MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_022525	TGA	2	6	871988	871993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478772
16503	NC_022525	CTAT	2	8	872062	872069	25 %	50 %	0 %	25 %	549478772
16504	NC_022525	CGC	2	6	872089	872094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478772
16505	NC_022525	ATA	2	6	872167	872172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478772
16506	NC_022525	GCT	2	6	872174	872179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16507	NC_022525	AGC	2	6	872185	872190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16508	NC_022525	GAT	2	6	872222	872227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478772
16509	NC_022525	CGGGC	2	10	872285	872294	0 %	0 %	60 %	40 %	549478772
16510	NC_022525	CCG	2	6	872298	872303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478772
16511	NC_022525	CCG	2	6	872326	872331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478772
16512	NC_022525	CTG	2	6	872337	872342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16513	NC_022525	GTG	2	6	872343	872348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478772
16514	NC_022525	GC	3	6	872403	872408	0 %	0 %	50 %	50 %	549478772
16515	NC_022525	CTAT	2	8	872503	872510	25 %	50 %	0 %	25 %	549478772
16516	NC_022525	TGA	2	6	872552	872557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478772
16517	NC_022525	GGT	2	6	872558	872563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478772
16518	NC_022525	CGAC	2	8	872577	872584	25 %	0 %	25 %	50 %	549478772
16519	NC_022525	GCT	2	6	872588	872593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16520	NC_022525	ATT	2	6	872601	872606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478772
16521	NC_022525	CTG	2	6	872640	872645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16522	NC_022525	GCGT	2	8	872752	872759	0 %	25 %	50 %	25 %	549478772
16523	NC_022525	ATC	2	6	872799	872804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478772
16524	NC_022525	TGG	2	6	872836	872841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478772
16525	NC_022525	CTG	2	6	872850	872855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16526	NC_022525	TGG	2	6	872887	872892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478772
16527	NC_022525	CG	3	6	872958	872963	0 %	0 %	50 %	50 %	549478772
16528	NC_022525	AGC	2	6	873058	873063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16529	NC_022525	A	6	6	873108	873113	100 %	0 %	0 %	0 %	549478772
16530	NC_022525	GCA	2	6	873233	873238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16531	NC_022525	ATG	2	6	873264	873269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478772
16532	NC_022525	GAA	2	6	873294	873299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478772
16533	NC_022525	GTT	2	6	873338	873343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478772
16534	NC_022525	AGA	2	6	873930	873935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481811
16535	NC_022525	AATAA	2	10	873943	873952	80 %	20 %	0 %	0 %	549481811
16536	NC_022525	AGA	2	6	874035	874040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481811
16537	NC_022525	ATA	2	6	874094	874099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481811
16538	NC_022525	TAG	2	6	874107	874112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481811
16539	NC_022525	AGG	2	6	874113	874118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481811
16540	NC_022525	GAGG	2	8	874198	874205	25 %	0 %	75 %	0 %	549481811
16541	NC_022525	AGTC	2	8	874211	874218	25 %	25 %	25 %	25 %	549481811
16542	NC_022525	GCA	2	6	874333	874338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481811
16543	NC_022525	GAA	2	6	874345	874350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481811
16544	NC_022525	ATA	2	6	874382	874387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481811
16545	NC_022525	ACT	2	6	874453	874458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481811
16546	NC_022525	ATA	2	6	874661	874666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481811
16547	NC_022525	GCC	2	6	874818	874823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481811
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16549	NC_022525	GTAA	2	8	874906	874913	50 %	25 %	25 %	0 %	549481811
16550	NC_022525	AAC	2	6	874956	874961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481811
16551	NC_022525	CGG	2	6	875009	875014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481811
16552	NC_022525	AAT	2	6	875022	875027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481811
16553	NC_022525	GTG	2	6	875081	875086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481811
16554	NC_022525	AAT	2	6	875106	875111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481811
16555	NC_022525	GAAC	2	8	875134	875141	50 %	0 %	25 %	25 %	549481811
16556	NC_022525	GAG	2	6	875278	875283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481811
16557	NC_022525	GGCG	2	8	875300	875307	0 %	0 %	75 %	25 %	549481811
16558	NC_022525	TAT	2	6	875457	875462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481811
16559	NC_022525	ACC	2	6	875510	875515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481811
16560	NC_022525	ATG	2	6	875540	875545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481811
16561	NC_022525	TCGC	2	8	875626	875633	0 %	25 %	25 %	50 %	549481811
16562	NC_022525	T	6	6	875656	875661	0 %	100 %	0 %	0 %	549481811
16563	NC_022525	CGAAGT	2	12	875667	875678	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549481811
16564	NC_022525	GTCGCT	2	12	875709	875720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481811
16565	NC_022525	ACA	2	6	875722	875727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481811
16566	NC_022525	AGA	2	6	875883	875888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481811
16567	NC_022525	ATG	2	6	875899	875904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481811
16568	NC_022525	ATCA	2	8	876031	876038	50 %	25 %	0 %	25 %	549481811
16569	NC_022525	AT	3	6	876065	876070	50 %	50 %	0 %	0 %	549481811
16570	NC_022525	A	6	6	876076	876081	100 %	0 %	0 %	0 %	549481811
16571	NC_022525	GCTC	2	8	876089	876096	0 %	25 %	25 %	50 %	549481811
16572	NC_022525	TAA	2	6	876248	876253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481812
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16575	NC_022525	AT	3	6	876378	876383	50 %	50 %	0 %	0 %	549481812
16576	NC_022525	CAT	2	6	876389	876394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481812
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16579	NC_022525	AATCAG	2	12	876554	876565	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549481812
16580	NC_022525	GCG	3	9	876634	876642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481812
16581	NC_022525	AATTA	2	10	876764	876773	60 %	40 %	0 %	0 %	549481812
16582	NC_022525	GCG	2	6	876959	876964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481812
16583	NC_022525	C	6	6	876980	876985	0 %	0 %	0 %	100 %	549481812
16584	NC_022525	GAA	2	6	877029	877034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481812
16585	NC_022525	GAG	2	6	877038	877043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481812
16586	NC_022525	CCG	2	6	877068	877073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481812
16587	NC_022525	CAGC	2	8	877096	877103	25 %	0 %	25 %	50 %	549481812
16588	NC_022525	CG	3	6	877540	877545	0 %	0 %	50 %	50 %	549478773
16589	NC_022525	TAC	2	6	877553	877558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478773
16590	NC_022525	TG	3	6	877579	877584	0 %	50 %	50 %	0 %	549478773
16591	NC_022525	CTGC	2	8	877603	877610	0 %	25 %	25 %	50 %	549478773
16592	NC_022525	GGC	2	6	877628	877633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478773
16593	NC_022525	AAC	2	6	877640	877645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478773
16594	NC_022525	TCG	2	6	877669	877674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478773
16595	NC_022525	CG	3	6	877680	877685	0 %	0 %	50 %	50 %	549478773
16596	NC_022525	CGG	2	6	877723	877728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478773
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16600	NC_022525	ATG	2	6	877782	877787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478773
16601	NC_022525	GC	3	6	877829	877834	0 %	0 %	50 %	50 %	549478773
16602	NC_022525	GCC	2	6	877961	877966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478773
16603	NC_022525	CCTT	2	8	878040	878047	0 %	50 %	0 %	50 %	549478773
16604	NC_022525	CAT	2	6	878129	878134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478773
16605	NC_022525	CGA	2	6	878155	878160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478773
16606	NC_022525	CCA	2	6	878182	878187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478773
16607	NC_022525	T	6	6	878220	878225	0 %	100 %	0 %	0 %	549478773
16608	NC_022525	CGTC	2	8	878310	878317	0 %	25 %	25 %	50 %	549478773
16609	NC_022525	CGG	2	6	878347	878352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478773
16610	NC_022525	GCA	2	6	878386	878391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478773
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16615	NC_022525	GTG	2	6	878654	878659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478774
16616	NC_022525	TGA	2	6	878725	878730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478774
16617	NC_022525	CG	4	8	878886	878893	0 %	0 %	50 %	50 %	549478774
16618	NC_022525	TGGCG	2	10	878899	878908	0 %	20 %	60 %	20 %	549478774
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16741	NC_022525	CGC	2	6	885043	885048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478781
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16743	NC_022525	T	6	6	885127	885132	0 %	100 %	0 %	0 %	549478781
16744	NC_022525	G	6	6	885249	885254	0 %	0 %	100 %	0 %	549478782
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16980	NC_022525	CGC	2	6	896158	896163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478790
16981	NC_022525	ATC	2	6	896220	896225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478791
16982	NC_022525	GATCTG	2	12	896259	896270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549478791
16983	NC_022525	CG	4	8	896276	896283	0 %	0 %	50 %	50 %	549478791
16984	NC_022525	AGGCGA	2	12	896360	896371	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549478791
16985	NC_022525	CCGC	2	8	896427	896434	0 %	0 %	25 %	75 %	549478791
16986	NC_022525	GC	3	6	896473	896478	0 %	0 %	50 %	50 %	549478791
16987	NC_022525	CTG	2	6	896514	896519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478791
16988	NC_022525	GTA	2	6	896541	896546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478791
16989	NC_022525	CGG	2	6	896624	896629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478791
16990	NC_022525	GC	3	6	896680	896685	0 %	0 %	50 %	50 %	549478791
16991	NC_022525	CGC	2	6	896692	896697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478791
16992	NC_022525	AAC	2	6	896704	896709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478791
16993	NC_022525	GC	3	6	896743	896748	0 %	0 %	50 %	50 %	549478791
16994	NC_022525	T	6	6	896844	896849	0 %	100 %	0 %	0 %	549478791
16995	NC_022525	GGCG	2	8	896859	896866	0 %	0 %	75 %	25 %	549478791
16996	NC_022525	TGAT	2	8	896935	896942	25 %	50 %	25 %	0 %	549478791
16997	NC_022525	ACG	2	6	896986	896991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478791
16998	NC_022525	CTGC	2	8	897003	897010	0 %	25 %	25 %	50 %	549478791
16999	NC_022525	CG	3	6	897032	897037	0 %	0 %	50 %	50 %	549478791
17000	NC_022525	GCCG	2	8	897057	897064	0 %	0 %	50 %	50 %	549478791

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