MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Z172 plasmid pZ172_2

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022605	ATA	2	6	658	663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554645847
2	NC_022605	CTT	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554645847
3	NC_022605	TCA	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554645847
4	NC_022605	ATTA	2	8	745	752	50 %	50 %	0 %	0 %	554645847
5	NC_022605	CCA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554645847
6	NC_022605	T	7	7	872	878	0 %	100 %	0 %	0 %	554645847
7	NC_022605	A	6	6	893	898	100 %	0 %	0 %	0 %	554645847
8	NC_022605	TTC	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554645847
9	NC_022605	TA	3	6	1054	1059	50 %	50 %	0 %	0 %	554645847
10	NC_022605	T	7	7	1066	1072	0 %	100 %	0 %	0 %	554645847
11	NC_022605	CAT	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554645847
12	NC_022605	TTA	2	6	1136	1141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554645847
13	NC_022605	CAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554645847
14	NC_022605	TTAG	2	8	1220	1227	25 %	50 %	25 %	0 %	554645847
15	NC_022605	CAAC	2	8	1291	1298	50 %	0 %	0 %	50 %	554645847
16	NC_022605	CTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554645847
17	NC_022605	TCGG	2	8	1439	1446	0 %	25 %	50 %	25 %	554645847
18	NC_022605	T	6	6	1490	1495	0 %	100 %	0 %	0 %	554645847
19	NC_022605	TTTTC	2	10	1539	1548	0 %	80 %	0 %	20 %	554645847
20	NC_022605	TC	3	6	1547	1552	0 %	50 %	0 %	50 %	554645847
21	NC_022605	GTT	2	6	1560	1565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554645847
22	NC_022605	TAT	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554645847
23	NC_022605	TAG	2	6	1623	1628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554645847
24	NC_022605	TAT	2	6	1629	1634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554645847
25	NC_022605	TAAA	2	8	1878	1885	75 %	25 %	0 %	0 %	554645848
26	NC_022605	AATA	2	8	1904	1911	75 %	25 %	0 %	0 %	554645848
27	NC_022605	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554645848
28	NC_022605	A	6	6	1996	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	554645848
29	NC_022605	TAAA	2	8	2002	2009	75 %	25 %	0 %	0 %	554645848
30	NC_022605	AATG	2	8	2092	2099	50 %	25 %	25 %	0 %	554645849
31	NC_022605	A	6	6	2106	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	554645849
32	NC_022605	T	6	6	2149	2154	0 %	100 %	0 %	0 %	554645849
33	NC_022605	AATTTT	2	12	2177	2188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554645849
34	NC_022605	AAG	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554645849
35	NC_022605	CAAAA	2	10	2204	2213	80 %	0 %	0 %	20 %	554645849
36	NC_022605	ACA	2	6	2214	2219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554645849
37	NC_022605	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	554645849
38	NC_022605	ATT	2	6	2291	2296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554645849
39	NC_022605	GATATG	2	12	2352	2363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554645849
40	NC_022605	TGG	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554645849
41	NC_022605	GCA	2	6	2525	2530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554645849
42	NC_022605	TGA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554645849
43	NC_022605	GCA	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554645849
44	NC_022605	A	7	7	2572	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	554645849
45	NC_022605	CTA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554645849

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.