MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022525	CTG	2	6	584503	584508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478548
11002	NC_022525	ATT	2	6	584554	584559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478548
11003	NC_022525	GCT	2	6	584573	584578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478548
11004	NC_022525	TCA	2	6	584580	584585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478548
11005	NC_022525	GC	3	6	584669	584674	0 %	0 %	50 %	50 %	549478549
11006	NC_022525	CCGT	2	8	584728	584735	0 %	25 %	25 %	50 %	549478549
11007	NC_022525	CGG	2	6	584762	584767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478549
11008	NC_022525	GTT	2	6	584775	584780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478549
11009	NC_022525	GGC	2	6	584796	584801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478549
11010	NC_022525	GTCG	2	8	584803	584810	0 %	25 %	50 %	25 %	549478549
11011	NC_022525	ACGCG	2	10	584825	584834	20 %	0 %	40 %	40 %	549478549
11012	NC_022525	CCAG	2	8	584835	584842	25 %	0 %	25 %	50 %	549478549
11013	NC_022525	CCA	2	6	584845	584850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478549
11014	NC_022525	GCC	2	6	584858	584863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478549
11015	NC_022525	GCC	2	6	584945	584950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478549
11016	NC_022525	CGC	2	6	584952	584957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478549
11017	NC_022525	CCG	2	6	584978	584983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478549
11018	NC_022525	CAA	2	6	584998	585003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478549
11019	NC_022525	GCC	2	6	585007	585012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478549
11020	NC_022525	AGA	2	6	585024	585029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478549
11021	NC_022525	ATC	2	6	585047	585052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478549
11022	NC_022525	T	6	6	585063	585068	0 %	100 %	0 %	0 %	549478550
11023	NC_022525	CTG	2	6	585127	585132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478550
11024	NC_022525	CAT	2	6	585144	585149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478550
11025	NC_022525	GCCGA	2	10	585169	585178	20 %	0 %	40 %	40 %	549478550
11026	NC_022525	AGT	2	6	585215	585220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478550
11027	NC_022525	CGG	2	6	585239	585244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478550
11028	NC_022525	CGG	2	6	585287	585292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478550
11029	NC_022525	CGGG	2	8	585479	585486	0 %	0 %	75 %	25 %	549478550
11030	NC_022525	TGG	2	6	585533	585538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478550
11031	NC_022525	GCA	2	6	585554	585559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478550
11032	NC_022525	TGGTCA	2	12	585632	585643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549478550
11033	NC_022525	GGC	2	6	585681	585686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478550
11034	NC_022525	GC	3	6	585685	585690	0 %	0 %	50 %	50 %	549478550
11035	NC_022525	CCT	2	6	585758	585763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478550
11036	NC_022525	CAT	2	6	585789	585794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478550
11037	NC_022525	ACA	2	6	585829	585834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478550
11038	NC_022525	CGA	2	6	585926	585931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478550
11039	NC_022525	CGA	2	6	585941	585946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478550
11040	NC_022525	CGA	2	6	586173	586178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481763
11041	NC_022525	GTT	2	6	586264	586269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481763
11042	NC_022525	TGG	2	6	586275	586280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481763
11043	NC_022525	TAA	2	6	586287	586292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481763
11044	NC_022525	TAC	2	6	586333	586338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481763
11045	NC_022525	CAG	2	6	586361	586366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481763
11046	NC_022525	CGG	2	6	586537	586542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481763
11047	NC_022525	CGA	2	6	586603	586608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481763
11048	NC_022525	ATT	2	6	586655	586660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481763
11049	NC_022525	GA	3	6	586764	586769	50 %	0 %	50 %	0 %	549481763
11050	NC_022525	AGG	2	6	586773	586778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481763
11051	NC_022525	ATA	2	6	586795	586800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481763
11052	NC_022525	TGC	2	6	586828	586833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478551
11053	NC_022525	TGG	3	9	586834	586842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478551
11054	NC_022525	TCA	2	6	586852	586857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478551
11055	NC_022525	ATT	2	6	586926	586931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478551
11056	NC_022525	GCC	2	6	586971	586976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478551
11057	NC_022525	GCT	2	6	586982	586987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478551
11058	NC_022525	CGC	2	6	587012	587017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478551
11059	NC_022525	AT	3	6	587042	587047	50 %	50 %	0 %	0 %	549478551
11060	NC_022525	TC	3	6	587060	587065	0 %	50 %	0 %	50 %	549478551
11061	NC_022525	CAAC	2	8	587210	587217	50 %	0 %	0 %	50 %	549478551
11062	NC_022525	AGC	3	9	587239	587247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478551
11063	NC_022525	AAGTT	2	10	587259	587268	40 %	40 %	20 %	0 %	549478551
11064	NC_022525	CCG	2	6	587293	587298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478551
11065	NC_022525	CGA	2	6	587335	587340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478551
11066	NC_022525	GAT	2	6	587381	587386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478551
11067	NC_022525	GATC	2	8	587408	587415	25 %	25 %	25 %	25 %	549478551
11068	NC_022525	TGT	2	6	587458	587463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478551
11069	NC_022525	CAGC	2	8	587467	587474	25 %	0 %	25 %	50 %	549478551
11070	NC_022525	CAT	2	6	587483	587488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478551
11071	NC_022525	TCA	2	6	587528	587533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478551
11072	NC_022525	GGC	2	6	587673	587678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478552
11073	NC_022525	CGG	3	9	587754	587762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478552
11074	NC_022525	CTT	2	6	587802	587807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478552
11075	NC_022525	TGCAAC	2	12	587825	587836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549478552
11076	NC_022525	GTTGC	2	10	587841	587850	0 %	40 %	40 %	20 %	549478552
11077	NC_022525	TGC	2	6	587882	587887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478552
11078	NC_022525	CCG	2	6	587913	587918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478552
11079	NC_022525	ATCCTG	2	12	587965	587976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549478552
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11081	NC_022525	CCT	2	6	588123	588128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478552
11082	NC_022525	TTG	2	6	588145	588150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478552
11083	NC_022525	CTT	2	6	588162	588167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478552
11084	NC_022525	CG	3	6	588168	588173	0 %	0 %	50 %	50 %	549478552
11085	NC_022525	CAG	2	6	588187	588192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478552
11086	NC_022525	GC	3	6	588275	588280	0 %	0 %	50 %	50 %	549478552
11087	NC_022525	GCG	2	6	588293	588298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478552
11088	NC_022525	ATC	2	6	588299	588304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478552
11089	NC_022525	CTG	2	6	588457	588462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478552
11090	NC_022525	CCGGC	2	10	588591	588600	0 %	0 %	40 %	60 %	549478553
11091	NC_022525	CTA	2	6	588695	588700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478553
11092	NC_022525	GCG	2	6	588727	588732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478553
11093	NC_022525	TG	3	6	588834	588839	0 %	50 %	50 %	0 %	549478553
11094	NC_022525	GGC	2	6	588891	588896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478553
11095	NC_022525	GCGCC	2	10	588901	588910	0 %	0 %	40 %	60 %	549478553
11096	NC_022525	TCA	2	6	588944	588949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478553
11097	NC_022525	GC	3	6	589007	589012	0 %	0 %	50 %	50 %	549478553
11098	NC_022525	A	6	6	589015	589020	100 %	0 %	0 %	0 %	549478553
11099	NC_022525	CGG	2	6	589142	589147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478553
11100	NC_022525	GATC	2	8	589175	589182	25 %	25 %	25 %	25 %	549478553
11101	NC_022525	CAT	2	6	589220	589225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478553
11102	NC_022525	GC	3	6	589277	589282	0 %	0 %	50 %	50 %	549478553
11103	NC_022525	TTA	2	6	589313	589318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478553
11104	NC_022525	GA	3	6	589493	589498	50 %	0 %	50 %	0 %	549478554
11105	NC_022525	A	6	6	589609	589614	100 %	0 %	0 %	0 %	549478554
11106	NC_022525	CGG	2	6	589734	589739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478554
11107	NC_022525	GCC	2	6	589813	589818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478554
11108	NC_022525	CCA	2	6	589824	589829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478554
11109	NC_022525	CTG	2	6	589882	589887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478554
11110	NC_022525	CGAC	2	8	589917	589924	25 %	0 %	25 %	50 %	549478554
11111	NC_022525	GTTTT	2	10	589925	589934	0 %	80 %	20 %	0 %	549478554
11112	NC_022525	GGC	2	6	589972	589977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478554
11113	NC_022525	TAA	2	6	590014	590019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478554
11114	NC_022525	GCG	3	9	590027	590035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478554
11115	NC_022525	GCT	2	6	590226	590231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478555
11116	NC_022525	TGG	2	6	590279	590284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478555
11117	NC_022525	GTTTT	2	10	590345	590354	0 %	80 %	20 %	0 %	549478555
11118	NC_022525	GCT	2	6	590460	590465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478555
11119	NC_022525	AAC	2	6	590468	590473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478555
11120	NC_022525	ACC	2	6	590495	590500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478555
11121	NC_022525	CGG	2	6	590517	590522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478555
11122	NC_022525	AGC	3	9	590525	590533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478555
11123	NC_022525	GC	4	8	590545	590552	0 %	0 %	50 %	50 %	549478555
11124	NC_022525	CAC	2	6	590664	590669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478555
11125	NC_022525	GGC	2	6	590700	590705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478555
11126	NC_022525	GC	3	6	590704	590709	0 %	0 %	50 %	50 %	549478555
11127	NC_022525	AGG	3	9	590747	590755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478555
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11130	NC_022525	CGC	2	6	591034	591039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478556
11131	NC_022525	CTG	2	6	591135	591140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478556
11132	NC_022525	GCT	2	6	591158	591163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478556
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11134	NC_022525	TGA	3	9	591277	591285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478556
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11137	NC_022525	GCTG	2	8	591388	591395	0 %	25 %	50 %	25 %	549478556
11138	NC_022525	GGA	3	9	591434	591442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478556
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11142	NC_022525	CTG	2	6	591513	591518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478556
11143	NC_022525	TGG	2	6	591574	591579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478556
11144	NC_022525	CGGGC	2	10	591601	591610	0 %	0 %	60 %	40 %	549478556
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11154	NC_022525	CGT	2	6	591920	591925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478556
11155	NC_022525	GCT	2	6	591932	591937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478556
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11158	NC_022525	TGG	2	6	592015	592020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478556
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11182	NC_022525	CGC	2	6	593597	593602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478557
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11224	NC_022525	ATGAA	2	10	596213	596222	60 %	20 %	20 %	0 %	549478559
11225	NC_022525	CA	3	6	596325	596330	50 %	0 %	0 %	50 %	549478559
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11229	NC_022525	CG	3	6	596515	596520	0 %	0 %	50 %	50 %	549478559
11230	NC_022525	TGG	2	6	596531	596536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478559
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11232	NC_022525	CGG	2	6	596564	596569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478559
11233	NC_022525	GCC	3	9	596572	596580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478559
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11239	NC_022525	TAT	2	6	597016	597021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478560
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11330	NC_022525	CAG	2	6	602149	602154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478565
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11339	NC_022525	TGG	2	6	602411	602416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478565
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11341	NC_022525	AAC	2	6	602506	602511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478565
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11345	NC_022525	GCG	2	6	602956	602961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478566
11346	NC_022525	ATA	2	6	603038	603043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478566
11347	NC_022525	GGC	2	6	603084	603089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478566
11348	NC_022525	GAA	3	9	603124	603132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478566
11349	NC_022525	AAAT	2	8	603188	603195	75 %	25 %	0 %	0 %	549478566
11350	NC_022525	TGG	2	6	603200	603205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478566
11351	NC_022525	GTTG	2	8	603249	603256	0 %	50 %	50 %	0 %	549478566
11352	NC_022525	AGA	2	6	603291	603296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478566
11353	NC_022525	TTA	2	6	603301	603306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478566
11354	NC_022525	ATTA	2	8	603375	603382	50 %	50 %	0 %	0 %	549478566
11355	NC_022525	ATA	2	6	603398	603403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478566
11356	NC_022525	ATG	2	6	603584	603589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478566
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11358	NC_022525	TCG	2	6	604029	604034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478567
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11480	NC_022525	ATG	2	6	610322	610327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478569
11481	NC_022525	AG	3	6	610357	610362	50 %	0 %	50 %	0 %	549478569
11482	NC_022525	GC	3	6	610424	610429	0 %	0 %	50 %	50 %	549478569
11483	NC_022525	TGTT	2	8	610432	610439	0 %	75 %	25 %	0 %	549478569
11484	NC_022525	TGG	2	6	610479	610484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478569
11485	NC_022525	CGG	2	6	610492	610497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478569
11486	NC_022525	ATT	2	6	610583	610588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478569
11487	NC_022525	GGC	3	9	610594	610602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478569
11488	NC_022525	TGG	2	6	610617	610622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478569
11489	NC_022525	GCT	2	6	610642	610647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478569
11490	NC_022525	ATT	2	6	610709	610714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478569
11491	NC_022525	CGG	2	6	610723	610728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478569
11492	NC_022525	TGC	2	6	610800	610805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478569
11493	NC_022525	TGG	2	6	610917	610922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478569
11494	NC_022525	CGCGG	2	10	610928	610937	0 %	0 %	60 %	40 %	549478569
11495	NC_022525	CGG	3	9	610935	610943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478569
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