MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_022525	CGC	2	6	846137	846142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478751
16003	NC_022525	CTG	2	6	846159	846164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478751
16004	NC_022525	CGG	2	6	846224	846229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478751
16005	NC_022525	GTACG	2	10	846239	846248	20 %	20 %	40 %	20 %	549478751
16006	NC_022525	TCG	2	6	846250	846255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478751
16007	NC_022525	CG	3	6	846254	846259	0 %	0 %	50 %	50 %	549478751
16008	NC_022525	CAT	2	6	846311	846316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478751
16009	NC_022525	GC	4	8	846404	846411	0 %	0 %	50 %	50 %	549478751
16010	NC_022525	CG	3	6	846470	846475	0 %	0 %	50 %	50 %	549478752
16011	NC_022525	GCA	2	6	846568	846573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478752
16012	NC_022525	GCG	2	6	846574	846579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478752
16013	NC_022525	GTGC	2	8	846589	846596	0 %	25 %	50 %	25 %	549478752
16014	NC_022525	TTC	2	6	846614	846619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478752
16015	NC_022525	GC	3	6	846631	846636	0 %	0 %	50 %	50 %	549478752
16016	NC_022525	GGAA	2	8	846658	846665	50 %	0 %	50 %	0 %	549478752
16017	NC_022525	CGCCAG	2	12	846707	846718	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549478752
16018	NC_022525	AG	3	6	846717	846722	50 %	0 %	50 %	0 %	549478752
16019	NC_022525	GCT	2	6	846727	846732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478752
16020	NC_022525	CGC	2	6	846797	846802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478752
16021	NC_022525	CAC	2	6	846812	846817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478752
16022	NC_022525	GCCA	2	8	846819	846826	25 %	0 %	25 %	50 %	549478752
16023	NC_022525	CCA	2	6	846883	846888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478752
16024	NC_022525	ATGCGG	2	12	846983	846994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549478752
16025	NC_022525	CGC	2	6	847010	847015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478752
16026	NC_022525	CGG	2	6	847063	847068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478752
16027	NC_022525	CG	4	8	847171	847178	0 %	0 %	50 %	50 %	549478752
16028	NC_022525	CA	3	6	847315	847320	50 %	0 %	0 %	50 %	549478752
16029	NC_022525	GCA	2	6	847345	847350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478752
16030	NC_022525	GCG	2	6	847402	847407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478752
16031	NC_022525	GAT	2	6	847453	847458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478752
16032	NC_022525	TGCCAG	2	12	847522	847533	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478753
16033	NC_022525	CGCGG	2	10	847631	847640	0 %	0 %	60 %	40 %	549478753
16034	NC_022525	TAAT	2	8	847651	847658	50 %	50 %	0 %	0 %	549478753
16035	NC_022525	ACG	2	6	847774	847779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478753
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16037	NC_022525	GCGA	2	8	847861	847868	25 %	0 %	50 %	25 %	549478753
16038	NC_022525	CGA	2	6	847873	847878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478753
16039	NC_022525	TCT	2	6	847933	847938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478753
16040	NC_022525	GC	3	6	847958	847963	0 %	0 %	50 %	50 %	549478753
16041	NC_022525	GCA	2	6	847982	847987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478753
16042	NC_022525	ACTCC	2	10	847995	848004	20 %	20 %	0 %	60 %	549478753
16043	NC_022525	GCG	2	6	848072	848077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478753
16044	NC_022525	CGCA	2	8	848169	848176	25 %	0 %	25 %	50 %	549478753
16045	NC_022525	GTT	2	6	848208	848213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478753
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16048	NC_022525	GCA	2	6	848444	848449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478753
16049	NC_022525	ACC	2	6	848484	848489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478753
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16051	NC_022525	CGA	2	6	848777	848782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481808
16052	NC_022525	AGCA	2	8	848832	848839	50 %	0 %	25 %	25 %	549481808
16053	NC_022525	GCG	2	6	848875	848880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481808
16054	NC_022525	AGCGT	2	10	848922	848931	20 %	20 %	40 %	20 %	549481808
16055	NC_022525	GTCA	2	8	849003	849010	25 %	25 %	25 %	25 %	549481808
16056	NC_022525	CAG	2	6	849042	849047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481808
16057	NC_022525	TTCA	2	8	849072	849079	25 %	50 %	0 %	25 %	549481808
16058	NC_022525	GGC	2	6	849108	849113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481808
16059	NC_022525	GAT	2	6	849128	849133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481808
16060	NC_022525	GTAG	2	8	849144	849151	25 %	25 %	50 %	0 %	549481808
16061	NC_022525	AAT	2	6	849168	849173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481808
16062	NC_022525	CTT	2	6	849215	849220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481808
16063	NC_022525	T	6	6	849265	849270	0 %	100 %	0 %	0 %	549481808
16064	NC_022525	CAT	3	9	849272	849280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481808
16065	NC_022525	ATC	2	6	849297	849302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481808
16066	NC_022525	AAAT	2	8	849314	849321	75 %	25 %	0 %	0 %	549481808
16067	NC_022525	CATT	2	8	849323	849330	25 %	50 %	0 %	25 %	549481808
16068	NC_022525	CCG	2	6	849398	849403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481808
16069	NC_022525	CTT	2	6	849404	849409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481808
16070	NC_022525	CGG	2	6	849488	849493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481808
16071	NC_022525	CGG	2	6	849524	849529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481808
16072	NC_022525	TAT	2	6	849612	849617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481808
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16074	NC_022525	CAGG	2	8	849882	849889	25 %	0 %	50 %	25 %	549478754
16075	NC_022525	ATG	2	6	849902	849907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478754
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16077	NC_022525	TC	3	6	849928	849933	0 %	50 %	0 %	50 %	549478754
16078	NC_022525	GC	4	8	850039	850046	0 %	0 %	50 %	50 %	549478754
16079	NC_022525	GCT	2	6	850063	850068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478754
16080	NC_022525	GA	3	6	850077	850082	50 %	0 %	50 %	0 %	549478754
16081	NC_022525	CCG	2	6	850099	850104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478754
16082	NC_022525	GA	3	6	850203	850208	50 %	0 %	50 %	0 %	549478754
16083	NC_022525	CTG	3	9	850254	850262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478754
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16085	NC_022525	CGC	2	6	850300	850305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478754
16086	NC_022525	CGC	3	9	850311	850319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478754
16087	NC_022525	GAT	2	6	850354	850359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478754
16088	NC_022525	TAA	2	6	850366	850371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478754
16089	NC_022525	CGA	2	6	850408	850413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478754
16090	NC_022525	GGT	2	6	850450	850455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478754
16091	NC_022525	GGA	2	6	850456	850461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478754
16092	NC_022525	GGCG	2	8	850531	850538	0 %	0 %	75 %	25 %	549478754
16093	NC_022525	CGCT	2	8	850578	850585	0 %	25 %	25 %	50 %	549478754
16094	NC_022525	GTC	2	6	850626	850631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478754
16095	NC_022525	TCA	2	6	850695	850700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478754
16096	NC_022525	GTT	2	6	850765	850770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478754
16097	NC_022525	TCA	2	6	850803	850808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478754
16098	NC_022525	TAA	2	6	850814	850819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478754
16099	NC_022525	CAG	2	6	850847	850852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478754
16100	NC_022525	CTG	2	6	850919	850924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478754
16101	NC_022525	AAT	2	6	850967	850972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478754
16102	NC_022525	TTA	2	6	851025	851030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478754
16103	NC_022525	TAA	2	6	851117	851122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478754
16104	NC_022525	GC	3	6	851140	851145	0 %	0 %	50 %	50 %	549478754
16105	NC_022525	AAT	2	6	851367	851372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478755
16106	NC_022525	CCTT	2	8	851410	851417	0 %	50 %	0 %	50 %	549478755
16107	NC_022525	GGC	2	6	851424	851429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478755
16108	NC_022525	CCGCG	2	10	851498	851507	0 %	0 %	40 %	60 %	549478755
16109	NC_022525	GCG	2	6	851545	851550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478755
16110	NC_022525	CG	3	6	851549	851554	0 %	0 %	50 %	50 %	549478755
16111	NC_022525	CTT	2	6	851609	851614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478755
16112	NC_022525	TCC	2	6	851620	851625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478755
16113	NC_022525	CGC	2	6	851639	851644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478755
16114	NC_022525	CAG	2	6	851688	851693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478755
16115	NC_022525	GATCGC	2	12	851717	851728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478755
16116	NC_022525	CAG	2	6	851796	851801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478755
16117	NC_022525	TCG	2	6	851824	851829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478755
16118	NC_022525	CGC	4	12	851915	851926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478755
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16120	NC_022525	CAG	2	6	852066	852071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478755
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16240	NC_022525	GAC	2	6	858933	858938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478762
16241	NC_022525	CGC	2	6	858994	858999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478762
16242	NC_022525	GCG	2	6	859053	859058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478762
16243	NC_022525	GGA	2	6	859096	859101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478762
16244	NC_022525	CTG	2	6	859112	859117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478762
16245	NC_022525	GC	3	6	859118	859123	0 %	0 %	50 %	50 %	549478762
16246	NC_022525	ATG	2	6	859130	859135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478762
16247	NC_022525	GCT	2	6	859159	859164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478762
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16249	NC_022525	GCT	2	6	859210	859215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478762
16250	NC_022525	GCC	2	6	859235	859240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478762
16251	NC_022525	GAC	2	6	859304	859309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478762
16252	NC_022525	GAT	2	6	859342	859347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478762
16253	NC_022525	AGC	2	6	859482	859487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478762
16254	NC_022525	GCG	2	6	859500	859505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478762
16255	NC_022525	GTT	2	6	859510	859515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478762
16256	NC_022525	CGG	2	6	859536	859541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478762
16257	NC_022525	TGA	2	6	859558	859563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478762
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16260	NC_022525	CCG	2	6	859649	859654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478762
16261	NC_022525	CTG	2	6	859661	859666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478762
16262	NC_022525	CGC	2	6	859667	859672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478762
16263	NC_022525	GTCGCC	2	12	859685	859696	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549478762
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16265	NC_022525	TGTGG	2	10	859876	859885	0 %	40 %	60 %	0 %	549478762
16266	NC_022525	GCG	2	6	860037	860042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478763
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16269	NC_022525	GCCA	2	8	860206	860213	25 %	0 %	25 %	50 %	549478763
16270	NC_022525	TGG	2	6	860231	860236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478763
16271	NC_022525	GC	3	6	860276	860281	0 %	0 %	50 %	50 %	549478763
16272	NC_022525	GCG	2	6	860345	860350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478763
16273	NC_022525	GACC	2	8	860451	860458	25 %	0 %	25 %	50 %	549478763
16274	NC_022525	CG	3	6	860515	860520	0 %	0 %	50 %	50 %	549478763
16275	NC_022525	GCG	2	6	860551	860556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478763
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16299	NC_022525	GCTG	2	8	861940	861947	0 %	25 %	50 %	25 %	549481810
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16360	NC_022525	CAT	2	6	864870	864875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478765
16361	NC_022525	TGGC	2	8	864886	864893	0 %	25 %	50 %	25 %	549478765
16362	NC_022525	T	6	6	864999	865004	0 %	100 %	0 %	0 %	549478765
16363	NC_022525	GCT	2	6	865032	865037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478765
16364	NC_022525	GCGA	2	8	865196	865203	25 %	0 %	50 %	25 %	549478766
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16392	NC_022525	CCAT	2	8	866438	866445	25 %	25 %	0 %	50 %	549478767
16393	NC_022525	GCG	2	6	866454	866459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478767
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16469	NC_022525	GC	3	6	869490	869495	0 %	0 %	50 %	50 %	549478770
16470	NC_022525	GGC	2	6	869504	869509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478770
16471	NC_022525	CCTGG	2	10	869567	869576	0 %	20 %	40 %	40 %	549478770
16472	NC_022525	GTG	2	6	869594	869599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478770
16473	NC_022525	CGG	2	6	869648	869653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478770
16474	NC_022525	GTG	2	6	869655	869660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478770
16475	NC_022525	ACC	2	6	869667	869672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478770
16476	NC_022525	GGCG	2	8	869785	869792	0 %	0 %	75 %	25 %	549478770
16477	NC_022525	TACTGA	2	12	870027	870038	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549478771
16478	NC_022525	CAG	2	6	870186	870191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478771
16479	NC_022525	CGA	2	6	870264	870269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478771
16480	NC_022525	CGG	2	6	870287	870292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478771
16481	NC_022525	TAT	2	6	870293	870298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478771
16482	NC_022525	GCAG	2	8	870324	870331	25 %	0 %	50 %	25 %	549478771
16483	NC_022525	GCGG	2	8	870352	870359	0 %	0 %	75 %	25 %	549478771
16484	NC_022525	CT	3	6	870373	870378	0 %	50 %	0 %	50 %	549478771
16485	NC_022525	AGC	2	6	870413	870418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478771
16486	NC_022525	GTT	2	6	870433	870438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478771
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16488	NC_022525	GCC	2	6	870537	870542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478771
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16492	NC_022525	CGT	2	6	871401	871406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478772
16493	NC_022525	GGA	2	6	871421	871426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478772
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16500	NC_022525	GCG	2	6	871924	871929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478772

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