MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15003	NC_022525	CAG	2	6	792555	792560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478709
15004	NC_022525	CGC	2	6	792596	792601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478709
15005	NC_022525	CGC	2	6	792696	792701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478709
15006	NC_022525	GAC	2	6	792708	792713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478709
15007	NC_022525	GCT	2	6	792723	792728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478709
15008	NC_022525	CGC	2	6	792786	792791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478709
15009	NC_022525	ATGA	2	8	792853	792860	50 %	25 %	25 %	0 %	549478709
15010	NC_022525	GC	3	6	792875	792880	0 %	0 %	50 %	50 %	549478709
15011	NC_022525	CGCC	2	8	792896	792903	0 %	0 %	25 %	75 %	549478709
15012	NC_022525	CCG	3	9	793021	793029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478709
15013	NC_022525	CCT	2	6	793052	793057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478709
15014	NC_022525	GTT	2	6	793085	793090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478709
15015	NC_022525	GTG	2	6	793105	793110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478709
15016	NC_022525	TTG	2	6	793146	793151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478709
15017	NC_022525	A	6	6	793155	793160	100 %	0 %	0 %	0 %	549478709
15018	NC_022525	ATA	2	6	793187	793192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478709
15019	NC_022525	ACC	2	6	793279	793284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478709
15020	NC_022525	CGC	2	6	793296	793301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478709
15021	NC_022525	CGC	2	6	793361	793366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478709
15022	NC_022525	CGG	2	6	793403	793408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478709
15023	NC_022525	CAG	2	6	793479	793484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478709
15024	NC_022525	CAG	2	6	793506	793511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478709
15025	NC_022525	GCCA	2	8	793599	793606	25 %	0 %	25 %	50 %	549478709
15026	NC_022525	AACGG	2	10	793615	793624	40 %	0 %	40 %	20 %	549478709
15027	NC_022525	A	6	6	793684	793689	100 %	0 %	0 %	0 %	549478709
15028	NC_022525	CGT	2	6	794189	794194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478710
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15030	NC_022525	ATGG	2	8	794311	794318	25 %	25 %	50 %	0 %	549478710
15031	NC_022525	TTA	2	6	794347	794352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478710
15032	NC_022525	CCCA	2	8	794467	794474	25 %	0 %	0 %	75 %	549478711
15033	NC_022525	GCC	3	9	794524	794532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478711
15034	NC_022525	CG	3	6	794547	794552	0 %	0 %	50 %	50 %	549478711
15035	NC_022525	GGC	2	6	794616	794621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478711
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15038	NC_022525	GGC	2	6	794652	794657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478711
15039	NC_022525	GCT	2	6	794679	794684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478711
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15041	NC_022525	A	6	6	794816	794821	100 %	0 %	0 %	0 %	549478711
15042	NC_022525	TGA	2	6	794882	794887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478711
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15045	NC_022525	GCG	2	6	794996	795001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478711
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15049	NC_022525	GGC	2	6	795199	795204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478711
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15053	NC_022525	CGCGT	2	10	795376	795385	0 %	20 %	40 %	40 %	549478711
15054	NC_022525	GCG	2	6	795451	795456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478711
15055	NC_022525	CTG	2	6	795532	795537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478711
15056	NC_022525	GCC	2	6	795595	795600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478711
15057	NC_022525	GGC	2	6	795607	795612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478711
15058	NC_022525	GA	3	6	795683	795688	50 %	0 %	50 %	0 %	549478711
15059	NC_022525	GGC	2	6	795864	795869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478711
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15063	NC_022525	CGC	2	6	796067	796072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478712
15064	NC_022525	CAG	2	6	796143	796148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478712
15065	NC_022525	GCG	2	6	796294	796299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478712
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15068	NC_022525	CCAG	2	8	796412	796419	25 %	0 %	25 %	50 %	549478712
15069	NC_022525	GAC	2	6	796425	796430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478712
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15071	NC_022525	GCC	2	6	796542	796547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478712
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15090	NC_022525	GTA	2	6	797367	797372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478712
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15102	NC_022525	CG	4	8	798339	798346	0 %	0 %	50 %	50 %	549481801
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15121	NC_022525	ATT	2	6	799152	799157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478714
15122	NC_022525	CG	3	6	799158	799163	0 %	0 %	50 %	50 %	549478714
15123	NC_022525	GAT	2	6	799386	799391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478714
15124	NC_022525	TGGCGG	2	12	799480	799491	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549478714
15125	NC_022525	GTA	2	6	799525	799530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478714
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15128	NC_022525	CTG	2	6	799812	799817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478714
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15141	NC_022525	GGC	2	6	800353	800358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478715
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15153	NC_022525	CGG	2	6	801207	801212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478716
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15234	NC_022525	TGT	2	6	805746	805751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478720
15235	NC_022525	GC	3	6	805776	805781	0 %	0 %	50 %	50 %	549478720
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15238	NC_022525	GACCG	2	10	805986	805995	20 %	0 %	40 %	40 %	549478720
15239	NC_022525	TGA	2	6	806043	806048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478720
15240	NC_022525	TATC	2	8	806055	806062	25 %	50 %	0 %	25 %	549478720
15241	NC_022525	GGC	2	6	806095	806100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478720
15242	NC_022525	GGC	2	6	806106	806111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478720
15243	NC_022525	CGG	3	9	806120	806128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478720
15244	NC_022525	TGC	2	6	806150	806155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478720
15245	NC_022525	ACCAC	2	10	806183	806192	40 %	0 %	0 %	60 %	549478720
15246	NC_022525	GGT	2	6	806244	806249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478720
15247	NC_022525	GTG	2	6	806284	806289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478720
15248	NC_022525	CG	3	6	806302	806307	0 %	0 %	50 %	50 %	549478720
15249	NC_022525	CGG	2	6	806322	806327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478720
15250	NC_022525	CCA	3	9	806348	806356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478720
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15252	NC_022525	CTG	2	6	806506	806511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478720
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15254	NC_022525	GTG	2	6	806578	806583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478720
15255	NC_022525	CAT	2	6	806592	806597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478720
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15258	NC_022525	CTG	2	6	806929	806934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478720
15259	NC_022525	TGG	2	6	806939	806944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478720
15260	NC_022525	CG	3	6	806953	806958	0 %	0 %	50 %	50 %	549478720
15261	NC_022525	TGC	2	6	806999	807004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478720
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15269	NC_022525	ATG	2	6	807596	807601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478721
15270	NC_022525	CTG	2	6	807602	807607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478721
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15272	NC_022525	CCG	2	6	807652	807657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478721
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15276	NC_022525	CTTA	2	8	807855	807862	25 %	50 %	0 %	25 %	549478721
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15287	NC_022525	CTT	2	6	808826	808831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478722
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15322	NC_022525	TGC	2	6	811018	811023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478722
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15335	NC_022525	ATAA	2	8	811549	811556	75 %	25 %	0 %	0 %	549478723
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15345	NC_022525	GTGG	2	8	811964	811971	0 %	25 %	75 %	0 %	549478723
15346	NC_022525	GCA	2	6	812042	812047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478723
15347	NC_022525	GC	4	8	812061	812068	0 %	0 %	50 %	50 %	549478723
15348	NC_022525	GAC	2	6	812152	812157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478723
15349	NC_022525	GTG	2	6	812327	812332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478723
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15352	NC_022525	A	7	7	812435	812441	100 %	0 %	0 %	0 %	549478723
15353	NC_022525	AGA	2	6	812485	812490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478723
15354	NC_022525	GGT	2	6	812498	812503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478723
15355	NC_022525	CGG	2	6	812521	812526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478723
15356	NC_022525	ATC	2	6	812555	812560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478723
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15358	NC_022525	ATGC	2	8	812588	812595	25 %	25 %	25 %	25 %	549478723
15359	NC_022525	GAT	2	6	812644	812649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478723
15360	NC_022525	CT	3	6	812660	812665	0 %	50 %	0 %	50 %	549478723
15361	NC_022525	ATC	2	6	812670	812675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478723
15362	NC_022525	CTG	2	6	812747	812752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478723
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15364	NC_022525	TAC	2	6	812980	812985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478724
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15391	NC_022525	TGG	2	6	814175	814180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478725
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15402	NC_022525	GTT	2	6	814759	814764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478725
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15479	NC_022525	TCG	2	6	819640	819645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481804
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15481	NC_022525	TTA	2	6	819932	819937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481805
15482	NC_022525	CGG	2	6	819953	819958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481805
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15484	NC_022525	TGC	2	6	820012	820017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481805
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