MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022525	GAT	2	6	638134	638139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481769
12002	NC_022525	ATCG	2	8	638939	638946	25 %	25 %	25 %	25 %	549478596
12003	NC_022525	TG	3	6	638988	638993	0 %	50 %	50 %	0 %	549478596
12004	NC_022525	GC	3	6	639072	639077	0 %	0 %	50 %	50 %	549478596
12005	NC_022525	CAC	3	9	639095	639103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478596
12006	NC_022525	ATG	2	6	639114	639119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478596
12007	NC_022525	GTT	2	6	639150	639155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478596
12008	NC_022525	GCC	2	6	639182	639187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478596
12009	NC_022525	GAA	2	6	639305	639310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478597
12010	NC_022525	TCA	2	6	639384	639389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478597
12011	NC_022525	ACG	2	6	639390	639395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478597
12012	NC_022525	AAT	2	6	639418	639423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478597
12013	NC_022525	ATTAA	2	10	639770	639779	60 %	40 %	0 %	0 %	549478597
12014	NC_022525	GTTGG	2	10	639816	639825	0 %	40 %	60 %	0 %	549478597
12015	NC_022525	TGT	2	6	639838	639843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478597
12016	NC_022525	GAT	2	6	640009	640014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478597
12017	NC_022525	TGG	2	6	640084	640089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478597
12018	NC_022525	GAA	2	6	640131	640136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478597
12019	NC_022525	AT	3	6	640165	640170	50 %	50 %	0 %	0 %	549478597
12020	NC_022525	GAA	2	6	640180	640185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478597
12021	NC_022525	TAAA	2	8	640192	640199	75 %	25 %	0 %	0 %	549478597
12022	NC_022525	TA	3	6	640424	640429	50 %	50 %	0 %	0 %	549481770
12023	NC_022525	ATGT	2	8	640434	640441	25 %	50 %	25 %	0 %	549481770
12024	NC_022525	TAT	2	6	640469	640474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481770
12025	NC_022525	ACA	2	6	640653	640658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481770
12026	NC_022525	CTG	2	6	640687	640692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481770
12027	NC_022525	ACT	2	6	640720	640725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481770
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12029	NC_022525	TGT	2	6	640754	640759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481770
12030	NC_022525	TTG	2	6	640813	640818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481770
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12036	NC_022525	GAT	2	6	641006	641011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481770
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12039	NC_022525	CGT	2	6	641083	641088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481770
12040	NC_022525	TTG	2	6	641089	641094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481770
12041	NC_022525	TTA	2	6	641194	641199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481770
12042	NC_022525	ATA	2	6	641356	641361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481770
12043	NC_022525	TGA	2	6	641447	641452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481770
12044	NC_022525	GGTTA	2	10	641462	641471	20 %	40 %	40 %	0 %	549481770
12045	NC_022525	AT	3	6	641513	641518	50 %	50 %	0 %	0 %	549481770
12046	NC_022525	AT	3	6	641600	641605	50 %	50 %	0 %	0 %	549481770
12047	NC_022525	ATG	3	9	641614	641622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481770
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12052	NC_022525	ATAA	2	8	641797	641804	75 %	25 %	0 %	0 %	549481771
12053	NC_022525	GTCA	2	8	642275	642282	25 %	25 %	25 %	25 %	549481772
12054	NC_022525	CGT	2	6	642495	642500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481773
12055	NC_022525	CG	3	6	642528	642533	0 %	0 %	50 %	50 %	549481773
12056	NC_022525	GTTCA	2	10	642646	642655	20 %	40 %	20 %	20 %	549481774
12057	NC_022525	TCG	2	6	642659	642664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481774
12058	NC_022525	GGTC	2	8	642746	642753	0 %	25 %	50 %	25 %	549481774
12059	NC_022525	CAG	2	6	642848	642853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481774
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12061	NC_022525	TAT	2	6	643074	643079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481775
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12064	NC_022525	T	7	7	643298	643304	0 %	100 %	0 %	0 %	549481775
12065	NC_022525	ATTT	2	8	643305	643312	25 %	75 %	0 %	0 %	549481775
12066	NC_022525	GCTTT	2	10	643346	643355	0 %	60 %	20 %	20 %	549481775
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12069	NC_022525	T	6	6	643432	643437	0 %	100 %	0 %	0 %	549481775
12070	NC_022525	TGG	2	6	643463	643468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481775
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12072	NC_022525	ATCA	2	8	643623	643630	50 %	25 %	0 %	25 %	549481775
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12075	NC_022525	TA	3	6	643683	643688	50 %	50 %	0 %	0 %	549481775
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12087	NC_022525	ATA	2	6	644356	644361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481775
12088	NC_022525	GTTG	2	8	644363	644370	0 %	50 %	50 %	0 %	549481775
12089	NC_022525	A	6	6	644377	644382	100 %	0 %	0 %	0 %	549481775
12090	NC_022525	TGC	2	6	644436	644441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481775
12091	NC_022525	A	7	7	644454	644460	100 %	0 %	0 %	0 %	549481775
12092	NC_022525	ATAAAT	2	12	644466	644477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481775
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12094	NC_022525	T	8	8	644536	644543	0 %	100 %	0 %	0 %	549481775
12095	NC_022525	CAT	2	6	644550	644555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481775
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12102	NC_022525	TTAAT	2	10	644971	644980	40 %	60 %	0 %	0 %	549478598
12103	NC_022525	ATT	2	6	645327	645332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478598
12104	NC_022525	CGT	2	6	645355	645360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478598
12105	NC_022525	TGA	2	6	645361	645366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478598
12106	NC_022525	CTT	2	6	645439	645444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478598
12107	NC_022525	GGC	2	6	645563	645568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478599
12108	NC_022525	CAA	2	6	645594	645599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478599
12109	NC_022525	CAT	2	6	645631	645636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478599
12110	NC_022525	GTG	3	9	645647	645655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478599
12111	NC_022525	GC	3	6	645673	645678	0 %	0 %	50 %	50 %	549478599
12112	NC_022525	AC	3	6	645756	645761	50 %	0 %	0 %	50 %	549478599
12113	NC_022525	CGAT	2	8	645804	645811	25 %	25 %	25 %	25 %	549478599
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12116	NC_022525	GATG	2	8	646339	646346	25 %	25 %	50 %	0 %	549481776
12117	NC_022525	GTC	2	6	646364	646369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481776
12118	NC_022525	TCA	2	6	646465	646470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481776
12119	NC_022525	GC	3	6	646747	646752	0 %	0 %	50 %	50 %	549481777
12120	NC_022525	GGGA	2	8	646847	646854	25 %	0 %	75 %	0 %	549481777
12121	NC_022525	CAA	2	6	646922	646927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481777
12122	NC_022525	GTC	2	6	646941	646946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481777
12123	NC_022525	CTT	2	6	646949	646954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481777
12124	NC_022525	GGC	2	6	646981	646986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481777
12125	NC_022525	AG	3	6	647004	647009	50 %	0 %	50 %	0 %	549481777
12126	NC_022525	GCA	2	6	647030	647035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481777
12127	NC_022525	TGA	2	6	647227	647232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481778
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12130	NC_022525	GC	3	6	647386	647391	0 %	0 %	50 %	50 %	549478600
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12132	NC_022525	TCGC	2	8	647460	647467	0 %	25 %	25 %	50 %	549478600
12133	NC_022525	ATCACC	2	12	647487	647498	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549478600
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12136	NC_022525	GTT	2	6	647547	647552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478600
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12139	NC_022525	CTG	2	6	647834	647839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478600
12140	NC_022525	GGC	2	6	647852	647857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478600
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12142	NC_022525	CGT	2	6	647939	647944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478600
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12145	NC_022525	CGC	2	6	648154	648159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478600
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12151	NC_022525	T	6	6	648672	648677	0 %	100 %	0 %	0 %	549478601
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12229	NC_022525	A	6	6	653051	653056	100 %	0 %	0 %	0 %	549478605
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12235	NC_022525	GTCGC	2	10	653239	653248	0 %	20 %	40 %	40 %	549478605
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12238	NC_022525	CG	3	6	653512	653517	0 %	0 %	50 %	50 %	549478605
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12359	NC_022525	AAACA	2	10	659969	659978	80 %	0 %	0 %	20 %	549478612
12360	NC_022525	GCA	3	9	660063	660071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478612
12361	NC_022525	TCA	2	6	660111	660116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478612
12362	NC_022525	CCG	2	6	660257	660262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478613
12363	NC_022525	AT	3	6	660281	660286	50 %	50 %	0 %	0 %	549478613
12364	NC_022525	T	6	6	660304	660309	0 %	100 %	0 %	0 %	549478613
12365	NC_022525	GC	3	6	660355	660360	0 %	0 %	50 %	50 %	549478613
12366	NC_022525	CAG	2	6	660379	660384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478613
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12370	NC_022525	CAG	2	6	660529	660534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478613
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12372	NC_022525	ATC	2	6	660674	660679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478613
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12376	NC_022525	GC	4	8	660778	660785	0 %	0 %	50 %	50 %	549478613
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12392	NC_022525	GAGC	2	8	661626	661633	25 %	0 %	50 %	25 %	549478614
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12395	NC_022525	TGC	2	6	661778	661783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478614
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12423	NC_022525	CTCCAG	2	12	663513	663524	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549478615
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12464	NC_022525	GCGT	2	8	665568	665575	0 %	25 %	50 %	25 %	549478616
12465	NC_022525	GCA	2	6	665629	665634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478616
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12473	NC_022525	CT	3	6	666046	666051	0 %	50 %	0 %	50 %	549478618
12474	NC_022525	AGCGGT	2	12	666126	666137	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549478618
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12479	NC_022525	GCG	2	6	666448	666453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478618
12480	NC_022525	GCA	2	6	666582	666587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478618
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12484	NC_022525	CGG	2	6	666683	666688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478618
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