MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 89274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_022569	CAG	2	6	110845	110850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899522
2003	NC_022569	TTC	2	6	110935	110940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899522
2004	NC_022569	CG	3	6	110989	110994	0 %	0 %	50 %	50 %	550899522
2005	NC_022569	T	6	6	111066	111071	0 %	100 %	0 %	0 %	550899522
2006	NC_022569	GAC	2	6	111123	111128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899522
2007	NC_022569	CAG	2	6	111142	111147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899522
2008	NC_022569	GC	3	6	111240	111245	0 %	0 %	50 %	50 %	550899522
2009	NC_022569	TCT	2	6	111251	111256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899522
2010	NC_022569	GGC	3	9	111268	111276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899522
2011	NC_022569	CGG	2	6	111315	111320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899522
2012	NC_022569	TTCGCG	2	12	111331	111342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899522
2013	NC_022569	GGT	2	6	111367	111372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899522
2014	NC_022569	CCA	2	6	111457	111462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899522
2015	NC_022569	CG	3	6	111542	111547	0 %	0 %	50 %	50 %	550899522
2016	NC_022569	CGGCAG	2	12	111589	111600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	550899522
2017	NC_022569	TCA	2	6	111707	111712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899522
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2020	NC_022569	TCG	2	6	111806	111811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899522
2021	NC_022569	CAG	2	6	111832	111837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899522
2022	NC_022569	TTC	2	6	111877	111882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899522
2023	NC_022569	CAG	2	6	111919	111924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899522
2024	NC_022569	TGGCG	2	10	111964	111973	0 %	20 %	60 %	20 %	550899522
2025	NC_022569	CAG	3	9	111976	111984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899522
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2033	NC_022569	CGT	2	6	112188	112193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899522
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2041	NC_022569	CGA	2	6	112409	112414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899522
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2044	NC_022569	AGCGC	2	10	112524	112533	20 %	0 %	40 %	40 %	550899522
2045	NC_022569	TCGA	2	8	112546	112553	25 %	25 %	25 %	25 %	550899522
2046	NC_022569	TCT	2	6	112682	112687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899522
2047	NC_022569	GC	3	6	112777	112782	0 %	0 %	50 %	50 %	550899522
2048	NC_022569	CATC	2	8	112833	112840	25 %	25 %	0 %	50 %	550899522
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2052	NC_022569	TTCC	2	8	113147	113154	0 %	50 %	0 %	50 %	550899523
2053	NC_022569	GCG	2	6	113198	113203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899523
2054	NC_022569	CTG	2	6	113205	113210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899523
2055	NC_022569	GAC	2	6	113282	113287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899523
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2058	NC_022569	ACGTT	2	10	113341	113350	20 %	40 %	20 %	20 %	550899523
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2061	NC_022569	GCTG	2	8	113555	113562	0 %	25 %	50 %	25 %	550899523
2062	NC_022569	T	6	6	113592	113597	0 %	100 %	0 %	0 %	550899523
2063	NC_022569	CCGCG	2	10	113609	113618	0 %	0 %	40 %	60 %	550899523
2064	NC_022569	CTCCAG	2	12	113658	113669	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	550899523
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2112	NC_022569	CTGA	2	8	116002	116009	25 %	25 %	25 %	25 %	550899524
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2114	NC_022569	TGA	2	6	116079	116084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899524
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2120	NC_022569	A	6	6	117007	117012	100 %	0 %	0 %	0 %	550899525
2121	NC_022569	ATT	2	6	117029	117034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899525
2122	NC_022569	CAA	2	6	117066	117071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899525
2123	NC_022569	TTC	2	6	117086	117091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899525
2124	NC_022569	GGAA	2	8	117100	117107	50 %	0 %	50 %	0 %	550899525
2125	NC_022569	ATT	2	6	117134	117139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899525
2126	NC_022569	AT	3	6	117187	117192	50 %	50 %	0 %	0 %	550899525
2127	NC_022569	TCA	2	6	117205	117210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899525
2128	NC_022569	C	6	6	117216	117221	0 %	0 %	0 %	100 %	550899525
2129	NC_022569	CAG	2	6	117295	117300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899526
2130	NC_022569	TGC	2	6	117305	117310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899526
2131	NC_022569	GCG	2	6	117324	117329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899526
2132	NC_022569	GGC	2	6	117336	117341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899526
2133	NC_022569	AGA	2	6	117342	117347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550899526
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2135	NC_022569	GCG	2	6	117458	117463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899526
2136	NC_022569	CAA	2	6	117489	117494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899526
2137	NC_022569	GGT	2	6	117589	117594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899526
2138	NC_022569	GT	3	6	117653	117658	0 %	50 %	50 %	0 %	550899526
2139	NC_022569	GCC	2	6	117664	117669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899526
2140	NC_022569	ACA	2	6	117690	117695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899526
2141	NC_022569	GAC	2	6	117716	117721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899526
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2143	NC_022569	CGC	2	6	117828	117833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899526
2144	NC_022569	TCT	2	6	117929	117934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899526
2145	NC_022569	CAGCG	2	10	118111	118120	20 %	0 %	40 %	40 %	550899527
2146	NC_022569	ATCA	2	8	118152	118159	50 %	25 %	0 %	25 %	550899527
2147	NC_022569	GC	3	6	118238	118243	0 %	0 %	50 %	50 %	550899527
2148	NC_022569	GCCA	2	8	118245	118252	25 %	0 %	25 %	50 %	550899527
2149	NC_022569	GCG	2	6	118334	118339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899527
2150	NC_022569	CAG	2	6	118365	118370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899527
2151	NC_022569	CGA	2	6	118403	118408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899527
2152	NC_022569	GCCGG	2	10	118411	118420	0 %	0 %	60 %	40 %	550899527
2153	NC_022569	GCC	2	6	118458	118463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899527
2154	NC_022569	GGAC	2	8	118512	118519	25 %	0 %	50 %	25 %	550899527
2155	NC_022569	AC	3	6	118518	118523	50 %	0 %	0 %	50 %	550899527
2156	NC_022569	CGAGC	2	10	118536	118545	20 %	0 %	40 %	40 %	550899527
2157	NC_022569	TCC	2	6	118582	118587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550899527
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2160	NC_022569	TGC	2	6	118687	118692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899527
2161	NC_022569	GTA	2	6	118750	118755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899527
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2163	NC_022569	CGC	2	6	118812	118817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899527
2164	NC_022569	GGCG	2	8	118857	118864	0 %	0 %	75 %	25 %	550899527
2165	NC_022569	GCT	2	6	118875	118880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899527
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2169	NC_022569	GTCA	2	8	119007	119014	25 %	25 %	25 %	25 %	550899527
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2173	NC_022569	CCG	2	6	119194	119199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899527
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2179	NC_022569	TGT	2	6	119657	119662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899528
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2193	NC_022569	TGC	2	6	120224	120229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899528
2194	NC_022569	CAC	2	6	120328	120333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899528
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2196	NC_022569	CGG	2	6	120567	120572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899528
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2213	NC_022569	TCG	2	6	121226	121231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899528
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2217	NC_022569	ATCG	2	8	121748	121755	25 %	25 %	25 %	25 %	550899529
2218	NC_022569	AT	3	6	121774	121779	50 %	50 %	0 %	0 %	550899529
2219	NC_022569	TAA	3	9	121813	121821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899529
2220	NC_022569	TGTC	2	8	121834	121841	0 %	50 %	25 %	25 %	550899529
2221	NC_022569	AT	3	6	121851	121856	50 %	50 %	0 %	0 %	550899529
2222	NC_022569	CCG	2	6	121865	121870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899529
2223	NC_022569	TCA	2	6	121879	121884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899529
2224	NC_022569	GC	3	6	122015	122020	0 %	0 %	50 %	50 %	550899529
2225	NC_022569	ATC	2	6	122051	122056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899529
2226	NC_022569	CTG	2	6	122105	122110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899529
2227	NC_022569	GTT	2	6	122116	122121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899529
2228	NC_022569	TAAT	2	8	122139	122146	50 %	50 %	0 %	0 %	550899529
2229	NC_022569	CCG	2	6	122159	122164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899529
2230	NC_022569	TGCC	2	8	122185	122192	0 %	25 %	25 %	50 %	550899529
2231	NC_022569	CAG	2	6	122291	122296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899529
2232	NC_022569	A	6	6	122438	122443	100 %	0 %	0 %	0 %	550899529
2233	NC_022569	CTG	2	6	122616	122621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899530
2234	NC_022569	CGCTGG	2	12	122689	122700	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	550899530
2235	NC_022569	GC	3	6	122743	122748	0 %	0 %	50 %	50 %	550899530
2236	NC_022569	GCG	2	6	122758	122763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899530
2237	NC_022569	CTGG	2	8	122783	122790	0 %	25 %	50 %	25 %	550899530
2238	NC_022569	TAT	2	6	122795	122800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899530
2239	NC_022569	CTGG	2	8	122831	122838	0 %	25 %	50 %	25 %	550899530
2240	NC_022569	GCT	2	6	122894	122899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899530
2241	NC_022569	CGA	2	6	122968	122973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899530
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2243	NC_022569	GCC	2	6	123059	123064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899530
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2352	NC_022569	AATG	2	8	127942	127949	50 %	25 %	25 %	0 %	550899534
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2365	NC_022569	GTT	2	6	129077	129082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899535
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2368	NC_022569	GGC	2	6	129158	129163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899535
2369	NC_022569	GTC	2	6	129168	129173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899535
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2481	NC_022569	ATTG	2	8	136155	136162	25 %	50 %	25 %	0 %	550899541
2482	NC_022569	ATG	2	6	136166	136171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899541
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2486	NC_022569	GGT	2	6	136305	136310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899541
2487	NC_022569	A	7	7	136345	136351	100 %	0 %	0 %	0 %	550899541
2488	NC_022569	A	6	6	136455	136460	100 %	0 %	0 %	0 %	550899541
2489	NC_022569	GGT	2	6	136464	136469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899541
2490	NC_022569	CAT	2	6	136521	136526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899541
2491	NC_022569	GGT	2	6	136545	136550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899541
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