MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022525	TTTG	2	8	691109	691116	0 %	75 %	25 %	0 %	549481785
13002	NC_022525	GAA	2	6	691151	691156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481785
13003	NC_022525	CAG	2	6	691225	691230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481785
13004	NC_022525	GAT	2	6	691261	691266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481785
13005	NC_022525	ACA	2	6	691302	691307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481785
13006	NC_022525	TGT	2	6	691345	691350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481785
13007	NC_022525	TAT	2	6	691363	691368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481785
13008	NC_022525	CTG	2	6	691418	691423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481785
13009	NC_022525	AGC	2	6	691435	691440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481785
13010	NC_022525	AAG	2	6	691488	691493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481785
13011	NC_022525	GAA	3	9	691774	691782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478632
13012	NC_022525	CGG	2	6	691879	691884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13013	NC_022525	CTG	2	6	691896	691901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478632
13014	NC_022525	AGA	2	6	691940	691945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478632
13015	NC_022525	CAG	2	6	691998	692003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478632
13016	NC_022525	GCT	2	6	692060	692065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478632
13017	NC_022525	CGG	2	6	692072	692077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13018	NC_022525	AAG	2	6	692089	692094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478632
13019	NC_022525	GCT	2	6	692102	692107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478632
13020	NC_022525	TTA	2	6	692150	692155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478632
13021	NC_022525	GGC	2	6	692247	692252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13022	NC_022525	AACGT	2	10	692275	692284	40 %	20 %	20 %	20 %	549478632
13023	NC_022525	CGG	2	6	692296	692301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13024	NC_022525	CG	3	6	692385	692390	0 %	0 %	50 %	50 %	549478632
13025	NC_022525	CCGGC	2	10	692440	692449	0 %	0 %	40 %	60 %	549478632
13026	NC_022525	GCG	2	6	692454	692459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13027	NC_022525	GC	3	6	692475	692480	0 %	0 %	50 %	50 %	549478632
13028	NC_022525	CGG	2	6	692516	692521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13029	NC_022525	GGCG	2	8	692588	692595	0 %	0 %	75 %	25 %	549478632
13030	NC_022525	ACG	2	6	692620	692625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478632
13031	NC_022525	GGC	2	6	692679	692684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13032	NC_022525	GC	3	6	692724	692729	0 %	0 %	50 %	50 %	549478632
13033	NC_022525	ATC	3	9	692733	692741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478632
13034	NC_022525	CGG	3	9	692864	692872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13035	NC_022525	ACGTT	2	10	692920	692929	20 %	40 %	20 %	20 %	549478632
13036	NC_022525	GTG	2	6	693051	693056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478632
13037	NC_022525	GCG	2	6	693082	693087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478632
13038	NC_022525	CTGG	2	8	693149	693156	0 %	25 %	50 %	25 %	549478632
13039	NC_022525	GC	3	6	693160	693165	0 %	0 %	50 %	50 %	549478632
13040	NC_022525	ATT	2	6	693192	693197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478632
13041	NC_022525	CGC	2	6	693233	693238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478632
13042	NC_022525	CAC	2	6	693248	693253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478632
13043	NC_022525	ATC	2	6	693273	693278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478632
13044	NC_022525	A	6	6	693714	693719	100 %	0 %	0 %	0 %	549478633
13045	NC_022525	T	7	7	693739	693745	0 %	100 %	0 %	0 %	549478633
13046	NC_022525	CTG	2	6	693798	693803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478633
13047	NC_022525	ACCG	2	8	693815	693822	25 %	0 %	25 %	50 %	549478633
13048	NC_022525	TCG	2	6	693861	693866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478633
13049	NC_022525	GCT	2	6	693877	693882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478633
13050	NC_022525	GGA	2	6	693910	693915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478633
13051	NC_022525	CTCA	2	8	694088	694095	25 %	25 %	0 %	50 %	549478633
13052	NC_022525	AT	3	6	694096	694101	50 %	50 %	0 %	0 %	549478633
13053	NC_022525	TA	3	6	694131	694136	50 %	50 %	0 %	0 %	549478633
13054	NC_022525	A	6	6	694140	694145	100 %	0 %	0 %	0 %	549478633
13055	NC_022525	TA	3	6	694173	694178	50 %	50 %	0 %	0 %	549478633
13056	NC_022525	TTATT	2	10	694193	694202	20 %	80 %	0 %	0 %	549478633
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13058	NC_022525	T	6	6	694268	694273	0 %	100 %	0 %	0 %	549478634
13059	NC_022525	GGA	2	6	694314	694319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478634
13060	NC_022525	GC	3	6	694336	694341	0 %	0 %	50 %	50 %	549478634
13061	NC_022525	GCC	2	6	694349	694354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478634
13062	NC_022525	GC	3	6	694471	694476	0 %	0 %	50 %	50 %	549478634
13063	NC_022525	GCC	2	6	694635	694640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478634
13064	NC_022525	A	6	6	694659	694664	100 %	0 %	0 %	0 %	549478634
13065	NC_022525	GAT	2	6	694739	694744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478634
13066	NC_022525	ACC	2	6	694761	694766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478634
13067	NC_022525	CAT	2	6	694871	694876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478634
13068	NC_022525	GC	3	6	694935	694940	0 %	0 %	50 %	50 %	549478634
13069	NC_022525	GCT	2	6	694973	694978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478634
13070	NC_022525	GCC	2	6	694989	694994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478634
13071	NC_022525	GC	3	6	695035	695040	0 %	0 %	50 %	50 %	549478634
13072	NC_022525	GC	3	6	695055	695060	0 %	0 %	50 %	50 %	549478634
13073	NC_022525	TGG	2	6	695065	695070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478634
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13080	NC_022525	TGC	2	6	695398	695403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478634
13081	NC_022525	GCC	2	6	695408	695413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478634
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13087	NC_022525	A	6	6	695622	695627	100 %	0 %	0 %	0 %	549478634
13088	NC_022525	TGG	2	6	695647	695652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478634
13089	NC_022525	TTC	2	6	695667	695672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478634
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13091	NC_022525	ACC	2	6	695712	695717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478634
13092	NC_022525	CTT	2	6	695743	695748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478634
13093	NC_022525	ACT	2	6	695755	695760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478634
13094	NC_022525	TAA	2	6	695846	695851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478634
13095	NC_022525	GCTG	2	8	695899	695906	0 %	25 %	50 %	25 %	549478634
13096	NC_022525	ACG	2	6	695920	695925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478634
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13099	NC_022525	GCC	2	6	696003	696008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478634
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13101	NC_022525	CTGGA	2	10	696183	696192	20 %	20 %	40 %	20 %	549478634
13102	NC_022525	CGTT	2	8	696214	696221	0 %	50 %	25 %	25 %	549478634
13103	NC_022525	ATCC	2	8	696225	696232	25 %	25 %	0 %	50 %	549478634
13104	NC_022525	TTC	2	6	696233	696238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478634
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13106	NC_022525	CAC	2	6	696320	696325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478634
13107	NC_022525	CGT	2	6	696395	696400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478634
13108	NC_022525	CTG	2	6	696412	696417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478634
13109	NC_022525	TGA	2	6	696427	696432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478634
13110	NC_022525	GC	3	6	696439	696444	0 %	0 %	50 %	50 %	549478634
13111	NC_022525	CAGT	2	8	696461	696468	25 %	25 %	25 %	25 %	549478634
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13119	NC_022525	T	6	6	697093	697098	0 %	100 %	0 %	0 %	549478636
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13121	NC_022525	GTG	2	6	697157	697162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478636
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13357	NC_022525	A	6	6	708894	708899	100 %	0 %	0 %	0 %	549478647
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13480	NC_022525	TCG	2	6	714877	714882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478652
13481	NC_022525	GCA	2	6	714935	714940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478652
13482	NC_022525	ACG	2	6	714941	714946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478652
13483	NC_022525	ATT	2	6	714962	714967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478652
13484	NC_022525	ATG	2	6	714968	714973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478652
13485	NC_022525	CTG	2	6	715124	715129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478653
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