MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022544	CCTG	2	8	804573	804580	0 %	25 %	25 %	50 %	549723429
15002	NC_022544	A	6	6	804616	804621	100 %	0 %	0 %	0 %	549723429
15003	NC_022544	GTT	2	6	804634	804639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723429
15004	NC_022544	AGG	2	6	804731	804736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723429
15005	NC_022544	GAC	2	6	804738	804743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723429
15006	NC_022544	CAG	2	6	804847	804852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723429
15007	NC_022544	GAA	2	6	804862	804867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723429
15008	NC_022544	AAC	2	6	804871	804876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723429
15009	NC_022544	CTG	2	6	804904	804909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723429
15010	NC_022544	GTGG	2	8	804952	804959	0 %	25 %	75 %	0 %	549723429
15011	NC_022544	GCA	2	6	805030	805035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723429
15012	NC_022544	GC	4	8	805049	805056	0 %	0 %	50 %	50 %	549723429
15013	NC_022544	GAC	2	6	805140	805145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723429
15014	NC_022544	GTG	2	6	805315	805320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723429
15015	NC_022544	ACT	2	6	805328	805333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723429
15016	NC_022544	CGC	2	6	805358	805363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723429
15017	NC_022544	A	7	7	805423	805429	100 %	0 %	0 %	0 %	549723429
15018	NC_022544	AGA	2	6	805473	805478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723429
15019	NC_022544	GGT	2	6	805486	805491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723429
15020	NC_022544	CGG	2	6	805509	805514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723429
15021	NC_022544	ATC	2	6	805543	805548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723429
15022	NC_022544	CGC	2	6	805553	805558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723429
15023	NC_022544	ATGC	2	8	805576	805583	25 %	25 %	25 %	25 %	549723429
15024	NC_022544	GAT	2	6	805632	805637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723429
15025	NC_022544	CT	3	6	805648	805653	0 %	50 %	0 %	50 %	549723429
15026	NC_022544	ATC	2	6	805658	805663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723429
15027	NC_022544	CTG	2	6	805735	805740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723429
15028	NC_022544	AAC	2	6	805919	805924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723430
15029	NC_022544	TAC	2	6	805968	805973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723430
15030	NC_022544	GAA	2	6	805987	805992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723430
15031	NC_022544	GGC	2	6	806047	806052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723430
15032	NC_022544	GCGG	2	8	806062	806069	0 %	0 %	75 %	25 %	549723430
15033	NC_022544	GTA	2	6	806077	806082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723430
15034	NC_022544	AGA	2	6	806091	806096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723430
15035	NC_022544	CTGG	2	8	806118	806125	0 %	25 %	50 %	25 %	549723430
15036	NC_022544	GCG	2	6	806191	806196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723430
15037	NC_022544	TCG	2	6	806247	806252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723430
15038	NC_022544	GGA	2	6	806304	806309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723430
15039	NC_022544	GCA	2	6	806415	806420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723430
15040	NC_022544	GCAG	2	8	806622	806629	25 %	0 %	50 %	25 %	549723430
15041	NC_022544	GAACT	2	10	806638	806647	40 %	20 %	20 %	20 %	549723430
15042	NC_022544	GGC	2	6	806731	806736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723430
15043	NC_022544	GCG	3	9	806762	806770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723430
15044	NC_022544	CGG	2	6	806850	806855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723430
15045	NC_022544	ATC	2	6	806887	806892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723430
15046	NC_022544	GAA	2	6	806902	806907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723430
15047	NC_022544	GGT	3	9	806925	806933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723430
15048	NC_022544	CAA	2	6	806946	806951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723430
15049	NC_022544	GAA	2	6	806967	806972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723430
15050	NC_022544	ATT	2	6	806995	807000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723430
15051	NC_022544	CAG	2	6	807028	807033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723430
15052	NC_022544	GTT	2	6	807034	807039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723430
15053	NC_022544	AAT	2	6	807056	807061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723430
15054	NC_022544	TAAT	2	8	807070	807077	50 %	50 %	0 %	0 %	549723431
15055	NC_022544	TGG	2	6	807163	807168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723431
15056	NC_022544	GCG	2	6	807169	807174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723431
15057	NC_022544	GGC	2	6	807189	807194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723431
15058	NC_022544	ATCACC	2	12	807339	807350	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549723431
15059	NC_022544	CAT	2	6	807467	807472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723431
15060	NC_022544	ACC	2	6	807552	807557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723431
15061	NC_022544	CGG	2	6	807593	807598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723431
15062	NC_022544	TGA	2	6	807673	807678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723431
15063	NC_022544	CGG	2	6	807689	807694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723431
15064	NC_022544	AGA	3	9	807701	807709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723431
15065	NC_022544	GCG	2	6	807711	807716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723431
15066	NC_022544	GTT	2	6	807747	807752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723431
15067	NC_022544	CAT	2	6	807809	807814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723431
15068	NC_022544	GGT	2	6	807819	807824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723431
15069	NC_022544	TAAAA	2	10	807922	807931	80 %	20 %	0 %	0 %	549723431
15070	NC_022544	ATG	2	6	809509	809514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723432
15071	NC_022544	CTG	2	6	809605	809610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15072	NC_022544	GTT	2	6	809682	809687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723432
15073	NC_022544	TAC	2	6	809758	809763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723432
15074	NC_022544	CTT	2	6	809820	809825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723432
15075	NC_022544	TTC	3	9	809851	809859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723432
15076	NC_022544	CTGG	2	8	809901	809908	0 %	25 %	50 %	25 %	549723432
15077	NC_022544	TAC	2	6	810124	810129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723432
15078	NC_022544	GCC	2	6	810178	810183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723432
15079	NC_022544	CGA	2	6	810225	810230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15080	NC_022544	CCT	2	6	810311	810316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723432
15081	NC_022544	TAT	2	6	810390	810395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723432
15082	NC_022544	CTG	2	6	810490	810495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15083	NC_022544	AGC	2	6	810497	810502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15084	NC_022544	GAA	2	6	810552	810557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723432
15085	NC_022544	CTG	3	9	810574	810582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15086	NC_022544	TGAC	2	8	810602	810609	25 %	25 %	25 %	25 %	549723432
15087	NC_022544	CGA	2	6	810635	810640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15088	NC_022544	ATTCC	2	10	810644	810653	20 %	40 %	0 %	40 %	549723432
15089	NC_022544	TGG	2	6	810689	810694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723432
15090	NC_022544	CTG	3	9	810706	810714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15091	NC_022544	ATC	2	6	810718	810723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723432
15092	NC_022544	A	6	6	810766	810771	100 %	0 %	0 %	0 %	549723432
15093	NC_022544	GC	3	6	810780	810785	0 %	0 %	50 %	50 %	549723432
15094	NC_022544	GGTT	2	8	810829	810836	0 %	50 %	50 %	0 %	549723432
15095	NC_022544	GTC	2	6	810851	810856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15096	NC_022544	CTG	2	6	810922	810927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15097	NC_022544	TGG	2	6	810968	810973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723432
15098	NC_022544	AGC	2	6	811015	811020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723432
15099	NC_022544	TAC	2	6	811112	811117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723433
15100	NC_022544	TGG	2	6	811126	811131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723433
15101	NC_022544	CTG	2	6	811132	811137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723433
15102	NC_022544	GTT	2	6	811305	811310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723433
15103	NC_022544	TGC	2	6	811311	811316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723433
15104	NC_022544	CGC	2	6	811332	811337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723433
15105	NC_022544	GAT	2	6	811362	811367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723433
15106	NC_022544	TTC	2	6	811387	811392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723433
15107	NC_022544	CGGT	2	8	811397	811404	0 %	25 %	50 %	25 %	549723433
15108	NC_022544	GCC	2	6	811482	811487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723433
15109	NC_022544	TAC	2	6	811561	811566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723433
15110	NC_022544	CTT	2	6	811575	811580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723433
15111	NC_022544	CTG	2	6	811603	811608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723433
15112	NC_022544	GAT	2	6	811629	811634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723433
15113	NC_022544	GC	6	12	811689	811700	0 %	0 %	50 %	50 %	549723433
15114	NC_022544	GCG	2	6	811714	811719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723433
15115	NC_022544	GGCG	2	8	811746	811753	0 %	0 %	75 %	25 %	549723433
15116	NC_022544	ATC	2	6	811802	811807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723433
15117	NC_022544	GCC	2	6	811810	811815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723433
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15119	NC_022544	CTGG	2	8	811857	811864	0 %	25 %	50 %	25 %	549723433
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15229	NC_022544	ATGGTA	2	12	816982	816993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723440
15230	NC_022544	GCA	3	9	817008	817016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723440
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15232	NC_022544	GGGAT	2	10	817132	817141	20 %	20 %	60 %	0 %	549723440
15233	NC_022544	GCCT	2	8	817215	817222	0 %	25 %	25 %	50 %	549723440
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15237	NC_022544	TTC	2	6	817339	817344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723441
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15301	NC_022544	ATG	2	6	821624	821629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723444
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15309	NC_022544	TGA	2	6	821852	821857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723445
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15345	NC_022544	CCAT	2	8	823724	823731	25 %	25 %	0 %	50 %	549723447
15346	NC_022544	CTG	2	6	823759	823764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723447
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15353	NC_022544	CTG	3	9	823984	823992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723447
15354	NC_022544	GCCT	2	8	824009	824016	0 %	25 %	25 %	50 %	549723447
15355	NC_022544	GCC	2	6	824017	824022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723447
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15359	NC_022544	ACT	2	6	824095	824100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723447
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15479	NC_022544	GCA	2	6	829389	829394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723452
15480	NC_022544	GTT	2	6	829400	829405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723452
15481	NC_022544	GTT	2	6	829458	829463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723452
15482	NC_022544	AGT	2	6	829482	829487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723452
15483	NC_022544	ATT	2	6	829530	829535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723452
15484	NC_022544	T	6	6	829562	829567	0 %	100 %	0 %	0 %	549723452
15485	NC_022544	GTTTG	2	10	829588	829597	0 %	60 %	40 %	0 %	549723452
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15488	NC_022544	CTG	2	6	829774	829779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723453
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15491	NC_022544	GGC	2	6	829848	829853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723453
15492	NC_022544	CGC	3	9	829857	829865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723453
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