MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_022525	CTGG	2	8	1118984	1118991	0 %	25 %	50 %	25 %	549478954
21002	NC_022525	ATT	2	6	1119021	1119026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478954
21003	NC_022525	TC	3	6	1119031	1119036	0 %	50 %	0 %	50 %	549478954
21004	NC_022525	TCGT	2	8	1119041	1119048	0 %	50 %	25 %	25 %	549478954
21005	NC_022525	TCGATC	2	12	1119076	1119087	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549478954
21006	NC_022525	CTG	2	6	1119129	1119134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478954
21007	NC_022525	AGA	2	6	1119140	1119145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478954
21008	NC_022525	AGA	2	6	1119158	1119163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478954
21009	NC_022525	GAA	2	6	1119201	1119206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478954
21010	NC_022525	GC	3	6	1119231	1119236	0 %	0 %	50 %	50 %	549478954
21011	NC_022525	CGT	2	6	1119279	1119284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478954
21012	NC_022525	AGCG	2	8	1119291	1119298	25 %	0 %	50 %	25 %	549478954
21013	NC_022525	AAC	2	6	1119400	1119405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478954
21014	NC_022525	GCG	2	6	1119436	1119441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478954
21015	NC_022525	A	6	6	1119595	1119600	100 %	0 %	0 %	0 %	549478954
21016	NC_022525	GCAA	2	8	1119625	1119632	50 %	0 %	25 %	25 %	549478954
21017	NC_022525	CG	3	6	1119720	1119725	0 %	0 %	50 %	50 %	549478954
21018	NC_022525	CGG	2	6	1119731	1119736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478954
21019	NC_022525	AACG	2	8	1119806	1119813	50 %	0 %	25 %	25 %	549478954
21020	NC_022525	AGA	2	6	1119842	1119847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478954
21021	NC_022525	TAC	2	6	1119874	1119879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478954
21022	NC_022525	ATA	2	6	1119907	1119912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478954
21023	NC_022525	GCG	2	6	1119940	1119945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478954
21024	NC_022525	CGG	2	6	1119965	1119970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478954
21025	NC_022525	ATG	2	6	1119976	1119981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478954
21026	NC_022525	GCA	2	6	1119989	1119994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478954
21027	NC_022525	AGC	2	6	1119997	1120002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478954
21028	NC_022525	CGA	2	6	1120009	1120014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478954
21029	NC_022525	A	8	8	1120029	1120036	100 %	0 %	0 %	0 %	549478954
21030	NC_022525	GAAGC	2	10	1120146	1120155	40 %	0 %	40 %	20 %	549478954
21031	NC_022525	T	6	6	1120191	1120196	0 %	100 %	0 %	0 %	549478954
21032	NC_022525	TG	3	6	1120329	1120334	0 %	50 %	50 %	0 %	549478955
21033	NC_022525	TGC	2	6	1120345	1120350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478955
21034	NC_022525	TGG	2	6	1120383	1120388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478955
21035	NC_022525	AGC	2	6	1120417	1120422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478955
21036	NC_022525	GCG	2	6	1120434	1120439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478955
21037	NC_022525	TGC	2	6	1120512	1120517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478955
21038	NC_022525	TAT	2	6	1120638	1120643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478955
21039	NC_022525	CTATT	2	10	1120677	1120686	20 %	60 %	0 %	20 %	549478955
21040	NC_022525	A	8	8	1120720	1120727	100 %	0 %	0 %	0 %	549478955
21041	NC_022525	TCC	2	6	1120746	1120751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478955
21042	NC_022525	ATCGGC	2	12	1120829	1120840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478955
21043	NC_022525	AGC	2	6	1120841	1120846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478955
21044	NC_022525	GT	3	6	1120894	1120899	0 %	50 %	50 %	0 %	549478955
21045	NC_022525	CGC	2	6	1120904	1120909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478955
21046	NC_022525	GAT	2	6	1120919	1120924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478955
21047	NC_022525	CTG	2	6	1121002	1121007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478955
21048	NC_022525	CCTG	2	8	1121017	1121024	0 %	25 %	25 %	50 %	549478955
21049	NC_022525	TTA	2	6	1121102	1121107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478955
21050	NC_022525	CTGG	2	8	1121195	1121202	0 %	25 %	50 %	25 %	549478955
21051	NC_022525	GGC	2	6	1121239	1121244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478955
21052	NC_022525	TAT	2	6	1121263	1121268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478955
21053	NC_022525	TTG	2	6	1121305	1121310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478955
21054	NC_022525	AGT	2	6	1121365	1121370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478955
21055	NC_022525	TGAT	2	8	1121394	1121401	25 %	50 %	25 %	0 %	549478955
21056	NC_022525	CT	3	6	1121420	1121425	0 %	50 %	0 %	50 %	549478955
21057	NC_022525	GTC	2	6	1121492	1121497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478955
21058	NC_022525	GAG	2	6	1121570	1121575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478955
21059	NC_022525	A	6	6	1121595	1121600	100 %	0 %	0 %	0 %	549481860
21060	NC_022525	CCA	2	6	1121702	1121707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481860
21061	NC_022525	CAC	2	6	1121729	1121734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481860
21062	NC_022525	ACG	2	6	1121763	1121768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481860
21063	NC_022525	CTGA	2	8	1121814	1121821	25 %	25 %	25 %	25 %	549481860
21064	NC_022525	TGC	2	6	1121875	1121880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481860
21065	NC_022525	GGT	2	6	1121900	1121905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481860
21066	NC_022525	GCT	2	6	1121948	1121953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481860
21067	NC_022525	CTT	2	6	1122015	1122020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481860
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21069	NC_022525	GCC	2	6	1122038	1122043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481860
21070	NC_022525	GTT	2	6	1122188	1122193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481860
21071	NC_022525	CGG	2	6	1122274	1122279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481860
21072	NC_022525	GAC	2	6	1122305	1122310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481860
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21074	NC_022525	GGC	3	9	1122318	1122326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481860
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21076	NC_022525	ACG	2	6	1122397	1122402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481860
21077	NC_022525	A	6	6	1122406	1122411	100 %	0 %	0 %	0 %	549481860
21078	NC_022525	GC	3	6	1122490	1122495	0 %	0 %	50 %	50 %	549481860
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21081	NC_022525	GC	3	6	1122655	1122660	0 %	0 %	50 %	50 %	549481860
21082	NC_022525	CGCTT	2	10	1122692	1122701	0 %	40 %	20 %	40 %	549481860
21083	NC_022525	GCC	2	6	1122761	1122766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481860
21084	NC_022525	ATT	2	6	1122801	1122806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481860
21085	NC_022525	CAG	2	6	1122815	1122820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481860
21086	NC_022525	TGG	2	6	1122847	1122852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481860
21087	NC_022525	CAA	2	6	1122869	1122874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481860
21088	NC_022525	GAT	2	6	1122890	1122895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481860
21089	NC_022525	ATA	2	6	1122961	1122966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481860
21090	NC_022525	CAGT	2	8	1122983	1122990	25 %	25 %	25 %	25 %	549481860
21091	NC_022525	GCA	2	6	1122995	1123000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481860
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21093	NC_022525	CGG	2	6	1123069	1123074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481860
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21096	NC_022525	A	6	6	1123226	1123231	100 %	0 %	0 %	0 %	549481860
21097	NC_022525	CTGG	2	8	1123255	1123262	0 %	25 %	50 %	25 %	549481861
21098	NC_022525	CGG	2	6	1123276	1123281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481861
21099	NC_022525	TAT	2	6	1123295	1123300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481861
21100	NC_022525	GTG	2	6	1123406	1123411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481861
21101	NC_022525	TGG	2	6	1123494	1123499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481861
21102	NC_022525	CTGG	2	8	1123521	1123528	0 %	25 %	50 %	25 %	549481861
21103	NC_022525	GTC	2	6	1123529	1123534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481861
21104	NC_022525	ACC	2	6	1123553	1123558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481861
21105	NC_022525	TTA	2	6	1123634	1123639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481861
21106	NC_022525	CAG	2	6	1123688	1123693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481861
21107	NC_022525	ATG	2	6	1123704	1123709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481861
21108	NC_022525	AGC	2	6	1123747	1123752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481861
21109	NC_022525	GAC	2	6	1124368	1124373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478956
21110	NC_022525	CCA	2	6	1124377	1124382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478956
21111	NC_022525	CGCCCA	2	12	1124497	1124508	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	549478956
21112	NC_022525	CGC	2	6	1124527	1124532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478956
21113	NC_022525	CCA	2	6	1124554	1124559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478956
21114	NC_022525	CCAGAC	2	12	1124575	1124586	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549478956
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21116	NC_022525	GCC	2	6	1124684	1124689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478956
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21118	NC_022525	CAT	2	6	1124717	1124722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478956
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21123	NC_022525	CGT	2	6	1125060	1125065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478957
21124	NC_022525	CTTCT	2	10	1125085	1125094	0 %	60 %	0 %	40 %	549478957
21125	NC_022525	GCA	2	6	1125105	1125110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478957
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21130	NC_022525	CCCA	2	8	1125226	1125233	25 %	0 %	0 %	75 %	549478957
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21217	NC_022525	AACT	2	8	1130847	1130854	50 %	25 %	0 %	25 %	549478962
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21220	NC_022525	TCG	2	6	1131206	1131211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478962
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21224	NC_022525	GCG	2	6	1131307	1131312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478962
21225	NC_022525	GC	3	6	1131378	1131383	0 %	0 %	50 %	50 %	549478962
21226	NC_022525	GCCTGC	2	12	1131397	1131408	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549478962
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21228	NC_022525	GAA	2	6	1131487	1131492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478962
21229	NC_022525	GCG	2	6	1131540	1131545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478962
21230	NC_022525	CGC	2	6	1131566	1131571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478962
21231	NC_022525	CGCTAA	2	12	1131630	1131641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549478962
21232	NC_022525	GCG	2	6	1131650	1131655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478962
21233	NC_022525	ACGG	2	8	1131752	1131759	25 %	0 %	50 %	25 %	549478962
21234	NC_022525	CAG	2	6	1131816	1131821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478962
21235	NC_022525	AAG	2	6	1131854	1131859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478962
21236	NC_022525	TGG	2	6	1131905	1131910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478962
21237	NC_022525	TCC	2	6	1131927	1131932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478962
21238	NC_022525	CAA	2	6	1131933	1131938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478962
21239	NC_022525	TGG	2	6	1131950	1131955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478962
21240	NC_022525	AGC	2	6	1131997	1132002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478962
21241	NC_022525	A	6	6	1132023	1132028	100 %	0 %	0 %	0 %	549478962
21242	NC_022525	GTC	2	6	1132074	1132079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478962
21243	NC_022525	CCA	2	6	1132146	1132151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478962
21244	NC_022525	GGT	2	6	1132161	1132166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478962
21245	NC_022525	CGG	2	6	1132276	1132281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478963
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21247	NC_022525	CG	3	6	1132297	1132302	0 %	0 %	50 %	50 %	549478963
21248	NC_022525	GAC	2	6	1132323	1132328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478963
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21250	NC_022525	GAT	2	6	1132395	1132400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478963
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21252	NC_022525	CCA	2	6	1132446	1132451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478963
21253	NC_022525	A	7	7	1132456	1132462	100 %	0 %	0 %	0 %	549478963
21254	NC_022525	CGC	2	6	1132515	1132520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478963
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21256	NC_022525	CAG	2	6	1132644	1132649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478963
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21259	NC_022525	CGC	2	6	1133129	1133134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481862
21260	NC_022525	GCC	2	6	1133244	1133249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481862
21261	NC_022525	GGA	2	6	1133273	1133278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481862
21262	NC_022525	GCA	3	9	1133345	1133353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481862
21263	NC_022525	T	6	6	1133397	1133402	0 %	100 %	0 %	0 %	549481862
21264	NC_022525	TCT	2	6	1133415	1133420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481862
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21268	NC_022525	TGG	2	6	1133512	1133517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481862
21269	NC_022525	CG	4	8	1133518	1133525	0 %	0 %	50 %	50 %	549481862
21270	NC_022525	GC	3	6	1133538	1133543	0 %	0 %	50 %	50 %	549481862
21271	NC_022525	GGC	2	6	1133591	1133596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481862
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21275	NC_022525	CG	3	6	1133738	1133743	0 %	0 %	50 %	50 %	549481862
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21282	NC_022525	GCT	2	6	1134017	1134022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481862
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21288	NC_022525	A	6	6	1134405	1134410	100 %	0 %	0 %	0 %	549481862
21289	NC_022525	A	6	6	1134438	1134443	100 %	0 %	0 %	0 %	549481862
21290	NC_022525	GAAG	2	8	1134506	1134513	50 %	0 %	50 %	0 %	549481862
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21298	NC_022525	CG	5	10	1134787	1134796	0 %	0 %	50 %	50 %	549481862
21299	NC_022525	GCT	2	6	1134809	1134814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481862
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21301	NC_022525	GAT	2	6	1135004	1135009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478964
21302	NC_022525	CCG	2	6	1135015	1135020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478964
21303	NC_022525	AGA	2	6	1135117	1135122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478964
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21319	NC_022525	TAA	2	6	1136010	1136015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478965
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21332	NC_022525	CAT	3	9	1136910	1136918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478967
21333	NC_022525	GCG	2	6	1136945	1136950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478967
21334	NC_022525	TCG	2	6	1136957	1136962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478967
21335	NC_022525	TCA	2	6	1136975	1136980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478967
21336	NC_022525	TCA	2	6	1136990	1136995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478967
21337	NC_022525	CGA	2	6	1137018	1137023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478967
21338	NC_022525	CGG	2	6	1137216	1137221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478968
21339	NC_022525	AAAT	2	8	1137292	1137299	75 %	25 %	0 %	0 %	549478968
21340	NC_022525	TCA	2	6	1137306	1137311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478968
21341	NC_022525	CAG	2	6	1137331	1137336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478968
21342	NC_022525	GCC	2	6	1137340	1137345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478968
21343	NC_022525	ATG	3	9	1137443	1137451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478968
21344	NC_022525	GC	3	6	1137482	1137487	0 %	0 %	50 %	50 %	549478968
21345	NC_022525	CGT	2	6	1137501	1137506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478968
21346	NC_022525	GTTCA	2	10	1137541	1137550	20 %	40 %	20 %	20 %	549478968
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21348	NC_022525	GCG	2	6	1137688	1137693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478968
21349	NC_022525	GAC	2	6	1137702	1137707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478968
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21449	NC_022525	AT	3	6	1143691	1143696	50 %	50 %	0 %	0 %	549478974
21450	NC_022525	GTTA	2	8	1143710	1143717	25 %	50 %	25 %	0 %	549478974
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21453	NC_022525	A	6	6	1144435	1144440	100 %	0 %	0 %	0 %	549478975
21454	NC_022525	TGC	2	6	1144441	1144446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478975
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21461	NC_022525	TC	3	6	1144884	1144889	0 %	50 %	0 %	50 %	549478976
21462	NC_022525	CAT	2	6	1144906	1144911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478976
21463	NC_022525	CGC	2	6	1145007	1145012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478976
21464	NC_022525	ATG	2	6	1145020	1145025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478976
21465	NC_022525	AT	3	6	1145040	1145045	50 %	50 %	0 %	0 %	549478976
21466	NC_022525	GC	3	6	1145056	1145061	0 %	0 %	50 %	50 %	549478976
21467	NC_022525	GAC	2	6	1145071	1145076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478976
21468	NC_022525	GCCA	2	8	1145099	1145106	25 %	0 %	25 %	50 %	549478976
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21495	NC_022525	CCT	2	6	1146874	1146879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481865
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