MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022544	GCG	2	6	830093	830098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723454
15502	NC_022544	CTGCGC	2	12	830143	830154	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549723454
15503	NC_022544	A	6	6	830161	830166	100 %	0 %	0 %	0 %	549723454
15504	NC_022544	TGC	3	9	830192	830200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723454
15505	NC_022544	GTG	2	6	830242	830247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723454
15506	NC_022544	TCG	2	6	830255	830260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723454
15507	NC_022544	GCC	2	6	830332	830337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723454
15508	NC_022544	ACC	2	6	830389	830394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723454
15509	NC_022544	CTGG	2	8	830418	830425	0 %	25 %	50 %	25 %	549723454
15510	NC_022544	CTG	2	6	830440	830445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723454
15511	NC_022544	GGC	2	6	830502	830507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723454
15512	NC_022544	A	6	6	830530	830535	100 %	0 %	0 %	0 %	549723454
15513	NC_022544	CCTGCA	2	12	830550	830561	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549723454
15514	NC_022544	CCA	2	6	830570	830575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723454
15515	NC_022544	GCT	2	6	830595	830600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723454
15516	NC_022544	TCC	2	6	830644	830649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723454
15517	NC_022544	TGG	2	6	830687	830692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723454
15518	NC_022544	CGC	2	6	830751	830756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723454
15519	NC_022544	TGG	2	6	830828	830833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723454
15520	NC_022544	AGC	2	6	830879	830884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723454
15521	NC_022544	CGG	2	6	830891	830896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723454
15522	NC_022544	CGGC	2	8	831047	831054	0 %	0 %	50 %	50 %	549723454
15523	NC_022544	GCCGGT	2	12	831081	831092	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549723454
15524	NC_022544	CGC	2	6	831096	831101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723454
15525	NC_022544	GCC	2	6	831143	831148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723454
15526	NC_022544	CGG	2	6	831149	831154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723454
15527	NC_022544	GCTG	2	8	831171	831178	0 %	25 %	50 %	25 %	549723454
15528	NC_022544	GAC	2	6	831244	831249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723454
15529	NC_022544	CGG	2	6	831311	831316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723454
15530	NC_022544	GTGGAA	2	12	831397	831408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549723454
15531	NC_022544	CGG	2	6	831438	831443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723454
15532	NC_022544	CAGC	2	8	831450	831457	25 %	0 %	25 %	50 %	549723454
15533	NC_022544	CGG	2	6	831473	831478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723454
15534	NC_022544	GCC	2	6	831502	831507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723454
15535	NC_022544	CGC	2	6	831536	831541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723454
15536	NC_022544	TGC	2	6	831602	831607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723454
15537	NC_022544	CCGCG	2	10	831642	831651	0 %	0 %	40 %	60 %	549723454
15538	NC_022544	TGA	2	6	831716	831721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723454
15539	NC_022544	CAGGC	2	10	831797	831806	20 %	0 %	40 %	40 %	549723455
15540	NC_022544	CAT	2	6	831807	831812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723455
15541	NC_022544	GCT	2	6	831813	831818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15542	NC_022544	CTG	4	12	831826	831837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15543	NC_022544	TGGC	2	8	831838	831845	0 %	25 %	50 %	25 %	549723455
15544	NC_022544	GAA	2	6	831852	831857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723455
15545	NC_022544	CTG	3	9	831871	831879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15546	NC_022544	CGG	2	6	831891	831896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15547	NC_022544	GCT	2	6	831897	831902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15548	NC_022544	CTG	2	6	831949	831954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15549	NC_022544	CAC	2	6	831958	831963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723455
15550	NC_022544	GC	3	6	832004	832009	0 %	0 %	50 %	50 %	549723455
15551	NC_022544	CGC	2	6	832151	832156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723455
15552	NC_022544	GCT	2	6	832200	832205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15553	NC_022544	CTG	3	9	832222	832230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15554	NC_022544	GCG	3	9	832234	832242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15555	NC_022544	ACT	2	6	832286	832291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723455
15556	NC_022544	GGC	3	9	832320	832328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15557	NC_022544	CGG	2	6	832341	832346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15558	NC_022544	GCT	2	6	832395	832400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15559	NC_022544	GGC	2	6	832416	832421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15560	NC_022544	GCC	2	6	832455	832460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723455
15561	NC_022544	A	6	6	832535	832540	100 %	0 %	0 %	0 %	549723455
15562	NC_022544	GGT	2	6	832551	832556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723455
15563	NC_022544	TAC	2	6	832562	832567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723455
15564	NC_022544	TGG	2	6	832568	832573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723455
15565	NC_022544	GCT	3	9	832575	832583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15566	NC_022544	CGC	2	6	832590	832595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723455
15567	NC_022544	GCT	2	6	832599	832604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15568	NC_022544	GCG	2	6	832640	832645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15569	NC_022544	TGG	2	6	832646	832651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723455
15570	NC_022544	TGG	2	6	832730	832735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723455
15571	NC_022544	CTG	3	9	832771	832779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15572	NC_022544	CGG	2	6	832805	832810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15573	NC_022544	GCT	2	6	832830	832835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15574	NC_022544	CGG	2	6	832877	832882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15575	NC_022544	CGG	2	6	832889	832894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15576	NC_022544	GGC	2	6	832902	832907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723455
15577	NC_022544	CTG	2	6	832954	832959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723455
15578	NC_022544	GCC	2	6	833008	833013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723455
15579	NC_022544	TGA	2	6	833163	833168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723456
15580	NC_022544	AAC	2	6	833256	833261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723456
15581	NC_022544	CTG	2	6	833279	833284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15582	NC_022544	GTT	2	6	833328	833333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723456
15583	NC_022544	GGC	2	6	833365	833370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723456
15584	NC_022544	GCT	2	6	833425	833430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15585	NC_022544	GCA	2	6	833438	833443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15586	NC_022544	GTC	2	6	833445	833450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15587	NC_022544	CAGT	2	8	833500	833507	25 %	25 %	25 %	25 %	549723456
15588	NC_022544	TGGCA	2	10	833515	833524	20 %	20 %	40 %	20 %	549723456
15589	NC_022544	GCA	2	6	833565	833570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15590	NC_022544	CGG	2	6	833588	833593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723456
15591	NC_022544	CTGC	2	8	833623	833630	0 %	25 %	25 %	50 %	549723456
15592	NC_022544	CTG	2	6	833639	833644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15593	NC_022544	CTG	2	6	833648	833653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15594	NC_022544	GCA	2	6	833683	833688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15595	NC_022544	GCT	2	6	833698	833703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15596	NC_022544	GCG	2	6	833712	833717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723456
15597	NC_022544	GAT	2	6	833756	833761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723456
15598	NC_022544	GCT	2	6	833803	833808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723456
15599	NC_022544	CTGA	2	8	833856	833863	25 %	25 %	25 %	25 %	549723456
15600	NC_022544	GAT	2	6	834359	834364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723457
15601	NC_022544	TGG	2	6	834376	834381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723457
15602	NC_022544	TCT	2	6	834396	834401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723457
15603	NC_022544	TGG	2	6	834514	834519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723457
15604	NC_022544	AAT	2	6	834564	834569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723457
15605	NC_022544	CGG	2	6	834607	834612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723457
15606	NC_022544	GCGCT	2	10	834619	834628	0 %	20 %	40 %	40 %	549723457
15607	NC_022544	GCC	2	6	834666	834671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723457
15608	NC_022544	CGC	2	6	834752	834757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723457
15609	NC_022544	GTG	2	6	834765	834770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723457
15610	NC_022544	TGA	2	6	834833	834838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723457
15611	NC_022544	CG	3	6	834885	834890	0 %	0 %	50 %	50 %	549723457
15612	NC_022544	GTG	2	6	834918	834923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723457
15613	NC_022544	T	6	6	834937	834942	0 %	100 %	0 %	0 %	549723457
15614	NC_022544	AG	3	6	834989	834994	50 %	0 %	50 %	0 %	549723457
15615	NC_022544	CCG	2	6	835019	835024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723457
15616	NC_022544	CTG	2	6	835032	835037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723457
15617	NC_022544	TTG	2	6	835041	835046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723457
15618	NC_022544	TCG	2	6	835081	835086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723457
15619	NC_022544	GCG	2	6	835212	835217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723457
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15621	NC_022544	TAC	2	6	835458	835463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723458
15622	NC_022544	GCT	2	6	835501	835506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723458
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15655	NC_022544	GC	3	6	838526	838531	0 %	0 %	50 %	50 %	549723461
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15726	NC_022544	GCG	2	6	841791	841796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723464
15727	NC_022544	AGCGT	2	10	841838	841847	20 %	20 %	40 %	20 %	549723464
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15732	NC_022544	GTAG	2	8	842060	842067	25 %	25 %	50 %	0 %	549723464
15733	NC_022544	AAT	2	6	842084	842089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723464
15734	NC_022544	CTT	2	6	842131	842136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723464
15735	NC_022544	T	6	6	842181	842186	0 %	100 %	0 %	0 %	549723464
15736	NC_022544	CAT	3	9	842188	842196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723464
15737	NC_022544	ATC	2	6	842213	842218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723464
15738	NC_022544	AAAT	2	8	842230	842237	75 %	25 %	0 %	0 %	549723464
15739	NC_022544	CATT	2	8	842239	842246	25 %	50 %	0 %	25 %	549723464
15740	NC_022544	CCG	2	6	842314	842319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723464
15741	NC_022544	CTT	2	6	842320	842325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723464
15742	NC_022544	CGG	2	6	842404	842409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723464
15743	NC_022544	CTG	2	6	842490	842495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723464
15744	NC_022544	AAAAT	2	10	842500	842509	80 %	20 %	0 %	0 %	549723464
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15751	NC_022544	GC	4	8	842955	842962	0 %	0 %	50 %	50 %	549723465
15752	NC_022544	GCT	2	6	842979	842984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723465
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15754	NC_022544	CCG	2	6	843015	843020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723465
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15756	NC_022544	CTG	3	9	843170	843178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723465
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15758	NC_022544	CGC	2	6	843216	843221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723465
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15804	NC_022544	CAGA	2	8	845319	845326	50 %	0 %	25 %	25 %	549723467
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15845	NC_022544	TC	3	6	847527	847532	0 %	50 %	0 %	50 %	549723470
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15850	NC_022544	TAC	2	6	847813	847818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723470
15851	NC_022544	GCC	2	6	847820	847825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723470
15852	NC_022544	GCA	2	6	847826	847831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723470
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15854	NC_022544	GCCTG	2	10	847973	847982	0 %	20 %	40 %	40 %	549723470
15855	NC_022544	GGTG	2	8	848033	848040	0 %	25 %	75 %	0 %	549723471
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15857	NC_022544	GC	4	8	848092	848099	0 %	0 %	50 %	50 %	549723471
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15978	NC_022544	CGG	2	6	854947	854952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723477
15979	NC_022544	CGCGC	2	10	854960	854969	0 %	0 %	40 %	60 %	549723477
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15981	NC_022544	CGC	2	6	855084	855089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723477
15982	NC_022544	CTG	2	6	855306	855311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723477
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