MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022525	AAC	2	6	741511	741516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481794
14002	NC_022525	ACC	2	6	741590	741595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481795
14003	NC_022525	GAA	2	6	741692	741697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481795
14004	NC_022525	GCA	2	6	741700	741705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481795
14005	NC_022525	GCC	2	6	741710	741715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481795
14006	NC_022525	GGA	2	6	741724	741729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481795
14007	NC_022525	CGA	2	6	741751	741756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481795
14008	NC_022525	TGG	2	6	741768	741773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481795
14009	NC_022525	GATA	2	8	741868	741875	50 %	25 %	25 %	0 %	549481795
14010	NC_022525	TTG	2	6	741941	741946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481795
14011	NC_022525	GAT	2	6	741983	741988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481795
14012	NC_022525	TTG	2	6	742074	742079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481795
14013	NC_022525	T	6	6	742103	742108	0 %	100 %	0 %	0 %	549481795
14014	NC_022525	GAT	2	6	742187	742192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481795
14015	NC_022525	TCG	2	6	742267	742272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481795
14016	NC_022525	GAC	2	6	742406	742411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481795
14017	NC_022525	GCTGG	2	10	742417	742426	0 %	20 %	60 %	20 %	549481795
14018	NC_022525	GCC	2	6	742428	742433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481795
14019	NC_022525	TTC	2	6	742448	742453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481795
14020	NC_022525	GC	3	6	742478	742483	0 %	0 %	50 %	50 %	549481795
14021	NC_022525	GC	4	8	742518	742525	0 %	0 %	50 %	50 %	549481795
14022	NC_022525	TTG	2	6	742587	742592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481795
14023	NC_022525	CGC	2	6	742665	742670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481795
14024	NC_022525	CGG	2	6	742689	742694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481795
14025	NC_022525	GGT	2	6	742699	742704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481795
14026	NC_022525	T	6	6	742733	742738	0 %	100 %	0 %	0 %	549481795
14027	NC_022525	CTG	2	6	742742	742747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481795
14028	NC_022525	GGA	2	6	742756	742761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481795
14029	NC_022525	GGC	2	6	742873	742878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481795
14030	NC_022525	A	6	6	742883	742888	100 %	0 %	0 %	0 %	549481795
14031	NC_022525	TCT	2	6	742892	742897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481795
14032	NC_022525	TGA	2	6	742941	742946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481795
14033	NC_022525	TTC	2	6	743000	743005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481795
14034	NC_022525	T	6	6	743008	743013	0 %	100 %	0 %	0 %	549481795
14035	NC_022525	CAT	2	6	743092	743097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478673
14036	NC_022525	CAG	2	6	743120	743125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14037	NC_022525	CGC	2	6	743126	743131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478673
14038	NC_022525	TAA	2	6	743143	743148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478673
14039	NC_022525	CG	3	6	743180	743185	0 %	0 %	50 %	50 %	549478673
14040	NC_022525	CTC	2	6	743195	743200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478673
14041	NC_022525	TGC	2	6	743286	743291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14042	NC_022525	GTC	2	6	743292	743297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14043	NC_022525	TGA	2	6	743317	743322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478673
14044	NC_022525	CAG	2	6	743348	743353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14045	NC_022525	CAG	2	6	743366	743371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14046	NC_022525	AATC	2	8	743446	743453	50 %	25 %	0 %	25 %	549478673
14047	NC_022525	ATT	2	6	743459	743464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478673
14048	NC_022525	TGG	2	6	743527	743532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478673
14049	NC_022525	GGT	2	6	743561	743566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478673
14050	NC_022525	ATG	2	6	743577	743582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478673
14051	NC_022525	GGC	2	6	743690	743695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478673
14052	NC_022525	CGC	2	6	743803	743808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478673
14053	NC_022525	TCA	3	9	743919	743927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478673
14054	NC_022525	TCA	2	6	744081	744086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478673
14055	NC_022525	CGC	2	6	744109	744114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478673
14056	NC_022525	GCGTA	2	10	744157	744166	20 %	20 %	40 %	20 %	549478673
14057	NC_022525	C	6	6	744195	744200	0 %	0 %	0 %	100 %	549478673
14058	NC_022525	TGC	2	6	744228	744233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14059	NC_022525	GCC	3	9	744255	744263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478673
14060	NC_022525	GCT	2	6	744331	744336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14061	NC_022525	ACG	2	6	744366	744371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14062	NC_022525	GCT	2	6	744382	744387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478673
14063	NC_022525	TCT	2	6	744405	744410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478673
14064	NC_022525	AGCG	2	8	744414	744421	25 %	0 %	50 %	25 %	549478673
14065	NC_022525	CCA	2	6	744559	744564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478673
14066	NC_022525	ATGG	2	8	744594	744601	25 %	25 %	50 %	0 %	549478673
14067	NC_022525	TTA	2	6	744621	744626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478673
14068	NC_022525	TGG	2	6	744673	744678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478673
14069	NC_022525	TCG	2	6	744843	744848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478674
14070	NC_022525	TCA	2	6	744849	744854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478674
14071	NC_022525	A	6	6	744873	744878	100 %	0 %	0 %	0 %	549478674
14072	NC_022525	GCGT	2	8	744892	744899	0 %	25 %	50 %	25 %	549478674
14073	NC_022525	AAACG	2	10	744912	744921	60 %	0 %	20 %	20 %	549478674
14074	NC_022525	ATCA	2	8	744974	744981	50 %	25 %	0 %	25 %	549478674
14075	NC_022525	GC	3	6	745006	745011	0 %	0 %	50 %	50 %	549478674
14076	NC_022525	CGG	2	6	745021	745026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478674
14077	NC_022525	GGCC	2	8	745069	745076	0 %	0 %	50 %	50 %	549478674
14078	NC_022525	AAT	2	6	745097	745102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478674
14079	NC_022525	CGC	2	6	745133	745138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478674
14080	NC_022525	AGTAA	2	10	745193	745202	60 %	20 %	20 %	0 %	549478674
14081	NC_022525	TCC	2	6	745203	745208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478674
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14083	NC_022525	CTT	2	6	745270	745275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478674
14084	NC_022525	GGCT	2	8	745341	745348	0 %	25 %	50 %	25 %	549478674
14085	NC_022525	GGCC	2	8	745368	745375	0 %	0 %	50 %	50 %	549478674
14086	NC_022525	GCG	3	9	745383	745391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478674
14087	NC_022525	TCAT	2	8	745434	745441	25 %	50 %	0 %	25 %	549478674
14088	NC_022525	CT	3	6	745461	745466	0 %	50 %	0 %	50 %	549478674
14089	NC_022525	ATA	2	6	745478	745483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478674
14090	NC_022525	CTGGC	2	10	745517	745526	0 %	20 %	40 %	40 %	549478674
14091	NC_022525	A	6	6	745530	745535	100 %	0 %	0 %	0 %	549478674
14092	NC_022525	GTT	2	6	745603	745608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478674
14093	NC_022525	A	6	6	745629	745634	100 %	0 %	0 %	0 %	549478674
14094	NC_022525	TTC	2	6	745667	745672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478674
14095	NC_022525	GCG	2	6	745708	745713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478674
14096	NC_022525	GCG	2	6	745785	745790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478674
14097	NC_022525	TCA	3	9	745794	745802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478674
14098	NC_022525	A	6	6	745857	745862	100 %	0 %	0 %	0 %	549478674
14099	NC_022525	GCG	2	6	745870	745875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478674
14100	NC_022525	GTA	2	6	746070	746075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478675
14101	NC_022525	CCA	2	6	746123	746128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478675
14102	NC_022525	ATA	2	6	746163	746168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478675
14103	NC_022525	CCA	2	6	746171	746176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478675
14104	NC_022525	CCAAC	2	10	746215	746224	40 %	0 %	0 %	60 %	549478675
14105	NC_022525	GGT	2	6	746232	746237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478675
14106	NC_022525	CAG	2	6	746253	746258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478675
14107	NC_022525	GCG	2	6	746285	746290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478675
14108	NC_022525	AGA	2	6	746330	746335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478675
14109	NC_022525	AGT	2	6	746341	746346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478675
14110	NC_022525	TCG	2	6	746357	746362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478675
14111	NC_022525	CGG	2	6	746399	746404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478675
14112	NC_022525	CAC	2	6	746445	746450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478675
14113	NC_022525	GCA	2	6	746512	746517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478675
14114	NC_022525	CGC	2	6	746543	746548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478675
14115	NC_022525	CAG	3	9	746598	746606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478675
14116	NC_022525	CGC	2	6	746801	746806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478675
14117	NC_022525	AGC	2	6	746833	746838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478675
14118	NC_022525	GCA	2	6	746849	746854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478675
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14120	NC_022525	CGG	2	6	746888	746893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478675
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14225	NC_022525	GA	3	6	752129	752134	50 %	0 %	50 %	0 %	549481797
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14240	NC_022525	ATC	2	6	752881	752886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478679
14241	NC_022525	ATG	2	6	752902	752907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478679
14242	NC_022525	CG	3	6	752954	752959	0 %	0 %	50 %	50 %	549478679
14243	NC_022525	GTTC	2	8	752975	752982	0 %	50 %	25 %	25 %	549478679
14244	NC_022525	AGA	2	6	753007	753012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478679
14245	NC_022525	GCTG	2	8	753044	753051	0 %	25 %	50 %	25 %	549478679
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14252	NC_022525	TCT	2	6	753356	753361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478680
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14257	NC_022525	CCAG	2	8	753666	753673	25 %	0 %	25 %	50 %	549478680
14258	NC_022525	GCC	2	6	753787	753792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478681
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14313	NC_022525	CAG	2	6	756345	756350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478682
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14328	NC_022525	GAT	2	6	757223	757228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478683
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14478	NC_022525	CGG	3	9	766353	766361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478689
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14482	NC_022525	GTT	2	6	766580	766585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478689
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