MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022525	TCA	2	6	611439	611444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478569
11502	NC_022525	T	6	6	611667	611672	0 %	100 %	0 %	0 %	549478570
11503	NC_022525	GTT	2	6	611685	611690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478570
11504	NC_022525	TGGC	2	8	611764	611771	0 %	25 %	50 %	25 %	549478570
11505	NC_022525	CAG	2	6	611835	611840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478570
11506	NC_022525	GCTG	2	8	611879	611886	0 %	25 %	50 %	25 %	549478570
11507	NC_022525	ACCA	2	8	611899	611906	50 %	0 %	0 %	50 %	549478570
11508	NC_022525	GCG	2	6	611934	611939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478570
11509	NC_022525	TA	3	6	611942	611947	50 %	50 %	0 %	0 %	549478570
11510	NC_022525	GCTG	2	8	611954	611961	0 %	25 %	50 %	25 %	549478570
11511	NC_022525	TCA	2	6	611987	611992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478570
11512	NC_022525	TCG	2	6	612103	612108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478570
11513	NC_022525	CTG	2	6	612117	612122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478570
11514	NC_022525	GCC	2	6	612126	612131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478570
11515	NC_022525	CGA	2	6	612158	612163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478570
11516	NC_022525	AAG	2	6	612164	612169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478570
11517	NC_022525	AAT	2	6	612222	612227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478570
11518	NC_022525	ATC	2	6	612300	612305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478570
11519	NC_022525	GCA	2	6	612372	612377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478571
11520	NC_022525	CCG	2	6	612429	612434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478571
11521	NC_022525	CG	3	6	612486	612491	0 %	0 %	50 %	50 %	549478571
11522	NC_022525	GTT	2	6	612546	612551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478571
11523	NC_022525	CA	3	6	612558	612563	50 %	0 %	0 %	50 %	549478571
11524	NC_022525	TCCA	2	8	612614	612621	25 %	25 %	0 %	50 %	549478571
11525	NC_022525	ATCGAT	2	12	612625	612636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549478571
11526	NC_022525	GC	3	6	612662	612667	0 %	0 %	50 %	50 %	549478571
11527	NC_022525	ACA	2	6	612755	612760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478571
11528	NC_022525	GACT	2	8	612839	612846	25 %	25 %	25 %	25 %	549478571
11529	NC_022525	CGA	2	6	612878	612883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478571
11530	NC_022525	CGA	2	6	612951	612956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478571
11531	NC_022525	GAC	2	6	612964	612969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478571
11532	NC_022525	CAA	2	6	613023	613028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478571
11533	NC_022525	CG	3	6	613046	613051	0 %	0 %	50 %	50 %	549478571
11534	NC_022525	GCG	2	6	613056	613061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478571
11535	NC_022525	CGG	2	6	613062	613067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478571
11536	NC_022525	TGC	2	6	613170	613175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478571
11537	NC_022525	A	6	6	613179	613184	100 %	0 %	0 %	0 %	549478571
11538	NC_022525	CTT	2	6	613203	613208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478571
11539	NC_022525	TAC	2	6	613222	613227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478571
11540	NC_022525	GCG	2	6	613242	613247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478571
11541	NC_022525	GCCA	2	8	613277	613284	25 %	0 %	25 %	50 %	549478571
11542	NC_022525	GGC	2	6	613285	613290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478571
11543	NC_022525	GC	3	6	613293	613298	0 %	0 %	50 %	50 %	549478571
11544	NC_022525	GCC	2	6	613318	613323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478571
11545	NC_022525	GAC	2	6	613327	613332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478571
11546	NC_022525	TG	3	6	613376	613381	0 %	50 %	50 %	0 %	549478571
11547	NC_022525	GGC	2	6	613389	613394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478571
11548	NC_022525	TCA	2	6	613412	613417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478571
11549	NC_022525	CTG	3	9	613459	613467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478571
11550	NC_022525	AG	3	6	613534	613539	50 %	0 %	50 %	0 %	549478571
11551	NC_022525	TCT	2	6	613553	613558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478571
11552	NC_022525	AAT	2	6	613601	613606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478572
11553	NC_022525	T	6	6	613622	613627	0 %	100 %	0 %	0 %	549478572
11554	NC_022525	ATC	2	6	613678	613683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478572
11555	NC_022525	ATCCTG	2	12	613726	613737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549478572
11556	NC_022525	ATA	2	6	613744	613749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478572
11557	NC_022525	GGGC	2	8	613767	613774	0 %	0 %	75 %	25 %	549478572
11558	NC_022525	AAT	2	6	613820	613825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478572
11559	NC_022525	GAAGA	2	10	613832	613841	60 %	0 %	40 %	0 %	549478572
11560	NC_022525	GGC	2	6	613917	613922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478572
11561	NC_022525	CAG	2	6	613936	613941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478572
11562	NC_022525	ATC	4	12	613961	613972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478572
11563	NC_022525	GCG	2	6	613994	613999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478572
11564	NC_022525	TAA	2	6	614002	614007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478572
11565	NC_022525	GC	3	6	614037	614042	0 %	0 %	50 %	50 %	549478572
11566	NC_022525	GGT	2	6	614122	614127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478572
11567	NC_022525	ATG	2	6	614144	614149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478572
11568	NC_022525	CCGCC	2	10	614205	614214	0 %	0 %	20 %	80 %	549478572
11569	NC_022525	AGAC	2	8	614248	614255	50 %	0 %	25 %	25 %	549478572
11570	NC_022525	AGC	2	6	614272	614277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478572
11571	NC_022525	T	8	8	614345	614352	0 %	100 %	0 %	0 %	549478572
11572	NC_022525	GCA	2	6	614402	614407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478572
11573	NC_022525	GCC	2	6	614476	614481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478572
11574	NC_022525	TTCG	2	8	614490	614497	0 %	50 %	25 %	25 %	549478572
11575	NC_022525	ATA	2	6	614500	614505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478572
11576	NC_022525	CGA	2	6	614568	614573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478572
11577	NC_022525	GGC	2	6	614575	614580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478572
11578	NC_022525	A	6	6	614989	614994	100 %	0 %	0 %	0 %	549478573
11579	NC_022525	ATT	2	6	615025	615030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478573
11580	NC_022525	TGAG	2	8	615041	615048	25 %	25 %	50 %	0 %	549478573
11581	NC_022525	TGA	2	6	615060	615065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478573
11582	NC_022525	ATG	2	6	615076	615081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478573
11583	NC_022525	GCT	2	6	615102	615107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478573
11584	NC_022525	GAA	2	6	615226	615231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478573
11585	NC_022525	GCA	2	6	615237	615242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478573
11586	NC_022525	AGC	2	6	615256	615261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478573
11587	NC_022525	GCG	2	6	615358	615363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478573
11588	NC_022525	TCGT	2	8	615387	615394	0 %	50 %	25 %	25 %	549478573
11589	NC_022525	TGA	2	6	615401	615406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478573
11590	NC_022525	TCT	2	6	615407	615412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478573
11591	NC_022525	GAC	2	6	615430	615435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478573
11592	NC_022525	CTG	2	6	615472	615477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478573
11593	NC_022525	CGC	2	6	615518	615523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478573
11594	NC_022525	CGG	2	6	615675	615680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478573
11595	NC_022525	GC	3	6	615686	615691	0 %	0 %	50 %	50 %	549478573
11596	NC_022525	GCC	2	6	615892	615897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478573
11597	NC_022525	GGC	2	6	615955	615960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478573
11598	NC_022525	CGG	2	6	615981	615986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478573
11599	NC_022525	GGC	2	6	615993	615998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478573
11600	NC_022525	GCT	2	6	616011	616016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478573
11601	NC_022525	GCG	2	6	616036	616041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478573
11602	NC_022525	ATG	2	6	616063	616068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478573
11603	NC_022525	CCA	2	6	616083	616088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478573
11604	NC_022525	GAT	2	6	616137	616142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478573
11605	NC_022525	TTA	2	6	616204	616209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478573
11606	NC_022525	CGT	2	6	616215	616220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478573
11607	NC_022525	CCG	2	6	616238	616243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478573
11608	NC_022525	CGC	2	6	616248	616253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478573
11609	NC_022525	CGGAA	2	10	616332	616341	40 %	0 %	40 %	20 %	549478573
11610	NC_022525	CAA	2	6	616363	616368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478573
11611	NC_022525	CGC	2	6	616371	616376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478573
11612	NC_022525	CT	4	8	616454	616461	0 %	50 %	0 %	50 %	549478573
11613	NC_022525	CATC	2	8	616468	616475	25 %	25 %	0 %	50 %	549478573
11614	NC_022525	AGCGGT	2	12	616494	616505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549478573
11615	NC_022525	GTG	2	6	616561	616566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478573
11616	NC_022525	TAA	2	6	616596	616601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478573
11617	NC_022525	A	6	6	616600	616605	100 %	0 %	0 %	0 %	549478573
11618	NC_022525	TCG	2	6	616692	616697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478574
11619	NC_022525	CTGG	2	8	616710	616717	0 %	25 %	50 %	25 %	549478574
11620	NC_022525	CTT	2	6	616730	616735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478574
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11622	NC_022525	CTT	2	6	616768	616773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478574
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11739	NC_022525	AGC	2	6	623227	623232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478581
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11741	NC_022525	CG	4	8	623243	623250	0 %	0 %	50 %	50 %	549478581
11742	NC_022525	CGAGC	2	10	623315	623324	20 %	0 %	40 %	40 %	549478581
11743	NC_022525	CGG	3	9	623417	623425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478581
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11751	NC_022525	CGG	2	6	623740	623745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478581
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11753	NC_022525	ATGA	2	8	623781	623788	50 %	25 %	25 %	0 %	549478581
11754	NC_022525	CCG	2	6	623869	623874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478581
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11847	NC_022525	CG	3	6	629029	629034	0 %	0 %	50 %	50 %	549478589
11848	NC_022525	TTAT	2	8	629035	629042	25 %	75 %	0 %	0 %	549478589
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11850	NC_022525	AGAA	2	8	629137	629144	75 %	0 %	25 %	0 %	549478589
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11854	NC_022525	GTCG	2	8	629279	629286	0 %	25 %	50 %	25 %	549478589
11855	NC_022525	A	6	6	629306	629311	100 %	0 %	0 %	0 %	549478589
11856	NC_022525	AACC	2	8	629435	629442	50 %	0 %	0 %	50 %	549478589
11857	NC_022525	TTA	2	6	629450	629455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478589
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11981	NC_022525	GAAAGT	2	12	636431	636442	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549478595
11982	NC_022525	AGT	2	6	636528	636533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478595
11983	NC_022525	CAT	2	6	636612	636617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478595
11984	NC_022525	GCA	2	6	636636	636641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478595
11985	NC_022525	TTA	2	6	636683	636688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478595
11986	NC_022525	AAT	2	6	636691	636696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478595
11987	NC_022525	ATC	3	9	636754	636762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478595
11988	NC_022525	TATC	2	8	636789	636796	25 %	50 %	0 %	25 %	549478595
11989	NC_022525	TCT	2	6	636797	636802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478595
11990	NC_022525	GGC	2	6	636803	636808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478595
11991	NC_022525	CTG	2	6	636823	636828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478595
11992	NC_022525	ATG	2	6	636851	636856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478595
11993	NC_022525	ATG	2	6	637584	637589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481768
11994	NC_022525	CGT	2	6	637626	637631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481768
11995	NC_022525	CG	3	6	637659	637664	0 %	0 %	50 %	50 %	549481768
11996	NC_022525	TCT	2	6	637913	637918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481769
11997	NC_022525	GACA	2	8	637947	637954	50 %	0 %	25 %	25 %	549481769
11998	NC_022525	GAA	2	6	638008	638013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481769
11999	NC_022525	CCA	2	6	638027	638032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481769
12000	NC_022525	TG	3	6	638063	638068	0 %	50 %	50 %	0 %	549481769

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