MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83501	NC_022525	GCC	2	6	4524334	4524339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482439
83502	NC_022525	GCT	2	6	4524410	4524415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83503	NC_022525	GCG	2	6	4524416	4524421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482439
83504	NC_022525	GCTG	2	8	4524504	4524511	0 %	25 %	50 %	25 %	549482439
83505	NC_022525	CGG	2	6	4524538	4524543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482439
83506	NC_022525	CCA	2	6	4524550	4524555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482439
83507	NC_022525	CG	3	6	4524630	4524635	0 %	0 %	50 %	50 %	549482439
83508	NC_022525	CAG	3	9	4524649	4524657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83509	NC_022525	GCA	2	6	4524673	4524678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83510	NC_022525	GAT	2	6	4524741	4524746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482439
83511	NC_022525	AGA	2	6	4524747	4524752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549482439
83512	NC_022525	ACG	2	6	4524764	4524769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83513	NC_022525	CCA	2	6	4524862	4524867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482439
83514	NC_022525	CGT	2	6	4524882	4524887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83515	NC_022525	CTG	2	6	4524895	4524900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83516	NC_022525	GGT	2	6	4524907	4524912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482439
83517	NC_022525	TAT	2	6	4524930	4524935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482439
83518	NC_022525	GCC	2	6	4524956	4524961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482439
83519	NC_022525	CAG	2	6	4524976	4524981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83520	NC_022525	G	8	8	4524993	4525000	0 %	0 %	100 %	0 %	549482439
83521	NC_022525	CCA	2	6	4525038	4525043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482439
83522	NC_022525	TTGC	2	8	4525045	4525052	0 %	50 %	25 %	25 %	549482439
83523	NC_022525	CG	3	6	4525163	4525168	0 %	0 %	50 %	50 %	549482439
83524	NC_022525	GTC	2	6	4525174	4525179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83525	NC_022525	T	6	6	4525186	4525191	0 %	100 %	0 %	0 %	549482439
83526	NC_022525	CGC	2	6	4525236	4525241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482439
83527	NC_022525	GCA	2	6	4525296	4525301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83528	NC_022525	CGC	2	6	4525356	4525361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482439
83529	NC_022525	AGC	2	6	4525413	4525418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83530	NC_022525	GC	3	6	4525422	4525427	0 %	0 %	50 %	50 %	549482439
83531	NC_022525	GACG	2	8	4525461	4525468	25 %	0 %	50 %	25 %	549482439
83532	NC_022525	CGC	2	6	4525469	4525474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482439
83533	NC_022525	GCC	2	6	4525498	4525503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482439
83534	NC_022525	TTC	3	9	4525516	4525524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549482439
83535	NC_022525	CTG	2	6	4525558	4525563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83536	NC_022525	TGA	2	6	4525582	4525587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482439
83537	NC_022525	CGC	2	6	4525664	4525669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482439
83538	NC_022525	CGG	2	6	4525707	4525712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482439
83539	NC_022525	GAA	2	6	4525763	4525768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549482439
83540	NC_022525	AGA	2	6	4525830	4525835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549482439
83541	NC_022525	CAG	2	6	4525903	4525908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83542	NC_022525	TTC	2	6	4525939	4525944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549482439
83543	NC_022525	ACGA	2	8	4525945	4525952	50 %	0 %	25 %	25 %	549482439
83544	NC_022525	GCCGT	2	10	4526012	4526021	0 %	20 %	40 %	40 %	549482439
83545	NC_022525	GTC	2	6	4526063	4526068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482439
83546	NC_022525	TCC	2	6	4526072	4526077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549482439
83547	NC_022525	TTG	2	6	4526092	4526097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549482439
83548	NC_022525	CAGA	2	8	4526125	4526132	50 %	0 %	25 %	25 %	549482439
83549	NC_022525	ACT	2	6	4526155	4526160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482439
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83551	NC_022525	TTTCAT	2	12	4526397	4526408	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	549482440
83552	NC_022525	T	6	6	4526433	4526438	0 %	100 %	0 %	0 %	549482440
83553	NC_022525	T	6	6	4526444	4526449	0 %	100 %	0 %	0 %	549482440
83554	NC_022525	CGT	2	6	4526723	4526728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482441
83555	NC_022525	TCA	2	6	4526774	4526779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482441
83556	NC_022525	CCT	2	6	4526860	4526865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549482441
83557	NC_022525	GCC	2	6	4526880	4526885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482441
83558	NC_022525	GCG	2	6	4526901	4526906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482441
83559	NC_022525	TGC	2	6	4526938	4526943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482441
83560	NC_022525	ACCCG	2	10	4526969	4526978	20 %	0 %	20 %	60 %	549482441
83561	NC_022525	CGG	2	6	4527124	4527129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482441
83562	NC_022525	TGCC	2	8	4527150	4527157	0 %	25 %	25 %	50 %	549482441
83563	NC_022525	ATT	2	6	4527193	4527198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482441
83564	NC_022525	T	6	6	4527197	4527202	0 %	100 %	0 %	0 %	549482441
83565	NC_022525	CGC	2	6	4527276	4527281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482441
83566	NC_022525	GCT	2	6	4527341	4527346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482441
83567	NC_022525	CGG	2	6	4527431	4527436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482441
83568	NC_022525	GGC	2	6	4527458	4527463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482441
83569	NC_022525	CTG	2	6	4527468	4527473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482441
83570	NC_022525	AGG	2	6	4527478	4527483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549482441
83571	NC_022525	CAC	2	6	4527524	4527529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482441
83572	NC_022525	CTC	2	6	4527530	4527535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549482441
83573	NC_022525	AT	3	6	4527725	4527730	50 %	50 %	0 %	0 %	549482441
83574	NC_022525	CG	3	6	4527862	4527867	0 %	0 %	50 %	50 %	549482441
83575	NC_022525	TGG	3	9	4527907	4527915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482441
83576	NC_022525	CGG	3	9	4527916	4527924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482441
83577	NC_022525	GTTC	2	8	4528084	4528091	0 %	50 %	25 %	25 %	549482441
83578	NC_022525	ATG	2	6	4528092	4528097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482441
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83580	NC_022525	GTTTC	2	10	4528226	4528235	0 %	60 %	20 %	20 %	549482441
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83582	NC_022525	GTC	2	6	4528252	4528257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482441
83583	NC_022525	TCGC	2	8	4528285	4528292	0 %	25 %	25 %	50 %	549482441
83584	NC_022525	CAC	2	6	4528328	4528333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549482441
83585	NC_022525	AAC	2	6	4528339	4528344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549482441
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83587	NC_022525	TGG	2	6	4528451	4528456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482441
83588	NC_022525	TCGG	2	8	4528750	4528757	0 %	25 %	50 %	25 %	549481544
83589	NC_022525	GCC	2	6	4528815	4528820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481544
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83591	NC_022525	GAG	2	6	4528833	4528838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481544
83592	NC_022525	TGA	2	6	4528907	4528912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481544
83593	NC_022525	CGG	2	6	4528966	4528971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481544
83594	NC_022525	T	6	6	4528993	4528998	0 %	100 %	0 %	0 %	549481544
83595	NC_022525	ATGA	2	8	4529016	4529023	50 %	25 %	25 %	0 %	549481544
83596	NC_022525	GAT	2	6	4529165	4529170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481544
83597	NC_022525	TGATC	2	10	4529207	4529216	20 %	40 %	20 %	20 %	549481544
83598	NC_022525	CATG	2	8	4529249	4529256	25 %	25 %	25 %	25 %	549481544
83599	NC_022525	ATG	2	6	4529277	4529282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481544
83600	NC_022525	TGAT	2	8	4529323	4529330	25 %	50 %	25 %	0 %	549481544
83601	NC_022525	TGA	2	6	4529348	4529353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481544
83602	NC_022525	CGG	2	6	4529390	4529395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481544
83603	NC_022525	CAGC	2	8	4529519	4529526	25 %	0 %	25 %	50 %	549481544
83604	NC_022525	CAT	2	6	4529619	4529624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481544
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83606	NC_022525	GCA	2	6	4529684	4529689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481544
83607	NC_022525	GAAA	2	8	4529816	4529823	75 %	0 %	25 %	0 %	549481545
83608	NC_022525	TA	3	6	4529850	4529855	50 %	50 %	0 %	0 %	549481545
83609	NC_022525	TTTA	2	8	4529894	4529901	25 %	75 %	0 %	0 %	549481545
83610	NC_022525	GGC	2	6	4529907	4529912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481545
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83612	NC_022525	TG	3	6	4530036	4530041	0 %	50 %	50 %	0 %	549481545
83613	NC_022525	TCT	2	6	4530089	4530094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481545
83614	NC_022525	TGC	2	6	4530163	4530168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481545
83615	NC_022525	TCCT	2	8	4530198	4530205	0 %	50 %	0 %	50 %	549481545
83616	NC_022525	GGT	2	6	4530266	4530271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481545
83617	NC_022525	CAT	2	6	4530290	4530295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481545
83618	NC_022525	GGT	2	6	4530302	4530307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481545
83619	NC_022525	GGC	2	6	4530308	4530313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481545
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83621	NC_022525	TGCTGG	2	12	4530391	4530402	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549481545
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83730	NC_022525	TGA	3	9	4536490	4536498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481550
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