MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022544	ATGCCG	2	12	856389	856400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549723477
16002	NC_022544	GCG	2	6	856457	856462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723477
16003	NC_022544	ACTC	2	8	856496	856503	25 %	25 %	0 %	50 %	549723478
16004	NC_022544	TC	4	8	856517	856524	0 %	50 %	0 %	50 %	549723478
16005	NC_022544	CTG	2	6	856665	856670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723478
16006	NC_022544	TGA	2	6	856688	856693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723478
16007	NC_022544	CGC	2	6	856733	856738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723478
16008	NC_022544	GC	3	6	856806	856811	0 %	0 %	50 %	50 %	549723478
16009	NC_022544	GCT	2	6	856949	856954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723478
16010	NC_022544	GC	3	6	856968	856973	0 %	0 %	50 %	50 %	549723478
16011	NC_022544	A	6	6	857009	857014	100 %	0 %	0 %	0 %	549723478
16012	NC_022544	GGC	2	6	857039	857044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16013	NC_022544	GCT	2	6	857060	857065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723478
16014	NC_022544	GTTT	2	8	857104	857111	0 %	75 %	25 %	0 %	549723478
16015	NC_022544	CCG	2	6	857134	857139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723478
16016	NC_022544	GCG	2	6	857146	857151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16017	NC_022544	GC	3	6	857196	857201	0 %	0 %	50 %	50 %	549723478
16018	NC_022544	CG	4	8	857210	857217	0 %	0 %	50 %	50 %	549723478
16019	NC_022544	ACA	2	6	857219	857224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723478
16020	NC_022544	CG	3	6	857240	857245	0 %	0 %	50 %	50 %	549723478
16021	NC_022544	GTT	2	6	857246	857251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723478
16022	NC_022544	CTG	2	6	857259	857264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723478
16023	NC_022544	ATCAC	2	10	857288	857297	40 %	20 %	0 %	40 %	549723478
16024	NC_022544	CTG	2	6	857391	857396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723478
16025	NC_022544	CGG	2	6	857459	857464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16026	NC_022544	GGC	2	6	857492	857497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16027	NC_022544	CTGGCG	2	12	857505	857516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549723478
16028	NC_022544	GC	3	6	857530	857535	0 %	0 %	50 %	50 %	549723478
16029	NC_022544	GCG	2	6	857543	857548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16030	NC_022544	TGA	2	6	857557	857562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723478
16031	NC_022544	CCG	2	6	857586	857591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723478
16032	NC_022544	GGC	2	6	857607	857612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16033	NC_022544	CCG	2	6	857644	857649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723478
16034	NC_022544	CGG	2	6	857746	857751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16035	NC_022544	GCG	2	6	857756	857761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16036	NC_022544	GGC	2	6	857774	857779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723478
16037	NC_022544	CAT	2	6	857792	857797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723478
16038	NC_022544	TGGC	2	8	857808	857815	0 %	25 %	50 %	25 %	549723478
16039	NC_022544	T	6	6	857921	857926	0 %	100 %	0 %	0 %	549723478
16040	NC_022544	GCT	2	6	857954	857959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723478
16041	NC_022544	GCGA	2	8	858118	858125	25 %	0 %	50 %	25 %	549723479
16042	NC_022544	CGC	2	6	858155	858160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723479
16043	NC_022544	TCA	2	6	858169	858174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723479
16044	NC_022544	GGC	2	6	858238	858243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723479
16045	NC_022544	GCCGC	2	10	858244	858253	0 %	0 %	40 %	60 %	549723479
16046	NC_022544	CCA	2	6	858308	858313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723479
16047	NC_022544	CG	3	6	858341	858346	0 %	0 %	50 %	50 %	549723479
16048	NC_022544	CCG	2	6	858350	858355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723479
16049	NC_022544	CAC	3	9	858363	858371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723479
16050	NC_022544	CCA	2	6	858378	858383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723479
16051	NC_022544	GCG	2	6	858467	858472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723479
16052	NC_022544	CAT	2	6	858485	858490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723479
16053	NC_022544	A	6	6	858630	858635	100 %	0 %	0 %	0 %	549723480
16054	NC_022544	AAT	2	6	858696	858701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723480
16055	NC_022544	GGC	2	6	858706	858711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723480
16056	NC_022544	CGA	2	6	858758	858763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723480
16057	NC_022544	GCC	2	6	858778	858783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723480
16058	NC_022544	ACC	2	6	858808	858813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723480
16059	NC_022544	CTG	2	6	858906	858911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723480
16060	NC_022544	CGC	2	6	858920	858925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723480
16061	NC_022544	CAG	2	6	858930	858935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723480
16062	NC_022544	GCC	2	6	859074	859079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723480
16063	NC_022544	CAG	2	6	859185	859190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723480
16064	NC_022544	GAT	2	6	859238	859243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723480
16065	NC_022544	AT	3	6	859242	859247	50 %	50 %	0 %	0 %	549723480
16066	NC_022544	CCCG	2	8	859254	859261	0 %	0 %	25 %	75 %	549723480
16067	NC_022544	CGG	2	6	859289	859294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723480
16068	NC_022544	CCAT	2	8	859360	859367	25 %	25 %	0 %	50 %	549723480
16069	NC_022544	GCG	2	6	859376	859381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723480
16070	NC_022544	CGC	2	6	859517	859522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723480
16071	NC_022544	GC	3	6	859521	859526	0 %	0 %	50 %	50 %	549723480
16072	NC_022544	CACCGA	2	12	859563	859574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549723480
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16074	NC_022544	GCC	2	6	859665	859670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723480
16075	NC_022544	ACATG	2	10	859673	859682	40 %	20 %	20 %	20 %	549723480
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16081	NC_022544	CCAC	2	8	860005	860012	25 %	0 %	0 %	75 %	549723481
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16086	NC_022544	TGT	2	6	860130	860135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723481
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16088	NC_022544	GGA	2	6	860301	860306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723481
16089	NC_022544	TAC	2	6	860441	860446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723481
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16091	NC_022544	CGG	2	6	860563	860568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723481
16092	NC_022544	TGT	2	6	860610	860615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723481
16093	NC_022544	CCG	2	6	860639	860644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723481
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16098	NC_022544	GGCG	2	8	860950	860957	0 %	0 %	75 %	25 %	549723481
16099	NC_022544	AGC	3	9	860964	860972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723481
16100	NC_022544	TGA	2	6	860991	860996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723481
16101	NC_022544	GAT	2	6	861008	861013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723481
16102	NC_022544	CAA	2	6	861043	861048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723482
16103	NC_022544	CGA	2	6	861054	861059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723482
16104	NC_022544	GCC	2	6	861095	861100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723482
16105	NC_022544	GCTG	2	8	861128	861135	0 %	25 %	50 %	25 %	549723482
16106	NC_022544	ATT	2	6	861205	861210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723482
16107	NC_022544	GCG	2	6	861251	861256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723482
16108	NC_022544	AGG	2	6	861302	861307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723482
16109	NC_022544	CG	3	6	861334	861339	0 %	0 %	50 %	50 %	549723482
16110	NC_022544	CTG	2	6	861340	861345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
16111	NC_022544	GCG	2	6	861361	861366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723482
16112	NC_022544	A	8	8	861394	861401	100 %	0 %	0 %	0 %	549723482
16113	NC_022544	CTG	2	6	861439	861444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
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16115	NC_022544	GCA	2	6	861498	861503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723482
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16117	NC_022544	GC	3	6	861584	861589	0 %	0 %	50 %	50 %	549723482
16118	NC_022544	CAT	2	6	861622	861627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723482
16119	NC_022544	GTTG	2	8	861636	861643	0 %	50 %	50 %	0 %	549723482
16120	NC_022544	ATG	2	6	861644	861649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723482
16121	NC_022544	GGGGC	2	10	861678	861687	0 %	0 %	80 %	20 %	549723482
16122	NC_022544	CTG	2	6	861690	861695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
16123	NC_022544	G	6	6	861701	861706	0 %	0 %	100 %	0 %	549723482
16124	NC_022544	TGG	2	6	861722	861727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723482
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16126	NC_022544	TGCTC	2	10	861767	861776	0 %	40 %	20 %	40 %	549723482
16127	NC_022544	CTG	2	6	861796	861801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
16128	NC_022544	GCC	2	6	861837	861842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723482
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16131	NC_022544	CGC	2	6	861918	861923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723482
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16134	NC_022544	GC	3	6	862105	862110	0 %	0 %	50 %	50 %	549723482
16135	NC_022544	TTAACG	2	12	862117	862128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549723482
16136	NC_022544	CTG	2	6	862159	862164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
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16139	NC_022544	GGCCG	2	10	862214	862223	0 %	0 %	60 %	40 %	549723483
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16144	NC_022544	TGC	2	6	862401	862406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723483
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16149	NC_022544	GTG	2	6	862577	862582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723483
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16152	NC_022544	TACTGA	2	12	862949	862960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549723484
16153	NC_022544	CAG	2	6	863108	863113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723484
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16155	NC_022544	CGG	2	6	863209	863214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723484
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16157	NC_022544	GCGG	2	8	863274	863281	0 %	0 %	75 %	25 %	549723484
16158	NC_022544	CT	3	6	863295	863300	0 %	50 %	0 %	50 %	549723484
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16167	NC_022544	CGT	2	6	864323	864328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723485
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16226	NC_022544	TCC	2	6	867865	867870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723486
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16231	NC_022544	AAT	2	6	868027	868032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723486
16232	NC_022544	GAAC	2	8	868055	868062	50 %	0 %	25 %	25 %	549723486
16233	NC_022544	GAG	2	6	868199	868204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723486
16234	NC_022544	GGCG	2	8	868221	868228	0 %	0 %	75 %	25 %	549723486
16235	NC_022544	GAGGCA	2	12	868232	868243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549723486
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16237	NC_022544	TATT	2	8	868374	868381	25 %	75 %	0 %	0 %	549723486
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16239	NC_022544	ATG	2	6	868461	868466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723486
16240	NC_022544	TCGC	2	8	868547	868554	0 %	25 %	25 %	50 %	549723486
16241	NC_022544	T	6	6	868577	868582	0 %	100 %	0 %	0 %	549723486
16242	NC_022544	CGAAGT	2	12	868588	868599	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549723486
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16357	NC_022544	GT	3	6	875021	875026	0 %	50 %	50 %	0 %	549723495
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16480	NC_022544	CG	3	6	880827	880832	0 %	0 %	50 %	50 %	549723502
16481	NC_022544	GCG	2	6	880918	880923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723502
16482	NC_022544	TGG	2	6	880943	880948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723502
16483	NC_022544	TGA	2	6	880994	880999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723502
16484	NC_022544	AGC	2	6	881065	881070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723502
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16488	NC_022544	CTGA	2	8	881256	881263	25 %	25 %	25 %	25 %	549723502
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16490	NC_022544	CGC	2	6	881321	881326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723502
16491	NC_022544	CG	3	6	881334	881339	0 %	0 %	50 %	50 %	549723502
16492	NC_022544	CTG	2	6	881340	881345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723502
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