MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_022544	TGG	2	6	909899	909904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723526
17003	NC_022544	GC	3	6	909944	909949	0 %	0 %	50 %	50 %	549723526
17004	NC_022544	CGG	2	6	909989	909994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723526
17005	NC_022544	GTC	2	6	910018	910023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723526
17006	NC_022544	CGA	2	6	910331	910336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723527
17007	NC_022544	A	6	6	910386	910391	100 %	0 %	0 %	0 %	549723527
17008	NC_022544	CTT	2	6	910445	910450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723527
17009	NC_022544	GC	3	6	910492	910497	0 %	0 %	50 %	50 %	549723527
17010	NC_022544	GTT	2	6	910520	910525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723527
17011	NC_022544	CTG	2	6	910572	910577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723527
17012	NC_022544	AGC	2	6	910585	910590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723527
17013	NC_022544	TCG	2	6	910597	910602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723527
17014	NC_022544	CAT	2	6	910799	910804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723527
17015	NC_022544	GTC	2	6	910876	910881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723527
17016	NC_022544	GTC	2	6	910914	910919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723527
17017	NC_022544	ATG	2	6	910939	910944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723527
17018	NC_022544	TGA	2	6	911027	911032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723527
17019	NC_022544	TAA	2	6	911033	911038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723527
17020	NC_022544	GC	3	6	911047	911052	0 %	0 %	50 %	50 %	549723527
17021	NC_022544	GAT	2	6	911198	911203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723528
17022	NC_022544	GAA	2	6	911234	911239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723528
17023	NC_022544	CACG	2	8	911257	911264	25 %	0 %	25 %	50 %	549723528
17024	NC_022544	T	6	6	911291	911296	0 %	100 %	0 %	0 %	549723528
17025	NC_022544	TGT	2	6	911326	911331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723528
17026	NC_022544	CGT	2	6	911414	911419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723528
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17028	NC_022544	CGC	2	6	911446	911451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723528
17029	NC_022544	GGTA	2	8	911465	911472	25 %	25 %	50 %	0 %	549723528
17030	NC_022544	CCG	2	6	911494	911499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723528
17031	NC_022544	GAT	2	6	911509	911514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723528
17032	NC_022544	GCC	2	6	911642	911647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723528
17033	NC_022544	TCA	2	6	911691	911696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723528
17034	NC_022544	GC	4	8	911712	911719	0 %	0 %	50 %	50 %	549723528
17035	NC_022544	CAG	2	6	911720	911725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17036	NC_022544	ATC	2	6	911738	911743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723528
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17038	NC_022544	GCT	2	6	911788	911793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17039	NC_022544	GCG	2	6	911826	911831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723528
17040	NC_022544	GCT	2	6	911836	911841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17041	NC_022544	T	6	6	911873	911878	0 %	100 %	0 %	0 %	549723528
17042	NC_022544	GCG	2	6	911883	911888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723528
17043	NC_022544	CGC	2	6	911947	911952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723528
17044	NC_022544	CTTG	2	8	911953	911960	0 %	50 %	25 %	25 %	549723528
17045	NC_022544	TCGC	2	8	911968	911975	0 %	25 %	25 %	50 %	549723528
17046	NC_022544	GTA	2	6	912074	912079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723528
17047	NC_022544	GGC	2	6	912098	912103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723528
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17049	NC_022544	GCC	2	6	912201	912206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723528
17050	NC_022544	TAA	2	6	912226	912231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723528
17051	NC_022544	CGG	2	6	912271	912276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723528
17052	NC_022544	CGC	2	6	912293	912298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723528
17053	NC_022544	TCA	2	6	912357	912362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723528
17054	NC_022544	CAG	2	6	912635	912640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17055	NC_022544	CAGC	2	8	912644	912651	25 %	0 %	25 %	50 %	549723528
17056	NC_022544	GCA	2	6	912658	912663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17057	NC_022544	CGA	2	6	912711	912716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
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17059	NC_022544	TGG	2	6	912840	912845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723528
17060	NC_022544	ACG	2	6	912887	912892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17061	NC_022544	CGCC	2	8	912910	912917	0 %	0 %	25 %	75 %	549723528
17062	NC_022544	GC	3	6	912923	912928	0 %	0 %	50 %	50 %	549723528
17063	NC_022544	GCG	2	6	913040	913045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723528
17064	NC_022544	CAG	3	9	913085	913093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17065	NC_022544	AGC	2	6	913198	913203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
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17067	NC_022544	CGT	2	6	913240	913245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17068	NC_022544	GTTT	2	8	913255	913262	0 %	75 %	25 %	0 %	549723528
17069	NC_022544	GCCGG	2	10	913286	913295	0 %	0 %	60 %	40 %	549723528
17070	NC_022544	GTC	2	6	913304	913309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723528
17071	NC_022544	CGGCG	2	10	913352	913361	0 %	0 %	60 %	40 %	549723528
17072	NC_022544	CGA	2	6	913384	913389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723528
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17077	NC_022544	CGG	2	6	913526	913531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723528
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17082	NC_022544	CGG	2	6	913881	913886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723529
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17085	NC_022544	CGC	2	6	914115	914120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723529
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17087	NC_022544	CGC	2	6	914208	914213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723529
17088	NC_022544	TG	3	6	914228	914233	0 %	50 %	50 %	0 %	549723529
17089	NC_022544	GCA	2	6	914236	914241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723529
17090	NC_022544	GATG	2	8	914283	914290	25 %	25 %	50 %	0 %	549723529
17091	NC_022544	GC	4	8	914304	914311	0 %	0 %	50 %	50 %	549723529
17092	NC_022544	GC	3	6	914334	914339	0 %	0 %	50 %	50 %	549723529
17093	NC_022544	CG	3	6	914366	914371	0 %	0 %	50 %	50 %	549723529
17094	NC_022544	GCGCGG	2	12	914390	914401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723529
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17098	NC_022544	TACG	2	8	915133	915140	25 %	25 %	25 %	25 %	549723530
17099	NC_022544	CGT	3	9	915199	915207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723530
17100	NC_022544	CG	3	6	915213	915218	0 %	0 %	50 %	50 %	549723530
17101	NC_022544	GGAAAC	2	12	915332	915343	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	549723530
17102	NC_022544	CGCCAG	2	12	915376	915387	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549723530
17103	NC_022544	GCCC	2	8	915415	915422	0 %	0 %	25 %	75 %	549723530
17104	NC_022544	AAT	2	6	915488	915493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723530
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17107	NC_022544	TTC	2	6	915752	915757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723531
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17112	NC_022544	AAT	2	6	916096	916101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723531
17113	NC_022544	GCA	2	6	916134	916139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723531
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17117	NC_022544	ACC	2	6	916328	916333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723531
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17119	NC_022544	GGC	2	6	916359	916364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723531
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17240	NC_022544	ATT	2	6	923053	923058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723536
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17353	NC_022544	TGAA	2	8	930373	930380	50 %	25 %	25 %	0 %	549723543
17354	NC_022544	TTACTG	2	12	930441	930452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549723543
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17360	NC_022544	ATC	2	6	930934	930939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723543
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17480	NC_022544	ATG	2	6	937713	937718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723550
17481	NC_022544	ACGG	2	8	937748	937755	25 %	0 %	50 %	25 %	549723550
17482	NC_022544	TGA	2	6	937904	937909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723550
17483	NC_022544	AGCG	2	8	937929	937936	25 %	0 %	50 %	25 %	549723550
17484	NC_022544	GGCGT	2	10	937960	937969	0 %	20 %	60 %	20 %	549723550
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17488	NC_022544	GCT	2	6	938366	938371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723551
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