MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_022544	GGC	2	6	539797	539802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723194
10003	NC_022544	TCG	2	6	539819	539824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723194
10004	NC_022544	GTT	2	6	539842	539847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723194
10005	NC_022544	GCC	2	6	539902	539907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723194
10006	NC_022544	ATG	2	6	539975	539980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723194
10007	NC_022544	GGGTGC	2	12	539982	539993	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549723194
10008	NC_022544	CTG	2	6	540017	540022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723194
10009	NC_022544	TGAT	2	8	540045	540052	25 %	50 %	25 %	0 %	549723194
10010	NC_022544	CAA	2	6	540059	540064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723194
10011	NC_022544	CAG	2	6	540241	540246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723195
10012	NC_022544	TTG	2	6	540364	540369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723195
10013	NC_022544	GC	3	6	540437	540442	0 %	0 %	50 %	50 %	549723195
10014	NC_022544	TGGGC	2	10	540453	540462	0 %	20 %	60 %	20 %	549723195
10015	NC_022544	CTG	2	6	540607	540612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723195
10016	NC_022544	GGC	2	6	540619	540624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723195
10017	NC_022544	CGT	2	6	540652	540657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723195
10018	NC_022544	GCG	2	6	540679	540684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723195
10019	NC_022544	TCA	3	9	540686	540694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723195
10020	NC_022544	GCG	2	6	540710	540715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723195
10021	NC_022544	AGC	2	6	540716	540721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723195
10022	NC_022544	CGT	2	6	540941	540946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723196
10023	NC_022544	TCA	2	6	541001	541006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723196
10024	NC_022544	T	6	6	541015	541020	0 %	100 %	0 %	0 %	549723196
10025	NC_022544	CG	3	6	541027	541032	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
10026	NC_022544	GCT	2	6	541058	541063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723196
10027	NC_022544	GCG	2	6	541108	541113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
10028	NC_022544	CGC	2	6	541172	541177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723196
10029	NC_022544	CTG	2	6	541209	541214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723196
10030	NC_022544	GC	3	6	541236	541241	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
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10032	NC_022544	ACC	2	6	541356	541361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723196
10033	NC_022544	CG	3	6	541491	541496	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
10034	NC_022544	GTT	2	6	541502	541507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723196
10035	NC_022544	CTGA	2	8	541548	541555	25 %	25 %	25 %	25 %	549723196
10036	NC_022544	GCG	2	6	541570	541575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
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10039	NC_022544	GGC	3	9	541700	541708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
10040	NC_022544	GC	3	6	541707	541712	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
10041	NC_022544	GCT	2	6	541730	541735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723196
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10052	NC_022544	GGC	2	6	542126	542131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
10053	NC_022544	GC	3	6	542130	542135	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
10054	NC_022544	GC	4	8	542147	542154	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
10055	NC_022544	CAAAA	2	10	542165	542174	80 %	0 %	0 %	20 %	549723196
10056	NC_022544	A	6	6	542171	542176	100 %	0 %	0 %	0 %	549723196
10057	NC_022544	CG	4	8	542199	542206	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
10058	NC_022544	GC	3	6	542262	542267	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
10059	NC_022544	AAAG	2	8	542300	542307	75 %	0 %	25 %	0 %	549723196
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10064	NC_022544	GGC	2	6	542414	542419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
10065	NC_022544	GGC	2	6	542426	542431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
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10081	NC_022544	GC	3	6	543007	543012	0 %	0 %	50 %	50 %	549723197
10082	NC_022544	GCC	2	6	543019	543024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723197
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10085	NC_022544	CGC	2	6	543108	543113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723197
10086	NC_022544	AGA	2	6	543133	543138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723197
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10088	NC_022544	GCG	2	6	543306	543311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723198
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10090	NC_022544	CGC	2	6	543531	543536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723198
10091	NC_022544	GAT	2	6	543554	543559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723198
10092	NC_022544	A	6	6	543597	543602	100 %	0 %	0 %	0 %	549723198
10093	NC_022544	GGC	2	6	543725	543730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723198
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10096	NC_022544	TCAG	2	8	543936	543943	25 %	25 %	25 %	25 %	549723199
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10100	NC_022544	CGTA	2	8	544323	544330	25 %	25 %	25 %	25 %	549723199
10101	NC_022544	AGGCGA	2	12	544380	544391	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549723199
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10106	NC_022544	GTAC	2	8	544806	544813	25 %	25 %	25 %	25 %	549723199
10107	NC_022544	TGAT	2	8	544880	544887	25 %	50 %	25 %	0 %	549723199
10108	NC_022544	GAC	2	6	545005	545010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723199
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10113	NC_022544	CTA	2	6	545199	545204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723199
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10119	NC_022544	GTCG	2	8	545352	545359	0 %	25 %	50 %	25 %	549723199
10120	NC_022544	CGA	2	6	545400	545405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723199
10121	NC_022544	AAG	2	6	545414	545419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723199
10122	NC_022544	CTG	2	6	545461	545466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723199
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10131	NC_022544	CTG	2	6	546268	546273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723200
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10184	NC_022544	GCG	2	6	548591	548596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723202
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10221	NC_022544	TCA	3	9	550452	550460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723204
10222	NC_022544	GC	3	6	550465	550470	0 %	0 %	50 %	50 %	549723204
10223	NC_022544	CAGC	2	8	550556	550563	25 %	0 %	25 %	50 %	549723204
10224	NC_022544	TTC	2	6	550595	550600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723204
10225	NC_022544	GCG	2	6	550605	550610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723204
10226	NC_022544	ACC	2	6	550677	550682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723204
10227	NC_022544	CGC	2	6	550694	550699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723204
10228	NC_022544	CAG	2	6	550715	550720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723204
10229	NC_022544	CAG	2	6	550745	550750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723204
10230	NC_022544	CTTCT	2	10	550781	550790	0 %	60 %	0 %	40 %	549723204
10231	NC_022544	CAG	2	6	550850	550855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723204
10232	NC_022544	GCA	2	6	550927	550932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723204
10233	NC_022544	GGC	2	6	550994	550999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723204
10234	NC_022544	CGAT	2	8	551056	551063	25 %	25 %	25 %	25 %	549723204
10235	NC_022544	AAC	2	6	551133	551138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723204
10236	NC_022544	A	6	6	551153	551158	100 %	0 %	0 %	0 %	549723204
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10238	NC_022544	GAA	2	6	551243	551248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723204
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10345	NC_022544	GC	4	8	556823	556830	0 %	0 %	50 %	50 %	549723208
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10354	NC_022544	ATAGA	2	10	557401	557410	60 %	20 %	20 %	0 %	549723209
10355	NC_022544	AAT	2	6	557438	557443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723209
10356	NC_022544	GTT	2	6	557553	557558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723209
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10477	NC_022544	CGC	2	6	563361	563366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723215
10478	NC_022544	AT	3	6	563391	563396	50 %	50 %	0 %	0 %	549723215
10479	NC_022544	TC	3	6	563409	563414	0 %	50 %	0 %	50 %	549723215
10480	NC_022544	CAAC	2	8	563559	563566	50 %	0 %	0 %	50 %	549723215
10481	NC_022544	AGC	3	9	563588	563596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723215
10482	NC_022544	AAGTT	2	10	563608	563617	40 %	40 %	20 %	0 %	549723215
10483	NC_022544	CCG	2	6	563642	563647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723215
10484	NC_022544	CGA	2	6	563684	563689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723215
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10486	NC_022544	GATC	2	8	563757	563764	25 %	25 %	25 %	25 %	549723215
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10489	NC_022544	CAT	2	6	563832	563837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723215
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