MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022544	GCT	2	6	79937	79942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722794
1502	NC_022544	CCAC	2	8	79966	79973	25 %	0 %	0 %	75 %	549722794
1503	NC_022544	GTC	2	6	80038	80043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722794
1504	NC_022544	TAT	2	6	80084	80089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722794
1505	NC_022544	ACC	2	6	80094	80099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722794
1506	NC_022544	CGC	2	6	80106	80111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722794
1507	NC_022544	CGC	2	6	80136	80141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722794
1508	NC_022544	GC	3	6	80143	80148	0 %	0 %	50 %	50 %	549722794
1509	NC_022544	CGG	2	6	80183	80188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722794
1510	NC_022544	ACG	2	6	80196	80201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722794
1511	NC_022544	TG	3	6	80551	80556	0 %	50 %	50 %	0 %	549722795
1512	NC_022544	GAT	2	6	80600	80605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722795
1513	NC_022544	TTGT	2	8	80713	80720	0 %	75 %	25 %	0 %	549722795
1514	NC_022544	GAT	2	6	80729	80734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722795
1515	NC_022544	TGCCAG	2	12	80760	80771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549722795
1516	NC_022544	GAAA	2	8	80835	80842	75 %	0 %	25 %	0 %	549722795
1517	NC_022544	C	6	6	80880	80885	0 %	0 %	0 %	100 %	549722795
1518	NC_022544	GAT	2	6	80915	80920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722795
1519	NC_022544	CGTC	2	8	81045	81052	0 %	25 %	25 %	50 %	549722796
1520	NC_022544	CGGT	2	8	81067	81074	0 %	25 %	50 %	25 %	549722796
1521	NC_022544	TTC	2	6	81076	81081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722796
1522	NC_022544	GTA	2	6	81195	81200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722796
1523	NC_022544	CG	3	6	81201	81206	0 %	0 %	50 %	50 %	549722796
1524	NC_022544	CCA	2	6	81216	81221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722796
1525	NC_022544	TTGCC	2	10	81226	81235	0 %	40 %	20 %	40 %	549722796
1526	NC_022544	GGC	2	6	81268	81273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722796
1527	NC_022544	CT	3	6	81281	81286	0 %	50 %	0 %	50 %	549722796
1528	NC_022544	CGTCC	2	10	81336	81345	0 %	20 %	20 %	60 %	549722796
1529	NC_022544	CAC	2	6	81346	81351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722796
1530	NC_022544	GGTATC	2	12	81403	81414	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549722796
1531	NC_022544	GCCT	2	8	81454	81461	0 %	25 %	25 %	50 %	549722796
1532	NC_022544	CAC	2	6	81580	81585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722796
1533	NC_022544	TCT	2	6	81788	81793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722797
1534	NC_022544	GCA	2	6	81798	81803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722797
1535	NC_022544	CGC	2	6	81825	81830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722797
1536	NC_022544	CTT	2	6	81849	81854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722797
1537	NC_022544	CG	3	6	81874	81879	0 %	0 %	50 %	50 %	549722797
1538	NC_022544	GTT	2	6	81927	81932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722797
1539	NC_022544	CG	3	6	81942	81947	0 %	0 %	50 %	50 %	549722797
1540	NC_022544	CTT	2	6	82005	82010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722797
1541	NC_022544	GCA	2	6	82062	82067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722797
1542	NC_022544	CGC	3	9	82086	82094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722797
1543	NC_022544	CCG	2	6	82164	82169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722797
1544	NC_022544	CCG	2	6	82187	82192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722797
1545	NC_022544	GCC	2	6	82264	82269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722797
1546	NC_022544	CAGC	2	8	82322	82329	25 %	0 %	25 %	50 %	549722797
1547	NC_022544	CGC	2	6	82347	82352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722797
1548	NC_022544	GGTC	2	8	82451	82458	0 %	25 %	50 %	25 %	549722797
1549	NC_022544	ACTC	2	8	82503	82510	25 %	25 %	0 %	50 %	549722797
1550	NC_022544	T	8	8	82576	82583	0 %	100 %	0 %	0 %	549722798
1551	NC_022544	ATT	2	6	82585	82590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722798
1552	NC_022544	TCA	2	6	82738	82743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722798
1553	NC_022544	ACCA	2	8	82761	82768	50 %	0 %	0 %	50 %	549722798
1554	NC_022544	ATA	2	6	82801	82806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722798
1555	NC_022544	CCG	2	6	82837	82842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722798
1556	NC_022544	CGA	2	6	82868	82873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1557	NC_022544	CATCCT	2	12	82886	82897	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	549722798
1558	NC_022544	CGG	2	6	83030	83035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722798
1559	NC_022544	TCG	2	6	83053	83058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1560	NC_022544	AAT	2	6	83133	83138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722798
1561	NC_022544	CAG	2	6	83172	83177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1562	NC_022544	TGC	2	6	83257	83262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1563	NC_022544	GCG	2	6	83275	83280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722798
1564	NC_022544	ATC	3	9	83302	83310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722798
1565	NC_022544	AGC	2	6	83383	83388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1566	NC_022544	TGC	2	6	83396	83401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1567	NC_022544	CGG	2	6	83402	83407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722798
1568	NC_022544	GCG	2	6	83422	83427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722798
1569	NC_022544	TCA	2	6	83476	83481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722798
1570	NC_022544	AGT	2	6	83507	83512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722798
1571	NC_022544	ACC	2	6	83545	83550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722798
1572	NC_022544	GGT	2	6	83565	83570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722798
1573	NC_022544	CCG	2	6	83591	83596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722798
1574	NC_022544	CGT	2	6	83675	83680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1575	NC_022544	GCT	2	6	83690	83695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1576	NC_022544	CAGA	2	8	83703	83710	50 %	0 %	25 %	25 %	549722798
1577	NC_022544	CAG	2	6	83781	83786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1578	NC_022544	TTC	2	6	83820	83825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722798
1579	NC_022544	A	6	6	83957	83962	100 %	0 %	0 %	0 %	549722798
1580	NC_022544	GTC	2	6	84075	84080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722798
1581	NC_022544	GGC	2	6	84260	84265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722799
1582	NC_022544	GTT	2	6	84311	84316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722799
1583	NC_022544	ATG	2	6	84330	84335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722799
1584	NC_022544	TTCAG	2	10	84453	84462	20 %	40 %	20 %	20 %	549722799
1585	NC_022544	GT	4	8	84489	84496	0 %	50 %	50 %	0 %	549722799
1586	NC_022544	GCCA	2	8	84498	84505	25 %	0 %	25 %	50 %	549722799
1587	NC_022544	CGA	2	6	84523	84528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722799
1588	NC_022544	GATG	2	8	84553	84560	25 %	25 %	50 %	0 %	549722799
1589	NC_022544	TG	3	6	84564	84569	0 %	50 %	50 %	0 %	549722799
1590	NC_022544	GGCCA	2	10	84602	84611	20 %	0 %	40 %	40 %	549722799
1591	NC_022544	GTA	2	6	84701	84706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722799
1592	NC_022544	CGC	2	6	84742	84747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722799
1593	NC_022544	AGT	2	6	84754	84759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722799
1594	NC_022544	CAT	2	6	84761	84766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722799
1595	NC_022544	GCA	2	6	84784	84789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722799
1596	NC_022544	GTC	2	6	84867	84872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722799
1597	NC_022544	CGG	2	6	84895	84900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722799
1598	NC_022544	CTC	2	6	85001	85006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722799
1599	NC_022544	TCA	2	6	85074	85079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722799
1600	NC_022544	CGG	2	6	85089	85094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722799
1601	NC_022544	GGT	2	6	85133	85138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722799
1602	NC_022544	GCG	2	6	85208	85213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722799
1603	NC_022544	A	6	6	85342	85347	100 %	0 %	0 %	0 %	549722799
1604	NC_022544	TCA	2	6	85396	85401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722799
1605	NC_022544	T	6	6	85416	85421	0 %	100 %	0 %	0 %	549722799
1606	NC_022544	TCA	2	6	85560	85565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722800
1607	NC_022544	ACC	2	6	85568	85573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722800
1608	NC_022544	GGT	2	6	85618	85623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722800
1609	NC_022544	CAG	2	6	85760	85765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722800
1610	NC_022544	CGA	2	6	85921	85926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722800
1611	NC_022544	CTT	2	6	85948	85953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722800
1612	NC_022544	CCGA	2	8	85979	85986	25 %	0 %	25 %	50 %	549722800
1613	NC_022544	CGT	2	6	86011	86016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722800
1614	NC_022544	CAG	2	6	86031	86036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722800
1615	NC_022544	TTG	2	6	86067	86072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722800
1616	NC_022544	TC	3	6	86142	86147	0 %	50 %	0 %	50 %	549722800
1617	NC_022544	ACA	2	6	86392	86397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722800
1618	NC_022544	GC	3	6	86407	86412	0 %	0 %	50 %	50 %	549722800
1619	NC_022544	TCCA	2	8	86427	86434	25 %	25 %	0 %	50 %	549722800
1620	NC_022544	CGG	2	6	86437	86442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722800
1621	NC_022544	CCG	2	6	86469	86474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722800
1622	NC_022544	TTC	2	6	86477	86482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722800
1623	NC_022544	CAG	2	6	86489	86494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722800
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1751	NC_022544	GGC	2	6	92687	92692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722806
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1755	NC_022544	TCG	2	6	92985	92990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722806
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1844	NC_022544	GCGCT	2	10	99395	99404	0 %	20 %	40 %	40 %	549722812
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1862	NC_022544	GCGAC	2	10	100122	100131	20 %	0 %	40 %	40 %	549722812
1863	NC_022544	GCG	2	6	100160	100165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722812
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1866	NC_022544	GCTGGG	2	12	100375	100386	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549722812
1867	NC_022544	GC	3	6	100405	100410	0 %	0 %	50 %	50 %	549722812
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1869	NC_022544	CGC	3	9	100483	100491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722812
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1871	NC_022544	TAAT	2	8	100835	100842	50 %	50 %	0 %	0 %	549722813
1872	NC_022544	GCG	2	6	100856	100861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722813
1873	NC_022544	CCTG	2	8	100909	100916	0 %	25 %	25 %	50 %	549722813
1874	NC_022544	TAAA	2	8	100947	100954	75 %	25 %	0 %	0 %	549722813
1875	NC_022544	GTC	2	6	100958	100963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722813
1876	NC_022544	CAG	2	6	101026	101031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722813
1877	NC_022544	CCAG	2	8	101032	101039	25 %	0 %	25 %	50 %	549722813
1878	NC_022544	CGA	2	6	101044	101049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722813
1879	NC_022544	GCG	2	6	101094	101099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722813
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1885	NC_022544	GCG	2	6	101656	101661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722814
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1982	NC_022544	GCCT	2	8	107324	107331	0 %	25 %	25 %	50 %	549722819
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1990	NC_022544	GCT	2	6	107704	107709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722819
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1994	NC_022544	GGC	2	6	107929	107934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722819
1995	NC_022544	TGA	2	6	108111	108116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722819
1996	NC_022544	TGG	2	6	108139	108144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722819
1997	NC_022544	AGA	2	6	108147	108152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722819
1998	NC_022544	T	6	6	108164	108169	0 %	100 %	0 %	0 %	549722819
1999	NC_022544	TGA	2	6	108466	108471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722820
2000	NC_022544	GCG	2	6	108475	108480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722820

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