MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 87606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022544	TTG	2	6	347378	347383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723020
6502	NC_022544	CGCACA	2	12	347393	347404	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549723020
6503	NC_022544	TTC	2	6	347468	347473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723020
6504	NC_022544	GCTG	2	8	347678	347685	0 %	25 %	50 %	25 %	549723020
6505	NC_022544	CGT	2	6	347689	347694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723020
6506	NC_022544	CAC	2	6	347706	347711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723020
6507	NC_022544	GCT	2	6	347727	347732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723020
6508	NC_022544	CTGA	2	8	347762	347769	25 %	25 %	25 %	25 %	549723020
6509	NC_022544	TGC	2	6	347790	347795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723021
6510	NC_022544	TCC	2	6	347804	347809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723021
6511	NC_022544	CAT	2	6	347812	347817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723021
6512	NC_022544	CGG	2	6	347818	347823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723021
6513	NC_022544	ATG	2	6	347849	347854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723021
6514	NC_022544	GCA	2	6	347924	347929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723021
6515	NC_022544	GTT	3	9	348007	348015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723021
6516	NC_022544	ATT	2	6	348024	348029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723021
6517	NC_022544	GAG	2	6	348093	348098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723021
6518	NC_022544	TCTGT	2	10	348144	348153	0 %	60 %	20 %	20 %	549723021
6519	NC_022544	TCC	2	6	348155	348160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723021
6520	NC_022544	AAT	2	6	348170	348175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723021
6521	NC_022544	AAT	2	6	348204	348209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723021
6522	NC_022544	ATG	2	6	348584	348589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723022
6523	NC_022544	AAT	2	6	348599	348604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723022
6524	NC_022544	GAT	2	6	348622	348627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723022
6525	NC_022544	TTA	2	6	348630	348635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723022
6526	NC_022544	CTG	2	6	348693	348698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723022
6527	NC_022544	TTACT	2	10	348738	348747	20 %	60 %	0 %	20 %	549723022
6528	NC_022544	ACTG	2	8	348772	348779	25 %	25 %	25 %	25 %	549723022
6529	NC_022544	AGCT	2	8	348946	348953	25 %	25 %	25 %	25 %	549723022
6530	NC_022544	T	7	7	348997	349003	0 %	100 %	0 %	0 %	549723022
6531	NC_022544	TGA	2	6	349021	349026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723022
6532	NC_022544	AT	3	6	349117	349122	50 %	50 %	0 %	0 %	549723022
6533	NC_022544	ATT	2	6	349169	349174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723022
6534	NC_022544	AAT	2	6	349274	349279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723022
6535	NC_022544	CCA	2	6	349347	349352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723022
6536	NC_022544	A	6	6	349360	349365	100 %	0 %	0 %	0 %	549723022
6537	NC_022544	TAT	2	6	349442	349447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723022
6538	NC_022544	AAT	2	6	349493	349498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723022
6539	NC_022544	ATG	2	6	349521	349526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723022
6540	NC_022544	ATG	2	6	349648	349653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723023
6541	NC_022544	ATA	2	6	349670	349675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723023
6542	NC_022544	TCC	2	6	349814	349819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723023
6543	NC_022544	GTAA	2	8	349876	349883	50 %	25 %	25 %	0 %	549723024
6544	NC_022544	CAT	2	6	349923	349928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723024
6545	NC_022544	TCA	2	6	349940	349945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723024
6546	NC_022544	T	6	6	349958	349963	0 %	100 %	0 %	0 %	549723024
6547	NC_022544	ATA	2	6	350012	350017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723024
6548	NC_022544	T	6	6	350069	350074	0 %	100 %	0 %	0 %	549723024
6549	NC_022544	CAGA	2	8	350079	350086	50 %	0 %	25 %	25 %	549723024
6550	NC_022544	TTA	2	6	350120	350125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723024
6551	NC_022544	ATA	2	6	350197	350202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723024
6552	NC_022544	T	6	6	350237	350242	0 %	100 %	0 %	0 %	549723024
6553	NC_022544	AAT	2	6	350272	350277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723024
6554	NC_022544	CGC	2	6	350382	350387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723024
6555	NC_022544	GTTGA	2	10	350453	350462	20 %	40 %	40 %	0 %	549723024
6556	NC_022544	CTT	2	6	350514	350519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723024
6557	NC_022544	ATG	2	6	350558	350563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723024
6558	NC_022544	TTTCA	2	10	350581	350590	20 %	60 %	0 %	20 %	549723024
6559	NC_022544	TTG	2	6	350941	350946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723025
6560	NC_022544	ATA	2	6	350992	350997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723025
6561	NC_022544	ATA	2	6	351007	351012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723025
6562	NC_022544	TGT	2	6	351020	351025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723025
6563	NC_022544	GCT	2	6	351048	351053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723025
6564	NC_022544	CGG	2	6	351060	351065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723025
6565	NC_022544	CTGA	2	8	351133	351140	25 %	25 %	25 %	25 %	549723025
6566	NC_022544	GTT	2	6	351153	351158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723025
6567	NC_022544	T	6	6	351166	351171	0 %	100 %	0 %	0 %	549723025
6568	NC_022544	GGGC	2	8	351225	351232	0 %	0 %	75 %	25 %	549723025
6569	NC_022544	GGA	2	6	351236	351241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723025
6570	NC_022544	CGCC	2	8	351276	351283	0 %	0 %	25 %	75 %	549723025
6571	NC_022544	CGA	2	6	351757	351762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723026
6572	NC_022544	GA	3	6	351761	351766	50 %	0 %	50 %	0 %	549723026
6573	NC_022544	CGG	2	6	351802	351807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723026
6574	NC_022544	CGC	2	6	351847	351852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723026
6575	NC_022544	GC	4	8	351921	351928	0 %	0 %	50 %	50 %	549723026
6576	NC_022544	AGCG	2	8	351951	351958	25 %	0 %	50 %	25 %	549723026
6577	NC_022544	TACA	2	8	351977	351984	50 %	25 %	0 %	25 %	549723026
6578	NC_022544	GAT	2	6	352079	352084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723026
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6581	NC_022544	GGT	2	6	352325	352330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723026
6582	NC_022544	CTGT	2	8	352379	352386	0 %	50 %	25 %	25 %	549723026
6583	NC_022544	TCCA	2	8	352413	352420	25 %	25 %	0 %	50 %	549723026
6584	NC_022544	GTT	2	6	352429	352434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723026
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6587	NC_022544	GGC	2	6	352694	352699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723027
6588	NC_022544	GC	3	6	352736	352741	0 %	0 %	50 %	50 %	549723027
6589	NC_022544	TGG	2	6	352797	352802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723027
6590	NC_022544	CTT	2	6	352834	352839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723027
6591	NC_022544	ACCG	2	8	352847	352854	25 %	0 %	25 %	50 %	549723027
6592	NC_022544	CGG	2	6	352864	352869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723027
6593	NC_022544	ATC	2	6	352989	352994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723027
6594	NC_022544	ACG	2	6	353013	353018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723027
6595	NC_022544	GCA	2	6	353035	353040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723027
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6597	NC_022544	CG	3	6	353187	353192	0 %	0 %	50 %	50 %	549723027
6598	NC_022544	GCC	2	6	353219	353224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723027
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6602	NC_022544	ACA	2	6	353398	353403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723027
6603	NC_022544	CAT	2	6	353422	353427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723027
6604	NC_022544	CTGCG	2	10	353432	353441	0 %	20 %	40 %	40 %	549723027
6605	NC_022544	ATC	2	6	353493	353498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723027
6606	NC_022544	GC	3	6	353545	353550	0 %	0 %	50 %	50 %	549723027
6607	NC_022544	CTG	2	6	353633	353638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723027
6608	NC_022544	GGTG	2	8	353644	353651	0 %	25 %	75 %	0 %	549723027
6609	NC_022544	CCG	2	6	353680	353685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723027
6610	NC_022544	GCG	2	6	353724	353729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723027
6611	NC_022544	CATC	2	8	353731	353738	25 %	25 %	0 %	50 %	549723027
6612	NC_022544	GATA	2	8	353795	353802	50 %	25 %	25 %	0 %	549723027
6613	NC_022544	GAC	2	6	353812	353817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723027
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6616	NC_022544	ATA	2	6	353958	353963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723027
6617	NC_022544	GGAAC	2	10	354010	354019	40 %	0 %	40 %	20 %	549723027
6618	NC_022544	GAC	3	9	354034	354042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723027
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6620	NC_022544	CTG	2	6	354215	354220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723027
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6622	NC_022544	TTC	2	6	354348	354353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723027
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6988	NC_022544	TGGG	2	8	376881	376888	0 %	25 %	75 %	0 %	549723048
6989	NC_022544	GTC	2	6	376898	376903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723048
6990	NC_022544	ATGG	2	8	376910	376917	25 %	25 %	50 %	0 %	549723048
6991	NC_022544	GTG	2	6	376944	376949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723048
6992	NC_022544	GTC	2	6	377017	377022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723048
6993	NC_022544	TGG	2	6	377085	377090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723048
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6998	NC_022544	ACGG	2	8	377297	377304	25 %	0 %	50 %	25 %	549723048
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7000	NC_022544	TTC	2	6	377341	377346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723048

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