MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_022544	GCA	2	6	1045029	1045034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723640
19502	NC_022544	AGA	2	6	1045065	1045070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723640
19503	NC_022544	GCTG	2	8	1045148	1045155	0 %	25 %	50 %	25 %	549723640
19504	NC_022544	ACG	2	6	1045157	1045162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723640
19505	NC_022544	AC	3	6	1045215	1045220	50 %	0 %	0 %	50 %	549723640
19506	NC_022544	TGA	2	6	1045242	1045247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723640
19507	NC_022544	CTG	2	6	1045258	1045263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723640
19508	NC_022544	TTGA	2	8	1045333	1045340	25 %	50 %	25 %	0 %	549723640
19509	NC_022544	ATT	2	6	1045356	1045361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723640
19510	NC_022544	GAT	2	6	1045372	1045377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723640
19511	NC_022544	CT	3	6	1045405	1045410	0 %	50 %	0 %	50 %	549723640
19512	NC_022544	CTT	2	6	1045440	1045445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723640
19513	NC_022544	AGATG	2	10	1045449	1045458	40 %	20 %	40 %	0 %	549723640
19514	NC_022544	GCG	2	6	1045561	1045566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723641
19515	NC_022544	ACGCAG	2	12	1045637	1045648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723641
19516	NC_022544	ATA	2	6	1045698	1045703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723641
19517	NC_022544	GC	3	6	1045809	1045814	0 %	0 %	50 %	50 %	549723641
19518	NC_022544	CGA	2	6	1045840	1045845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723641
19519	NC_022544	AGT	2	6	1045873	1045878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723641
19520	NC_022544	CGG	2	6	1045933	1045938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723641
19521	NC_022544	TA	3	6	1045969	1045974	50 %	50 %	0 %	0 %	549723641
19522	NC_022544	GC	3	6	1046034	1046039	0 %	0 %	50 %	50 %	549723641
19523	NC_022544	TCT	2	6	1046052	1046057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723641
19524	NC_022544	GGCT	2	8	1046227	1046234	0 %	25 %	50 %	25 %	549723641
19525	NC_022544	GTA	2	6	1046273	1046278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723641
19526	NC_022544	T	6	6	1046373	1046378	0 %	100 %	0 %	0 %	549723641
19527	NC_022544	CGG	2	6	1046389	1046394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723641
19528	NC_022544	CGTG	2	8	1046432	1046439	0 %	25 %	50 %	25 %	549723641
19529	NC_022544	GC	3	6	1046458	1046463	0 %	0 %	50 %	50 %	549723641
19530	NC_022544	CAG	2	6	1046477	1046482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723641
19531	NC_022544	TCG	2	6	1046536	1046541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723641
19532	NC_022544	T	6	6	1046570	1046575	0 %	100 %	0 %	0 %	549723641
19533	NC_022544	TA	3	6	1046614	1046619	50 %	50 %	0 %	0 %	549723641
19534	NC_022544	GCG	2	6	1046700	1046705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723641
19535	NC_022544	GTAA	2	8	1046916	1046923	50 %	25 %	25 %	0 %	549723642
19536	NC_022544	GCC	2	6	1046932	1046937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723642
19537	NC_022544	TCG	2	6	1046941	1046946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19538	NC_022544	CAG	2	6	1046982	1046987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19539	NC_022544	AGT	2	6	1047029	1047034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723642
19540	NC_022544	CGCC	2	8	1047041	1047048	0 %	0 %	25 %	75 %	549723642
19541	NC_022544	AT	3	6	1047052	1047057	50 %	50 %	0 %	0 %	549723642
19542	NC_022544	GCC	2	6	1047075	1047080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723642
19543	NC_022544	TTTG	2	8	1047180	1047187	0 %	75 %	25 %	0 %	549723642
19544	NC_022544	CAA	2	6	1047218	1047223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723642
19545	NC_022544	GTT	2	6	1047267	1047272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723642
19546	NC_022544	CAT	2	6	1047275	1047280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723642
19547	NC_022544	CTG	2	6	1047333	1047338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19548	NC_022544	TTGCTG	2	12	1047352	1047363	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	549723642
19549	NC_022544	CGCCAT	2	12	1047416	1047427	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549723642
19550	NC_022544	AG	3	6	1047483	1047488	50 %	0 %	50 %	0 %	549723642
19551	NC_022544	CCA	2	6	1047494	1047499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723642
19552	NC_022544	AAG	2	6	1047505	1047510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723642
19553	NC_022544	CAA	2	6	1047528	1047533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723642
19554	NC_022544	GCC	2	6	1047573	1047578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723642
19555	NC_022544	CAT	2	6	1047626	1047631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723642
19556	NC_022544	CTG	2	6	1047720	1047725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19557	NC_022544	GAC	2	6	1047872	1047877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19558	NC_022544	TTA	2	6	1047904	1047909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723642
19559	NC_022544	TAT	2	6	1047917	1047922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723642
19560	NC_022544	CTG	2	6	1047929	1047934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19561	NC_022544	GCA	2	6	1047946	1047951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19562	NC_022544	CAG	2	6	1047954	1047959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723642
19563	NC_022544	TCA	2	6	1047992	1047997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723642
19564	NC_022544	TTAT	2	8	1047998	1048005	25 %	75 %	0 %	0 %	549723642
19565	NC_022544	ACC	2	6	1048748	1048753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723643
19566	NC_022544	ACC	2	6	1048827	1048832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723643
19567	NC_022544	GAT	2	6	1048833	1048838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723643
19568	NC_022544	GCC	2	6	1048870	1048875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723643
19569	NC_022544	TTTC	2	8	1048919	1048926	0 %	75 %	0 %	25 %	549723643
19570	NC_022544	CAC	2	6	1048938	1048943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723643
19571	NC_022544	AG	3	6	1048992	1048997	50 %	0 %	50 %	0 %	549723643
19572	NC_022544	GGC	2	6	1049279	1049284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723643
19573	NC_022544	CG	3	6	1049301	1049306	0 %	0 %	50 %	50 %	549723643
19574	NC_022544	GC	3	6	1049339	1049344	0 %	0 %	50 %	50 %	549723643
19575	NC_022544	A	6	6	1049400	1049405	100 %	0 %	0 %	0 %	549723643
19576	NC_022544	GAA	2	6	1049550	1049555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723643
19577	NC_022544	CG	3	6	1049588	1049593	0 %	0 %	50 %	50 %	549723643
19578	NC_022544	GCC	2	6	1049668	1049673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723643
19579	NC_022544	GGTA	2	8	1049678	1049685	25 %	25 %	50 %	0 %	549723643
19580	NC_022544	GCGAC	2	10	1049756	1049765	20 %	0 %	40 %	40 %	549723643
19581	NC_022544	TAC	2	6	1049778	1049783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723643
19582	NC_022544	AGC	2	6	1049789	1049794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723643
19583	NC_022544	GTC	2	6	1049797	1049802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723643
19584	NC_022544	CTT	2	6	1049813	1049818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723643
19585	NC_022544	ATT	2	6	1049838	1049843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723643
19586	NC_022544	AGGA	2	8	1049890	1049897	50 %	0 %	50 %	0 %	549723643
19587	NC_022544	CGG	2	6	1049917	1049922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723643
19588	NC_022544	CTT	2	6	1049948	1049953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723643
19589	NC_022544	ATA	2	6	1050004	1050009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723643
19590	NC_022544	CTTG	2	8	1050229	1050236	0 %	50 %	25 %	25 %	549723644
19591	NC_022544	GAAAA	2	10	1050285	1050294	80 %	0 %	20 %	0 %	549723644
19592	NC_022544	GTA	2	6	1050371	1050376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723644
19593	NC_022544	CTG	2	6	1050380	1050385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723644
19594	NC_022544	CAC	2	6	1050452	1050457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723644
19595	NC_022544	CAC	2	6	1050461	1050466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723644
19596	NC_022544	CCT	2	6	1050532	1050537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723644
19597	NC_022544	ACG	2	6	1050551	1050556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723644
19598	NC_022544	AAT	2	6	1050627	1050632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723644
19599	NC_022544	TTA	2	6	1050994	1050999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723645
19600	NC_022544	A	6	6	1051023	1051028	100 %	0 %	0 %	0 %	549723645
19601	NC_022544	A	6	6	1051095	1051100	100 %	0 %	0 %	0 %	549723645
19602	NC_022544	TCCA	2	8	1051167	1051174	25 %	25 %	0 %	50 %	549723645
19603	NC_022544	GGC	2	6	1051224	1051229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723645
19604	NC_022544	TGC	2	6	1051292	1051297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723645
19605	NC_022544	A	6	6	1051321	1051326	100 %	0 %	0 %	0 %	549723645
19606	NC_022544	GTG	2	6	1051372	1051377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723645
19607	NC_022544	GGC	2	6	1051385	1051390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723645
19608	NC_022544	CGT	2	6	1051412	1051417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723645
19609	NC_022544	ATC	2	6	1051433	1051438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723645
19610	NC_022544	CAT	2	6	1051464	1051469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723645
19611	NC_022544	GAT	2	6	1051503	1051508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723645
19612	NC_022544	CAAA	2	8	1051536	1051543	75 %	0 %	0 %	25 %	549723645
19613	NC_022544	AGC	2	6	1051642	1051647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723645
19614	NC_022544	AAAC	2	8	1051654	1051661	75 %	0 %	0 %	25 %	549723645
19615	NC_022544	A	6	6	1051738	1051743	100 %	0 %	0 %	0 %	549723645
19616	NC_022544	ATT	2	6	1051764	1051769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723645
19617	NC_022544	GAT	2	6	1051818	1051823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723645
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19735	NC_022544	GGT	2	6	1059951	1059956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723651
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19744	NC_022544	CGAT	2	8	1060519	1060526	25 %	25 %	25 %	25 %	549723651
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19845	NC_022544	GCC	2	6	1067931	1067936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723663
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19959	NC_022544	CTGA	2	8	1074529	1074536	25 %	25 %	25 %	25 %	549723673
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19991	NC_022544	A	7	7	1076071	1076077	100 %	0 %	0 %	0 %	549723673
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19994	NC_022544	GGT	2	6	1076111	1076116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723673
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19997	NC_022544	ACCC	2	8	1076419	1076426	25 %	0 %	0 %	75 %	549723674
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19999	NC_022544	ATC	2	6	1076585	1076590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723674
20000	NC_022544	TGG	2	6	1076769	1076774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723674

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