MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022525	GCAA	2	8	533184	533191	50 %	0 %	25 %	25 %	549478509
10002	NC_022525	TGG	2	6	533326	533331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478509
10003	NC_022525	ATA	2	6	533476	533481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478509
10004	NC_022525	AAC	2	6	533488	533493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478509
10005	NC_022525	CTG	2	6	533517	533522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478509
10006	NC_022525	GCG	2	6	533562	533567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478509
10007	NC_022525	GGC	2	6	533627	533632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478509
10008	NC_022525	CGA	2	6	533650	533655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478509
10009	NC_022525	TGGCG	2	10	533672	533681	0 %	20 %	60 %	20 %	549478509
10010	NC_022525	CGT	2	6	533699	533704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478509
10011	NC_022525	CTG	2	6	533706	533711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478509
10012	NC_022525	A	6	6	533754	533759	100 %	0 %	0 %	0 %	549478509
10013	NC_022525	TGA	2	6	533812	533817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478509
10014	NC_022525	AAAATC	2	12	533838	533849	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	549478509
10015	NC_022525	CAG	2	6	533865	533870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478509
10016	NC_022525	TTA	2	6	534048	534053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478510
10017	NC_022525	CTTT	2	8	534056	534063	0 %	75 %	0 %	25 %	549478510
10018	NC_022525	GC	3	6	534087	534092	0 %	0 %	50 %	50 %	549478510
10019	NC_022525	GGC	2	6	534094	534099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478510
10020	NC_022525	A	6	6	534112	534117	100 %	0 %	0 %	0 %	549478510
10021	NC_022525	CTT	2	6	534147	534152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478510
10022	NC_022525	TCC	2	6	534155	534160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478510
10023	NC_022525	GAT	2	6	534191	534196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478510
10024	NC_022525	GGA	2	6	534232	534237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478510
10025	NC_022525	TGA	2	6	534249	534254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478510
10026	NC_022525	A	6	6	534269	534274	100 %	0 %	0 %	0 %	549478510
10027	NC_022525	GAG	2	6	534299	534304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478510
10028	NC_022525	GAT	2	6	534326	534331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478510
10029	NC_022525	GC	3	6	534357	534362	0 %	0 %	50 %	50 %	549478510
10030	NC_022525	TGG	2	6	534363	534368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478510
10031	NC_022525	ATC	2	6	534529	534534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478511
10032	NC_022525	TAA	2	6	534554	534559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478511
10033	NC_022525	TGG	2	6	534655	534660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478511
10034	NC_022525	CGG	2	6	534688	534693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478511
10035	NC_022525	CCAG	2	8	534718	534725	25 %	0 %	25 %	50 %	549478511
10036	NC_022525	ACA	2	6	534728	534733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478511
10037	NC_022525	GCG	2	6	534748	534753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478511
10038	NC_022525	GGT	2	6	534791	534796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478511
10039	NC_022525	TCA	2	6	534808	534813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478511
10040	NC_022525	GTTT	2	8	534815	534822	0 %	75 %	25 %	0 %	549478511
10041	NC_022525	T	7	7	535018	535024	0 %	100 %	0 %	0 %	549478512
10042	NC_022525	GCC	2	6	535033	535038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478512
10043	NC_022525	CCG	2	6	535043	535048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478512
10044	NC_022525	GC	3	6	535081	535086	0 %	0 %	50 %	50 %	549478512
10045	NC_022525	AAT	2	6	535178	535183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478512
10046	NC_022525	CGC	2	6	535377	535382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478512
10047	NC_022525	GCT	2	6	535482	535487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478512
10048	NC_022525	GTTC	2	8	535496	535503	0 %	50 %	25 %	25 %	549478512
10049	NC_022525	GC	3	6	535529	535534	0 %	0 %	50 %	50 %	549478512
10050	NC_022525	GC	4	8	535558	535565	0 %	0 %	50 %	50 %	549478512
10051	NC_022525	TCA	2	6	535621	535626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478512
10052	NC_022525	GTG	2	6	535654	535659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478512
10053	NC_022525	ACA	2	6	535681	535686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478512
10054	NC_022525	CTT	2	6	535760	535765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478513
10055	NC_022525	GGC	2	6	535775	535780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478513
10056	NC_022525	CATC	2	8	535896	535903	25 %	25 %	0 %	50 %	549478513
10057	NC_022525	TTG	2	6	535918	535923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478513
10058	NC_022525	GCGCG	2	10	535926	535935	0 %	0 %	60 %	40 %	549478513
10059	NC_022525	CAT	2	6	536089	536094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478513
10060	NC_022525	T	6	6	536245	536250	0 %	100 %	0 %	0 %	549478513
10061	NC_022525	TCA	2	6	536264	536269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478513
10062	NC_022525	AGC	2	6	536303	536308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478513
10063	NC_022525	CAG	2	6	536353	536358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478513
10064	NC_022525	ATG	2	6	536365	536370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478513
10065	NC_022525	ATA	2	6	536372	536377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478513
10066	NC_022525	CGC	2	6	536387	536392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478513
10067	NC_022525	CTG	2	6	536395	536400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478513
10068	NC_022525	ACT	2	6	536458	536463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478513
10069	NC_022525	GGC	2	6	536520	536525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478513
10070	NC_022525	AAC	2	6	536645	536650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478513
10071	NC_022525	GCCA	2	8	536729	536736	25 %	0 %	25 %	50 %	549478513
10072	NC_022525	TAA	2	6	536802	536807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478513
10073	NC_022525	AGC	2	6	536834	536839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478513
10074	NC_022525	CGG	2	6	536934	536939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478513
10075	NC_022525	A	6	6	537009	537014	100 %	0 %	0 %	0 %	549478513
10076	NC_022525	CG	3	6	537037	537042	0 %	0 %	50 %	50 %	549478513
10077	NC_022525	TAG	2	6	537083	537088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478513
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10079	NC_022525	GCT	2	6	537195	537200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478513
10080	NC_022525	CAT	2	6	537223	537228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478513
10081	NC_022525	CTG	2	6	537319	537324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478513
10082	NC_022525	GCA	2	6	537333	537338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478513
10083	NC_022525	CGG	2	6	537411	537416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478513
10084	NC_022525	GCA	2	6	537578	537583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478514
10085	NC_022525	ATGG	2	8	537590	537597	25 %	25 %	50 %	0 %	549478514
10086	NC_022525	TTA	2	6	537602	537607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478514
10087	NC_022525	GTC	2	6	537693	537698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478514
10088	NC_022525	CTTAT	2	10	537744	537753	20 %	60 %	0 %	20 %	549478514
10089	NC_022525	TGC	2	6	537795	537800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478514
10090	NC_022525	GCG	2	6	538011	538016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478514
10091	NC_022525	GAA	2	6	538064	538069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478514
10092	NC_022525	CG	3	6	538070	538075	0 %	0 %	50 %	50 %	549478514
10093	NC_022525	CGGG	2	8	538234	538241	0 %	0 %	75 %	25 %	549478514
10094	NC_022525	ATGCC	2	10	538257	538266	20 %	20 %	20 %	40 %	549478514
10095	NC_022525	CGC	2	6	538276	538281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478514
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10097	NC_022525	GTAA	2	8	538444	538451	50 %	25 %	25 %	0 %	549478515
10098	NC_022525	CGC	2	6	538538	538543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478515
10099	NC_022525	CCAG	2	8	538667	538674	25 %	0 %	25 %	50 %	549478515
10100	NC_022525	TG	3	6	538675	538680	0 %	50 %	50 %	0 %	549478515
10101	NC_022525	GGC	2	6	538692	538697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478515
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10103	NC_022525	AAG	2	6	538739	538744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478515
10104	NC_022525	GAC	2	6	538757	538762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478515
10105	NC_022525	CCA	3	9	538850	538858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478515
10106	NC_022525	TCG	2	6	538901	538906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478515
10107	NC_022525	ATT	2	6	538998	539003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478515
10108	NC_022525	GTTCA	2	10	539061	539070	20 %	40 %	20 %	20 %	549478515
10109	NC_022525	GGC	2	6	539088	539093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478515
10110	NC_022525	GCC	2	6	539130	539135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478515
10111	NC_022525	CG	3	6	539212	539217	0 %	0 %	50 %	50 %	549478515
10112	NC_022525	TGA	2	6	539247	539252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478515
10113	NC_022525	AAT	2	6	539259	539264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478515
10114	NC_022525	CTT	2	6	539273	539278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478515
10115	NC_022525	AGCG	2	8	539311	539318	25 %	0 %	50 %	25 %	549478515
10116	NC_022525	CCG	2	6	539423	539428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478515
10117	NC_022525	TGG	2	6	539434	539439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478515
10118	NC_022525	TCA	2	6	539483	539488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478515
10119	NC_022525	GCT	2	6	539625	539630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481756
10120	NC_022525	GCA	2	6	539640	539645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481756
10121	NC_022525	CT	3	6	539656	539661	0 %	50 %	0 %	50 %	549481756
10122	NC_022525	GAC	2	6	539691	539696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481756
10123	NC_022525	GCT	2	6	539760	539765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481756
10124	NC_022525	GCA	2	6	539817	539822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481756
10125	NC_022525	CAG	2	6	539826	539831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481756
10126	NC_022525	CGT	2	6	539856	539861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481756
10127	NC_022525	GAC	2	6	539953	539958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481756
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10131	NC_022525	TGCTTA	2	12	540171	540182	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549478516
10132	NC_022525	GTG	2	6	540212	540217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478516
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10140	NC_022525	CGT	2	6	540478	540483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478516
10141	NC_022525	GCG	2	6	540488	540493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478516
10142	NC_022525	TGCCGA	2	12	540597	540608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549478516
10143	NC_022525	TGA	2	6	540618	540623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478516
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10145	NC_022525	CGCA	2	8	540695	540702	25 %	0 %	25 %	50 %	549478516
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10147	NC_022525	GCG	2	6	540770	540775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478516
10148	NC_022525	CG	3	6	540823	540828	0 %	0 %	50 %	50 %	549478516
10149	NC_022525	GCG	2	6	540882	540887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478516
10150	NC_022525	TGG	2	6	540897	540902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478516
10151	NC_022525	ATG	2	6	540941	540946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478516
10152	NC_022525	TGA	2	6	540957	540962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478516
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10155	NC_022525	CGG	2	6	541107	541112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478516
10156	NC_022525	ACG	2	6	541139	541144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478516
10157	NC_022525	GA	3	6	541272	541277	50 %	0 %	50 %	0 %	549478516
10158	NC_022525	GTC	2	6	541340	541345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478516
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10162	NC_022525	GCT	2	6	541558	541563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478516
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10173	NC_022525	GCG	4	12	541968	541979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478517
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10232	NC_022525	T	6	6	544514	544519	0 %	100 %	0 %	0 %	549478519
10233	NC_022525	GAA	2	6	544544	544549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478519
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10236	NC_022525	CGG	2	6	544672	544677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478519
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10239	NC_022525	GCG	2	6	544741	544746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478519
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10353	NC_022525	TTAT	2	8	551156	551163	25 %	75 %	0 %	0 %	549478526
10354	NC_022525	TCA	2	6	551165	551170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478526
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10480	NC_022525	TGC	2	6	557548	557553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478531
10481	NC_022525	CTG	2	6	557562	557567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478531
10482	NC_022525	CGT	2	6	557571	557576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478531
10483	NC_022525	GCG	2	6	557577	557582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478531
10484	NC_022525	A	7	7	557651	557657	100 %	0 %	0 %	0 %	549478531
10485	NC_022525	CTG	2	6	557682	557687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478531
10486	NC_022525	GC	3	6	557714	557719	0 %	0 %	50 %	50 %	549478531
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10490	NC_022525	CTG	2	6	557932	557937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478532
10491	NC_022525	TC	3	6	558039	558044	0 %	50 %	0 %	50 %	549478532
10492	NC_022525	CAG	2	6	558064	558069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478532
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10494	NC_022525	ATG	3	9	558212	558220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478532
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