MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
84501	NC_022544	GGC	2	6	4636080	4636085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726941
84502	NC_022544	GCT	2	6	4636143	4636148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726941
84503	NC_022544	TGCTGG	2	12	4636163	4636174	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549726941
84504	NC_022544	ATTC	2	8	4636185	4636192	25 %	50 %	0 %	25 %	549726941
84505	NC_022544	ACG	2	6	4636204	4636209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726941
84506	NC_022544	TATG	2	8	4636245	4636252	25 %	50 %	25 %	0 %	549726941
84507	NC_022544	TGT	2	6	4636317	4636322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549726941
84508	NC_022544	CTG	2	6	4636339	4636344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726941
84509	NC_022544	GCA	2	6	4636475	4636480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726941
84510	NC_022544	GAT	2	6	4636521	4636526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726941
84511	NC_022544	GCTG	2	8	4636581	4636588	0 %	25 %	50 %	25 %	549726941
84512	NC_022544	CGC	2	6	4636604	4636609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726941
84513	NC_022544	GAT	2	6	4636617	4636622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726941
84514	NC_022544	AAG	2	6	4636633	4636638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726941
84515	NC_022544	GCG	2	6	4636642	4636647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726941
84516	NC_022544	GTG	2	6	4636732	4636737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726941
84517	NC_022544	TATT	2	8	4636759	4636766	25 %	75 %	0 %	0 %	549726941
84518	NC_022544	AAT	2	6	4636969	4636974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726942
84519	NC_022544	A	6	6	4636983	4636988	100 %	0 %	0 %	0 %	549726942
84520	NC_022544	TAA	2	6	4637068	4637073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726942
84521	NC_022544	TGA	2	6	4637113	4637118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726942
84522	NC_022544	GAG	2	6	4637210	4637215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549726942
84523	NC_022544	GTA	2	6	4637216	4637221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726942
84524	NC_022544	A	8	8	4637221	4637228	100 %	0 %	0 %	0 %	549726942
84525	NC_022544	ATT	2	6	4637236	4637241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726942
84526	NC_022544	GC	3	6	4637262	4637267	0 %	0 %	50 %	50 %	549726942
84527	NC_022544	ATG	2	6	4637292	4637297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726942
84528	NC_022544	GCC	2	6	4637308	4637313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726942
84529	NC_022544	CAT	3	9	4637486	4637494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726942
84530	NC_022544	TGA	2	6	4637602	4637607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726942
84531	NC_022544	TAT	2	6	4637614	4637619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726942
84532	NC_022544	CAG	2	6	4637651	4637656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726942
84533	NC_022544	TTC	2	6	4637710	4637715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726942
84534	NC_022544	TGC	3	9	4637775	4637783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726942
84535	NC_022544	TTA	2	6	4637866	4637871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726943
84536	NC_022544	AT	3	6	4637924	4637929	50 %	50 %	0 %	0 %	549726943
84537	NC_022544	CGC	2	6	4637938	4637943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726943
84538	NC_022544	GC	3	6	4638089	4638094	0 %	0 %	50 %	50 %	549726943
84539	NC_022544	GAT	2	6	4638116	4638121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726943
84540	NC_022544	GGA	2	6	4638221	4638226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549726943
84541	NC_022544	TGC	2	6	4638229	4638234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726943
84542	NC_022544	TCGAA	2	10	4638257	4638266	40 %	20 %	20 %	20 %	549726943
84543	NC_022544	CTT	2	6	4638374	4638379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726943
84544	NC_022544	AGGGC	2	10	4638389	4638398	20 %	0 %	60 %	20 %	549726943
84545	NC_022544	CTG	2	6	4638447	4638452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726943
84546	NC_022544	CGA	2	6	4638514	4638519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726943
84547	NC_022544	TCA	2	6	4638521	4638526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726943
84548	NC_022544	CAC	2	6	4638635	4638640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726943
84549	NC_022544	CG	3	6	4638688	4638693	0 %	0 %	50 %	50 %	549726943
84550	NC_022544	CGG	2	6	4638838	4638843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726944
84551	NC_022544	CTT	2	6	4638852	4638857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726944
84552	NC_022544	TCTT	2	8	4638860	4638867	0 %	75 %	0 %	25 %	549726944
84553	NC_022544	CGA	2	6	4638951	4638956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726944
84554	NC_022544	CAC	2	6	4638994	4638999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726944
84555	NC_022544	CTG	2	6	4639000	4639005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726944
84556	NC_022544	TTC	2	6	4639016	4639021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726944
84557	NC_022544	GCA	2	6	4639065	4639070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726944
84558	NC_022544	GGC	3	9	4639092	4639100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726944
84559	NC_022544	CCA	2	6	4639191	4639196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726944
84560	NC_022544	TCGTCT	2	12	4639268	4639279	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	549726944
84561	NC_022544	TCA	2	6	4639286	4639291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726944
84562	NC_022544	CGT	2	6	4639299	4639304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726944
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84564	NC_022544	TGTCA	2	10	4639327	4639336	20 %	40 %	20 %	20 %	549726944
84565	NC_022544	GAA	2	6	4639482	4639487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726945
84566	NC_022544	ACC	2	6	4639554	4639559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726945
84567	NC_022544	GC	3	6	4639618	4639623	0 %	0 %	50 %	50 %	549726945
84568	NC_022544	CG	3	6	4639724	4639729	0 %	0 %	50 %	50 %	549726945
84569	NC_022544	CTG	2	6	4639773	4639778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726945
84570	NC_022544	GC	4	8	4640104	4640111	0 %	0 %	50 %	50 %	549726945
84571	NC_022544	CGC	2	6	4640131	4640136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726945
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84574	NC_022544	GAA	2	6	4640301	4640306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726945
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84576	NC_022544	CCGC	2	8	4640425	4640432	0 %	0 %	25 %	75 %	549726945
84577	NC_022544	CGG	2	6	4640462	4640467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726945
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84581	NC_022544	GTA	2	6	4640722	4640727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726945
84582	NC_022544	AAT	2	6	4640776	4640781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726945
84583	NC_022544	TTCGG	2	10	4640924	4640933	0 %	40 %	40 %	20 %	549726946
84584	NC_022544	TGC	2	6	4640941	4640946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726946
84585	NC_022544	ATA	2	6	4640958	4640963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726946
84586	NC_022544	GTT	2	6	4640990	4640995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549726946
84587	NC_022544	CTGAA	2	10	4641015	4641024	40 %	20 %	20 %	20 %	549726946
84588	NC_022544	GC	3	6	4641043	4641048	0 %	0 %	50 %	50 %	549726946
84589	NC_022544	CGC	2	6	4641075	4641080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726946
84590	NC_022544	GC	3	6	4641165	4641170	0 %	0 %	50 %	50 %	549726946
84591	NC_022544	CGAA	2	8	4641180	4641187	50 %	0 %	25 %	25 %	549726946
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84600	NC_022544	TGA	2	6	4641758	4641763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726948
84601	NC_022544	GGC	2	6	4641803	4641808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726948
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84603	NC_022544	TAT	2	6	4641841	4641846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726948
84604	NC_022544	A	6	6	4641887	4641892	100 %	0 %	0 %	0 %	549726949
84605	NC_022544	CGT	2	6	4641906	4641911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726949
84606	NC_022544	GGC	2	6	4641945	4641950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726949
84607	NC_022544	GCGG	2	8	4641964	4641971	0 %	0 %	75 %	25 %	549726949
84608	NC_022544	CG	3	6	4641973	4641978	0 %	0 %	50 %	50 %	549726949
84609	NC_022544	GTC	2	6	4641979	4641984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726949
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84611	NC_022544	CATTT	2	10	4642050	4642059	20 %	60 %	0 %	20 %	549726949
84612	NC_022544	GCG	3	9	4642067	4642075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726949
84613	NC_022544	AGA	2	6	4642200	4642205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726949
84614	NC_022544	TGA	3	9	4642252	4642260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726949
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84616	NC_022544	CGG	2	6	4642348	4642353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726950
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84730	NC_022544	GA	3	6	4647522	4647527	50 %	0 %	50 %	0 %	549726956
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