MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of strain 284/09 Stolbur phytoplasma draft

Total Repeats: 13453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022588	ATT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
2	NC_022588	TGA	2	6	86	91	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085531
3	NC_022588	AACTT	2	10	115	124	40 %	40 %	0 %	20 %	554085531
4	NC_022588	TTTA	2	8	130	137	25 %	75 %	0 %	0 %	554085531
5	NC_022588	A	8	8	144	151	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
6	NC_022588	T	7	7	158	164	0 %	100 %	0 %	0 %	554085531
7	NC_022588	CAA	2	6	180	185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554085531
8	NC_022588	T	6	6	227	232	0 %	100 %	0 %	0 %	554085531
9	NC_022588	ATTA	2	8	236	243	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
10	NC_022588	TCA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554085531
11	NC_022588	AAT	2	6	306	311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085531
12	NC_022588	ATA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085531
13	NC_022588	ATT	2	6	356	361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
14	NC_022588	ATAAA	2	10	409	418	80 %	20 %	0 %	0 %	554085531
15	NC_022588	AAT	2	6	419	424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085531
16	NC_022588	AGA	2	6	443	448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554085531
17	NC_022588	CAC	2	6	466	471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554085531
18	NC_022588	ATT	2	6	491	496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
19	NC_022588	T	7	7	577	583	0 %	100 %	0 %	0 %	554085531
20	NC_022588	ATA	2	6	616	621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085531
21	NC_022588	ATT	2	6	635	640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
22	NC_022588	A	7	7	662	668	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
23	NC_022588	A	6	6	698	703	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
24	NC_022588	TTA	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
25	NC_022588	TAT	2	6	714	719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
26	NC_022588	A	6	6	739	744	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
27	NC_022588	ATT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
28	NC_022588	AAG	2	6	763	768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554085531
29	NC_022588	A	7	7	812	818	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
30	NC_022588	ATTCTT	2	12	829	840	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	554085531
31	NC_022588	TTA	2	6	846	851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
32	NC_022588	ATT	2	6	863	868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
33	NC_022588	A	7	7	890	896	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
34	NC_022588	AAATT	2	10	955	964	60 %	40 %	0 %	0 %	554085531
35	NC_022588	A	7	7	971	977	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
36	NC_022588	AT	3	6	1028	1033	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
37	NC_022588	TTA	2	6	1067	1072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
38	NC_022588	ATG	2	6	1150	1155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085531
39	NC_022588	GAT	2	6	1200	1205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085531
40	NC_022588	TGA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085531
41	NC_022588	TTA	2	6	1300	1305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
42	NC_022588	A	8	8	1425	1432	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
43	NC_022588	GAT	2	6	1434	1439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085531
44	NC_022588	AT	3	6	1445	1450	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
45	NC_022588	A	8	8	1461	1468	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
46	NC_022588	AATT	2	8	1480	1487	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
47	NC_022588	AG	3	6	1605	1610	50 %	0 %	50 %	0 %	554085531
48	NC_022588	TTTTGA	2	12	1706	1717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	554085531
49	NC_022588	ATG	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085531
50	NC_022588	AAT	2	6	1758	1763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085531
51	NC_022588	TAT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
52	NC_022588	A	7	7	1826	1832	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
53	NC_022588	TAA	2	6	1847	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085531
54	NC_022588	TTG	2	6	1867	1872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554085531
55	NC_022588	A	8	8	1892	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	554085531
56	NC_022588	TA	3	6	1927	1932	50 %	50 %	0 %	0 %	554085531
57	NC_022588	TAA	2	6	1943	1948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085531
58	NC_022588	ATT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085531
59	NC_022588	AAT	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085532
60	NC_022588	ATT	2	6	2387	2392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085532
61	NC_022588	T	7	7	2398	2404	0 %	100 %	0 %	0 %	554085532
62	NC_022588	TGT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554085532
63	NC_022588	A	7	7	2479	2485	100 %	0 %	0 %	0 %	554085532
64	NC_022588	CGT	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554085532
65	NC_022588	AGA	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554085532
66	NC_022588	TA	3	6	2577	2582	50 %	50 %	0 %	0 %	554085532
67	NC_022588	T	6	6	2704	2709	0 %	100 %	0 %	0 %	554085532
68	NC_022588	ATT	2	6	2716	2721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085532
69	NC_022588	ATT	2	6	2757	2762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085532
70	NC_022588	TCT	2	6	2765	2770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554085532
71	NC_022588	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085532
72	NC_022588	T	7	7	2872	2878	0 %	100 %	0 %	0 %	554085532
73	NC_022588	ATT	2	6	2885	2890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085532
74	NC_022588	T	7	7	2889	2895	0 %	100 %	0 %	0 %	554085532
75	NC_022588	TTA	3	9	2912	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085532
76	NC_022588	TAA	2	6	2932	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085532
77	NC_022588	CTT	2	6	2938	2943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554085532
78	NC_022588	TAA	2	6	2958	2963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085532
79	NC_022588	ATT	2	6	2978	2983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085532
80	NC_022588	A	7	7	2993	2999	100 %	0 %	0 %	0 %	554085532
81	NC_022588	AT	3	6	3482	3487	50 %	50 %	0 %	0 %	554085533
82	NC_022588	TAT	2	6	3494	3499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085533
83	NC_022588	GTTGAA	2	12	3537	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085533
84	NC_022588	GTA	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085533
85	NC_022588	ATT	2	6	3696	3701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085533
86	NC_022588	TAA	2	6	3779	3784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085533
87	NC_022588	T	6	6	3848	3853	0 %	100 %	0 %	0 %	554085533
88	NC_022588	TA	3	6	3873	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	554085533
89	NC_022588	ATG	2	6	3912	3917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085533
90	NC_022588	ATT	2	6	3921	3926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085533
91	NC_022588	TGG	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554085533
92	NC_022588	TCA	2	6	4034	4039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554085533
93	NC_022588	CTA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554085533
94	NC_022588	TGA	2	6	4085	4090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085533
95	NC_022588	CGAA	2	8	4117	4124	50 %	0 %	25 %	25 %	554085533
96	NC_022588	ATT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085533
97	NC_022588	T	7	7	4186	4192	0 %	100 %	0 %	0 %	554085533
98	NC_022588	A	6	6	4236	4241	100 %	0 %	0 %	0 %	554085533
99	NC_022588	TAG	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085533
100	NC_022588	TTA	2	6	4295	4300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085533
101	NC_022588	TGGAT	2	10	4343	4352	20 %	40 %	40 %	0 %	554085533
102	NC_022588	TGA	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085533
103	NC_022588	ATA	2	6	4468	4473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085533
104	NC_022588	AAATC	2	10	4499	4508	60 %	20 %	0 %	20 %	554085533
105	NC_022588	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	554085533
106	NC_022588	CTT	2	6	4555	4560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554085533
107	NC_022588	TCGCA	2	10	4575	4584	20 %	20 %	20 %	40 %	554085533
108	NC_022588	ACG	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554085533
109	NC_022588	ATT	2	6	4694	4699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085533
110	NC_022588	ATA	2	6	4716	4721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085533
111	NC_022588	A	7	7	4760	4766	100 %	0 %	0 %	0 %	554085533
112	NC_022588	A	6	6	4768	4773	100 %	0 %	0 %	0 %	554085533
113	NC_022588	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085534
114	NC_022588	TTTA	2	8	4919	4926	25 %	75 %	0 %	0 %	554085534
115	NC_022588	T	6	6	4952	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	554085534
116	NC_022588	ATCA	2	8	5072	5079	50 %	25 %	0 %	25 %	554085534
117	NC_022588	TAA	2	6	5091	5096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085534
118	NC_022588	T	6	6	5133	5138	0 %	100 %	0 %	0 %	554085534
119	NC_022588	TCAC	2	8	5211	5218	25 %	25 %	0 %	50 %	554085534
120	NC_022588	TTTG	2	8	5238	5245	0 %	75 %	25 %	0 %	554085534
121	NC_022588	A	7	7	5253	5259	100 %	0 %	0 %	0 %	554085534
122	NC_022588	AAAC	2	8	5272	5279	75 %	0 %	0 %	25 %	554085534
123	NC_022588	T	6	6	5334	5339	0 %	100 %	0 %	0 %	554085534
124	NC_022588	ATT	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085534
125	NC_022588	ATA	2	6	5408	5413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554085534
126	NC_022588	ACT	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554085534
127	NC_022588	A	6	6	5455	5460	100 %	0 %	0 %	0 %	554085534
128	NC_022588	T	6	6	5466	5471	0 %	100 %	0 %	0 %	554085534
129	NC_022588	CAAA	2	8	5484	5491	75 %	0 %	0 %	25 %	554085534
130	NC_022588	CAA	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554085534
131	NC_022588	TTA	2	6	5528	5533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085534
132	NC_022588	TGT	2	6	5541	5546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554085534
133	NC_022588	GAT	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554085534
134	NC_022588	ATT	2	6	5654	5659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085534
135	NC_022588	A	6	6	5693	5698	100 %	0 %	0 %	0 %	554085534
136	NC_022588	A	6	6	5703	5708	100 %	0 %	0 %	0 %	554085534
137	NC_022588	TTA	2	6	5713	5718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554085534
138	NC_022588	AAG	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554085534
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