MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_022544	GCC	2	6	777505	777510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723403
14503	NC_022544	TCG	2	6	777572	777577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723403
14504	NC_022544	GC	3	6	777614	777619	0 %	0 %	50 %	50 %	549723403
14505	NC_022544	GTA	2	6	777664	777669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723403
14506	NC_022544	GAT	2	6	778027	778032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723404
14507	NC_022544	AAC	2	6	778050	778055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723404
14508	NC_022544	GCT	2	6	778171	778176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723404
14509	NC_022544	TCA	2	6	778216	778221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723404
14510	NC_022544	CAA	2	6	778351	778356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723404
14511	NC_022544	GGC	2	6	778366	778371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723404
14512	NC_022544	GCG	2	6	778500	778505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723404
14513	NC_022544	CGG	3	9	778546	778554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723404
14514	NC_022544	GCC	2	6	778574	778579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723404
14515	NC_022544	CATT	2	8	778627	778634	25 %	50 %	0 %	25 %	549723404
14516	NC_022544	CG	4	8	778636	778643	0 %	0 %	50 %	50 %	549723404
14517	NC_022544	GCC	2	6	778664	778669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723404
14518	NC_022544	CGG	2	6	778690	778695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723404
14519	NC_022544	AGCG	2	8	778794	778801	25 %	0 %	50 %	25 %	549723405
14520	NC_022544	GTT	2	6	778803	778808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723405
14521	NC_022544	CGG	2	6	778824	778829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723405
14522	NC_022544	CCG	2	6	778847	778852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723405
14523	NC_022544	GTG	2	6	778916	778921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723405
14524	NC_022544	TGG	2	6	779009	779014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723405
14525	NC_022544	AG	3	6	779017	779022	50 %	0 %	50 %	0 %	549723405
14526	NC_022544	GGC	2	6	779072	779077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723405
14527	NC_022544	GGC	2	6	779095	779100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723405
14528	NC_022544	GGCAC	2	10	779104	779113	20 %	0 %	40 %	40 %	549723405
14529	NC_022544	GTC	2	6	779165	779170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723405
14530	NC_022544	CG	3	6	779240	779245	0 %	0 %	50 %	50 %	549723405
14531	NC_022544	CCGG	2	8	779264	779271	0 %	0 %	50 %	50 %	549723405
14532	NC_022544	CGG	2	6	779284	779289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723405
14533	NC_022544	GGC	2	6	779324	779329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723405
14534	NC_022544	AGG	2	6	779430	779435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723405
14535	NC_022544	ATT	2	6	779449	779454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723406
14536	NC_022544	CG	3	6	779455	779460	0 %	0 %	50 %	50 %	549723406
14537	NC_022544	GAT	2	6	779683	779688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723406
14538	NC_022544	TGGCGG	2	12	779777	779788	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549723406
14539	NC_022544	GCT	2	6	779865	779870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723406
14540	NC_022544	AAG	2	6	780008	780013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723406
14541	NC_022544	CTG	2	6	780109	780114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723406
14542	NC_022544	TGC	2	6	780125	780130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723406
14543	NC_022544	AATG	2	8	780174	780181	50 %	25 %	25 %	0 %	549723406
14544	NC_022544	GGC	2	6	780196	780201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723406
14545	NC_022544	CAT	2	6	780219	780224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723406
14546	NC_022544	GGA	2	6	780294	780299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723406
14547	NC_022544	CG	3	6	780309	780314	0 %	0 %	50 %	50 %	549723406
14548	NC_022544	CAGCGA	2	12	780403	780414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723407
14549	NC_022544	ATT	2	6	780415	780420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723407
14550	NC_022544	TCC	2	6	780431	780436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723407
14551	NC_022544	TGCG	2	8	780488	780495	0 %	25 %	50 %	25 %	549723407
14552	NC_022544	GC	3	6	780525	780530	0 %	0 %	50 %	50 %	549723407
14553	NC_022544	GCC	2	6	780580	780585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723407
14554	NC_022544	GC	3	6	780621	780626	0 %	0 %	50 %	50 %	549723407
14555	NC_022544	GGC	2	6	780650	780655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723407
14556	NC_022544	GGC	2	6	780697	780702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723407
14557	NC_022544	AGG	2	6	780831	780836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723407
14558	NC_022544	GC	3	6	780894	780899	0 %	0 %	50 %	50 %	549723407
14559	NC_022544	ACG	2	6	780906	780911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723407
14560	NC_022544	GAC	2	6	780982	780987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723407
14561	NC_022544	TCGC	2	8	781041	781048	0 %	25 %	25 %	50 %	549723407
14562	NC_022544	CGC	2	6	781057	781062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723407
14563	NC_022544	TCA	2	6	781415	781420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723408
14564	NC_022544	GAC	2	6	781422	781427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723408
14565	NC_022544	GATT	2	8	781448	781455	25 %	50 %	25 %	0 %	549723408
14566	NC_022544	T	6	6	781534	781539	0 %	100 %	0 %	0 %	549723408
14567	NC_022544	TTTGT	2	10	781603	781612	0 %	80 %	20 %	0 %	549723409
14568	NC_022544	GAAAA	2	10	781613	781622	80 %	0 %	20 %	0 %	549723409
14569	NC_022544	AAG	2	6	781633	781638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723409
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14571	NC_022544	CGAC	2	8	781660	781667	25 %	0 %	25 %	50 %	549723409
14572	NC_022544	GAAA	2	8	781683	781690	75 %	0 %	25 %	0 %	549723409
14573	NC_022544	GCT	2	6	781693	781698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723409
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14577	NC_022544	CAG	2	6	781940	781945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723409
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14580	NC_022544	TGC	2	6	782017	782022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723409
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14582	NC_022544	AG	3	6	782670	782675	50 %	0 %	50 %	0 %	549723410
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14591	NC_022544	GGA	2	6	783075	783080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723411
14592	NC_022544	GCT	2	6	783108	783113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723411
14593	NC_022544	CCG	2	6	783152	783157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723411
14594	NC_022544	CTG	2	6	783178	783183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723411
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14599	NC_022544	CGG	2	6	783475	783480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723411
14600	NC_022544	TGT	2	6	783494	783499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723411
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14602	NC_022544	TGA	2	6	785149	785154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723412
14603	NC_022544	A	8	8	785198	785205	100 %	0 %	0 %	0 %	549723412
14604	NC_022544	GA	3	6	785212	785217	50 %	0 %	50 %	0 %	549723412
14605	NC_022544	TAA	2	6	785252	785257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723412
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14607	NC_022544	TGG	2	6	785339	785344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723412
14608	NC_022544	GTAG	2	8	785361	785368	25 %	25 %	50 %	0 %	549723412
14609	NC_022544	AT	4	8	785372	785379	50 %	50 %	0 %	0 %	549723412
14610	NC_022544	ATG	4	12	785413	785424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723412
14611	NC_022544	TTA	2	6	785460	785465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723412
14612	NC_022544	TATT	2	8	785573	785580	25 %	75 %	0 %	0 %	549723412
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14984	NC_022544	TCC	2	6	803831	803836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723428
14985	NC_022544	AGGGC	2	10	803896	803905	20 %	0 %	60 %	20 %	549723428
14986	NC_022544	CG	3	6	803920	803925	0 %	0 %	50 %	50 %	549723428
14987	NC_022544	TGC	2	6	804006	804011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723428
14988	NC_022544	CGT	2	6	804035	804040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723428
14989	NC_022544	TGG	2	6	804045	804050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723428
14990	NC_022544	GCT	2	6	804067	804072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723428
14991	NC_022544	TGA	2	6	804100	804105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723428
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