_022655	CGTA	2	8	9805	9812	25 %	25 %	25 %	25 %	556560064
130	NC_022655	A	7	7	9854	9860	100 %	0 %	0 %	0 %	556560064
131	NC_022655	ACA	2	6	10410	10415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560065
132	NC_022655	GCTG	2	8	10449	10456	0 %	25 %	50 %	25 %	556560065
133	NC_022655	AGA	2	6	10472	10477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560065
134	NC_022655	CTTC	2	8	10523	10530	0 %	50 %	0 %	50 %	556560065
135	NC_022655	TTC	2	6	10612	10617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560065
136	NC_022655	TCC	2	6	10649	10654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556560065
137	NC_022655	CAG	2	6	10675	10680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560065
138	NC_022655	TTG	2	6	10727	10732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560065
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141	NC_022655	TTA	2	6	11586	11591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560066
142	NC_022655	TTGA	2	8	11592	11599	25 %	50 %	25 %	0 %	556560066
143	NC_022655	TCT	2	6	11604	11609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560066
144	NC_022655	T	6	6	11625	11630	0 %	100 %	0 %	0 %	556560066
145	NC_022655	CAG	2	6	11640	11645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560066
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147	NC_022655	TGG	2	6	11749	11754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560066
148	NC_022655	GAC	2	6	11771	11776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560066
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150	NC_022655	TGA	2	6	11828	11833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560066
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153	NC_022655	GGT	2	6	12020	12025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556560066
154	NC_022655	GAA	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556560066
155	NC_022655	ATA	2	6	12148	12153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556560066
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158	NC_022655	GTC	2	6	12446	12451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560066
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161	NC_022655	A	6	6	12661	12666	100 %	0 %	0 %	0 %	556560066
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166	NC_022655	TGA	3	9	12836	12844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560066
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168	NC_022655	AAGA	2	8	13053	13060	75 %	0 %	25 %	0 %	556560066
169	NC_022655	CTTG	2	8	13064	13071	0 %	50 %	25 %	25 %	556560066
170	NC_022655	GCTG	2	8	13127	13134	0 %	25 %	50 %	25 %	556560066
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172	NC_022655	CAG	2	6	13240	13245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560066
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245	NC_022655	GA	3	6	17315	17320	50 %	0 %	50 %	0 %	556560070
246	NC_022655	T	6	6	17429	17434	0 %	100 %	0 %	0 %	556560071
247	NC_022655	ATG	2	6	17511	17516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560071
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249	NC_022655	T	6	6	17665	17670	0 %	100 %	0 %	0 %	556560071
250	NC_022655	GT	3	6	17779	17784	0 %	50 %	50 %	0 %	556560071
251	NC_022655	TTTC	2	8	17817	17824	0 %	75 %	0 %	25 %	556560071
252	NC_022655	GA	3	6	17867	17872	50 %	0 %	50 %	0 %	556560071
253	NC_022655	TCAA	2	8	17907	17914	50 %	25 %	0 %	25 %	556560071
254	NC_022655	CAAG	2	8	17968	17975	50 %	0 %	25 %	25 %	556560071
255	NC_022655	A	7	7	18094	18100	100 %	0 %	0 %	0 %	556560071
256	NC_022655	G	6	6	18117	18122	0 %	0 %	100 %	0 %	556560072
257	NC_022655	TCAA	2	8	18155	18162	50 %	25 %	0 %	25 %	556560072
258	NC_022655	GATT	2	8	18273	18280	25 %	50 %	25 %	0 %	556560072
259	NC_022655	GAT	2	6	18283	18288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560072
260	NC_022655	GCT	2	6	18406	18411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556560072
261	NC_022655	TTC	2	6	18415	18420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556560072
262	NC_022655	TTCT	2	8	18564	18571	0 %	75 %	0 %	25 %	556560072
263	NC_022655	GCTT	2	8	18611	18618	0 %	50 %	25 %	25 %	556560072
264	NC_022655	AAC	2	6	18619	18624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556560072
265	NC_022655	AG	3	6	18630	18635	50 %	0 %	50 %	0 %	556560072
266	NC_022655	GGC	2	6	18678	18683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556560072
267	NC_022655	TGA	2	6	18684	18689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560072
268	NC_022655	TGA	2	6	18728	18733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560072
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272	NC_022655	A	6	6	18904	18909	100 %	0 %	0 %	0 %	556560072
273	NC_022655	ATT	2	6	18917	18922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560072
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275	NC_022655	TGT	2	6	18963	18968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556560072
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291	NC_022655	TAT	2	6	20111	20116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556560076
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296	NC_022655	A	6	6	20211	20216	100 %	0 %	0 %	0 %	556560076
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299	NC_022655	T	6	6	20904	20909	0 %	100 %	0 %	0 %	556560077
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302	NC_022655	GAC	2	6	20949	20954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556560077
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392	NC_022655	GAT	2	6	26122	26127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556560080
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493	NC_022655	AAGA	2	8	31542	31549	75 %	0 %	25 %	0 %	556560082
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