MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022544	GTG	2	6	699545	699550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723339
13002	NC_022544	GCC	2	6	700056	700061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723340
13003	NC_022544	GCTG	2	8	700080	700087	0 %	25 %	50 %	25 %	549723340
13004	NC_022544	GC	3	6	700141	700146	0 %	0 %	50 %	50 %	549723340
13005	NC_022544	GCT	3	9	700157	700165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723340
13006	NC_022544	GGT	2	6	700178	700183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723340
13007	NC_022544	GAA	2	6	700216	700221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723340
13008	NC_022544	CCG	2	6	700266	700271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723340
13009	NC_022544	CGT	2	6	700316	700321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723340
13010	NC_022544	TAT	2	6	700390	700395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723340
13011	NC_022544	CCG	2	6	700414	700419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723340
13012	NC_022544	ACG	2	6	700479	700484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723340
13013	NC_022544	GCG	2	6	700548	700553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723340
13014	NC_022544	CAT	2	6	700612	700617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723340
13015	NC_022544	GGCCA	2	10	700625	700634	20 %	0 %	40 %	40 %	549723340
13016	NC_022544	TCCGC	2	10	700734	700743	0 %	20 %	20 %	60 %	549723340
13017	NC_022544	GCG	2	6	700780	700785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723340
13018	NC_022544	GGT	2	6	700790	700795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723340
13019	NC_022544	TGC	2	6	700797	700802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723340
13020	NC_022544	CCG	2	6	700806	700811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723340
13021	NC_022544	AGT	2	6	700830	700835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723340
13022	NC_022544	ACA	2	6	700904	700909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723341
13023	NC_022544	AAT	2	6	701059	701064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723341
13024	NC_022544	GCCA	2	8	701079	701086	25 %	0 %	25 %	50 %	549723341
13025	NC_022544	GGC	2	6	701115	701120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723341
13026	NC_022544	ATT	2	6	701137	701142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723341
13027	NC_022544	CCA	2	6	701177	701182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723341
13028	NC_022544	AGCC	2	8	701266	701273	25 %	0 %	25 %	50 %	549723341
13029	NC_022544	GCC	2	6	701286	701291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723341
13030	NC_022544	AAT	2	6	701316	701321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723341
13031	NC_022544	CAT	2	6	701364	701369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723341
13032	NC_022544	CAGAC	2	10	701466	701475	40 %	0 %	20 %	40 %	549723341
13033	NC_022544	GCG	2	6	701536	701541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723341
13034	NC_022544	CAG	2	6	701544	701549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723341
13035	NC_022544	GGGC	2	8	701598	701605	0 %	0 %	75 %	25 %	549723341
13036	NC_022544	TAA	2	6	701618	701623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723341
13037	NC_022544	GC	3	6	701705	701710	0 %	0 %	50 %	50 %	549723341
13038	NC_022544	CG	3	6	701795	701800	0 %	0 %	50 %	50 %	549723341
13039	NC_022544	CAC	2	6	701817	701822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723341
13040	NC_022544	ACC	2	6	701827	701832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723341
13041	NC_022544	CAT	2	6	701865	701870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723341
13042	NC_022544	CAG	2	6	701928	701933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723341
13043	NC_022544	T	7	7	701978	701984	0 %	100 %	0 %	0 %	549723341
13044	NC_022544	ATT	2	6	702004	702009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723342
13045	NC_022544	TCC	2	6	702012	702017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723342
13046	NC_022544	ACC	2	6	702027	702032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723342
13047	NC_022544	GTT	2	6	702056	702061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723342
13048	NC_022544	ATG	2	6	702072	702077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
13049	NC_022544	GCC	2	6	702122	702127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
13050	NC_022544	GAT	2	6	702137	702142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
13051	NC_022544	TCA	2	6	702184	702189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723342
13052	NC_022544	CGC	2	6	702278	702283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
13053	NC_022544	GC	3	6	702295	702300	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
13054	NC_022544	GCCGT	2	10	702318	702327	0 %	20 %	40 %	40 %	549723342
13055	NC_022544	CGG	2	6	702398	702403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
13056	NC_022544	CGT	2	6	702481	702486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723342
13057	NC_022544	TAA	2	6	702487	702492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723342
13058	NC_022544	T	6	6	702584	702589	0 %	100 %	0 %	0 %	549723342
13059	NC_022544	CCAT	2	8	702682	702689	25 %	25 %	0 %	50 %	549723342
13060	NC_022544	CGAT	2	8	702699	702706	25 %	25 %	25 %	25 %	549723342
13061	NC_022544	AGA	2	6	702730	702735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723342
13062	NC_022544	CCG	2	6	702742	702747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
13063	NC_022544	T	6	6	702791	702796	0 %	100 %	0 %	0 %	549723342
13064	NC_022544	CCA	2	6	702833	702838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723342
13065	NC_022544	TGA	2	6	702868	702873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
13066	NC_022544	CG	3	6	702944	702949	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
13067	NC_022544	AGC	2	6	702978	702983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723342
13068	NC_022544	AAT	2	6	702988	702993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723342
13069	NC_022544	CGC	2	6	703060	703065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
13070	NC_022544	CCG	2	6	703090	703095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
13071	NC_022544	CG	3	6	703094	703099	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
13072	NC_022544	CTGC	2	8	703101	703108	0 %	25 %	25 %	50 %	549723342
13073	NC_022544	CAG	2	6	703109	703114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723342
13074	NC_022544	CTG	2	6	703127	703132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723342
13075	NC_022544	GCG	2	6	703174	703179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
13076	NC_022544	GTT	2	6	703214	703219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723342
13077	NC_022544	TAG	2	6	703266	703271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
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13079	NC_022544	GTTT	2	8	703321	703328	0 %	75 %	25 %	0 %	549723342
13080	NC_022544	ATA	2	6	703409	703414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723342
13081	NC_022544	GCG	2	6	703415	703420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
13082	NC_022544	GC	3	6	703472	703477	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
13083	NC_022544	GTTT	2	8	703496	703503	0 %	75 %	25 %	0 %	549723342
13084	NC_022544	GC	3	6	703536	703541	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
13085	NC_022544	T	6	6	703544	703549	0 %	100 %	0 %	0 %	549723342
13086	NC_022544	GGC	2	6	703553	703558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
13087	NC_022544	TCG	3	9	703563	703571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723342
13088	NC_022544	CAT	2	6	703634	703639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723342
13089	NC_022544	GATA	2	8	703648	703655	50 %	25 %	25 %	0 %	549723342
13090	NC_022544	TTCG	2	8	703739	703746	0 %	50 %	25 %	25 %	549723342
13091	NC_022544	CAG	2	6	703814	703819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723342
13092	NC_022544	TCAC	2	8	703937	703944	25 %	25 %	0 %	50 %	549723343
13093	NC_022544	TGGT	2	8	703956	703963	0 %	50 %	50 %	0 %	549723343
13094	NC_022544	GCC	2	6	704093	704098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723343
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13096	NC_022544	CGG	3	9	704212	704220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723343
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13098	NC_022544	GGC	2	6	704437	704442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723344
13099	NC_022544	TTC	2	6	704447	704452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723344
13100	NC_022544	CGA	2	6	704485	704490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723344
13101	NC_022544	GCA	2	6	704530	704535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723344
13102	NC_022544	CG	4	8	704543	704550	0 %	0 %	50 %	50 %	549723344
13103	NC_022544	CAC	2	6	704558	704563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723344
13104	NC_022544	AAT	2	6	704609	704614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723344
13105	NC_022544	GAT	2	6	704657	704662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723344
13106	NC_022544	TCA	2	6	704679	704684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723344
13107	NC_022544	TCA	2	6	705051	705056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723345
13108	NC_022544	GGC	2	6	705165	705170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723345
13109	NC_022544	CAG	2	6	705228	705233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723345
13110	NC_022544	GGC	2	6	705348	705353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723345
13111	NC_022544	GC	5	10	705486	705495	0 %	0 %	50 %	50 %	549723345
13112	NC_022544	GC	3	6	705775	705780	0 %	0 %	50 %	50 %	549723346
13113	NC_022544	CG	3	6	705888	705893	0 %	0 %	50 %	50 %	549723346
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13115	NC_022544	TCA	3	9	705968	705976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723346
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13118	NC_022544	TGGC	2	8	706151	706158	0 %	25 %	50 %	25 %	549723346
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13120	NC_022544	CTG	2	6	706239	706244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723346
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13241	NC_022544	CCG	2	6	712316	712321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723352
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13243	NC_022544	GCT	2	6	712447	712452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723352
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13263	NC_022544	ATG	2	6	713277	713282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723352
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13356	NC_022544	CTGG	2	8	717531	717538	0 %	25 %	50 %	25 %	549723356
13357	NC_022544	TGC	2	6	717555	717560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723356
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13479	NC_022544	C	6	6	723672	723677	0 %	0 %	0 %	100 %	549723360
13480	NC_022544	TGC	2	6	723705	723710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723360
13481	NC_022544	GCC	3	9	723732	723740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723360
13482	NC_022544	GCT	2	6	723808	723813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723360
13483	NC_022544	GCT	2	6	723859	723864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723360
13484	NC_022544	TCT	2	6	723882	723887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723360
13485	NC_022544	AGCG	2	8	723891	723898	25 %	0 %	50 %	25 %	549723360
13486	NC_022544	CCA	2	6	724036	724041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723360
13487	NC_022544	ATGG	2	8	724071	724078	25 %	25 %	50 %	0 %	549723360
13488	NC_022544	TTA	2	6	724098	724103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723360
13489	NC_022544	GTG	2	6	724152	724157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723360
13490	NC_022544	TCA	2	6	724326	724331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723361
13491	NC_022544	A	6	6	724350	724355	100 %	0 %	0 %	0 %	549723361
13492	NC_022544	GCGT	2	8	724369	724376	0 %	25 %	50 %	25 %	549723361
13493	NC_022544	AAACG	2	10	724389	724398	60 %	0 %	20 %	20 %	549723361
13494	NC_022544	ATCA	2	8	724451	724458	50 %	25 %	0 %	25 %	549723361
13495	NC_022544	GC	3	6	724483	724488	0 %	0 %	50 %	50 %	549723361
13496	NC_022544	CGG	2	6	724498	724503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723361
13497	NC_022544	TTG	2	6	724539	724544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723361
13498	NC_022544	AAT	2	6	724574	724579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723361
13499	NC_022544	AGTAA	2	10	724670	724679	60 %	20 %	20 %	0 %	549723361
13500	NC_022544	TCC	2	6	724680	724685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723361

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